MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Natrialba magadii ATCC 43099 plasmid pNMAG01

Total Repeats: 238

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013923	TGGC	2	8	1807	1814	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
2	NC_013923	GATC	2	8	1868	1875	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
3	NC_013923	GCGA	2	8	2254	2261	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
4	NC_013923	TATT	2	8	3571	3578	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_013923	AGTT	2	8	4026	4033	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
6	NC_013923	TGTC	2	8	4837	4844	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
7	NC_013923	GTTT	2	8	7332	7339	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
8	NC_013923	GGTG	2	8	7743	7750	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
9	NC_013923	TCGG	2	8	9427	9434	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
10	NC_013923	CAGC	2	8	9665	9672	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
11	NC_013923	GTCG	2	8	9701	9708	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
12	NC_013923	GGTC	2	8	10046	10053	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
13	NC_013923	TAGA	2	8	11332	11339	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
14	NC_013923	TGCC	2	8	12367	12374	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
15	NC_013923	CGTG	2	8	12381	12388	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
16	NC_013923	GCGA	2	8	15307	15314	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
17	NC_013923	AGCG	2	8	15315	15322	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
18	NC_013923	ATCG	2	8	19070	19077	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
19	NC_013923	TGCC	2	8	19112	19119	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
20	NC_013923	GCGG	2	8	19341	19348	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
21	NC_013923	CCCA	2	8	19385	19392	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
22	NC_013923	ACGA	2	8	22305	22312	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
23	NC_013923	GCCA	2	8	33929	33936	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
24	NC_013923	GTTG	2	8	40380	40387	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
25	NC_013923	GCTG	2	8	40920	40927	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
26	NC_013923	ACCG	2	8	47078	47085	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
27	NC_013923	GTTT	2	8	51248	51255	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
28	NC_013923	CAAT	2	8	51693	51700	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
29	NC_013923	AATA	2	8	53971	53978	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_013923	CGTT	2	8	54459	54466	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
31	NC_013923	CCAC	2	8	56398	56405	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
32	NC_013923	GCAG	2	8	56414	56421	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
33	NC_013923	CGAA	2	8	56995	57002	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
34	NC_013923	CATT	2	8	58532	58539	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
35	NC_013923	ATTG	2	8	58771	58778	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
36	NC_013923	GTGG	2	8	60627	60634	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
37	NC_013923	ACCG	2	8	60703	60710	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
38	NC_013923	GCGT	2	8	61023	61030	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
39	NC_013923	ATCG	2	8	61982	61989	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
40	NC_013923	TGAC	2	8	62409	62416	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
41	NC_013923	TCGT	2	8	64258	64265	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
42	NC_013923	CGGG	2	8	65808	65815	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
43	NC_013923	ATTG	2	8	66512	66519	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
44	NC_013923	GAGC	2	8	66646	66653	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
45	NC_013923	GTGG	2	8	67700	67707	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
46	NC_013923	TGAC	2	8	67814	67821	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
47	NC_013923	TCGT	2	8	67880	67887	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
48	NC_013923	CGAC	2	8	67934	67941	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
49	NC_013923	GTCT	2	8	68009	68016	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
50	NC_013923	GAAT	2	8	68357	68364	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
51	NC_013923	GCGG	2	8	68950	68957	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
52	NC_013923	GCTC	2	8	69242	69249	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
53	NC_013923	CGCC	2	8	70588	70595	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
54	NC_013923	GACG	2	8	70687	70694	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
55	NC_013923	TGAC	2	8	70899	70906	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
56	NC_013923	GTCT	2	8	72267	72274	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
57	NC_013923	TTTC	2	8	72341	72348	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
58	NC_013923	TGGA	2	8	73407	73414	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
59	NC_013923	CATC	2	8	74341	74348	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
60	NC_013923	ATCT	2	8	74379	74386	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
61	NC_013923	CGAC	2	8	74581	74588	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
62	NC_013923	CTTC	2	8	76954	76961	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
63	NC_013923	CGGT	2	8	78510	78517	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
64	NC_013923	ATCG	2	8	80310	80317	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
65	NC_013923	AAAC	2	8	81330	81337	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
66	NC_013923	GTGG	2	8	86362	86369	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
67	NC_013923	CGTC	2	8	90000	90007	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
68	NC_013923	ACAA	2	8	92325	92332	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
69	NC_013923	CGGA	2	8	94612	94619	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
70	NC_013923	GCGA	2	8	101486	101493	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
71	NC_013923	CGAC	2	8	102627	102634	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
