MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Neisseria meningitidis alpha14 chromosome

Total Repeats: 8247

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_013016	CCA	2	6	143866	143871	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
502	NC_013016	CCA	2	6	143947	143952	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
503	NC_013016	GAA	2	6	143973	143978	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
504	NC_013016	ATA	2	6	144034	144039	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
505	NC_013016	CAA	2	6	144115	144120	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
506	NC_013016	ACAAAG	2	12	144121	144132	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
507	NC_013016	GTTT	2	8	144134	144141	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
508	NC_013016	T	6	6	144145	144150	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
509	NC_013016	TC	3	6	144172	144177	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
510	NC_013016	GA	3	6	144180	144185	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
511	NC_013016	AAAC	2	8	144191	144198	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
512	NC_013016	TGA	2	6	144211	144216	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
513	NC_013016	ACA	2	6	144260	144265	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
514	NC_013016	AAG	2	6	144339	144344	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
515	NC_013016	GAT	2	6	144397	144402	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
516	NC_013016	CGA	2	6	144406	144411	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
517	NC_013016	GGA	2	6	144570	144575	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
518	NC_013016	AGT	2	6	144600	144605	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
519	NC_013016	GCGA	2	8	144607	144614	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
520	NC_013016	GGA	2	6	144619	144624	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
521	NC_013016	TAA	2	6	144634	144639	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
522	NC_013016	AGA	2	6	144650	144655	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
523	NC_013016	G	6	6	144767	144772	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
524	NC_013016	TCC	2	6	144777	144782	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
525	NC_013016	TCA	2	6	144795	144800	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
526	NC_013016	GGGAG	2	10	144849	144858	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
527	NC_013016	GGA	2	6	145084	145089	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
528	NC_013016	AAAC	2	8	145147	145154	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
529	NC_013016	GACA	2	8	145302	145309	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
530	NC_013016	AAC	2	6	145340	145345	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
531	NC_013016	AGC	2	6	145430	145435	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
532	NC_013016	CAT	2	6	145436	145441	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
533	NC_013016	AAAG	2	8	145444	145451	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
534	NC_013016	GTC	2	6	145472	145477	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
535	NC_013016	AGGTT	2	10	145791	145800	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
536	NC_013016	TCT	2	6	145860	145865	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
537	NC_013016	GAC	2	6	145880	145885	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
538	NC_013016	GA	3	6	146008	146013	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
539	NC_013016	TTA	2	6	146134	146139	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
540	NC_013016	CGG	2	6	146249	146254	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
541	NC_013016	TCC	2	6	146342	146347	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
542	NC_013016	GCT	2	6	146393	146398	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
543	NC_013016	ACC	2	6	146520	146525	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
544	NC_013016	TCC	2	6	146606	146611	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
545	NC_013016	GGA	2	6	146623	146628	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
546	NC_013016	GGT	2	6	146743	146748	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
547	NC_013016	CGG	2	6	146830	146835	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
548	NC_013016	TCA	2	6	146858	146863	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
549	NC_013016	CGT	2	6	146938	146943	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
550	NC_013016	GCT	2	6	146992	146997	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
551	NC_013016	GAA	2	6	147259	147264	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
552	NC_013016	ACTG	2	8	147284	147291	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
553	NC_013016	AT	3	6	147308	147313	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
554	NC_013016	GGC	2	6	147351	147356	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
555	NC_013016	GAT	2	6	147417	147422	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
556	NC_013016	TTC	2	6	147430	147435	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
557	NC_013016	ATT	2	6	147482	147487	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
558	NC_013016	CTG	2	6	147979	147984	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
559	NC_013016	AAT	2	6	148020	148025	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
560	NC_013016	AAGTA	2	10	148039	148048	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
561	NC_013016	ATCG	2	8	148511	148518	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
562	NC_013016	ATTG	2	8	148666	148673	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
563	NC_013016	T	6	6	148681	148686	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
564	NC_013016	T	7	7	148707	148713	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
565	NC_013016	GTTTT	2	10	148722	148731	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
566	NC_013016	AT	3	6	148775	148780	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
567	NC_013016	ATA	2	6	148855	148860	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
568	NC_013016	GTAG	2	8	149247	149254	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
569	NC_013016	GTT	2	6	149282	149287	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
570	NC_013016	TGG	2	6	149333	149338	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
571	NC_013016	GTC	2	6	149367	149372	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
572	NC_013016	GAC	2	6	149388	149393	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
573	NC_013016	GGA	2	6	149433	149438	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
574	NC_013016	TAA	2	6	149472	149477	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
575	NC_013016	ATT	2	6	149486	149491	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
576	NC_013016	TA	3	6	149516	149521	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
577	NC_013016	AGTT	2	8	149523	149530	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
578	NC_013016	ATT	2	6	149543	149548	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
579	NC_013016	GAA	2	6	150633	150638	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
