MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Nitrosococcus watsonii C-113 chromosome

Total Repeats: 10857

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_014315	CGAG	2	8	1014263	1014270	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
3002	NC_014315	TGGGG	2	10	1014331	1014340	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
3003	NC_014315	TTG	2	6	1014359	1014364	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3004	NC_014315	TTC	2	6	1014386	1014391	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3005	NC_014315	ATT	2	6	1014420	1014425	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3006	NC_014315	T	7	7	1014433	1014439	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3007	NC_014315	TCG	2	6	1014548	1014553	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3008	NC_014315	GGA	2	6	1014660	1014665	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3009	NC_014315	TGT	2	6	1014666	1014671	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3010	NC_014315	T	7	7	1014695	1014701	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3011	NC_014315	GGC	2	6	1015188	1015193	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3012	NC_014315	TTA	2	6	1019772	1019777	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3013	NC_014315	TAA	2	6	1019796	1019801	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3014	NC_014315	GTTT	2	8	1020763	1020770	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
3015	NC_014315	TTA	2	6	1020779	1020784	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3016	NC_014315	GCT	2	6	1021191	1021196	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3017	NC_014315	GGTT	2	8	1021220	1021227	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3018	NC_014315	AAAT	2	8	1021258	1021265	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
3019	NC_014315	ATTAC	2	10	1023375	1023384	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
3020	NC_014315	AGA	2	6	1023430	1023435	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3021	NC_014315	GCA	2	6	1028368	1028373	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3022	NC_014315	A	6	6	1029078	1029083	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3023	NC_014315	CT	4	8	1029164	1029171	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3024	NC_014315	AAG	2	6	1030057	1030062	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3025	NC_014315	A	7	7	1030089	1030095	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3026	NC_014315	TTC	2	6	1030147	1030152	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3027	NC_014315	GATA	2	8	1030166	1030173	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
3028	NC_014315	AATTAG	2	12	1032201	1032212	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
3029	NC_014315	T	6	6	1037091	1037096	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3030	NC_014315	TTTA	2	8	1038567	1038574	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
3031	NC_014315	AG	3	6	1038587	1038592	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3032	NC_014315	GCTC	2	8	1038666	1038673	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
3033	NC_014315	TTGT	2	8	1038708	1038715	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
3034	NC_014315	CTT	2	6	1039715	1039720	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3035	NC_014315	GATT	2	8	1039763	1039770	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
3036	NC_014315	CCGC	2	8	1039777	1039784	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
3037	NC_014315	ACTG	2	8	1039832	1039839	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
3038	NC_014315	CTTG	2	8	1039842	1039849	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
3039	NC_014315	TGA	2	6	1039854	1039859	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3040	NC_014315	GC	3	6	1039896	1039901	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3041	NC_014315	TGC	2	6	1039942	1039947	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3042	NC_014315	ACC	2	6	1039950	1039955	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3043	NC_014315	GCG	2	6	1039989	1039994	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3044	NC_014315	GCCG	2	8	1040069	1040076	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3045	NC_014315	GTT	2	6	1040104	1040109	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3046	NC_014315	CAA	2	6	1040164	1040169	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3047	NC_014315	CG	3	6	1040251	1040256	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3048	NC_014315	ATC	2	6	1040270	1040275	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3049	NC_014315	GCGG	2	8	1040387	1040394	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
3050	NC_014315	TAGA	2	8	1040427	1040434	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
3051	NC_014315	GCT	2	6	1040439	1040444	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3052	NC_014315	CTG	2	6	1040456	1040461	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3053	NC_014315	GCTG	2	8	1040472	1040479	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
3054	NC_014315	TGT	2	6	1040513	1040518	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3055	NC_014315	CT	3	6	1040570	1040575	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3056	NC_014315	TCC	2	6	1040576	1040581	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3057	NC_014315	GCT	2	6	1040596	1040601	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3058	NC_014315	CTTG	2	8	1040677	1040684	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
3059	NC_014315	TCG	2	6	1040711	1040716	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3060	NC_014315	TCG	2	6	1044491	1044496	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3061	NC_014315	AAAT	2	8	1044500	1044507	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
3062	NC_014315	ATA	2	6	1045440	1045445	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3063	NC_014315	A	6	6	1046244	1046249	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3064	NC_014315	T	6	6	1046267	1046272	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3065	NC_014315	AAT	2	6	1046290	1046295	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3066	NC_014315	TAA	2	6	1046364	1046369	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3067	NC_014315	CT	3	6	1046396	1046401	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3068	NC_014315	TTA	2	6	1046441	1046446	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3069	NC_014315	T	8	8	1046461	1046468	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3070	NC_014315	TAGA	2	8	1046536	1046543	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
3071	NC_014315	TAA	2	6	1046578	1046583	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3072	NC_014315	T	6	6	1046587	1046592	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3073	NC_014315	CTGAT	2	10	1049445	1049454	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
3074	NC_014315	GGC	2	6	1049504	1049509	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3075	NC_014315	ATG	2	6	1049602	1049607	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3076	NC_014315	TGCTT	2	10	1049608	1049617	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
3077	NC_014315	CGG	2	6	1049649	1049654	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3078	NC_014315	CCT	2	6	1049659	1049664	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3079	NC_014315	TTC	2	6	1055788	1055793	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3080	NC_014315	CACAAT	2	12	1055799	1055810	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3081	NC_014315	AAC	2	6	1055825	1055830	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3082	NC_014315	TCT	2	6	1055846	1055851	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3083	NC_014315	GC	3	6	1055858	1055863	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3084	NC_014315	CGG	2	6	1055879	1055884	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3085	NC_014315	AGT	2	6	1055891	1055896	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3086	NC_014315	G	6	6	1057378	1057383	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
