MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Neisseria meningitidis alpha14 chromosome

Total Repeats: 156

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013016	AAAATA	2	12	49909	49920	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_013016	GTTGCT	2	12	50046	50057	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
3	NC_013016	GCTGTT	2	12	56082	56093	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
4	NC_013016	TATTTT	2	12	64604	64615	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_013016	ACAAAG	2	12	144121	144132	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
6	NC_013016	GGAAGT	2	12	150755	150766	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
7	NC_013016	TTACTT	2	12	150997	151008	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
8	NC_013016	TTTTGT	2	12	173188	173199	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
9	NC_013016	GCTTCC	2	12	207700	207711	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
10	NC_013016	GGTTTT	2	12	209923	209934	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11	NC_013016	TGATTT	2	12	210863	210874	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
12	NC_013016	TGATTT	2	12	211236	211247	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
13	NC_013016	ATGGTG	2	12	221155	221166	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
14	NC_013016	ATTTAA	2	12	261418	261429	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_013016	ATTTAA	2	12	263433	263444	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_013016	GCAGGG	2	12	266629	266640	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
17	NC_013016	GGGGCG	2	12	274650	274661	0 %	0 %	83.33 %	16.67 %	Non-Coding
18	NC_013016	ATTTAA	2	12	283623	283634	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_013016	ATGCTG	2	12	294532	294543	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
20	NC_013016	TTAAAT	2	12	294644	294655	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_013016	ATTTAA	2	12	308168	308179	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_013016	CAACCC	2	12	333358	333369	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
23	NC_013016	TTTTGT	2	12	339899	339910	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
24	NC_013016	TTAAAT	2	12	353959	353970	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_013016	CCTATG	2	12	362235	362246	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
26	NC_013016	CATTGG	2	12	367044	367055	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
27	NC_013016	TTCAGA	2	12	376582	376593	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
28	NC_013016	ACCGAA	2	12	391502	391513	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
29	NC_013016	ACCGAA	2	12	391702	391713	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_013016	CGCGGT	2	12	411433	411444	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_013016	ATTTAA	2	12	427301	427312	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_013016	TTAAAT	2	12	465244	465255	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_013016	CAAATC	2	12	465446	465457	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_013016	GTGTGG	2	12	475741	475752	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
35	NC_013016	GGTTTT	2	12	476214	476225	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
36	NC_013016	AATTTA	2	12	479811	479822	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_013016	ATGCCG	2	12	486815	486826	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_013016	CGAAAA	2	12	494742	494753	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
39	NC_013016	TCGGTT	2	12	506118	506129	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
40	NC_013016	AAAAAC	2	12	506383	506394	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
41	NC_013016	TTCAAA	2	12	516498	516509	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
42	NC_013016	ATCCGC	2	12	526227	526238	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
43	NC_013016	CGGACA	2	12	546689	546700	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
44	NC_013016	TTATGT	2	12	577409	577420	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
45	NC_013016	GGAAAA	2	12	578648	578659	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
46	NC_013016	TCAAAT	2	12	611356	611367	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
47	NC_013016	TTTTTG	2	12	642157	642168	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
48	NC_013016	ATTTAA	2	12	643973	643984	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_013016	CCTTAA	2	12	649425	649436	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
50	NC_013016	CCGAAC	2	12	649851	649862	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
51	NC_013016	TTAAAT	2	12	658857	658868	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_013016	CGCCTG	2	12	685719	685730	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
53	NC_013016	AAAATA	2	12	689251	689262	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_013016	TTCGGA	2	12	699040	699051	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
55	NC_013016	ATCCCC	2	12	762552	762563	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
56	NC_013016	ATATGG	2	12	787620	787631	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
57	NC_013016	AAGGAT	2	12	792898	792909	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
58	NC_013016	ATTTAA	2	12	803598	803609	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_013016	AAGGAA	2	12	805659	805670	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
60	NC_013016	TTAAAT	2	12	805792	805803	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_013016	ATTTAT	2	12	806560	806571	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_013016	TTCAAT	2	12	806572	806583	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
63	NC_013016	GATGGT	2	12	827997	828008	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
64	NC_013016	AAACCG	2	12	850985	850996	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
65	NC_013016	TAATCA	2	12	855185	855196	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
66	NC_013016	ATTTAA	2	12	857802	857813	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_013016	TGGTTT	2	12	862459	862470	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
68	NC_013016	ATTTAA	2	12	893519	893530	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_013016	TTTTTG	2	12	898412	898423	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
70	NC_013016	TCTTTG	2	12	905852	905863	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
71	NC_013016	ATTTTT	2	12	914379	914390	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_013016	TTAAAT	2	12	919896	919907	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_013016	CGTTTG	2	12	920051	920062	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
74	NC_013016	CCACAC	2	12	925025	925036	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
75	NC_013016	TTGTTT	2	12	936455	936466	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
76	NC_013016	ATTTAA	2	12	937729	937740	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_013016	TTAAAT	2	12	945434	945445	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_013016	GGGGTG	2	12	946503	946514	0 %	16.67 %	83.33 %	0 %	Non-Coding
