MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Neisseria gonorrhoeae NCCP11945 chromosome

Total Repeats: 6102

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_011035	GAAA	2	8	164944	164951	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
502	NC_011035	A	6	6	167572	167577	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
503	NC_011035	AC	3	6	168312	168317	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
504	NC_011035	TCA	2	6	168343	168348	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
505	NC_011035	ATT	2	6	168400	168405	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
506	NC_011035	CCTTA	2	10	169137	169146	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
507	NC_011035	CCT	2	6	169733	169738	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
508	NC_011035	TTC	2	6	169766	169771	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
509	NC_011035	AAAT	2	8	169805	169812	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
510	NC_011035	CAA	2	6	169867	169872	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
511	NC_011035	T	6	6	169914	169919	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
512	NC_011035	T	6	6	169964	169969	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
513	NC_011035	A	7	7	170305	170311	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
514	NC_011035	GGA	2	6	170312	170317	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
515	NC_011035	AAAATC	2	12	170886	170897	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
516	NC_011035	TTGA	2	8	171780	171787	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
517	NC_011035	ATA	2	6	171834	171839	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
518	NC_011035	T	7	7	171868	171874	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
519	NC_011035	TTCAAA	2	12	171961	171972	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
520	NC_011035	TTC	2	6	172907	172912	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
521	NC_011035	ATAAC	2	10	172919	172928	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
522	NC_011035	GCC	2	6	172948	172953	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
523	NC_011035	TGTT	2	8	172954	172961	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
524	NC_011035	TTAA	2	8	174828	174835	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
525	NC_011035	TTGCC	2	10	174860	174869	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
526	NC_011035	A	6	6	174884	174889	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
527	NC_011035	T	6	6	175302	175307	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
528	NC_011035	GGC	2	6	176573	176578	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
529	NC_011035	AT	3	6	176858	176863	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
530	NC_011035	GCG	2	6	177586	177591	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
531	NC_011035	GGC	2	6	177609	177614	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
532	NC_011035	CGTGT	2	10	177639	177648	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
533	NC_011035	GCT	2	6	177675	177680	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
534	NC_011035	CCG	2	6	177688	177693	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
535	NC_011035	TTGAGG	2	12	177694	177705	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
536	NC_011035	GT	3	6	177749	177754	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
537	NC_011035	TG	3	6	177775	177780	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
538	NC_011035	GGC	2	6	177809	177814	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
539	NC_011035	CGG	2	6	177831	177836	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
540	NC_011035	GAATTG	2	12	177903	177914	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
541	NC_011035	AT	3	6	179303	179308	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
542	NC_011035	TG	3	6	179353	179358	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
543	NC_011035	GCT	2	6	180832	180837	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
544	NC_011035	GCGTG	2	10	181558	181567	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
545	NC_011035	TAAG	2	8	186210	186217	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
546	NC_011035	GGC	2	6	188218	188223	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
547	NC_011035	GAA	2	6	188244	188249	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
548	NC_011035	TAC	2	6	188286	188291	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
549	NC_011035	TTCCC	2	10	188312	188321	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
550	NC_011035	CCT	2	6	188374	188379	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
551	NC_011035	C	7	7	188405	188411	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
552	NC_011035	GCC	2	6	188437	188442	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
553	NC_011035	TGG	2	6	188915	188920	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
554	NC_011035	TAT	2	6	188967	188972	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
555	NC_011035	GGT	2	6	188985	188990	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
556	NC_011035	CAT	2	6	189367	189372	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
557	NC_011035	CTTT	2	8	189415	189422	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
558	NC_011035	CAA	2	6	189434	189439	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
559	NC_011035	ACG	2	6	189465	189470	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
560	NC_011035	TA	3	6	189481	189486	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
561	NC_011035	CTT	2	6	189528	189533	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
562	NC_011035	AT	3	6	189543	189548	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
563	NC_011035	A	6	6	190535	190540	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
564	NC_011035	T	6	6	190545	190550	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
565	NC_011035	TGT	2	6	190634	190639	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
566	NC_011035	AGT	2	6	190647	190652	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
567	NC_011035	AAC	2	6	190917	190922	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
568	NC_011035	TGA	2	6	190977	190982	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
569	NC_011035	T	6	6	191881	191886	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
570	NC_011035	ATT	2	6	195995	196000	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
571	NC_011035	CTGAAT	2	12	196037	196048	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
572	NC_011035	TAAA	2	8	196077	196084	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
573	NC_011035	CA	3	6	196098	196103	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
574	NC_011035	GTTTTT	2	12	197028	197039	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
575	NC_011035	GCC	2	6	197167	197172	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
576	NC_011035	TCA	2	6	197213	197218	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
577	NC_011035	A	6	6	197227	197232	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
578	NC_011035	CAGG	2	8	197244	197251	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
579	NC_011035	CCG	2	6	197319	197324	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
580	NC_011035	ATG	2	6	197469	197474	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
