MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Nautilia profundicola AmH chromosome

Total Repeats: 400

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_012115	AGTA	2	8	11261	11268	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
2	NC_012115	AGTT	2	8	15144	15151	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
3	NC_012115	ATTA	2	8	21113	21120	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_012115	TTAA	2	8	28775	28782	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_012115	GTTA	2	8	28795	28802	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
6	NC_012115	TAAC	2	8	28848	28855	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
7	NC_012115	TTAT	2	8	41838	41845	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_012115	GAAA	2	8	43007	43014	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
9	NC_012115	ATTT	2	8	46599	46606	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_012115	TAAT	2	8	49442	49449	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_012115	TTAA	2	8	49481	49488	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_012115	CTAA	2	8	49594	49601	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
13	NC_012115	GGAT	2	8	49709	49716	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
14	NC_012115	ATTT	2	8	51449	51456	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_012115	TTTA	2	8	63734	63741	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_012115	GACA	2	8	69912	69919	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
17	NC_012115	GACA	2	8	71831	71838	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
18	NC_012115	CACC	2	8	71935	71942	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
19	NC_012115	CATT	2	8	77450	77457	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
20	NC_012115	TTTA	2	8	85069	85076	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_012115	AATT	2	8	95738	95745	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_012115	AAAT	2	8	100176	100183	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_012115	TAAT	2	8	100190	100197	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_012115	AATG	2	8	116317	116324	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
25	NC_012115	TAAA	2	8	116329	116336	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_012115	ATTG	2	8	116366	116373	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
27	NC_012115	ATTT	2	8	131437	131444	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_012115	TTTA	2	8	134132	134139	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_012115	CTTT	2	8	139128	139135	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
30	NC_012115	AGCG	2	8	140278	140285	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
31	NC_012115	GCCT	2	8	141481	141488	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
32	NC_012115	GTTG	2	8	141629	141636	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
33	NC_012115	CCGG	2	8	141786	141793	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
34	NC_012115	AAAG	2	8	142747	142754	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
35	NC_012115	CCCT	2	8	143334	143341	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
36	NC_012115	AGGG	2	8	143678	143685	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
37	NC_012115	AGCC	2	8	144017	144024	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
38	NC_012115	ATTT	2	8	144856	144863	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_012115	TACT	2	8	144890	144897	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
40	NC_012115	TTAT	2	8	144923	144930	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_012115	TATT	2	8	145168	145175	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_012115	TAAA	2	8	151189	151196	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_012115	AAAC	2	8	163810	163817	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
44	NC_012115	ATAA	2	8	165632	165639	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_012115	TAAT	2	8	166355	166362	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_012115	AATA	2	8	184308	184315	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_012115	GACA	2	8	184339	184346	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
48	NC_012115	AAGT	2	8	191778	191785	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
49	NC_012115	AAGT	2	8	199282	199289	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
50	NC_012115	TGAT	2	8	200166	200173	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
51	NC_012115	TGTT	2	8	210671	210678	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
52	NC_012115	CTTT	2	8	217879	217886	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
53	NC_012115	GACA	2	8	218943	218950	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
54	NC_012115	GAAA	2	8	218969	218976	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
55	NC_012115	TTGA	2	8	223067	223074	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
56	NC_012115	AGTT	2	8	233547	233554	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
57	NC_012115	TGTT	2	8	238119	238126	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
58	NC_012115	GACA	2	8	244523	244530	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
59	NC_012115	CATT	2	8	245235	245242	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
60	NC_012115	TAAT	2	8	245256	245263	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_012115	TAAT	2	8	246168	246175	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_012115	GACA	2	8	248388	248395	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
63	NC_012115	TTGG	2	8	255618	255625	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
64	NC_012115	AAGG	2	8	258575	258582	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
65	NC_012115	TAGG	2	8	271403	271410	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
66	NC_012115	GACA	2	8	271574	271581	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
67	NC_012115	ATTG	2	8	271598	271605	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
68	NC_012115	TGAT	2	8	302685	302692	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
69	NC_012115	AGTA	2	8	304303	304310	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
70	NC_012115	TTTA	2	8	320835	320842	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_012115	ATTA	2	8	326663	326670	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_012115	ATTA	2	8	326684	326691	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_012115	AAAT	2	8	333802	333809	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_012115	CTTC	2	8	335208	335215	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
75	NC_012115	CTTA	2	8	341660	341667	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
