MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Neisseria gonorrhoeae NCCP11945 chromosome

Total Repeats: 6102

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_011035	AC	3	6	398522	398527	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1002	NC_011035	CTG	2	6	398852	398857	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1003	NC_011035	T	6	6	399171	399176	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1004	NC_011035	TGA	2	6	399208	399213	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1005	NC_011035	TCT	2	6	399259	399264	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1006	NC_011035	CTTT	2	8	399284	399291	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
1007	NC_011035	T	6	6	399330	399335	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1008	NC_011035	TTG	2	6	399370	399375	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1009	NC_011035	ATCAT	2	10	399379	399388	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
1010	NC_011035	GAT	2	6	399422	399427	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1011	NC_011035	GGA	2	6	399483	399488	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1012	NC_011035	GCGG	2	8	399498	399505	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
1013	NC_011035	TAT	2	6	400417	400422	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1014	NC_011035	T	6	6	403827	403832	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1015	NC_011035	GAAT	2	8	403844	403851	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1016	NC_011035	AACA	2	8	404856	404863	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
1017	NC_011035	GGC	2	6	404889	404894	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1018	NC_011035	TTCGGA	2	12	404930	404941	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
1019	NC_011035	AAAT	2	8	406465	406472	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1020	NC_011035	T	6	6	406485	406490	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1021	NC_011035	GGC	2	6	406492	406497	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1022	NC_011035	TTA	2	6	406602	406607	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1023	NC_011035	GCC	2	6	408983	408988	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1024	NC_011035	CGA	2	6	409220	409225	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1025	NC_011035	TAT	2	6	409294	409299	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1026	NC_011035	TGA	2	6	409332	409337	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1027	NC_011035	TTG	2	6	410420	410425	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1028	NC_011035	CCCG	2	8	410444	410451	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
1029	NC_011035	GGC	2	6	410470	410475	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1030	NC_011035	TTTG	2	8	410487	410494	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
1031	NC_011035	CGCC	2	8	410543	410550	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
1032	NC_011035	GTT	2	6	412363	412368	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1033	NC_011035	AACA	2	8	412406	412413	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
1034	NC_011035	CGA	2	6	416658	416663	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1035	NC_011035	AGA	2	6	418427	418432	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1036	NC_011035	TTTTC	2	10	418447	418456	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
1037	NC_011035	AAC	2	6	419205	419210	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1038	NC_011035	ACC	2	6	421013	421018	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1039	NC_011035	AAACA	2	10	421024	421033	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
1040	NC_011035	CCG	2	6	421036	421041	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1041	NC_011035	T	6	6	421064	421069	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1042	NC_011035	ATG	2	6	421137	421142	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1043	NC_011035	AC	3	6	421148	421153	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1044	NC_011035	GAC	2	6	421156	421161	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1045	NC_011035	GCC	2	6	421171	421176	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1046	NC_011035	TGC	3	9	421230	421238	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1047	NC_011035	GAA	2	6	426225	426230	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1048	NC_011035	AGA	2	6	430270	430275	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1049	NC_011035	AACGC	25	125	430375	430499	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
1050	NC_011035	TTGT	2	8	430593	430600	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
1051	NC_011035	TAA	3	9	430636	430644	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1052	NC_011035	A	6	6	430643	430648	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1053	NC_011035	T	6	6	430649	430654	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1054	NC_011035	AAG	2	6	430659	430664	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1055	NC_011035	T	7	7	430675	430681	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1056	NC_011035	GTC	2	6	433347	433352	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1057	NC_011035	A	7	7	438168	438174	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1058	NC_011035	AGG	2	6	438232	438237	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1059	NC_011035	T	6	6	440582	440587	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1060	NC_011035	AGC	2	6	442107	442112	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1061	NC_011035	GCT	2	6	442124	442129	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1062	NC_011035	ATT	2	6	442685	442690	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1063	NC_011035	GTC	2	6	442723	442728	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1064	NC_011035	TTG	2	6	442753	442758	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1065	NC_011035	CAA	2	6	444205	444210	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1066	NC_011035	GTGTA	2	10	444297	444306	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
1067	NC_011035	AT	3	6	444308	444313	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1068	NC_011035	TAT	2	6	446413	446418	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1069	NC_011035	TGCCGT	2	12	449296	449307	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1070	NC_011035	TTG	2	6	449801	449806	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1071	NC_011035	GAT	2	6	449811	449816	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1072	NC_011035	T	6	6	450881	450886	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1073	NC_011035	CAAT	2	8	452111	452118	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
