MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111 chromosome 2

Total Repeats: 202

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014211	CGCGG	2	10	1844	1853	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
2	NC_014211	GAGGC	2	10	5679	5688	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
3	NC_014211	GGCCG	2	10	10690	10699	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
4	NC_014211	CCCGG	2	10	11102	11111	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
5	NC_014211	ACGGG	2	10	14024	14033	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
6	NC_014211	GAGGG	2	10	19037	19046	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
7	NC_014211	CCCGG	2	10	19981	19990	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
8	NC_014211	GGCCA	2	10	30259	30268	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
9	NC_014211	CGAAG	2	10	47662	47671	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
10	NC_014211	CCGCC	2	10	50545	50554	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
11	NC_014211	GCGCC	2	10	60337	60346	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
12	NC_014211	CGCGG	2	10	60367	60376	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
13	NC_014211	TCCCT	2	10	63695	63704	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
14	NC_014211	TCGAT	2	10	68050	68059	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
15	NC_014211	GCCCG	2	10	72552	72561	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
16	NC_014211	GAAGG	2	10	76939	76948	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
17	NC_014211	GCCCC	2	10	77093	77102	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
18	NC_014211	CCGAC	2	10	85080	85089	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
19	NC_014211	GCCCC	2	10	86385	86394	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
20	NC_014211	CGACC	2	10	86473	86482	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
21	NC_014211	CGGGG	2	10	90483	90492	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
22	NC_014211	AGCGG	2	10	90527	90536	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
23	NC_014211	CACCC	2	10	90626	90635	20 %	0 %	0 %	80 %	Non-Coding
24	NC_014211	CGTGA	2	10	92281	92290	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
25	NC_014211	CGGTG	2	10	104568	104577	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
26	NC_014211	GGGGC	2	10	110851	110860	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
27	NC_014211	GACAC	2	10	116539	116548	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
28	NC_014211	CCCCG	2	10	122003	122012	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
29	NC_014211	GGGCA	2	10	127347	127356	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
30	NC_014211	CGGGA	2	10	127406	127415	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
31	NC_014211	GGCGG	2	10	129060	129069	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
32	NC_014211	CGCGG	2	10	132249	132258	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
33	NC_014211	CGGTC	2	10	132616	132625	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
34	NC_014211	GGGGC	2	10	135558	135567	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
35	NC_014211	GCGCC	2	10	145395	145404	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
36	NC_014211	GCCCG	2	10	145907	145916	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
37	NC_014211	GCTCC	2	10	155014	155023	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
38	NC_014211	CGGGG	2	10	158407	158416	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
39	NC_014211	GCTCC	2	10	166643	166652	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
40	NC_014211	AAAGG	2	10	169482	169491	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
41	NC_014211	CCCGG	2	10	175396	175405	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
42	NC_014211	GCCCC	2	10	179258	179267	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
43	NC_014211	CTCTC	2	10	190558	190567	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
44	NC_014211	GGCCG	2	10	190896	190905	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
45	NC_014211	CTCCG	2	10	194410	194419	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
46	NC_014211	GCCGG	2	10	215630	215639	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
47	NC_014211	GGGGC	2	10	218308	218317	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
48	NC_014211	CCGGC	2	10	225749	225758	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
49	NC_014211	TCTGC	2	10	230143	230152	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
50	NC_014211	GACCG	2	10	234123	234132	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
51	NC_014211	GCCGC	2	10	234229	234238	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
52	NC_014211	GGCCG	2	10	234242	234251	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
53	NC_014211	CGGTG	2	10	235499	235508	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
54	NC_014211	CTCCG	2	10	236655	236664	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
55	NC_014211	GTCCT	2	10	247044	247053	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
56	NC_014211	CGGGG	2	10	249463	249472	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
57	NC_014211	TTCTG	2	10	251990	251999	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
58	NC_014211	GGCCA	2	10	252087	252096	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
59	NC_014211	GCGCA	2	10	255463	255472	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
60	NC_014211	CCTGC	2	10	255573	255582	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
61	NC_014211	TGCGG	2	10	255594	255603	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
62	NC_014211	CCGCA	2	10	255618	255627	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
63	NC_014211	CCGCG	2	10	255946	255955	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
64	NC_014211	CCGCT	2	10	258589	258598	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
65	NC_014211	CGTCC	2	10	261305	261314	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
66	NC_014211	TCCCG	2	10	261394	261403	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
67	NC_014211	GGTGT	2	10	261642	261651	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
