MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Neorickettsia risticii str. Illinois

Total Repeats: 124

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013009	TATTT	2	10	7892	7901	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_013009	TGTAG	2	10	10121	10130	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
3	NC_013009	CGCTG	2	10	15112	15121	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
4	NC_013009	TCCTC	2	10	23916	23925	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
5	NC_013009	TAACA	2	10	29235	29244	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
6	NC_013009	TAGTA	2	10	29679	29688	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
7	NC_013009	GTTTA	2	10	31430	31439	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
8	NC_013009	TCGTG	2	10	37416	37425	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
9	NC_013009	TATGG	2	10	37558	37567	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
10	NC_013009	GGTGG	2	10	37817	37826	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
11	NC_013009	AATCT	2	10	44180	44189	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
12	NC_013009	GAAAG	2	10	61216	61225	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
13	NC_013009	TTAAT	2	10	65454	65463	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_013009	TTCAT	2	10	69159	69168	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
15	NC_013009	AAGCT	2	10	70716	70725	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
16	NC_013009	CAGAT	2	10	74015	74024	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
17	NC_013009	ACAAT	2	10	74032	74041	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
18	NC_013009	TTTGT	2	10	75599	75608	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
19	NC_013009	GGGCT	2	10	78869	78878	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
20	NC_013009	ACTGC	2	10	79879	79888	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
21	NC_013009	TAGTA	2	10	80284	80293	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
22	NC_013009	CTTGT	2	10	88198	88207	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
23	NC_013009	CTTTC	2	10	88208	88217	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
24	NC_013009	TTTTA	2	10	88517	88526	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_013009	CAATT	2	10	89734	89743	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
26	NC_013009	AAGAT	2	10	102324	102333	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
27	NC_013009	TACCT	2	10	103275	103284	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
28	NC_013009	CAGGA	2	10	105824	105833	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
29	NC_013009	ATAGC	2	10	111857	111866	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
30	NC_013009	TTTCA	2	10	117704	117713	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
31	NC_013009	AAGCT	2	10	119202	119211	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
32	NC_013009	TAAAT	2	10	131313	131322	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_013009	ATGTT	2	10	138482	138491	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
34	NC_013009	TAAAG	2	10	138502	138511	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
35	NC_013009	TTTAG	2	10	156419	156428	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
36	NC_013009	GCTAT	2	10	160417	160426	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
37	NC_013009	TACTC	2	10	161957	161966	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
38	NC_013009	GAAGA	2	10	178763	178772	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
39	NC_013009	TATTT	2	10	181380	181389	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_013009	TAGAG	2	10	203514	203523	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
41	NC_013009	ATTTG	2	10	210272	210281	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
42	NC_013009	ACTAA	2	10	215087	215096	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
43	NC_013009	TGTAT	2	10	215105	215114	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
44	NC_013009	CAATA	2	10	216996	217005	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
45	NC_013009	CGTGA	2	10	225576	225585	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
46	NC_013009	AAGAT	2	10	238150	238159	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
47	NC_013009	TTCTT	2	10	249483	249492	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
48	NC_013009	CTAAA	2	10	256165	256174	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
49	NC_013009	ATCCT	2	10	271418	271427	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
50	NC_013009	GAAAT	2	10	274796	274805	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
51	NC_013009	TTGTC	2	10	277467	277476	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
52	NC_013009	GCTTT	2	10	284582	284591	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
53	NC_013009	CTTTG	2	10	284955	284964	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
54	NC_013009	CATGG	2	10	323264	323273	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
55	NC_013009	TTAAT	2	10	328751	328760	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_013009	AACAG	2	10	337321	337330	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
57	NC_013009	CATTT	2	10	345542	345551	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
58	NC_013009	GCCTT	2	10	347254	347263	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
59	NC_013009	TTTAT	2	10	349329	349338	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_013009	ATTTG	2	10	379776	379785	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
61	NC_013009	ATACA	2	10	388799	388808	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
62	NC_013009	CCTTT	2	10	389618	389627	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
