MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111 chromosome 2

Total Repeats: 3347

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_014211	CCG	2	6	663718	663723	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3002	NC_014211	CCCG	2	8	664801	664808	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
3003	NC_014211	CCG	2	6	664816	664821	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3004	NC_014211	GCGCC	2	10	664847	664856	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
3005	NC_014211	GTC	2	6	664880	664885	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3006	NC_014211	G	6	6	664942	664947	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
3007	NC_014211	CG	3	6	664977	664982	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3008	NC_014211	GGAC	2	8	665000	665007	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
3009	NC_014211	TCC	2	6	665043	665048	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3010	NC_014211	GTC	2	6	665116	665121	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3011	NC_014211	GTT	2	6	665140	665145	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3012	NC_014211	GTA	2	6	665171	665176	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3013	NC_014211	GA	3	6	665180	665185	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3014	NC_014211	GTC	2	6	665213	665218	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3015	NC_014211	CCG	2	6	665225	665230	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3016	NC_014211	CG	3	6	665281	665286	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3017	NC_014211	CGG	2	6	665359	665364	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3018	NC_014211	CGG	3	9	665375	665383	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3019	NC_014211	GT	3	6	665462	665467	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3020	NC_014211	GAC	2	6	665477	665482	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3021	NC_014211	CGG	2	6	667808	667813	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3022	NC_014211	CG	3	6	667852	667857	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3023	NC_014211	GAG	2	6	667904	667909	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3024	NC_014211	GGC	2	6	667949	667954	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3025	NC_014211	CGGGGG	2	12	667967	667978	0 %	0 %	83.33 %	16.67 %	Non-Coding
3026	NC_014211	G	6	6	669352	669357	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
3027	NC_014211	CGGGGG	2	12	670052	670063	0 %	0 %	83.33 %	16.67 %	Non-Coding
3028	NC_014211	GCC	2	6	670089	670094	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3029	NC_014211	GTGCG	2	10	670101	670110	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
3030	NC_014211	CG	3	6	670174	670179	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3031	NC_014211	GCG	2	6	670210	670215	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3032	NC_014211	CCGC	2	8	670232	670239	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
3033	NC_014211	TCT	2	6	670318	670323	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3034	NC_014211	GGT	2	6	670330	670335	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3035	NC_014211	GGCG	2	8	671119	671126	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
3036	NC_014211	CCA	2	6	671161	671166	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3037	NC_014211	GCC	2	6	671170	671175	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3038	NC_014211	GC	4	8	671202	671209	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3039	NC_014211	CG	3	6	672276	672281	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3040	NC_014211	C	6	6	672297	672302	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
3041	NC_014211	GAG	2	6	672321	672326	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3042	NC_014211	GACG	2	8	673228	673235	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
3043	NC_014211	GGT	2	6	673312	673317	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3044	NC_014211	CGG	2	6	673332	673337	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3045	NC_014211	GAG	2	6	673343	673348	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3046	NC_014211	CGG	2	6	673350	673355	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3047	NC_014211	GCG	2	6	673361	673366	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3048	NC_014211	GGA	2	6	673368	673373	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3049	NC_014211	GAG	3	9	673374	673382	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3050	NC_014211	TG	3	6	676667	676672	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3051	NC_014211	CTG	2	6	676673	676678	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3052	NC_014211	G	6	6	676678	676683	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
3053	NC_014211	CGGGGC	2	12	676688	676699	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3054	NC_014211	GC	3	6	676725	676730	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3055	NC_014211	GCC	2	6	676739	676744	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3056	NC_014211	GCC	2	6	676758	676763	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3057	NC_014211	CGGT	2	8	676775	676782	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
3058	NC_014211	GCC	2	6	676826	676831	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3059	NC_014211	GAC	2	6	676846	676851	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3060	NC_014211	GCG	2	6	676862	676867	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3061	NC_014211	C	6	6	676895	676900	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
3062	NC_014211	GGGGA	2	10	676933	676942	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
3063	NC_014211	GAG	2	6	677509	677514	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3064	NC_014211	GGGC	2	8	677531	677538	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
3065	NC_014211	GGC	2	6	677564	677569	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3066	NC_014211	AGG	2	6	677589	677594	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3067	NC_014211	GGGC	2	8	677606	677613	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
3068	NC_014211	CCCT	2	8	678241	678248	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
3069	NC_014211	CCG	2	6	678259	678264	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3070	NC_014211	GAT	2	6	678327	678332	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3071	NC_014211	GCCGC	2	10	678400	678409	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