68	NC_014211	CGGTC	2	10	267469	267478	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
69	NC_014211	CGCTC	2	10	291412	291421	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
70	NC_014211	CGGCC	2	10	291445	291454	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
71	NC_014211	GCACC	2	10	291464	291473	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
72	NC_014211	GGACT	2	10	292013	292022	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
73	NC_014211	GCGCC	2	10	292516	292525	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
74	NC_014211	GGAAG	2	10	292636	292645	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
75	NC_014211	AGGGG	2	10	295356	295365	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
76	NC_014211	CCGCC	2	10	298323	298332	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
77	NC_014211	GACCC	2	10	305117	305126	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
78	NC_014211	TGTCC	2	10	305230	305239	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
79	NC_014211	CCCGT	2	10	312089	312098	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
80	NC_014211	CGCGG	2	10	312174	312183	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
81	NC_014211	CGCCC	2	10	320896	320905	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
82	NC_014211	CCGGG	2	10	327228	327237	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
83	NC_014211	CCCCG	2	10	332280	332289	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
84	NC_014211	GCCGC	2	10	335660	335669	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
85	NC_014211	CGCGG	2	10	343407	343416	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
86	NC_014211	GGCCG	2	10	346588	346597	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
87	NC_014211	CGGCG	2	10	349127	349136	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
88	NC_014211	CGGGA	2	10	349211	349220	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
89	NC_014211	GTCGG	2	10	359920	359929	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
90	NC_014211	CGGCA	2	10	359992	360001	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
91	NC_014211	GCCCC	2	10	361021	361030	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
92	NC_014211	GGGCG	2	10	363509	363518	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
93	NC_014211	CCACA	2	10	365647	365656	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
94	NC_014211	GTCGC	2	10	370882	370891	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
95	NC_014211	CGACA	2	10	374585	374594	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
96	NC_014211	CGTGA	2	10	377261	377270	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
97	NC_014211	CCGGG	2	10	390382	390391	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
98	NC_014211	GGCCG	2	10	390435	390444	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
99	NC_014211	TAAAG	2	10	390603	390612	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
100	NC_014211	CGGGT	2	10	390858	390867	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
101	NC_014211	TCGTG	2	10	391931	391940	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
102	NC_014211	CGTCA	2	10	392268	392277	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
103	NC_014211	GGGGT	2	10	396104	396113	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
104	NC_014211	GACGC	2	10	396915	396924	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
105	NC_014211	ACAGG	2	10	397449	397458	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
106	NC_014211	CCGCT	2	10	397531	397540	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
107	NC_014211	CCGTT	2	10	397861	397870	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
108	NC_014211	CCGGA	2	10	399704	399713	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
109	NC_014211	CCGCG	2	10	399833	399842	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
110	NC_014211	GGGGA	2	10	400976	400985	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
111	NC_014211	GCACG	2	10	402059	402068	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
112	NC_014211	GCCCG	2	10	413841	413850	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
113	NC_014211	CCCGG	2	10	415417	415426	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
114	NC_014211	GCTCC	2	10	415505	415514	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
115	NC_014211	CTCGG	2	10	423723	423732	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
116	NC_014211	CCGGC	2	10	435049	435058	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
117	NC_014211	CGCCC	2	10	436151	436160	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
118	NC_014211	CCCCG	2	10	441739	441748	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
119	NC_014211	GCACT	2	10	457353	457362	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
120	NC_014211	GCCCC	2	10	458067	458076	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
121	NC_014211	CGGGC	2	10	466711	466720	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
122	NC_014211	CCGCG	2	10	466779	466788	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
123	NC_014211	CAGCA	2	10	468185	468194	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
124	NC_014211	CCGCG	2	10	468385	468394	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
125	NC_014211	CGGCC	2	10	468972	468981	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
126	NC_014211	CCGGG	2	10	468990	468999	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
127	NC_014211	GGCGG	2	10	470754	470763	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
128	NC_014211	GGTCG	2	10	470774	470783	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
129	NC_014211	CGGTG	2	10	478913	478922	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
130	NC_014211	CCGCG	2	10	481803	481812	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
131	NC_014211	CCGGC	2	10	485213	485222	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
132	NC_014211	CCGGA	2	10	491339	491348	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
133	NC_014211	TCCCC	2	10	494372	494381	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
134	NC_014211	CGACA	2	10	495272	495281	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
135	NC_014211	TAAAG	2	10	504959	504968	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