63	NC_013009	TAGAT	2	10	391705	391714	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
64	NC_013009	AGCAA	2	10	401353	401362	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
65	NC_013009	TTTGC	2	10	411472	411481	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
66	NC_013009	CTGTG	2	10	416568	416577	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
67	NC_013009	TAATG	2	10	426933	426942	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
68	NC_013009	AAATA	2	10	430908	430917	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_013009	GATAG	2	10	462213	462222	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
70	NC_013009	ATTCA	2	10	462359	462368	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
71	NC_013009	CTAAA	2	10	485435	485444	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
72	NC_013009	ATTTC	2	10	490544	490553	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
73	NC_013009	AGATC	2	10	492147	492156	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
74	NC_013009	AACAC	2	10	506884	506893	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
75	NC_013009	CTGCG	2	10	512129	512138	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
76	NC_013009	TTACT	2	10	512212	512221	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
77	NC_013009	ATGAC	2	10	512886	512895	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
78	NC_013009	AACAA	2	10	518867	518876	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
79	NC_013009	TGCAT	2	10	522614	522623	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
80	NC_013009	TTGCG	2	10	523611	523620	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
81	NC_013009	CTAAC	2	10	529392	529401	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
82	NC_013009	TAAAG	2	10	530796	530805	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
83	NC_013009	GAACA	2	10	542268	542277	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
84	NC_013009	ATATT	2	10	545883	545892	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_013009	AGATA	2	10	554146	554155	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
86	NC_013009	ATAAC	2	10	571973	571982	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
87	NC_013009	AACCC	2	10	574116	574125	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
88	NC_013009	CCACA	2	10	601798	601807	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
89	NC_013009	GCCTA	2	10	638821	638830	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
90	NC_013009	AAAAG	2	10	639534	639543	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
91	NC_013009	TTTTG	2	10	639559	639568	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
92	NC_013009	AACGA	2	10	647828	647837	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
93	NC_013009	GTCAT	2	10	651058	651067	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
94	NC_013009	CTGTT	2	10	683751	683760	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
95	NC_013009	TAAGT	2	10	689805	689814	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
96	NC_013009	ACCTT	2	10	693275	693284	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
97	NC_013009	AGACA	2	10	698498	698507	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
98	NC_013009	CAGGC	2	10	714191	714200	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
99	NC_013009	AAAGC	2	10	724357	724366	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
100	NC_013009	CCTCA	2	10	729509	729518	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
101	NC_013009	TTCAA	2	10	732520	732529	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
102	NC_013009	CCAAT	2	10	732831	732840	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
103	NC_013009	CAAAG	2	10	737440	737449	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
104	NC_013009	CAAGA	2	10	738006	738015	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
105	NC_013009	CTCTT	2	10	751918	751927	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
106	NC_013009	TTGCT	2	10	752387	752396	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
107	NC_013009	CCTTT	2	10	752480	752489	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
108	NC_013009	ACCAC	2	10	756113	756122	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
109	NC_013009	CAAAC	2	10	756371	756380	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
110	NC_013009	TTTTA	2	10	758062	758071	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_013009	TGAAT	2	10	770503	770512	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
112	NC_013009	GACTC	2	10	775053	775062	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
113	NC_013009	CTTAT	2	10	792785	792794	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
114	NC_013009	CATTT	2	10	796033	796042	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
115	NC_013009	CACTT	2	10	812295	812304	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
116	NC_013009	AGAGC	2	10	826741	826750	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
117	NC_013009	ACAAA	2	10	828612	828621	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
118	NC_013009	GTTTT	2	10	835346	835355	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
119	NC_013009	AGAAC	2	10	838470	838479	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
120	NC_013009	GAAAA	2	10	839186	839195	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
121	NC_013009	AGTTA	2	10	844832	844841	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
122	NC_013009	CCTTA	2	10	846523	846532	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
123	NC_013009	TAGAT	2	10	858036	858045	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
124	NC_013009	ATATT	2	10	867096	867105	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.