3072	NC_014211	CGCTC	2	10	678451	678460	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
3073	NC_014211	GTG	2	6	678546	678551	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3074	NC_014211	CGT	2	6	678583	678588	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3075	NC_014211	CA	3	6	682231	682236	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3076	NC_014211	TGC	2	6	682274	682279	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3077	NC_014211	CGT	2	6	682286	682291	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3078	NC_014211	TC	3	6	682338	682343	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3079	NC_014211	GCC	2	6	682409	682414	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3080	NC_014211	CGG	2	6	683108	683113	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3081	NC_014211	CG	3	6	683116	683121	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3082	NC_014211	GGT	2	6	683140	683145	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3083	NC_014211	CGG	2	6	683828	683833	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3084	NC_014211	CG	3	6	683846	683851	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3085	NC_014211	CGGG	2	8	683865	683872	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
3086	NC_014211	CGG	2	6	684282	684287	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3087	NC_014211	GC	4	8	684293	684300	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3088	NC_014211	CAA	2	6	684335	684340	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3089	NC_014211	TTC	2	6	684352	684357	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3090	NC_014211	CG	3	6	684396	684401	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3091	NC_014211	GGA	2	6	684430	684435	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3092	NC_014211	GCCC	2	8	686999	687006	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
3093	NC_014211	GAG	2	6	687425	687430	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3094	NC_014211	CGG	2	6	687434	687439	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3095	NC_014211	CGG	2	6	687445	687450	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3096	NC_014211	GCC	2	6	687467	687472	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3097	NC_014211	GCC	3	9	687514	687522	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3098	NC_014211	CG	3	6	687876	687881	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3099	NC_014211	GC	3	6	687883	687888	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3100	NC_014211	CGCGC	2	10	687890	687899	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
3101	NC_014211	TG	3	6	687906	687911	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3102	NC_014211	CGGAC	2	10	688714	688723	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
3103	NC_014211	CCG	2	6	688730	688735	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3104	NC_014211	TCT	2	6	689928	689933	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3105	NC_014211	C	6	6	690669	690674	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
3106	NC_014211	CGG	2	6	690684	690689	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3107	NC_014211	GCC	4	12	690714	690725	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3108	NC_014211	GCG	2	6	690757	690762	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3109	NC_014211	CGC	2	6	690766	690771	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3110	NC_014211	G	6	6	692131	692136	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
3111	NC_014211	TCCG	2	8	692142	692149	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
3112	NC_014211	GGGCAG	2	12	692159	692170	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
3113	NC_014211	TGA	2	6	692181	692186	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3114	NC_014211	GAT	2	6	692190	692195	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3115	NC_014211	CG	3	6	692211	692216	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3116	NC_014211	CCG	2	6	692259	692264	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3117	NC_014211	GGCGG	2	10	692265	692274	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
3118	NC_014211	CG	3	6	692304	692309	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3119	NC_014211	GCG	2	6	692617	692622	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3120	NC_014211	TCC	2	6	692926	692931	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3121	NC_014211	CGC	2	6	692971	692976	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3122	NC_014211	GAAC	2	8	693005	693012	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
3123	NC_014211	TCG	2	6	693026	693031	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3124	NC_014211	TGG	2	6	693117	693122	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3125	NC_014211	GGGT	2	8	693137	693144	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
3126	NC_014211	GT	3	6	693173	693178	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3127	NC_014211	GGGGA	2	10	693203	693212	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
3128	NC_014211	GCC	2	6	693232	693237	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3129	NC_014211	CGG	2	6	693240	693245	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3130	NC_014211	CGG	2	6	693250	693255	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3131	NC_014211	G	6	6	693284	693289	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
3132	NC_014211	CCGC	2	8	694541	694548	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
3133	NC_014211	CGCGG	2	10	694549	694558	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
3134	NC_014211	TCGT	2	8	694582	694589	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
3135	NC_014211	GC	3	6	696143	696148	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3136	NC_014211	CGG	2	6	696157	696162	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3137	NC_014211	CTC	2	6	696169	696174	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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3329	NC_014211	AGCCGC	2	12	770454	770465	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
3330	NC_014211	GCCC	2	8	770512	770519	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
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3332	NC_014211	CGG	3	9	770556	770564	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3333	NC_014211	CGT	2	6	770588	770593	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.