MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Nitrosococcus halophilus Nc4 chromosome

Total Repeats: 11206

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4501	NC_013960	CTTGGG	2	12	1595429	1595440	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
4502	NC_013960	ATC	2	6	1595451	1595456	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4503	NC_013960	ATA	2	6	1595548	1595553	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4504	NC_013960	AT	3	6	1596676	1596681	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4505	NC_013960	CTT	2	6	1596805	1596810	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4506	NC_013960	TGTAAG	2	12	1598125	1598136	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4507	NC_013960	TAG	2	6	1598169	1598174	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4508	NC_013960	ATT	2	6	1598195	1598200	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4509	NC_013960	ATG	2	6	1598223	1598228	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4510	NC_013960	T	8	8	1598289	1598296	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4511	NC_013960	ATG	2	6	1598422	1598427	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4512	NC_013960	A	6	6	1598430	1598435	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4513	NC_013960	TAAT	2	8	1598453	1598460	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4514	NC_013960	GCCAA	2	10	1598494	1598503	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
4515	NC_013960	AAAC	2	8	1598519	1598526	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
4516	NC_013960	AAG	2	6	1598536	1598541	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4517	NC_013960	A	7	7	1598556	1598562	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4518	NC_013960	CAA	2	6	1598570	1598575	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4519	NC_013960	A	7	7	1598574	1598580	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4520	NC_013960	A	6	6	1598582	1598587	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4521	NC_013960	ATTT	2	8	1598589	1598596	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
4522	NC_013960	TTG	2	6	1598601	1598606	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4523	NC_013960	TAAA	2	8	1599000	1599007	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
4524	NC_013960	ATT	3	9	1599011	1599019	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4525	NC_013960	AAT	2	6	1599083	1599088	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4526	NC_013960	GAAA	2	8	1599105	1599112	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
4527	NC_013960	T	6	6	1599123	1599128	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4528	NC_013960	ATA	2	6	1599144	1599149	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4529	NC_013960	GTT	3	9	1599153	1599161	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4530	NC_013960	T	8	8	1599160	1599167	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4531	NC_013960	ATT	2	6	1599174	1599179	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4532	NC_013960	AAG	2	6	1599238	1599243	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4533	NC_013960	TAT	2	6	1600442	1600447	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4534	NC_013960	TTAA	2	8	1601598	1601605	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4535	NC_013960	T	6	6	1601621	1601626	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4536	NC_013960	AAT	2	6	1601637	1601642	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4537	NC_013960	CT	3	6	1601659	1601664	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4538	NC_013960	AG	3	6	1602065	1602070	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4539	NC_013960	AGA	2	6	1603490	1603495	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4540	NC_013960	TGG	2	6	1603509	1603514	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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4542	NC_013960	A	8	8	1604832	1604839	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4543	NC_013960	AGG	2	6	1605897	1605902	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4544	NC_013960	TCC	2	6	1605925	1605930	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4545	NC_013960	GAAA	2	8	1605961	1605968	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
4546	NC_013960	CAG	2	6	1605977	1605982	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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4548	NC_013960	CA	3	6	1605991	1605996	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4549	NC_013960	TTAA	2	8	1606005	1606012	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4550	NC_013960	TA	4	8	1606021	1606028	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4551	NC_013960	GCC	2	6	1606092	1606097	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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4553	NC_013960	AGA	2	6	1606563	1606568	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4554	NC_013960	A	7	7	1609348	1609354	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4555	NC_013960	AT	3	6	1609913	1609918	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4556	NC_013960	CAG	2	6	1610004	1610009	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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4562	NC_013960	TA	3	6	1610104	1610109	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4563	NC_013960	TCC	2	6	1611019	1611024	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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4569	NC_013960	AGCGG	2	10	1615548	1615557	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
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4591	NC_013960	CA	3	6	1620879	1620884	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4592	NC_013960	AATA	2	8	1620885	1620892	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4597	NC_013960	ACTCT	2	10	1622111	1622120	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
4598	NC_013960	A	6	6	1622128	1622133	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4599	NC_013960	T	6	6	1623468	1623473	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4600	NC_013960	TA	3	6	1623538	1623543	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4601	NC_013960	T	7	7	1624558	1624564	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4602	NC_013960	T	6	6	1624899	1624904	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4603	NC_013960	ATT	2	6	1624909	1624914	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4604	NC_013960	TCC	2	6	1625067	1625072	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4605	NC_013960	TA	3	6	1625099	1625104	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4606	NC_013960	ATA	2	6	1625452	1625457	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4607	NC_013960	AAT	3	9	1625470	1625478	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4608	NC_013960	AATT	2	8	1625503	1625510	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4609	NC_013960	CCT	2	6	1625520	1625525	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4610	NC_013960	AGT	2	6	1625553	1625558	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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4612	NC_013960	TAG	2	6	1625628	1625633	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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4615	NC_013960	CTTC	2	8	1625797	1625804	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4616	NC_013960	AGGG	2	8	1625805	1625812	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
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4621	NC_013960	AGA	2	6	1627040	1627045	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4622	NC_013960	AAG	2	6	1627056	1627061	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4623	NC_013960	T	7	7	1627214	1627220	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4624	NC_013960	T	6	6	1627295	1627300	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4625	NC_013960	TTTGAT	2	12	1627320	1627331	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
4626	NC_013960	AT	4	8	1627330	1627337	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4627	NC_013960	TAGG	2	8	1627369	1627376	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
4628	NC_013960	AATGC	2	10	1627388	1627397	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
4629	NC_013960	AGG	2	6	1627421	1627426	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4630	NC_013960	TAA	2	6	1628135	1628140	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4631	NC_013960	AG	3	6	1628146	1628151	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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4633	NC_013960	TCCTAT	2	12	1628456	1628467	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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