MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Nitrosococcus halophilus Nc4 chromosome

Total Repeats: 11206

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_013960	G	6	6	1100739	1100744	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
3002	NC_013960	G	6	6	1101069	1101074	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
3003	NC_013960	AC	3	6	1101133	1101138	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3004	NC_013960	GGTG	2	8	1101139	1101146	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
3005	NC_013960	AGG	2	6	1101244	1101249	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3006	NC_013960	AGC	2	6	1101260	1101265	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3007	NC_013960	AAAG	2	8	1101274	1101281	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
3008	NC_013960	TGA	2	6	1101718	1101723	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3009	NC_013960	GA	3	6	1101829	1101834	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3010	NC_013960	GA	3	6	1101849	1101854	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3011	NC_013960	TTA	2	6	1101977	1101982	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3012	NC_013960	CGG	2	6	1102103	1102108	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3013	NC_013960	TGAAAT	2	12	1102212	1102223	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
3014	NC_013960	TAC	2	6	1102277	1102282	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3015	NC_013960	ACC	2	6	1102374	1102379	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3016	NC_013960	TGG	2	6	1102434	1102439	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3017	NC_013960	TCC	2	6	1102460	1102465	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3018	NC_013960	GGA	2	6	1102477	1102482	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3019	NC_013960	AGTG	2	8	1102519	1102526	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
3020	NC_013960	GGT	2	6	1102597	1102602	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3021	NC_013960	CGG	2	6	1102684	1102689	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3022	NC_013960	TCA	2	6	1102712	1102717	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3023	NC_013960	CGT	2	6	1102792	1102797	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3024	NC_013960	GCT	2	6	1102846	1102851	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3025	NC_013960	GGAC	2	8	1102874	1102881	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
3026	NC_013960	CTC	2	6	1102970	1102975	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3027	NC_013960	GTT	2	6	1103014	1103019	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3028	NC_013960	GAC	2	6	1103023	1103028	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3029	NC_013960	TG	3	6	1103062	1103067	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3030	NC_013960	CAAG	2	8	1103114	1103121	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
3031	NC_013960	AG	4	8	1103138	1103145	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3032	NC_013960	AGA	2	6	1103152	1103157	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3033	NC_013960	AG	4	8	1103170	1103177	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3034	NC_013960	TGG	2	6	1103190	1103195	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3035	NC_013960	ACT	2	6	1103244	1103249	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3036	NC_013960	GAT	2	6	1103257	1103262	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3037	NC_013960	G	7	7	1103358	1103364	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
3038	NC_013960	TA	3	6	1103365	1103370	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3039	NC_013960	TTA	2	6	1103904	1103909	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3040	NC_013960	TCT	2	6	1104372	1104377	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3041	NC_013960	GGC	2	6	1104387	1104392	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3042	NC_013960	AAT	2	6	1104437	1104442	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3043	NC_013960	AATTA	2	10	1104450	1104459	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
3044	NC_013960	GTT	2	6	1104596	1104601	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3045	NC_013960	GCTA	2	8	1104625	1104632	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
3046	NC_013960	GTT	2	6	1104717	1104722	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3047	NC_013960	TCA	2	6	1104750	1104755	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3048	NC_013960	TTA	3	9	1104779	1104787	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3049	NC_013960	CAA	2	6	1104990	1104995	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3050	NC_013960	A	6	6	1104998	1105003	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3051	NC_013960	ATAG	2	8	1105797	1105804	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
3052	NC_013960	AAT	2	6	1105823	1105828	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3053	NC_013960	GAT	2	6	1105885	1105890	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3054	NC_013960	T	6	6	1105890	1105895	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3055	NC_013960	TTA	2	6	1105960	1105965	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3056	NC_013960	CT	3	6	1106863	1106868	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3057	NC_013960	T	6	6	1106893	1106898	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3058	NC_013960	A	7	7	1106997	1107003	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3059	NC_013960	T	6	6	1107012	1107017	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3060	NC_013960	ATT	2	6	1107030	1107035	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3061	NC_013960	TCT	2	6	1107043	1107048	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3062	NC_013960	ATC	2	6	1107064	1107069	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3063	NC_013960	AAG	2	6	1108514	1108519	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3064	NC_013960	AAAT	2	8	1108528	1108535	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