580	NC_013016	GGAAGT	2	12	150755	150766	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
581	NC_013016	TTA	2	6	150799	150804	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
582	NC_013016	TCGG	2	8	150859	150866	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
583	NC_013016	GAA	2	6	150876	150881	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
584	NC_013016	GAA	2	6	150901	150906	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
585	NC_013016	A	6	6	150918	150923	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
586	NC_013016	ATT	2	6	150941	150946	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
587	NC_013016	CAA	2	6	150956	150961	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
588	NC_013016	CTA	2	6	150973	150978	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
589	NC_013016	TTACTT	2	12	150997	151008	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
590	NC_013016	GAA	2	6	151027	151032	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
591	NC_013016	AAT	2	6	151395	151400	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
592	NC_013016	CAT	2	6	151558	151563	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
593	NC_013016	AGA	2	6	151647	151652	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
594	NC_013016	A	7	7	151652	151658	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
595	NC_013016	A	6	6	151724	151729	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
596	NC_013016	TAT	2	6	151822	151827	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
597	NC_013016	GGC	2	6	151851	151856	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
598	NC_013016	ATT	2	6	151911	151916	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
599	NC_013016	TGC	2	6	151921	151926	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
600	NC_013016	CATAG	2	10	151979	151988	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
601	NC_013016	ATTG	2	8	151999	152006	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
602	NC_013016	AGA	2	6	152077	152082	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
603	NC_013016	ACA	2	6	152134	152139	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
604	NC_013016	TAA	2	6	152196	152201	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
605	NC_013016	A	7	7	152239	152245	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
606	NC_013016	GGT	2	6	152254	152259	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
607	NC_013016	GTCG	2	8	156039	156046	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
608	NC_013016	CAT	2	6	156061	156066	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
609	NC_013016	GCAG	2	8	157697	157704	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
610	NC_013016	TTC	2	6	157727	157732	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
611	NC_013016	A	6	6	157762	157767	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
612	NC_013016	GTT	2	6	157813	157818	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
613	NC_013016	TGT	2	6	158997	159002	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
614	NC_013016	TTG	2	6	159038	159043	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
615	NC_013016	TTG	3	9	160586	160594	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
616	NC_013016	AGC	2	6	160603	160608	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
617	NC_013016	GGC	2	6	160631	160636	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
618	NC_013016	TGT	2	6	162075	162080	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
619	NC_013016	CGG	2	6	162082	162087	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
620	NC_013016	TATG	2	8	162102	162109	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
621	NC_013016	GT	3	6	163368	163373	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
622	NC_013016	GCA	2	6	164580	164585	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
623	NC_013016	AGG	2	6	165607	165612	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
624	NC_013016	GCC	2	6	165619	165624	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
625	NC_013016	TTG	2	6	165658	165663	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
626	NC_013016	TA	3	6	165668	165673	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
627	NC_013016	A	7	7	165673	165679	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
628	NC_013016	A	6	6	165692	165697	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
629	NC_013016	TA	3	6	165731	165736	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
630	NC_013016	CCG	2	6	165763	165768	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
631	NC_013016	GCC	2	6	165803	165808	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
632	NC_013016	TCAG	2	8	165819	165826	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
633	NC_013016	CAA	2	6	166751	166756	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
634	NC_013016	AGC	2	6	166782	166787	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
635	NC_013016	CCGC	2	8	168291	168298	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
636	NC_013016	CGG	2	6	168318	168323	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
637	NC_013016	ATA	2	6	168384	168389	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
638	NC_013016	TA	3	6	173066	173071	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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916	NC_013016	CGG	2	6	231154	231159	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
917	NC_013016	GCA	3	9	231180	231188	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
918	NC_013016	CCTC	2	8	231215	231222	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
919	NC_013016	CGA	2	6	231265	231270	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
920	NC_013016	ACA	2	6	231367	231372	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
921	NC_013016	CAT	2	6	231692	231697	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
922	NC_013016	CTT	2	6	231734	231739	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
923	NC_013016	TA	3	6	231743	231748	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
924	NC_013016	CGA	2	6	231775	231780	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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926	NC_013016	T	6	6	232644	232649	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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939	NC_013016	TCG	2	6	239097	239102	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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941	NC_013016	ATT	2	6	239142	239147	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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943	NC_013016	ATA	2	6	239247	239252	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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948	NC_013016	GCC	2	6	240281	240286	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
949	NC_013016	ACA	2	6	240296	240301	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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951	NC_013016	TGA	2	6	240365	240370	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
952	NC_013016	GAT	2	6	240375	240380	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1000	NC_013016	CGG	2	6	258667	258672	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding

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