MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Non-Coding Repeats of Nitrosococcus halophilus Nc4 chromosome

Total Repeats: 936

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013960	TC	3	6	183	188	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
2	NC_013960	AG	3	6	1875	1880	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3	NC_013960	CT	3	6	12531	12536	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4	NC_013960	GA	3	6	14398	14403	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5	NC_013960	GA	3	6	27994	27999	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
6	NC_013960	AT	4	8	30012	30019	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_013960	GC	3	6	30492	30497	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
8	NC_013960	AT	4	8	44725	44732	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_013960	TA	3	6	45027	45032	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_013960	TA	4	8	45039	45046	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_013960	AG	3	6	45082	45087	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
12	NC_013960	CT	3	6	46325	46330	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
13	NC_013960	TA	4	8	51885	51892	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_013960	TC	3	6	52600	52605	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
15	NC_013960	GT	3	6	58339	58344	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
16	NC_013960	AT	3	6	58815	58820	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_013960	GC	3	6	58875	58880	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
18	NC_013960	TA	3	6	60383	60388	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_013960	CA	3	6	60756	60761	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
20	NC_013960	CT	3	6	65798	65803	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
21	NC_013960	GC	3	6	76135	76140	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
22	NC_013960	CT	3	6	78349	78354	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
23	NC_013960	GA	3	6	90800	90805	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
24	NC_013960	AG	3	6	109126	109131	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
25	NC_013960	GT	3	6	119804	119809	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
26	NC_013960	TC	3	6	122023	122028	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
27	NC_013960	AT	3	6	126297	126302	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_013960	TC	3	6	126448	126453	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
29	NC_013960	CT	3	6	129786	129791	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
30	NC_013960	GC	3	6	130868	130873	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
31	NC_013960	GC	3	6	131508	131513	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
32	NC_013960	AC	3	6	132127	132132	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
33	NC_013960	AT	3	6	132825	132830	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_013960	TG	3	6	134594	134599	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
35	NC_013960	CG	3	6	136115	136120	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
36	NC_013960	AT	4	8	136563	136570	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_013960	AG	4	8	147838	147845	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
38	NC_013960	TA	3	6	148107	148112	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_013960	CA	3	6	149557	149562	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
40	NC_013960	AG	3	6	151540	151545	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
41	NC_013960	AG	3	6	153434	153439	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
42	NC_013960	GC	3	6	157719	157724	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
43	NC_013960	TC	3	6	157819	157824	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
44	NC_013960	TC	3	6	157925	157930	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
45	NC_013960	GA	3	6	157984	157989	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
46	NC_013960	GT	3	6	158002	158007	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
47	NC_013960	AT	3	6	158384	158389	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_013960	CG	3	6	171673	171678	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
49	NC_013960	GT	3	6	173207	173212	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
50	NC_013960	CG	3	6	173334	173339	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
51	NC_013960	CT	3	6	177751	177756	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
52	NC_013960	TA	3	6	181124	181129	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_013960	TA	3	6	181378	181383	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_013960	TG	3	6	183572	183577	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
55	NC_013960	GT	3	6	198194	198199	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
56	NC_013960	GT	3	6	198599	198604	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
57	NC_013960	GC	3	6	200182	200187	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
58	NC_013960	AG	4	8	206809	206816	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
59	NC_013960	TC	3	6	206837	206842	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
60	NC_013960	CA	3	6	215296	215301	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
61	NC_013960	TA	3	6	215513	215518	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_013960	TA	3	6	228310	228315	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_013960	GA	3	6	228350	228355	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
64	NC_013960	GC	3	6	235524	235529	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
65	NC_013960	TC	3	6	245290	245295	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
66	NC_013960	CT	4	8	246539	246546	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
67	NC_013960	CT	3	6	247720	247725	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
68	NC_013960	GC	3	6	250533	250538	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
69	NC_013960	TG	3	6	252418	252423	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
70	NC_013960	AT	3	6	256285	256290	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_013960	CT	3	6	256332	256337	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
72	NC_013960	GA	3	6	257435	257440	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
73	NC_013960	CT	3	6	257471	257476	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
74	NC_013960	CG	4	8	257779	257786	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
75	NC_013960	TC	3	6	269339	269344	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
76	NC_013960	CG	3	6	274669	274674	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