3087	NC_014315	CCCT	2	8	1058863	1058870	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
3088	NC_014315	CTA	2	6	1060805	1060810	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3089	NC_014315	A	8	8	1060813	1060820	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3090	NC_014315	TTGAGA	2	12	1060821	1060832	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3091	NC_014315	GTC	2	6	1060859	1060864	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3092	NC_014315	TAAT	2	8	1061352	1061359	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3093	NC_014315	A	7	7	1066239	1066245	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3094	NC_014315	T	6	6	1066277	1066282	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3095	NC_014315	TCA	2	6	1066298	1066303	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3096	NC_014315	GCG	2	6	1066330	1066335	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3097	NC_014315	A	7	7	1066370	1066376	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3098	NC_014315	AATC	2	8	1066383	1066390	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
3099	NC_014315	AAATA	2	10	1066398	1066407	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
3100	NC_014315	A	6	6	1066465	1066470	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3101	NC_014315	TCT	2	6	1066509	1066514	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3102	NC_014315	GCTG	2	8	1066694	1066701	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
3103	NC_014315	GA	3	6	1066709	1066714	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3104	NC_014315	GTT	2	6	1067556	1067561	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3105	NC_014315	GTCATC	2	12	1067604	1067615	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
3106	NC_014315	GA	3	6	1067626	1067631	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3107	NC_014315	TAGA	2	8	1068315	1068322	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
3108	NC_014315	T	6	6	1068382	1068387	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3109	NC_014315	GCTT	2	8	1068389	1068396	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
3110	NC_014315	AGTT	2	8	1068413	1068420	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
3111	NC_014315	GCT	2	6	1068436	1068441	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3112	NC_014315	GTA	2	6	1068471	1068476	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3113	NC_014315	T	7	7	1068548	1068554	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3114	NC_014315	AG	3	6	1068555	1068560	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3115	NC_014315	TGG	2	6	1068564	1068569	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3116	NC_014315	ATAGA	2	10	1068572	1068581	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
3117	NC_014315	ATC	2	6	1068609	1068614	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3118	NC_014315	AAT	2	6	1068678	1068683	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3119	NC_014315	TAT	2	6	1068690	1068695	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3120	NC_014315	TAA	2	6	1068741	1068746	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3121	NC_014315	TAAAA	2	10	1068796	1068805	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
3122	NC_014315	TTCC	2	8	1068808	1068815	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3123	NC_014315	CTATC	2	10	1068897	1068906	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
3124	NC_014315	AAAG	2	8	1071214	1071221	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
3125	NC_014315	T	6	6	1071305	1071310	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3126	NC_014315	AGA	2	6	1071316	1071321	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3127	NC_014315	TTG	2	6	1071329	1071334	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3128	NC_014315	AGG	2	6	1073129	1073134	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3129	NC_014315	TCA	2	6	1074576	1074581	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3130	NC_014315	TAAC	2	8	1074582	1074589	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
3131	NC_014315	GGA	2	6	1074597	1074602	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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3133	NC_014315	AAG	2	6	1074618	1074623	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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3261	NC_014315	CCCGT	2	10	1111280	1111289	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
3262	NC_014315	TAT	2	6	1111290	1111295	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3263	NC_014315	CCAAA	2	10	1111302	1111311	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
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3266	NC_014315	CGC	2	6	1111505	1111510	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3267	NC_014315	CCG	2	6	1111544	1111549	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3268	NC_014315	TGAA	2	8	1111551	1111558	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
3269	NC_014315	CTGTT	2	10	1111616	1111625	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
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3276	NC_014315	AGAA	2	8	1113692	1113699	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
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3279	NC_014315	A	7	7	1113793	1113799	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3298	NC_014315	AGG	3	9	1117848	1117856	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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3383	NC_014315	TGG	2	6	1143234	1143239	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3384	NC_014315	GAG	2	6	1143250	1143255	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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3387	NC_014315	G	7	7	1143358	1143364	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
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3392	NC_014315	GGC	2	6	1143484	1143489	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3393	NC_014315	GGT	2	6	1143513	1143518	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3394	NC_014315	ATA	2	6	1143567	1143572	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3395	NC_014315	GGTGA	2	10	1143639	1143648	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
3396	NC_014315	CG	3	6	1143703	1143708	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3397	NC_014315	GTCATC	2	12	1143726	1143737	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
3398	NC_014315	TCGC	2	8	1143865	1143872	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
3399	NC_014315	GGTTGG	2	12	1143900	1143911	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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3401	NC_014315	A	6	6	1144006	1144011	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3402	NC_014315	ACC	2	6	1144061	1144066	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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3412	NC_014315	GTC	2	6	1148800	1148805	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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3415	NC_014315	T	7	7	1148892	1148898	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3416	NC_014315	CG	3	6	1148925	1148930	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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3420	NC_014315	TGA	2	6	1152703	1152708	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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3423	NC_014315	CATT	2	8	1152904	1152911	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
3424	NC_014315	CCAG	2	8	1157961	1157968	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
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3432	NC_014315	AG	3	6	1158820	1158825	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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3468	NC_014315	ATT	2	6	1169029	1169034	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3489	NC_014315	GCCG	2	8	1185643	1185650	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3490	NC_014315	ATTG	2	8	1185672	1185679	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
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