MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Natrialba magadii ATCC 43099 chromosome

Total Repeats: 12775

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_013922	CAGC	2	8	997076	997083	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
3502	NC_013922	CGA	2	6	997146	997151	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3503	NC_013922	ATC	2	6	998078	998083	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3504	NC_013922	CA	3	6	998090	998095	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3505	NC_013922	AACC	2	8	998389	998396	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3506	NC_013922	ACC	2	6	998531	998536	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3507	NC_013922	ACC	2	6	999657	999662	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3508	NC_013922	CAG	2	6	999665	999670	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3509	NC_013922	TTC	2	6	999679	999684	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3510	NC_013922	CGGC	2	8	999744	999751	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3511	NC_013922	GTG	2	6	999832	999837	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3512	NC_013922	ACG	2	6	999845	999850	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3513	NC_013922	TC	3	6	1001282	1001287	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3514	NC_013922	CTGTC	2	10	1001331	1001340	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
3515	NC_013922	AG	3	6	1001342	1001347	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3516	NC_013922	CAG	2	6	1002138	1002143	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3517	NC_013922	AGT	2	6	1002151	1002156	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3518	NC_013922	CGCA	2	8	1002197	1002204	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
3519	NC_013922	ACGT	2	8	1003745	1003752	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
3520	NC_013922	GAT	2	6	1003759	1003764	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3521	NC_013922	GTC	2	6	1004655	1004660	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3522	NC_013922	TGT	2	6	1004682	1004687	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3523	NC_013922	ACGA	2	8	1004785	1004792	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
3524	NC_013922	ACCGC	2	10	1004800	1004809	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
3525	NC_013922	GC	3	6	1006236	1006241	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3526	NC_013922	GTC	2	6	1006280	1006285	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3527	NC_013922	CCGG	2	8	1006305	1006312	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3528	NC_013922	ATA	2	6	1006357	1006362	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3529	NC_013922	GA	4	8	1006374	1006381	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3530	NC_013922	CCGT	2	8	1006399	1006406	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
3531	NC_013922	ATCA	2	8	1007202	1007209	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
3532	NC_013922	ATA	2	6	1007247	1007252	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3533	NC_013922	C	6	6	1007338	1007343	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
3534	NC_013922	TGC	2	6	1007369	1007374	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3535	NC_013922	AAC	2	6	1007376	1007381	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3536	NC_013922	CTT	2	6	1007498	1007503	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3537	NC_013922	CTC	2	6	1007674	1007679	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3538	NC_013922	ACC	2	6	1007787	1007792	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3539	NC_013922	TGA	2	6	1007810	1007815	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3540	NC_013922	TTG	2	6	1007841	1007846	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3541	NC_013922	GT	3	6	1007859	1007864	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3542	NC_013922	T	6	6	1007876	1007881	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3543	NC_013922	G	6	6	1008255	1008260	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
3544	NC_013922	CGA	2	6	1008316	1008321	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3545	NC_013922	CCG	2	6	1008325	1008330	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3546	NC_013922	GGT	2	6	1008362	1008367	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3547	NC_013922	GGT	2	6	1008371	1008376	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3548	NC_013922	GTG	2	6	1008408	1008413	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3549	NC_013922	TCGAAG	2	12	1008460	1008471	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
3550	NC_013922	CTG	2	6	1008475	1008480	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3551	NC_013922	ACGC	2	8	1008518	1008525	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
3552	NC_013922	GCCG	2	8	1008526	1008533	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3553	NC_013922	TGA	2	6	1008551	1008556	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3554	NC_013922	CGT	2	6	1009103	1009108	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3555	NC_013922	TGCG	2	8	1009752	1009759	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
3556	NC_013922	TTCTGT	6	36	1009767	1009802	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
3557	NC_013922	ACC	2	6	1009808	1009813	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3558	NC_013922	CTT	2	6	1009826	1009831	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3559	NC_013922	CGA	2	6	1009944	1009949	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3560	NC_013922	CG	3	6	1010768	1010773	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3561	NC_013922	C	6	6	1016466	1016471	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
3562	NC_013922	CCG	2	6	1016484	1016489	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3563	NC_013922	CGAG	2	8	1017045	1017052	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
3564	NC_013922	AG	3	6	1017051	1017056	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3565	NC_013922	ACT	2	6	1017068	1017073	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3566	NC_013922	CAC	2	6	1017082	1017087	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3567	NC_013922	CGG	2	6	1017357	1017362	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3568	NC_013922	CAGC	2	8	1017478	1017485	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
3569	NC_013922	GTCAC	2	10	1017514	1017523	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
3570	NC_013922	CCAC	2	8	1017533	1017540	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
3571	NC_013922	AC	3	6	1017555	1017560	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3572	NC_013922	AC	3	6	1017573	1017578	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3573	NC_013922	GCG	2	6	1018472	1018477	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3574	NC_013922	ACT	2	6	1018478	1018483	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3575	NC_013922	CGA	2	6	1018485	1018490	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3576	NC_013922	AACCG	2	10	1018533	1018542	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
3577	NC_013922	CGA	2	6	1019785	1019790	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3578	NC_013922	GAC	2	6	1019823	1019828	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3579	NC_013922	CCGGTA	2	12	1019841	1019852	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3580	NC_013922	GTG	2	6	1020452	1020457	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3581	NC_013922	GAT	2	6	1020477	1020482	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3582	NC_013922	AGA	2	6	1020516	1020521	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3583	NC_013922	GCGCT	2	10	1020815	1020824	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