79	NC_013016	ATTTAA	2	12	947969	947980	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_013016	TTAAAT	2	12	973336	973347	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_013016	TTCGGC	2	12	973540	973551	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
82	NC_013016	AATTTG	2	12	995091	995102	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
83	NC_013016	CAAAGA	2	12	1000144	1000155	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
84	NC_013016	TTAAAT	2	12	1000478	1000489	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_013016	ATTTAA	2	12	1005576	1005587	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_013016	CAAAGC	2	12	1014064	1014075	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
87	NC_013016	TTGATT	2	12	1024239	1024250	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
88	NC_013016	GAAAAA	2	12	1057091	1057102	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
89	NC_013016	GTGTGG	2	12	1066070	1066081	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
90	NC_013016	TTAAAT	2	12	1067068	1067079	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_013016	TGCGGG	2	12	1100018	1100029	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
92	NC_013016	CTCCGA	2	12	1106499	1106510	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
93	NC_013016	TGCCGA	2	12	1123351	1123362	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
94	NC_013016	CAAACC	2	12	1138567	1138578	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
95	NC_013016	GCTGTG	2	12	1147146	1147157	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
96	NC_013016	TTTCAG	2	12	1173605	1173616	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
97	NC_013016	CCGGCT	2	12	1173718	1173729	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
98	NC_013016	AAACAC	2	12	1189826	1189837	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
99	NC_013016	GCTGCC	2	12	1207616	1207627	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
100	NC_013016	GTAAGT	2	12	1255086	1255097	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
101	NC_013016	CAAAAA	2	12	1262716	1262727	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
102	NC_013016	ATCCGA	2	12	1267897	1267908	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
103	NC_013016	AACAAA	2	12	1268286	1268297	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
104	NC_013016	TATCAA	2	12	1272631	1272642	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
105	NC_013016	TGCCTT	2	12	1275677	1275688	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
106	NC_013016	TTAAAT	2	12	1279888	1279899	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_013016	TAAATA	2	12	1292042	1292053	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_013016	ATTTAA	2	12	1309561	1309572	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_013016	ATTTAA	2	12	1368793	1368804	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_013016	ATTTAA	2	12	1369262	1369273	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_013016	GAATCT	2	12	1396260	1396271	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
112	NC_013016	GAATCT	2	12	1396559	1396570	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
113	NC_013016	TTCGGT	2	12	1402196	1402207	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
114	NC_013016	TTCGGT	2	12	1402346	1402357	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
115	NC_013016	TCATCT	2	12	1494139	1494150	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
116	NC_013016	ATTTAA	2	12	1509321	1509332	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_013016	GTGTGG	2	12	1520890	1520901	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
118	NC_013016	GGTTTT	2	12	1521363	1521374	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
119	NC_013016	GATTCA	2	12	1523381	1523392	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
120	NC_013016	TTTAAA	2	12	1528995	1529006	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_013016	ACCGAA	2	12	1530660	1530671	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
122	NC_013016	ACCGAA	2	12	1530844	1530855	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
123	NC_013016	GCAGCC	2	12	1552305	1552316	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
124	NC_013016	CTTTGT	2	12	1580639	1580650	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
125	NC_013016	CATTTC	2	12	1614718	1614729	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
126	NC_013016	CGGCAT	2	12	1621099	1621110	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
127	NC_013016	CGGCAG	2	12	1629948	1629959	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
128	NC_013016	TTAAAT	2	12	1669551	1669562	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_013016	GAAGCC	2	12	1674007	1674018	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
130	NC_013016	GAAATA	2	12	1697017	1697028	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
131	NC_013016	TTCGGT	2	12	1697383	1697394	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
132	NC_013016	ATTTAA	2	12	1716341	1716352	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_013016	CGGAAA	2	12	1720417	1720428	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
134	NC_013016	GCCCGC	2	12	1721276	1721287	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
135	NC_013016	CTGCTC	2	12	1752080	1752091	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
136	NC_013016	AAATCA	2	12	1762366	1762377	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
137	NC_013016	CCATTC	2	12	1766876	1766887	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
138	NC_013016	GTGTGG	2	12	1778779	1778790	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
139	NC_013016	TATCAA	2	12	1779124	1779135	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
140	NC_013016	CTGAAT	3	18	1796185	1796202	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
141	NC_013016	ATTTAA	2	12	1799355	1799366	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_013016	TAAATT	2	12	1821981	1821992	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_013016	ATTTAA	2	12	1848272	1848283	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_013016	ATAAAA	2	12	1852578	1852589	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_013016	AACCGA	2	12	1864873	1864884	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
146	NC_013016	AACCGA	2	12	1865936	1865947	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
147	NC_013016	CTTTGT	2	12	1874904	1874915	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
148	NC_013016	ATTTAA	2	12	1888215	1888226	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
149	NC_013016	AAGGGA	2	12	1950329	1950340	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
150	NC_013016	TATTTT	2	12	1997019	1997030	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
151	NC_013016	CTTTTC	2	12	2055847	2055858	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
152	NC_013016	GCATAA	2	12	2073180	2073191	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
153	NC_013016	ATTTAA	2	12	2084113	2084124	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
154	NC_013016	CACCAT	2	12	2096208	2096219	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
155	NC_013016	CTTTGT	2	12	2100589	2100600	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
156	NC_013016	CAAGCC	2	12	2131474	2131485	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.