3065	NC_013960	AGA	2	6	1109599	1109604	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3066	NC_013960	AAGA	2	8	1109730	1109737	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
3067	NC_013960	ATGG	2	8	1109793	1109800	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
3068	NC_013960	A	6	6	1109803	1109808	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3069	NC_013960	ATC	2	6	1109879	1109884	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3070	NC_013960	GGT	2	6	1109890	1109895	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3071	NC_013960	TCGGA	2	10	1109978	1109987	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
3072	NC_013960	ATG	2	6	1111195	1111200	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3073	NC_013960	AGAC	2	8	1113790	1113797	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
3074	NC_013960	GGGCAG	2	12	1113853	1113864	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
3075	NC_013960	GAA	2	6	1113885	1113890	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3076	NC_013960	TTG	2	6	1113903	1113908	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3077	NC_013960	AGCA	2	8	1113928	1113935	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
3078	NC_013960	AGCA	2	8	1113949	1113956	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
3079	NC_013960	GCG	2	6	1113971	1113976	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3080	NC_013960	TAGA	2	8	1114026	1114033	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
3081	NC_013960	AATT	2	8	1115063	1115070	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3082	NC_013960	TTTA	2	8	1115116	1115123	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
3083	NC_013960	GAT	2	6	1119334	1119339	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3084	NC_013960	TAA	2	6	1119353	1119358	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3085	NC_013960	AG	3	6	1120663	1120668	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3086	NC_013960	TA	3	6	1120689	1120694	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3087	NC_013960	ATA	2	6	1120713	1120718	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3088	NC_013960	GCA	2	6	1120728	1120733	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3089	NC_013960	TTA	2	6	1120774	1120779	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3090	NC_013960	TAT	2	6	1120791	1120796	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3091	NC_013960	CAT	2	6	1120805	1120810	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3092	NC_013960	TTAAAG	2	12	1121156	1121167	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
3093	NC_013960	T	6	6	1121173	1121178	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3094	NC_013960	GA	3	6	1121182	1121187	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3095	NC_013960	TAG	2	6	1121233	1121238	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3096	NC_013960	CT	4	8	1121260	1121267	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3097	NC_013960	ATA	2	6	1121291	1121296	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3098	NC_013960	T	8	8	1121367	1121374	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3099	NC_013960	T	7	7	1121408	1121414	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3100	NC_013960	ATA	2	6	1121425	1121430	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3101	NC_013960	CG	3	6	1121443	1121448	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3102	NC_013960	GC	3	6	1121515	1121520	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3103	NC_013960	ACA	2	6	1121538	1121543	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3104	NC_013960	ATT	2	6	1121553	1121558	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3105	NC_013960	ATT	2	6	1121567	1121572	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3106	NC_013960	AAT	2	6	1121664	1121669	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3107	NC_013960	GTG	2	6	1121672	1121677	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3108	NC_013960	CGG	2	6	1121730	1121735	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3109	NC_013960	GT	3	6	1121756	1121761	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3110	NC_013960	GCTC	2	8	1121784	1121791	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
3111	NC_013960	GCCT	2	8	1121796	1121803	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
3112	NC_013960	GGC	2	6	1121908	1121913	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3113	NC_013960	GGCCGA	2	12	1121947	1121958	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
3114	NC_013960	TCT	2	6	1122048	1122053	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3115	NC_013960	ACCC	2	8	1122060	1122067	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
3116	NC_013960	ACC	2	6	1122089	1122094	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3117	NC_013960	A	6	6	1122209	1122214	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3118	NC_013960	GCC	2	6	1122242	1122247	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3119	NC_013960	TCAA	2	8	1122249	1122256	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
3120	NC_013960	A	6	6	1122306	1122311	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3121	NC_013960	TTC	2	6	1122348	1122353	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3122	NC_013960	TTTTC	2	10	1122982	1122991	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