72	NC_013923	GCCA	2	8	104390	104397	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
73	NC_013923	GCCA	2	8	104920	104927	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
74	NC_013923	CTAC	2	8	105713	105720	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
75	NC_013923	TCGT	2	8	106212	106219	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
76	NC_013923	GACC	2	8	106709	106716	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
77	NC_013923	GAGG	2	8	106780	106787	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
78	NC_013923	ATGT	2	8	107623	107630	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
79	NC_013923	CGTT	2	8	108682	108689	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
80	NC_013923	GGCC	2	8	110951	110958	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
81	NC_013923	GACG	2	8	111112	111119	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
82	NC_013923	GAAC	2	8	111534	111541	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
83	NC_013923	TGCC	2	8	112840	112847	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
84	NC_013923	TAGG	2	8	113215	113222	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
85	NC_013923	CATA	2	8	113981	113988	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
86	NC_013923	GCCT	2	8	114168	114175	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
87	NC_013923	TGTT	2	8	116258	116265	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
88	NC_013923	TCGG	2	8	116360	116367	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
89	NC_013923	AGTG	2	8	118622	118629	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
90	NC_013923	CGTT	2	8	119950	119957	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
91	NC_013923	ACTG	2	8	124150	124157	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
92	NC_013923	GTTT	2	8	124214	124221	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
93	NC_013923	TGAC	2	8	124328	124335	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
94	NC_013923	GCAC	2	8	124385	124392	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
95	NC_013923	AAAT	2	8	128103	128110	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_013923	ACTG	2	8	130299	130306	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
97	NC_013923	TAAC	2	8	135086	135093	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
98	NC_013923	CGGT	2	8	135253	135260	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
99	NC_013923	CCTA	2	8	141699	141706	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
100	NC_013923	GAGT	2	8	146144	146151	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
101	NC_013923	GTCT	2	8	148972	148979	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
102	NC_013923	GTCA	2	8	149296	149303	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
103	NC_013923	TTGG	2	8	150342	150349	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
104	NC_013923	GACG	2	8	152491	152498	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
105	NC_013923	GGTG	2	8	154398	154405	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
106	NC_013923	CAGC	2	8	156352	156359	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
107	NC_013923	AGCG	2	8	157907	157914	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
108	NC_013923	AACC	2	8	159645	159652	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
109	NC_013923	CATT	2	8	159838	159845	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
110	NC_013923	CACC	2	8	164657	164664	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
111	NC_013923	CAAC	2	8	167287	167294	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
112	NC_013923	TAGC	2	8	169977	169984	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
113	NC_013923	GATC	2	8	172617	172624	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
114	NC_013923	AGGC	2	8	172740	172747	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
115	NC_013923	TTTA	2	8	173349	173356	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_013923	GTTG	2	8	175928	175935	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
117	NC_013923	CATA	2	8	176031	176038	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
118	NC_013923	TGCC	2	8	176086	176093	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
119	NC_013923	TCAC	2	8	176204	176211	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
120	NC_013923	TCGC	2	8	176217	176224	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
121	NC_013923	TCAC	2	8	176260	176267	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
122	NC_013923	TTCG	2	8	176268	176275	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
123	NC_013923	CGCT	2	8	176286	176293	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
124	NC_013923	CGCT	2	8	176302	176309	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
125	NC_013923	CAAA	2	8	176686	176693	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
126	NC_013923	GAAC	2	8	182545	182552	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
127	NC_013923	GGAC	2	8	182555	182562	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
128	NC_013923	GAGC	2	8	183759	183766	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
129	NC_013923	GAAC	2	8	183775	183782	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
130	NC_013923	AGTG	2	8	183785	183792	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
131	NC_013923	CGAA	2	8	183834	183841	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
132	NC_013923	GTGA	2	8	183842	183849	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
133	NC_013923	CGAA	2	8	183890	183897	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
134	NC_013923	GTGA	2	8	183898	183905	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
135	NC_013923	TGCC	2	8	184077	184084	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
136	NC_013923	GATT	2	8	187779	187786	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
137	NC_013923	ATCG	2	8	189503	189510	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
138	NC_013923	ATCG	2	8	189519	189526	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
139	NC_013923	TCGC	2	8	189586	189593	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
140	NC_013923	GCGA	2	8	189607	189614	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
141	NC_013923	GCCG	2	8	191250	191257	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