581	NC_011035	CAA	2	6	197534	197539	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
582	NC_011035	GAA	2	6	197548	197553	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
583	NC_011035	A	6	6	197552	197557	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
584	NC_011035	TCC	2	6	197617	197622	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
585	NC_011035	TTG	2	6	197650	197655	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
586	NC_011035	AGC	2	6	197679	197684	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
587	NC_011035	ACT	2	6	197740	197745	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
588	NC_011035	TAG	2	6	197750	197755	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
589	NC_011035	TTC	2	6	198481	198486	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
590	NC_011035	A	6	6	198530	198535	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
591	NC_011035	TGC	2	6	198538	198543	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
592	NC_011035	A	6	6	198620	198625	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
593	NC_011035	CAG	2	6	198693	198698	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
594	NC_011035	ATT	2	6	198728	198733	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
595	NC_011035	TGA	2	6	198754	198759	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
596	NC_011035	AT	3	6	198763	198768	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
597	NC_011035	TAA	2	6	198774	198779	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
598	NC_011035	TAAA	2	8	198790	198797	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
599	NC_011035	CCA	2	6	198800	198805	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
600	NC_011035	CGC	2	6	198882	198887	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
601	NC_011035	CTA	2	6	198909	198914	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
602	NC_011035	TTGT	2	8	199022	199029	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
603	NC_011035	GGA	2	6	199080	199085	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
604	NC_011035	AT	3	6	199123	199128	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
605	NC_011035	ATTC	2	8	199163	199170	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
606	NC_011035	TTA	2	6	199214	199219	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
607	NC_011035	T	6	6	201857	201862	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
608	NC_011035	TC	3	6	201868	201873	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
609	NC_011035	ATTTT	2	10	204218	204227	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
610	NC_011035	GAT	2	6	205759	205764	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
611	NC_011035	AAT	2	6	205784	205789	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
612	NC_011035	AAT	2	6	205793	205798	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
613	NC_011035	GGCGG	2	10	206809	206818	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
614	NC_011035	ATA	2	6	207508	207513	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
615	NC_011035	TCT	2	6	207520	207525	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
616	NC_011035	CGGG	2	8	207546	207553	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
617	NC_011035	TTC	2	6	207634	207639	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
618	NC_011035	TTC	2	6	207735	207740	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
619	NC_011035	AT	3	6	207925	207930	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
620	NC_011035	CGG	2	6	207935	207940	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
621	NC_011035	GTG	2	6	208032	208037	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
622	NC_011035	T	7	7	208149	208155	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
623	NC_011035	GT	3	6	209302	209307	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
624	NC_011035	TCG	2	6	210722	210727	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
625	NC_011035	TA	3	6	210754	210759	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
626	NC_011035	TTG	2	6	211735	211740	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
627	NC_011035	CG	3	6	212550	212555	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
628	NC_011035	TCT	2	6	212564	212569	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
629	NC_011035	GTT	2	6	212586	212591	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
630	NC_011035	CTT	2	6	212658	212663	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
631	NC_011035	GTT	2	6	212680	212685	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
632	NC_011035	CGG	2	6	216076	216081	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
633	NC_011035	GTC	2	6	216093	216098	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
634	NC_011035	AATA	2	8	217528	217535	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
635	NC_011035	TTC	2	6	217779	217784	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
636	NC_011035	CGC	2	6	217833	217838	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
637	NC_011035	GT	3	6	217842	217847	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
638	NC_011035	CAC	2	6	217869	217874	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
639	NC_011035	T	7	7	217895	217901	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
640	NC_011035	CAAT	2	8	218044	218051	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
641	NC_011035	AT	3	6	218050	218055	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
642	NC_011035	GTT	2	6	218063	218068	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
643	NC_011035	AT	3	6	218142	218147	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
644	NC_011035	AAAAT	2	10	218150	218159	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
645	NC_011035	TCAA	2	8	218165	218172	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
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647	NC_011035	A	6	6	218259	218264	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
648	NC_011035	ATCA	2	8	218291	218298	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
649	NC_011035	A	7	7	218316	218322	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
650	NC_011035	A	6	6	218336	218341	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
651	NC_011035	TTGA	2	8	218365	218372	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
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674	NC_011035	TCG	2	6	234109	234114	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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676	NC_011035	A	6	6	234195	234200	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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682	NC_011035	AT	3	6	239791	239796	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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688	NC_011035	TGT	2	6	246662	246667	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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761	NC_011035	AT	3	6	279888	279893	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
762	NC_011035	AT	3	6	279901	279906	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
763	NC_011035	AT	5	10	279998	280007	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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918	NC_011035	A	6	6	361272	361277	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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