1074	NC_011035	GCC	2	6	452122	452127	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1075	NC_011035	GCC	2	6	453084	453089	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1076	NC_011035	AG	3	6	453109	453114	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1077	NC_011035	TAA	2	6	453205	453210	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1078	NC_011035	T	6	6	453927	453932	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1079	NC_011035	TGT	2	6	456228	456233	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1080	NC_011035	TGC	2	6	458818	458823	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1081	NC_011035	A	7	7	460241	460247	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1082	NC_011035	TGA	2	6	460261	460266	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1083	NC_011035	AAT	2	6	460269	460274	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1084	NC_011035	TA	3	6	460284	460289	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1085	NC_011035	A	6	6	460292	460297	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1086	NC_011035	CGG	2	6	460313	460318	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1087	NC_011035	TG	3	6	460346	460351	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1088	NC_011035	CGGGG	2	10	461724	461733	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
1089	NC_011035	AAT	2	6	461766	461771	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1090	NC_011035	AT	3	6	463199	463204	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1091	NC_011035	GAC	2	6	465095	465100	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1092	NC_011035	AAT	2	6	465134	465139	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1093	NC_011035	CCCG	2	8	465232	465239	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
1094	NC_011035	CG	3	6	465238	465243	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1095	NC_011035	GTT	2	6	465349	465354	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1096	NC_011035	GGC	2	6	465382	465387	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1097	NC_011035	CGGGG	2	10	465465	465474	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
1098	NC_011035	ACG	2	6	465477	465482	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1099	NC_011035	GTC	2	6	465528	465533	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1100	NC_011035	CGAAA	2	10	465542	465551	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
1101	NC_011035	A	7	7	468397	468403	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1102	NC_011035	TA	3	6	468443	468448	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1103	NC_011035	GTT	2	6	470006	470011	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1104	NC_011035	CAA	2	6	470022	470027	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1105	NC_011035	GGC	2	6	470059	470064	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1106	NC_011035	TGA	2	6	471331	471336	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1107	NC_011035	AG	3	6	471359	471364	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1108	NC_011035	TAT	2	6	471370	471375	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1109	NC_011035	TAT	2	6	471391	471396	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1110	NC_011035	AAATG	2	10	471433	471442	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
1111	NC_011035	AGC	2	6	472350	472355	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1112	NC_011035	GGC	2	6	472425	472430	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1113	NC_011035	GAC	2	6	472569	472574	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1114	NC_011035	TA	3	6	478463	478468	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1115	NC_011035	CGG	2	6	478792	478797	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1116	NC_011035	CCG	2	6	478811	478816	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1117	NC_011035	CGCC	2	8	478861	478868	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
1118	NC_011035	TG	3	6	478881	478886	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1119	NC_011035	TGT	2	6	478892	478897	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1120	NC_011035	TGA	2	6	478942	478947	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1121	NC_011035	A	7	7	478947	478953	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1122	NC_011035	GGCA	2	8	479001	479008	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
1123	NC_011035	CGC	2	6	479021	479026	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1124	NC_011035	TCTT	2	8	480394	480401	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
1125	NC_011035	GGC	2	6	480433	480438	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1126	NC_011035	CCG	2	6	481068	481073	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1127	NC_011035	GGC	2	6	483579	483584	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1128	NC_011035	TTGT	2	8	483624	483631	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
1129	NC_011035	ACG	2	6	483632	483637	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1130	NC_011035	AAAG	2	8	483656	483663	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
1131	NC_011035	ATC	2	6	483686	483691	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1132	NC_011035	TAT	2	6	485359	485364	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1133	NC_011035	GCC	2	6	485410	485415	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1134	NC_011035	CAA	2	6	485450	485455	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1135	NC_011035	GTT	2	6	486862	486867	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1136	NC_011035	T	7	7	487447	487453	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1137	NC_011035	TTA	2	6	488107	488112	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1270	NC_011035	CTTT	2	8	523415	523422	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
1271	NC_011035	TCA	2	6	523439	523444	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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1413	NC_011035	AACCG	2	10	569241	569250	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
1414	NC_011035	CGC	2	6	569310	569315	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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