142	NC_013923	TCGC	2	8	194486	194493	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
143	NC_013923	CCAC	2	8	195614	195621	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
144	NC_013923	TTGA	2	8	199989	199996	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
145	NC_013923	ACTC	2	8	206567	206574	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
146	NC_013923	GTCG	2	8	206614	206621	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
147	NC_013923	ATTT	2	8	207843	207850	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
148	NC_013923	CAGT	2	8	209388	209395	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
149	NC_013923	GAGT	2	8	209492	209499	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
150	NC_013923	ACCG	2	8	209542	209549	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
151	NC_013923	CGTG	2	8	211136	211143	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
152	NC_013923	CGTC	2	8	212744	212751	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
153	NC_013923	ATCT	2	8	218406	218413	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
154	NC_013923	CTTC	2	8	218414	218421	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
155	NC_013923	ACTC	2	8	218475	218482	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
156	NC_013923	GACA	2	8	226261	226268	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
157	NC_013923	GTGA	2	8	227837	227844	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
158	NC_013923	GTGA	2	8	227866	227873	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
159	NC_013923	GCAG	2	8	234042	234049	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
160	NC_013923	GTCG	2	8	235113	235120	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
161	NC_013923	CTGT	2	8	235226	235233	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
162	NC_013923	CTGT	2	8	235364	235371	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
163	NC_013923	GCGA	2	8	235415	235422	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
164	NC_013923	TTCT	2	8	235475	235482	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
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170	NC_013923	GTTT	2	8	252212	252219	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
171	NC_013923	GACA	2	8	252369	252376	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
172	NC_013923	TCCG	2	8	255217	255224	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
173	NC_013923	GGTC	2	8	262386	262393	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
174	NC_013923	TTAT	2	8	262438	262445	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
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176	NC_013923	AGTC	2	8	266775	266782	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
177	NC_013923	TGCT	2	8	266831	266838	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
178	NC_013923	GCCA	2	8	266841	266848	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
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180	NC_013923	CGTC	2	8	280591	280598	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
181	NC_013923	GATA	2	8	280708	280715	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
182	NC_013923	GTCT	2	8	280716	280723	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
183	NC_013923	CTAG	2	8	281258	281265	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
184	NC_013923	ATAG	2	8	281466	281473	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
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187	NC_013923	GAGT	2	8	290177	290184	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
188	NC_013923	GCCG	2	8	290344	290351	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
189	NC_013923	CGAC	2	8	290359	290366	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
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191	NC_013923	CCTT	2	8	293067	293074	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
192	NC_013923	AGTT	2	8	295587	295594	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
193	NC_013923	GTCT	2	8	295673	295680	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
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195	NC_013923	AGCT	2	8	301941	301948	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
196	NC_013923	AACC	2	8	305305	305312	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
197	NC_013923	GAAC	2	8	305405	305412	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
198	NC_013923	GAAC	2	8	316003	316010	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
199	NC_013923	ATCG	2	8	323903	323910	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
200	NC_013923	TGGG	2	8	326910	326917	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
201	NC_013923	CATC	2	8	330537	330544	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
202	NC_013923	GTAC	2	8	330595	330602	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
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220	NC_013923	TGTA	2	8	369460	369467	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
221	NC_013923	GCAG	2	8	369531	369538	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
222	NC_013923	ATAG	2	8	369998	370005	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
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225	NC_013923	CGTT	2	8	372167	372174	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
226	NC_013923	CGTC	2	8	372590	372597	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
227	NC_013923	CGGC	2	8	372750	372757	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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231	NC_013923	ATCT	2	8	374928	374935	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
232	NC_013923	GAAA	2	8	375052	375059	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
233	NC_013923	ACAG	2	8	375129	375136	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
234	NC_013923	CAGT	2	8	375849	375856	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
235	NC_013923	TCGA	2	8	376027	376034	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
236	NC_013923	CACT	2	8	376532	376539	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
237	NC_013923	CATC	2	8	376779	376786	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
238	NC_013923	AACG	2	8	377229	377236	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.