76	NC_012115	CCTT	2	8	354603	354610	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
77	NC_012115	ATTT	2	8	357129	357136	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_012115	ATTA	2	8	361738	361745	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_012115	TAAT	2	8	364117	364124	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_012115	GGTG	2	8	367524	367531	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
81	NC_012115	ATAA	2	8	368382	368389	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_012115	TAAT	2	8	369573	369580	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_012115	AAAT	2	8	370739	370746	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_012115	TCTT	2	8	375031	375038	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
85	NC_012115	ATTT	2	8	375582	375589	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_012115	GACA	2	8	375785	375792	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
87	NC_012115	TTTC	2	8	376150	376157	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
88	NC_012115	ATTT	2	8	382243	382250	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_012115	GACA	2	8	391879	391886	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
90	NC_012115	GACA	2	8	396346	396353	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
91	NC_012115	ATTA	2	8	396370	396377	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_012115	TCAA	2	8	396409	396416	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
93	NC_012115	TAAT	2	8	396676	396683	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_012115	AAAT	2	8	396696	396703	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_012115	TAAT	2	8	396726	396733	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_012115	AATG	2	8	405040	405047	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
97	NC_012115	TAAA	2	8	407989	407996	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_012115	ATAA	2	8	408054	408061	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_012115	AAAT	2	8	408111	408118	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_012115	GACA	2	8	409439	409446	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
101	NC_012115	GATT	2	8	409451	409458	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
102	NC_012115	GAAA	2	8	414976	414983	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
103	NC_012115	AATT	2	8	433036	433043	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_012115	GTTG	2	8	438505	438512	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
105	NC_012115	ATTT	2	8	447169	447176	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_012115	TACC	2	8	449319	449326	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
107	NC_012115	TAAC	2	8	462194	462201	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
108	NC_012115	CTAA	2	8	462204	462211	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
109	NC_012115	TTAA	2	8	462276	462283	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_012115	TTCG	2	8	465431	465438	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
111	NC_012115	TTTA	2	8	466140	466147	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_012115	GATT	2	8	466178	466185	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
113	NC_012115	TTAA	2	8	466191	466198	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_012115	TTAC	2	8	466336	466343	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
115	NC_012115	TAAA	2	8	467439	467446	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_012115	TAGT	2	8	471494	471501	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
117	NC_012115	TAAC	2	8	471653	471660	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
118	NC_012115	TTAA	2	8	471687	471694	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_012115	TTAA	2	8	471753	471760	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_012115	ACAA	2	8	482781	482788	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
121	NC_012115	TTCT	2	8	483554	483561	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
122	NC_012115	ATGT	2	8	485746	485753	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
123	NC_012115	TTAT	2	8	495069	495076	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_012115	TCTT	3	12	495664	495675	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
125	NC_012115	ATTT	2	8	509054	509061	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_012115	ATTT	2	8	509084	509091	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_012115	TTTC	2	8	512684	512691	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
128	NC_012115	AAAG	2	8	512800	512807	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
129	NC_012115	TTAA	2	8	513401	513408	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_012115	TTTA	2	8	518172	518179	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_012115	GGTA	2	8	526885	526892	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
132	NC_012115	ATTT	2	8	535773	535780	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_012115	AGTT	2	8	544762	544769	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
134	NC_012115	GTTA	2	8	544782	544789	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
135	NC_012115	AGTT	2	8	544791	544798	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
136	NC_012115	AGGA	2	8	544889	544896	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
137	NC_012115	AGTT	2	8	546997	547004	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
138	NC_012115	AATA	2	8	557842	557849	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_012115	AAAT	2	8	560754	560761	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_012115	CATT	2	8	560797	560804	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
141	NC_012115	GAAA	2	8	567409	567416	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
142	NC_012115	TATT	2	8	569978	569985	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_012115	ATTT	2	8	569997	570004	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_012115	ACAA	2	8	576512	576519	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
145	NC_012115	AGAC	2	8	576579	576586	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
146	NC_012115	CCAG	2	8	576807	576814	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
147	NC_012115	AAAG	2	8	576868	576875	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
148	NC_012115	ACTG	2	8	576933	576940	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
149	NC_012115	TAAA	2	8	577463	577470	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
150	NC_012115	GGTA	2	8	577644	577651	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
151	NC_012115	CAGA	2	8	578198	578205	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.