77	NC_013960	GT	3	6	274888	274893	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
78	NC_013960	GT	3	6	283248	283253	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
79	NC_013960	GT	3	6	299902	299907	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
80	NC_013960	GA	3	6	302013	302018	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
81	NC_013960	GA	3	6	308723	308728	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
82	NC_013960	CT	3	6	319182	319187	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
83	NC_013960	AT	3	6	319194	319199	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_013960	TA	3	6	319202	319207	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_013960	TA	3	6	319209	319214	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_013960	GA	3	6	335516	335521	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
87	NC_013960	CG	3	6	339551	339556	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
88	NC_013960	CT	3	6	347307	347312	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
89	NC_013960	TA	3	6	347553	347558	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_013960	TA	3	6	347561	347566	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_013960	AT	3	6	350631	350636	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_013960	AT	3	6	357910	357915	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_013960	AG	3	6	358761	358766	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
94	NC_013960	TG	3	6	369610	369615	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
95	NC_013960	GC	3	6	379316	379321	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
96	NC_013960	AG	3	6	385462	385467	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
97	NC_013960	AG	3	6	401606	401611	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
98	NC_013960	CT	3	6	411695	411700	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
99	NC_013960	TA	3	6	411744	411749	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_013960	GA	3	6	417259	417264	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
101	NC_013960	CG	3	6	417333	417338	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
102	NC_013960	TA	3	6	423513	423518	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_013960	TA	3	6	425028	425033	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_013960	GA	4	8	427238	427245	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
105	NC_013960	AT	3	6	428846	428851	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_013960	AT	3	6	434591	434596	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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108	NC_013960	AT	3	6	447774	447779	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_013960	AG	3	6	454207	454212	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
110	NC_013960	GC	3	6	455255	455260	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
111	NC_013960	AT	3	6	457861	457866	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_013960	AG	3	6	457903	457908	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
113	NC_013960	CA	3	6	458656	458661	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
114	NC_013960	AG	3	6	459753	459758	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
115	NC_013960	AG	3	6	462270	462275	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
116	NC_013960	TC	3	6	462546	462551	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
117	NC_013960	AG	3	6	463106	463111	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
118	NC_013960	TA	3	6	464373	464378	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_013960	GA	3	6	477059	477064	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
120	NC_013960	GA	3	6	477923	477928	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
121	NC_013960	AG	4	8	487287	487294	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
122	NC_013960	CT	3	6	489607	489612	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
123	NC_013960	CG	3	6	492156	492161	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
124	NC_013960	GC	3	6	492474	492479	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
125	NC_013960	CT	3	6	511799	511804	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
126	NC_013960	CT	3	6	516081	516086	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
127	NC_013960	CG	3	6	525525	525530	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
128	NC_013960	CA	3	6	525826	525831	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
129	NC_013960	GT	3	6	526136	526141	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
130	NC_013960	CT	3	6	527193	527198	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
131	NC_013960	TC	3	6	527896	527901	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
132	NC_013960	GC	3	6	528238	528243	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
133	NC_013960	AT	3	6	530622	530627	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_013960	AG	3	6	535124	535129	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
135	NC_013960	GT	3	6	548397	548402	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
136	NC_013960	GA	3	6	563152	563157	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
137	NC_013960	AG	3	6	565670	565675	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
138	NC_013960	AT	3	6	568648	568653	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_013960	AT	4	8	569643	569650	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_013960	TG	3	6	574657	574662	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
141	NC_013960	TA	3	6	583381	583386	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_013960	GC	3	6	603739	603744	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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144	NC_013960	TC	3	6	607504	607509	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
145	NC_013960	CT	3	6	607677	607682	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
146	NC_013960	AC	3	6	612841	612846	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
147	NC_013960	GT	3	6	612880	612885	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
148	NC_013960	TC	3	6	614175	614180	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
149	NC_013960	GT	3	6	614191	614196	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
150	NC_013960	CT	3	6	619390	619395	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
151	NC_013960	GC	3	6	621879	621884	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
152	NC_013960	AT	3	6	638366	638371	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
153	NC_013960	AT	3	6	643692	643697	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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