3584	NC_013922	CCTATA	2	12	1020829	1020840	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3585	NC_013922	GCC	2	6	1020896	1020901	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3586	NC_013922	TGA	2	6	1020957	1020962	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3587	NC_013922	CGTGGT	2	12	1020971	1020982	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
3588	NC_013922	CAG	3	9	1021019	1021027	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3589	NC_013922	CAG	2	6	1021037	1021042	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3590	NC_013922	CACT	2	8	1024672	1024679	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
3591	NC_013922	CA	3	6	1025716	1025721	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3592	NC_013922	ACC	2	6	1027119	1027124	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3593	NC_013922	GT	4	8	1027131	1027138	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3594	NC_013922	GA	3	6	1027204	1027209	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3595	NC_013922	ACGT	2	8	1027417	1027424	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
3596	NC_013922	ACA	2	6	1027519	1027524	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3597	NC_013922	GTCG	2	8	1028006	1028013	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
3598	NC_013922	AACGCA	2	12	1028112	1028123	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
3599	NC_013922	CAC	2	6	1028126	1028131	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3600	NC_013922	CAT	2	6	1028152	1028157	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3601	NC_013922	GACC	2	8	1028172	1028179	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
3602	NC_013922	GGA	2	6	1028186	1028191	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3603	NC_013922	TCG	2	6	1028262	1028267	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3604	NC_013922	GCG	2	6	1028325	1028330	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3605	NC_013922	TCG	2	6	1028331	1028336	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3606	NC_013922	CAGT	2	8	1028345	1028352	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
3607	NC_013922	ACG	2	6	1028358	1028363	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3608	NC_013922	CAGCAC	2	12	1028621	1028632	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
3609	NC_013922	CCA	2	6	1028642	1028647	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3610	NC_013922	TGC	2	6	1029637	1029642	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3611	NC_013922	G	6	6	1029733	1029738	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
3612	NC_013922	TCGT	2	8	1031394	1031401	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
3613	NC_013922	TCAC	2	8	1031423	1031430	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
3614	NC_013922	GGT	2	6	1034946	1034951	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3615	NC_013922	TAT	2	6	1034980	1034985	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3616	NC_013922	GCC	2	6	1035189	1035194	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3617	NC_013922	CAC	2	6	1035218	1035223	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3618	NC_013922	GAC	2	6	1035286	1035291	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3619	NC_013922	CCGA	2	8	1036102	1036109	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
3620	NC_013922	CAC	2	6	1036812	1036817	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3621	NC_013922	AAG	2	6	1041463	1041468	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3622	NC_013922	TGTC	2	8	1041472	1041479	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
3623	NC_013922	TTGGT	2	10	1041486	1041495	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
3624	NC_013922	GCG	2	6	1041558	1041563	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3625	NC_013922	CT	3	6	1041566	1041571	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3626	NC_013922	CAC	3	9	1042734	1042742	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3627	NC_013922	CA	3	6	1042811	1042816	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3628	NC_013922	ACAGC	2	10	1042837	1042846	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
3629	NC_013922	CG	3	6	1042896	1042901	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3630	NC_013922	ATA	2	6	1042946	1042951	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3631	NC_013922	AGT	2	6	1042976	1042981	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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3762	NC_013922	TCC	2	6	1085646	1085651	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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3874	NC_013922	CGT	2	6	1119140	1119145	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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3878	NC_013922	GCT	2	6	1121242	1121247	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3879	NC_013922	ACTCG	2	10	1121297	1121306	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
3880	NC_013922	GA	3	6	1122520	1122525	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3881	NC_013922	ACG	2	6	1124573	1124578	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3882	NC_013922	AGC	2	6	1124579	1124584	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3883	NC_013922	AGAA	2	8	1124585	1124592	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
3884	NC_013922	ACT	2	6	1124602	1124607	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3885	NC_013922	GAC	2	6	1125231	1125236	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3886	NC_013922	CTT	2	6	1125277	1125282	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3887	NC_013922	TCC	2	6	1125307	1125312	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3888	NC_013922	AC	3	6	1125323	1125328	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3889	NC_013922	TCGA	2	8	1126053	1126060	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
3890	NC_013922	GAGTT	2	10	1126097	1126106	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
3891	NC_013922	CGA	3	9	1126111	1126119	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3892	NC_013922	TGG	2	6	1126127	1126132	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3893	NC_013922	AG	3	6	1126184	1126189	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3894	NC_013922	CCGC	2	8	1126686	1126693	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
3895	NC_013922	GT	4	8	1126726	1126733	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3896	NC_013922	GCCA	2	8	1126747	1126754	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
3897	NC_013922	CGA	2	6	1126761	1126766	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3898	NC_013922	CT	3	6	1126799	1126804	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3899	NC_013922	CT	3	6	1126809	1126814	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3900	NC_013922	TC	3	6	1126828	1126833	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3901	NC_013922	CTG	2	6	1126853	1126858	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3902	NC_013922	TCG	2	6	1126867	1126872	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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3933	NC_013922	GTC	2	6	1132414	1132419	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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3935	NC_013922	TGA	2	6	1134152	1134157	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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