MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Neisseria gonorrhoeae NCCP11945 chromosome

Total Repeats: 6102

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_011035	ATT	2	6	1355441	1355446	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3502	NC_011035	GAA	2	6	1355514	1355519	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3503	NC_011035	GAC	2	6	1355551	1355556	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3504	NC_011035	TTG	2	6	1355563	1355568	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3505	NC_011035	T	7	7	1355570	1355576	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3506	NC_011035	AACCT	2	10	1355577	1355586	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
3507	NC_011035	ACC	2	6	1355639	1355644	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3508	NC_011035	ACTA	2	8	1355702	1355709	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
3509	NC_011035	CAT	2	6	1355761	1355766	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3510	NC_011035	CAT	2	6	1355770	1355775	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3511	NC_011035	T	8	8	1355796	1355803	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3512	NC_011035	TTC	2	6	1355812	1355817	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3513	NC_011035	TGG	2	6	1355818	1355823	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3514	NC_011035	TAA	2	6	1355824	1355829	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3515	NC_011035	CAG	2	6	1355830	1355835	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3516	NC_011035	TGC	2	6	1356584	1356589	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3517	NC_011035	CTTA	2	8	1356732	1356739	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
3518	NC_011035	TGC	2	6	1357904	1357909	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3519	NC_011035	GAA	2	6	1357937	1357942	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3520	NC_011035	TCA	2	6	1358324	1358329	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3521	NC_011035	CA	3	6	1358403	1358408	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3522	NC_011035	TAA	2	6	1358409	1358414	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3523	NC_011035	TGT	2	6	1358462	1358467	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3524	NC_011035	A	7	7	1358478	1358484	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3525	NC_011035	A	6	6	1358624	1358629	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3526	NC_011035	AAT	2	6	1358632	1358637	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3527	NC_011035	T	7	7	1358689	1358695	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3528	NC_011035	TTC	2	6	1358731	1358736	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3529	NC_011035	ATC	2	6	1358737	1358742	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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3531	NC_011035	TCT	2	6	1358812	1358817	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3532	NC_011035	ATA	2	6	1358837	1358842	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3533	NC_011035	GGAT	2	8	1359319	1359326	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
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3535	NC_011035	GAA	2	6	1360518	1360523	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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3539	NC_011035	GAA	2	6	1360883	1360888	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3540	NC_011035	T	8	8	1360892	1360899	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3541	NC_011035	ATG	2	6	1360907	1360912	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3542	NC_011035	TCA	2	6	1360952	1360957	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3543	NC_011035	TA	3	6	1361134	1361139	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3544	NC_011035	AAT	2	6	1361190	1361195	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3545	NC_011035	T	6	6	1361546	1361551	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3546	NC_011035	CAACC	2	10	1361552	1361561	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
3547	NC_011035	ATTG	2	8	1361772	1361779	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
3548	NC_011035	A	6	6	1361804	1361809	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3549	NC_011035	TAT	2	6	1361813	1361818	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3550	NC_011035	TCAAA	2	10	1361830	1361839	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
3551	NC_011035	TCCC	2	8	1362282	1362289	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
3552	NC_011035	AAT	2	6	1362376	1362381	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3553	NC_011035	GAA	2	6	1362444	1362449	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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3555	NC_011035	GTTT	2	8	1365843	1365850	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
3556	NC_011035	TGC	2	6	1366686	1366691	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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3558	NC_011035	ATC	2	6	1377475	1377480	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3559	NC_011035	CAAAT	2	10	1377499	1377508	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
3560	NC_011035	ATA	2	6	1377540	1377545	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3561	NC_011035	TGT	2	6	1377583	1377588	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3562	NC_011035	GGC	2	6	1377591	1377596	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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3564	NC_011035	TTA	2	6	1378929	1378934	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3565	NC_011035	A	7	7	1378964	1378970	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3569	NC_011035	CAAA	2	8	1383301	1383308	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
3570	NC_011035	ATCAA	2	10	1385826	1385835	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
3571	NC_011035	A	6	6	1385874	1385879	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3572	NC_011035	GAA	2	6	1391847	1391852	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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3574	NC_011035	T	7	7	1391932	1391938	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3580	NC_011035	GAT	2	6	1392095	1392100	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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3584	NC_011035	AAAT	2	8	1393731	1393738	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
3585	NC_011035	ATT	2	6	1393742	1393747	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3588	NC_011035	AAT	2	6	1397333	1397338	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3589	NC_011035	TTC	2	6	1397430	1397435	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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3591	NC_011035	CCTG	2	8	1399324	1399331	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
3592	NC_011035	AT	3	6	1399394	1399399	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3593	NC_011035	TA	3	6	1399409	1399414	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3594	NC_011035	CGC	2	6	1399445	1399450	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3595	NC_011035	A	7	7	1401472	1401478	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3596	NC_011035	T	7	7	1401499	1401505	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3597	NC_011035	CCCAAG	2	12	1401564	1401575	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
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3599	NC_011035	ATA	2	6	1401647	1401652	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3600	NC_011035	AAT	3	9	1401653	1401661	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3601	NC_011035	TAT	2	6	1401662	1401667	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3602	NC_011035	TTA	2	6	1403640	1403645	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3603	NC_011035	ATA	2	6	1404819	1404824	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3604	NC_011035	GTT	2	6	1404930	1404935	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3605	NC_011035	TAA	2	6	1404936	1404941	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3606	NC_011035	GGT	2	6	1404966	1404971	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3607	NC_011035	ATGA	2	8	1404978	1404985	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
3608	NC_011035	GTA	2	6	1405029	1405034	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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3610	NC_011035	GGA	2	6	1405980	1405985	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3611	NC_011035	GTG	2	6	1406834	1406839	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3612	NC_011035	GCAA	2	8	1407684	1407691	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
3613	NC_011035	CAAGC	2	10	1407773	1407782	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
3614	NC_011035	T	6	6	1407793	1407798	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3615	NC_011035	ACCC	2	8	1407799	1407806	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
3616	NC_011035	TCG	2	6	1407821	1407826	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3617	NC_011035	T	6	6	1407862	1407867	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3618	NC_011035	ATC	2	6	1407884	1407889	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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3620	NC_011035	CGG	2	6	1407934	1407939	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3621	NC_011035	T	6	6	1407940	1407945	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3622	NC_011035	TTG	2	6	1407956	1407961	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3623	NC_011035	GTT	2	6	1408015	1408020	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3624	NC_011035	TTG	2	6	1408023	1408028	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3625	NC_011035	TCG	2	6	1408071	1408076	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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3627	NC_011035	TGC	2	6	1408158	1408163	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3628	NC_011035	CGC	2	6	1408165	1408170	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3629	NC_011035	GCG	2	6	1408203	1408208	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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3631	NC_011035	GCGAT	2	10	1411097	1411106	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
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3902	NC_011035	TTG	2	6	1504883	1504888	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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3904	NC_011035	GTA	2	6	1506049	1506054	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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3951	NC_011035	AT	3	6	1528163	1528168	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3980	NC_011035	CG	3	6	1541942	1541947	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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3998	NC_011035	CTTC	2	8	1550012	1550019	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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4000	NC_011035	C	7	7	1550099	1550105	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding

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