MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Natrialba magadii ATCC 43099 chromosome

Total Repeats: 12775

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4501	NC_013922	CAGA	2	8	1295946	1295953	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
4502	NC_013922	CACTG	2	10	1295990	1295999	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
4503	NC_013922	AGT	2	6	1297131	1297136	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4504	NC_013922	TA	3	6	1297153	1297158	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4505	NC_013922	AGAT	2	8	1297174	1297181	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
4506	NC_013922	GAG	2	6	1298863	1298868	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4507	NC_013922	CGG	2	6	1301044	1301049	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4508	NC_013922	GCG	2	6	1301089	1301094	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4509	NC_013922	ACG	2	6	1301119	1301124	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4510	NC_013922	TAG	2	6	1301230	1301235	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4511	NC_013922	TTCG	2	8	1303453	1303460	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
4512	NC_013922	AGT	2	6	1303516	1303521	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4513	NC_013922	GGA	2	6	1304260	1304265	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4514	NC_013922	AGACG	2	10	1304316	1304325	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
4515	NC_013922	CA	3	6	1304328	1304333	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4516	NC_013922	CG	3	6	1304652	1304657	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4517	NC_013922	AGTG	2	8	1304687	1304694	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
4518	NC_013922	CTGT	2	8	1304698	1304705	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
4519	NC_013922	GTGTGG	2	12	1305540	1305551	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4520	NC_013922	GTGTGA	3	18	1305552	1305569	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
4521	NC_013922	GT	4	8	1305570	1305577	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4522	NC_013922	GT	4	8	1305590	1305597	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4523	NC_013922	CTT	2	6	1306299	1306304	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4524	NC_013922	TGG	2	6	1306921	1306926	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4525	NC_013922	GAA	2	6	1306942	1306947	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4526	NC_013922	GCC	2	6	1306950	1306955	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4527	NC_013922	GGT	2	6	1308108	1308113	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4528	NC_013922	ATC	2	6	1308269	1308274	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4529	NC_013922	GGT	2	6	1308316	1308321	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4530	NC_013922	TGC	2	6	1308322	1308327	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4531	NC_013922	CAG	2	6	1308339	1308344	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4532	NC_013922	CAT	2	6	1309493	1309498	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4533	NC_013922	CGC	2	6	1310964	1310969	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4534	NC_013922	CGG	2	6	1314091	1314096	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4535	NC_013922	TGC	2	6	1315028	1315033	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4536	NC_013922	AACTG	2	10	1315954	1315963	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
4537	NC_013922	CTA	2	6	1315998	1316003	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4538	NC_013922	CCTC	2	8	1318023	1318030	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
4539	NC_013922	GCTCGT	2	12	1318094	1318105	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4540	NC_013922	CGC	2	6	1320473	1320478	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4541	NC_013922	CCG	2	6	1321833	1321838	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4542	NC_013922	GCC	2	6	1321873	1321878	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4543	NC_013922	GCT	2	6	1321895	1321900	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4544	NC_013922	ACT	2	6	1321940	1321945	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4545	NC_013922	AAC	2	6	1323093	1323098	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4546	NC_013922	ACCG	2	8	1323146	1323153	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
4547	NC_013922	CGG	2	6	1323155	1323160	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4548	NC_013922	TGGC	2	8	1324131	1324138	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
4549	NC_013922	GTT	2	6	1324148	1324153	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4550	NC_013922	TCC	2	6	1324251	1324256	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4551	NC_013922	AC	3	6	1324305	1324310	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4552	NC_013922	GTG	2	6	1324931	1324936	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4553	NC_013922	AGG	2	6	1324949	1324954	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4554	NC_013922	TA	3	6	1324991	1324996	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4555	NC_013922	GTAC	2	8	1325568	1325575	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
4556	NC_013922	GAA	2	6	1325598	1325603	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4557	NC_013922	G	6	6	1327015	1327020	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
4558	NC_013922	CAT	2	6	1327040	1327045	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4559	NC_013922	CACC	2	8	1327054	1327061	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
4560	NC_013922	CAC	2	6	1327082	1327087	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4561	NC_013922	CAC	2	6	1327109	1327114	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4562	NC_013922	GCTG	2	8	1328348	1328355	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
4563	NC_013922	ACCC	2	8	1328398	1328405	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
4564	NC_013922	GAC	2	6	1328439	1328444	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4565	NC_013922	CAG	2	6	1330015	1330020	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4566	NC_013922	TGA	2	6	1330056	1330061	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4567	NC_013922	CAC	2	6	1330067	1330072	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4568	NC_013922	ACTGC	2	10	1330929	1330938	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
4569	NC_013922	CCCGT	2	10	1330949	1330958	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
4570	NC_013922	GTCGGC	2	12	1330973	1330984	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
4571	NC_013922	TG	3	6	1331513	1331518	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4572	NC_013922	CCAC	2	8	1331554	1331561	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
4573	NC_013922	GTCG	2	8	1331863	1331870	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
4574	NC_013922	GTGC	2	8	1331950	1331957	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
4575	NC_013922	CGA	2	6	1333523	1333528	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4576	NC_013922	CT	3	6	1334557	1334562	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4577	NC_013922	TC	3	6	1334564	1334569	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4578	NC_013922	GC	3	6	1335061	1335066	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4579	NC_013922	CAC	2	6	1335094	1335099	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4580	NC_013922	GTC	2	6	1335128	1335133	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4581	NC_013922	GTT	2	6	1335139	1335144	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4582	NC_013922	TCT	2	6	1335148	1335153	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4583	NC_013922	TTC	2	6	1335173	1335178	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4584	NC_013922	AGA	2	6	1335202	1335207	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4585	NC_013922	CA	3	6	1335218	1335223	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4586	NC_013922	CAA	2	6	1335227	1335232	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4587	NC_013922	CAG	2	6	1335257	1335262	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4588	NC_013922	AGGTAG	2	12	1335282	1335293	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