136	NC_014211	CGGGT	2	10	505214	505223	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
137	NC_014211	TCGTG	2	10	506286	506295	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
138	NC_014211	CGTCA	2	10	506617	506626	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
139	NC_014211	CCCCG	2	10	512888	512897	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
140	NC_014211	GACGT	2	10	515573	515582	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
141	NC_014211	CCCGG	2	10	516440	516449	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
142	NC_014211	CCCCG	2	10	518675	518684	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
143	NC_014211	ACCGG	2	10	519543	519552	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
144	NC_014211	GTGCC	2	10	522942	522951	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
145	NC_014211	TTTTC	2	10	525311	525320	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
146	NC_014211	GAGCG	2	10	529610	529619	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
147	NC_014211	GCCGC	2	10	530250	530259	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
148	NC_014211	GCCCC	2	10	537761	537770	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
149	NC_014211	GCCGT	2	10	539362	539371	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
150	NC_014211	TCGCG	2	10	544062	544071	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
151	NC_014211	CCCGC	2	10	551998	552007	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
152	NC_014211	TCCCG	2	10	555523	555532	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
153	NC_014211	GAGGG	2	10	558772	558781	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
154	NC_014211	CCGGT	2	10	559638	559647	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
155	NC_014211	GCGCG	2	10	560595	560604	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
156	NC_014211	AGGGG	2	10	564279	564288	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
157	NC_014211	CGGGG	2	10	568005	568014	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
158	NC_014211	TCCCG	2	10	569634	569643	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
159	NC_014211	CGGGG	2	10	571939	571948	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
160	NC_014211	CGTCC	2	10	571952	571961	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
161	NC_014211	GCCCG	2	10	572682	572691	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
162	NC_014211	CCGTC	2	10	573596	573605	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
163	NC_014211	CGGAC	2	10	573679	573688	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
164	NC_014211	GGCGC	2	10	575590	575599	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
165	NC_014211	CGCGG	2	10	582199	582208	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
166	NC_014211	CCTTT	2	10	593025	593034	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
167	NC_014211	GCCCC	2	10	595144	595153	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
168	NC_014211	AGCCC	2	10	600573	600582	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
169	NC_014211	CGGCG	2	10	607695	607704	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
170	NC_014211	GCGCC	2	10	618472	618481	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
171	NC_014211	GAGGG	2	10	619299	619308	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
172	NC_014211	CGGAC	2	10	624522	624531	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
173	NC_014211	TGGTC	2	10	626081	626090	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
174	NC_014211	GGGCG	2	10	628232	628241	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
175	NC_014211	CGGGG	2	10	630286	630295	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
176	NC_014211	GTGGA	2	10	631719	631728	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
177	NC_014211	TTCCT	2	10	641019	641028	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
178	NC_014211	CCGGG	2	10	652867	652876	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
179	NC_014211	CTCGA	2	10	661415	661424	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
180	NC_014211	AGTTG	2	10	663353	663362	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
181	NC_014211	GCGCC	2	10	664847	664856	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
182	NC_014211	GTGCG	2	10	670101	670110	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
183	NC_014211	GGGGA	2	10	676933	676942	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
184	NC_014211	GCCGC	2	10	678400	678409	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
185	NC_014211	CGCTC	2	10	678451	678460	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
186	NC_014211	CGCGC	2	10	687890	687899	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
187	NC_014211	CGGAC	2	10	688714	688723	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
188	NC_014211	GGCGG	2	10	692265	692274	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
189	NC_014211	GGGGA	2	10	693203	693212	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
190	NC_014211	CGCGG	2	10	694549	694558	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
191	NC_014211	GGCGC	2	10	702036	702045	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
192	NC_014211	GCACC	2	10	705953	705962	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
193	NC_014211	CGGGT	2	10	711898	711907	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
194	NC_014211	CGGGG	2	10	720753	720762	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
195	NC_014211	CCCGT	2	10	723703	723712	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
196	NC_014211	GAGAG	2	10	728271	728280	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
197	NC_014211	CCCTG	2	10	733653	733662	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
198	NC_014211	CCCGG	2	10	737065	737074	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
199	NC_014211	GCCGG	2	10	743477	743486	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
200	NC_014211	GCGCG	2	10	752147	752156	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
201	NC_014211	CGTCC	2	10	773849	773858	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
202	NC_014211	CCGGA	2	10	774098	774107	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.