MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Natrialba magadii ATCC 43099 chromosome

Total Repeats: 12775

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5501	NC_013922	ACTGA	2	10	1594963	1594972	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
5502	NC_013922	ACT	2	6	1595234	1595239	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5503	NC_013922	CACAC	2	10	1595240	1595249	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
5504	NC_013922	TCG	2	6	1595308	1595313	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5505	NC_013922	GC	3	6	1595318	1595323	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5506	NC_013922	CGAG	2	8	1595980	1595987	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
5507	NC_013922	TTC	2	6	1596043	1596048	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5508	NC_013922	GCC	2	6	1596052	1596057	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5509	NC_013922	AGT	2	6	1597275	1597280	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5510	NC_013922	ACT	2	6	1597922	1597927	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5511	NC_013922	TCC	3	9	1597948	1597956	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5512	NC_013922	CGG	2	6	1597982	1597987	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5513	NC_013922	TC	3	6	1598527	1598532	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5514	NC_013922	CGC	2	6	1598558	1598563	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5515	NC_013922	AACG	2	8	1598566	1598573	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
5516	NC_013922	CG	3	6	1598586	1598591	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5517	NC_013922	GAC	2	6	1599632	1599637	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5518	NC_013922	GAG	2	6	1599743	1599748	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5519	NC_013922	ACCGTC	2	12	1600191	1600202	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
5520	NC_013922	CTG	2	6	1601549	1601554	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5521	NC_013922	GA	3	6	1601559	1601564	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5522	NC_013922	AGC	2	6	1601614	1601619	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5523	NC_013922	GCG	2	6	1602333	1602338	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5524	NC_013922	GAC	2	6	1603343	1603348	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5525	NC_013922	CTG	2	6	1603397	1603402	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5526	NC_013922	CGG	2	6	1603435	1603440	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5527	NC_013922	GCC	2	6	1603494	1603499	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5528	NC_013922	CGA	2	6	1603513	1603518	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5529	NC_013922	CAGA	2	8	1605001	1605008	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
5530	NC_013922	TCAA	2	8	1609062	1609069	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
5531	NC_013922	AT	3	6	1609083	1609088	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5532	NC_013922	AGA	2	6	1609625	1609630	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5533	NC_013922	AGT	2	6	1609670	1609675	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5534	NC_013922	AT	3	6	1609676	1609681	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5535	NC_013922	CGC	2	6	1609968	1609973	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5536	NC_013922	AG	3	6	1611962	1611967	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5537	NC_013922	GGT	2	6	1612242	1612247	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5538	NC_013922	ACA	2	6	1612274	1612279	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5539	NC_013922	GGT	2	6	1612280	1612285	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5540	NC_013922	AAC	2	6	1612348	1612353	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5541	NC_013922	AC	3	6	1612365	1612370	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5542	NC_013922	CTA	2	6	1612418	1612423	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5543	NC_013922	GGT	2	6	1612436	1612441	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5544	NC_013922	CCGT	2	8	1612969	1612976	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
5545	NC_013922	AGC	2	6	1613281	1613286	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5546	NC_013922	GCT	2	6	1613287	1613292	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5547	NC_013922	ACG	2	6	1613315	1613320	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5548	NC_013922	CAG	2	6	1613322	1613327	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5549	NC_013922	TGA	2	6	1613362	1613367	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5550	NC_013922	AT	3	6	1613427	1613432	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5551	NC_013922	ACG	2	6	1613485	1613490	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5552	NC_013922	ACGGTG	3	18	1614548	1614565	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
5553	NC_013922	GAC	2	6	1614583	1614588	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5554	NC_013922	GCG	2	6	1614590	1614595	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5555	NC_013922	GACAAC	2	12	1614610	1614621	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
5556	NC_013922	TGGG	2	8	1618371	1618378	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
5557	NC_013922	GAT	2	6	1618756	1618761	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5558	NC_013922	GAC	2	6	1618766	1618771	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5559	NC_013922	ACG	2	6	1618782	1618787	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5560	NC_013922	GTGA	2	8	1618827	1618834	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
5561	NC_013922	CGGTC	2	10	1618838	1618847	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
5562	NC_013922	AGCG	2	8	1618868	1618875	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
5563	NC_013922	GAA	2	6	1619358	1619363	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5564	NC_013922	G	6	6	1619405	1619410	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