4589	NC_013922	GAA	2	6	1335296	1335301	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4590	NC_013922	GCC	2	6	1335338	1335343	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4591	NC_013922	CGGT	2	8	1335356	1335363	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
4592	NC_013922	AGGA	2	8	1335393	1335400	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4593	NC_013922	CGA	2	6	1335406	1335411	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4594	NC_013922	CGA	3	9	1335421	1335429	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4595	NC_013922	CCGC	2	8	1335438	1335445	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
4596	NC_013922	GA	3	6	1335495	1335500	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4597	NC_013922	CCG	2	6	1335501	1335506	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4598	NC_013922	GGAT	2	8	1335543	1335550	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
4599	NC_013922	GCA	2	6	1335568	1335573	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4600	NC_013922	CT	3	6	1335579	1335584	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4601	NC_013922	GAT	2	6	1335614	1335619	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4602	NC_013922	CGGC	2	8	1335715	1335722	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4603	NC_013922	CGA	2	6	1335733	1335738	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4604	NC_013922	CGG	2	6	1335808	1335813	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4605	NC_013922	CGAG	2	8	1335829	1335836	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
4606	NC_013922	CCT	2	6	1335853	1335858	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4607	NC_013922	CGA	2	6	1335886	1335891	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4608	NC_013922	GGA	2	6	1335907	1335912	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4609	NC_013922	CGG	2	6	1335928	1335933	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4610	NC_013922	CGG	2	6	1335937	1335942	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4611	NC_013922	ATG	2	6	1336026	1336031	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4612	NC_013922	GCC	2	6	1336044	1336049	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4613	NC_013922	TGA	2	6	1336078	1336083	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4614	NC_013922	CGAC	2	8	1336138	1336145	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
4615	NC_013922	GAT	2	6	1336238	1336243	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4616	NC_013922	CGC	2	6	1336303	1336308	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4617	NC_013922	CGA	2	6	1336309	1336314	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4618	NC_013922	CGA	2	6	1336351	1336356	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4619	NC_013922	ATA	2	6	1336377	1336382	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4620	NC_013922	CGAGC	2	10	1336394	1336403	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
4621	NC_013922	GCC	2	6	1336406	1336411	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4622	NC_013922	ATCC	2	8	1336440	1336447	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
4623	NC_013922	ATC	2	6	1336455	1336460	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4624	NC_013922	AC	3	6	1336535	1336540	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4625	NC_013922	ATTG	2	8	1336551	1336558	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
4626	NC_013922	TC	4	8	1336571	1336578	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4627	NC_013922	AT	3	6	1336608	1336613	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4628	NC_013922	ACA	2	6	1336627	1336632	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4629	NC_013922	GAC	2	6	1336725	1336730	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4630	NC_013922	AC	3	6	1336740	1336745	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4631	NC_013922	CCGAC	2	10	1336787	1336796	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
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4634	NC_013922	CGG	2	6	1337414	1337419	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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4750	NC_013922	GTGAG	2	10	1368703	1368712	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
4751	NC_013922	CGAAC	2	10	1368718	1368727	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
4752	NC_013922	CA	3	6	1368816	1368821	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4753	NC_013922	GCA	2	6	1369019	1369024	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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4755	NC_013922	GA	3	6	1369430	1369435	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4756	NC_013922	GCG	2	6	1369501	1369506	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4757	NC_013922	AAC	2	6	1369621	1369626	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4758	NC_013922	TA	3	6	1369630	1369635	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4759	NC_013922	CGAA	2	8	1369681	1369688	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
4760	NC_013922	CGG	2	6	1370608	1370613	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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4762	NC_013922	GCGG	2	8	1370725	1370732	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
4763	NC_013922	TGCCAC	2	12	1370743	1370754	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
4764	NC_013922	TCGAG	2	10	1370796	1370805	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
4765	NC_013922	CTGGAA	2	12	1370811	1370822	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
4766	NC_013922	TTGC	2	8	1371313	1371320	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
4767	NC_013922	A	6	6	1371338	1371343	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4770	NC_013922	TG	3	6	1371919	1371924	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4771	NC_013922	AGT	2	6	1371925	1371930	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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4776	NC_013922	AAT	2	6	1373994	1373999	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4796	NC_013922	GAC	2	6	1377616	1377621	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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4802	NC_013922	TCGTC	2	10	1383631	1383640	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
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4804	NC_013922	CCAG	2	8	1383724	1383731	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
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4839	NC_013922	TCG	3	9	1400549	1400557	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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4879	NC_013922	CA	3	6	1417536	1417541	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4880	NC_013922	GTT	2	6	1417542	1417547	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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4882	NC_013922	GC	3	6	1418734	1418739	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4883	NC_013922	CTG	2	6	1418764	1418769	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4884	NC_013922	TGG	2	6	1418792	1418797	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4885	NC_013922	CGA	2	6	1418877	1418882	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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4887	NC_013922	GGT	2	6	1420941	1420946	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4888	NC_013922	CAT	2	6	1421030	1421035	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4889	NC_013922	CAT	2	6	1421041	1421046	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4890	NC_013922	TCT	2	6	1421047	1421052	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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4892	NC_013922	GAT	2	6	1421127	1421132	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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4980	NC_013922	TCCAC	2	10	1447654	1447663	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
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4991	NC_013922	GAC	2	6	1452218	1452223	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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4993	NC_013922	CCCG	2	8	1454071	1454078	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
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