3123	NC_013960	CGC	3	9	1123071	1123079	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3124	NC_013960	GA	3	6	1123137	1123142	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3125	NC_013960	A	6	6	1123167	1123172	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3126	NC_013960	T	7	7	1123185	1123191	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3127	NC_013960	AGGG	2	8	1123290	1123297	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
3128	NC_013960	G	6	6	1123295	1123300	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
3129	NC_013960	TTA	2	6	1123308	1123313	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3130	NC_013960	AT	3	6	1123339	1123344	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3131	NC_013960	TAA	2	6	1123352	1123357	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3132	NC_013960	ATA	2	6	1123359	1123364	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3133	NC_013960	A	6	6	1124092	1124097	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3134	NC_013960	CTT	2	6	1124141	1124146	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3135	NC_013960	TGA	2	6	1124168	1124173	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3136	NC_013960	GGA	2	6	1124230	1124235	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3137	NC_013960	TCT	2	6	1125922	1125927	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3138	NC_013960	CTA	2	6	1125941	1125946	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3139	NC_013960	AAT	2	6	1126006	1126011	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3140	NC_013960	AAG	2	6	1126031	1126036	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3141	NC_013960	AGC	2	6	1126057	1126062	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3142	NC_013960	A	6	6	1126090	1126095	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3143	NC_013960	TTC	2	6	1126133	1126138	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3144	NC_013960	T	6	6	1126216	1126221	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3145	NC_013960	TCG	2	6	1126237	1126242	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3146	NC_013960	GCCT	2	8	1126291	1126298	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
3147	NC_013960	CAC	2	6	1126325	1126330	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3148	NC_013960	ATC	2	6	1126374	1126379	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3149	NC_013960	TGA	2	6	1126418	1126423	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3150	NC_013960	ACTC	2	8	1126481	1126488	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
3151	NC_013960	GGC	2	6	1126530	1126535	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3152	NC_013960	CAT	2	6	1126635	1126640	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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3154	NC_013960	TTC	2	6	1126720	1126725	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3155	NC_013960	CAC	2	6	1127686	1127691	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3156	NC_013960	C	7	7	1127723	1127729	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
3157	NC_013960	TGC	2	6	1127810	1127815	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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3159	NC_013960	AATC	2	8	1128615	1128622	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
3160	NC_013960	TTG	2	6	1128627	1128632	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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3163	NC_013960	GCT	2	6	1130439	1130444	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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3165	NC_013960	CAA	2	6	1130571	1130576	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3166	NC_013960	GAA	2	6	1130624	1130629	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3167	NC_013960	CAA	2	6	1130637	1130642	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3168	NC_013960	A	6	6	1130718	1130723	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3169	NC_013960	TAT	3	9	1130998	1131006	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3171	NC_013960	CT	3	6	1131080	1131085	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3172	NC_013960	ATG	2	6	1131092	1131097	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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3186	NC_013960	CGG	2	6	1134308	1134313	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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3250	NC_013960	CTG	2	6	1150937	1150942	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3251	NC_013960	GCT	2	6	1150992	1150997	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3252	NC_013960	ACGGG	2	10	1151002	1151011	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
3253	NC_013960	TGC	2	6	1151021	1151026	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3254	NC_013960	TGG	2	6	1152762	1152767	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3255	NC_013960	GCTC	2	8	1152773	1152780	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
3256	NC_013960	CGG	2	6	1153192	1153197	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3257	NC_013960	AG	3	6	1153535	1153540	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3258	NC_013960	A	8	8	1153907	1153914	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3259	NC_013960	GCA	2	6	1154840	1154845	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3260	NC_013960	ACC	2	6	1154848	1154853	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3261	NC_013960	AGTC	2	8	1154865	1154872	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
3262	NC_013960	GTG	2	6	1154893	1154898	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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3264	NC_013960	GCCGAG	2	12	1154969	1154980	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
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