5565	NC_013922	AGC	2	6	1619413	1619418	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5566	NC_013922	GACA	2	8	1619447	1619454	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
5567	NC_013922	GAC	2	6	1619496	1619501	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5568	NC_013922	TGG	2	6	1620486	1620491	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5569	NC_013922	GGT	2	6	1620564	1620569	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5570	NC_013922	CGA	2	6	1621575	1621580	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5571	NC_013922	CACCG	2	10	1621586	1621595	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
5572	NC_013922	GC	3	6	1622139	1622144	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5573	NC_013922	GTA	2	6	1622145	1622150	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5574	NC_013922	GAC	2	6	1622245	1622250	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5575	NC_013922	TG	3	6	1622814	1622819	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
5576	NC_013922	CGG	2	6	1622853	1622858	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5577	NC_013922	AAC	2	6	1624735	1624740	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5578	NC_013922	AGCG	2	8	1624782	1624789	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
5579	NC_013922	CCGA	2	8	1624900	1624907	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
5580	NC_013922	GTC	2	6	1624929	1624934	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5581	NC_013922	GTC	2	6	1624944	1624949	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5582	NC_013922	GTC	3	9	1624954	1624962	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5583	NC_013922	CCG	2	6	1625029	1625034	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5584	NC_013922	TAG	2	6	1625036	1625041	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5585	NC_013922	TGGAC	2	10	1626090	1626099	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
5586	NC_013922	CAGTCG	2	12	1626101	1626112	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5587	NC_013922	GAC	2	6	1626122	1626127	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5588	NC_013922	CGA	2	6	1626158	1626163	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5589	NC_013922	GTA	2	6	1626184	1626189	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5590	NC_013922	GGC	2	6	1627992	1627997	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5591	NC_013922	GT	3	6	1628009	1628014	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
5592	NC_013922	GCC	2	6	1628028	1628033	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5593	NC_013922	AAG	2	6	1628088	1628093	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5594	NC_013922	CCT	2	6	1628457	1628462	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5595	NC_013922	GCC	2	6	1628497	1628502	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5596	NC_013922	ACG	2	6	1628568	1628573	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5597	NC_013922	CAA	2	6	1628575	1628580	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5598	NC_013922	GGT	2	6	1628651	1628656	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5599	NC_013922	GCC	2	6	1629697	1629702	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5600	NC_013922	GAA	2	6	1629713	1629718	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5601	NC_013922	ACT	2	6	1629733	1629738	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5602	NC_013922	GCCCG	2	10	1629823	1629832	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
5603	NC_013922	TGA	2	6	1629854	1629859	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5604	NC_013922	GCG	2	6	1629865	1629870	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5605	NC_013922	AGCGA	2	10	1629917	1629926	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
5606	NC_013922	GT	3	6	1629939	1629944	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
5607	NC_013922	CGA	2	6	1629975	1629980	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5608	NC_013922	CGTC	2	8	1629984	1629991	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
5609	NC_013922	CCG	2	6	1630034	1630039	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5610	NC_013922	ATC	2	6	1630075	1630080	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5611	NC_013922	GTC	2	6	1630120	1630125	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5612	NC_013922	CT	3	6	1630230	1630235	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5613	NC_013922	CAATC	2	10	1630295	1630304	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
5614	NC_013922	CCA	2	6	1634692	1634697	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5615	NC_013922	TCG	2	6	1634708	1634713	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5616	NC_013922	GC	3	6	1634750	1634755	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5617	NC_013922	GAA	2	6	1635042	1635047	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5618	NC_013922	TGG	2	6	1635061	1635066	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5619	NC_013922	CTG	2	6	1635299	1635304	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5620	NC_013922	AC	3	6	1635358	1635363	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5621	NC_013922	TC	3	6	1635503	1635508	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5622	NC_013922	GGC	2	6	1635529	1635534	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5623	NC_013922	CCG	2	6	1635551	1635556	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5624	NC_013922	CCA	2	6	1635563	1635568	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5625	NC_013922	GTT	2	6	1635634	1635639	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5626	NC_013922	TCG	2	6	1637649	1637654	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5627	NC_013922	TA	3	6	1637668	1637673	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5629	NC_013922	ATA	2	6	1641281	1641286	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5881	NC_013922	ATA	2	6	1701056	1701061	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5883	NC_013922	TCT	2	6	1702100	1702105	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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