MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Neisseria gonorrhoeae NCCP11945 chromosome

Total Repeats: 6102

< Previous12345678910111213Next >

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
6001	NC_011035	TGT	2	6	2187057	2187062	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6002	NC_011035	AAT	2	6	2187069	2187074	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6003	NC_011035	ACTT	2	8	2187098	2187105	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
6004	NC_011035	T	6	6	2187121	2187126	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6005	NC_011035	A	9	9	2187130	2187138	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6006	NC_011035	CAT	2	6	2187149	2187154	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6007	NC_011035	ATA	2	6	2187352	2187357	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6008	NC_011035	TAC	2	6	2187437	2187442	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6009	NC_011035	TTAC	2	8	2187471	2187478	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
6010	NC_011035	TA	3	6	2189552	2189557	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6011	NC_011035	TTAAAT	2	12	2189563	2189574	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6012	NC_011035	CGA	2	6	2189585	2189590	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6013	NC_011035	CA	3	6	2189682	2189687	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
6014	NC_011035	ATT	2	6	2189697	2189702	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6015	NC_011035	CCG	2	6	2190329	2190334	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6016	NC_011035	CACAC	2	10	2190360	2190369	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
6017	NC_011035	GT	3	6	2191502	2191507	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
6018	NC_011035	TAA	2	6	2191773	2191778	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6019	NC_011035	GTT	2	6	2191784	2191789	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6020	NC_011035	CAT	2	6	2191799	2191804	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6021	NC_011035	CGG	3	9	2191862	2191870	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6022	NC_011035	CCT	2	6	2191896	2191901	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6023	NC_011035	GCT	2	6	2191927	2191932	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6024	NC_011035	CGGG	2	8	2192022	2192029	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
6025	NC_011035	GGTA	2	8	2193890	2193897	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
6026	NC_011035	A	7	7	2194126	2194132	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6027	NC_011035	ATA	2	6	2194143	2194148	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6028	NC_011035	ATG	2	6	2196742	2196747	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6029	NC_011035	GTC	2	6	2198707	2198712	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6030	NC_011035	GAC	2	6	2198727	2198732	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6031	NC_011035	TATT	2	8	2198737	2198744	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
6032	NC_011035	CCGA	2	8	2198772	2198779	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
6033	NC_011035	ACT	2	6	2198783	2198788	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6034	NC_011035	T	6	6	2198804	2198809	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6035	NC_011035	ATT	2	6	2198810	2198815	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6036	NC_011035	CAAA	2	8	2198827	2198834	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
6037	NC_011035	CGG	2	6	2198953	2198958	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6038	NC_011035	TAA	2	6	2198992	2198997	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6039	NC_011035	AGT	2	6	2200270	2200275	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6040	NC_011035	CTG	2	6	2201656	2201661	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6041	NC_011035	TCTG	2	8	2201696	2201703	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
6042	NC_011035	CAT	2	6	2205541	2205546	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6043	NC_011035	GTTTG	2	10	2205963	2205972	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
6044	NC_011035	A	6	6	2206021	2206026	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6045	NC_011035	ATCC	2	8	2206029	2206036	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
6046	NC_011035	TAAAA	2	10	2206095	2206104	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
6047	NC_011035	TTTAT	2	10	2206107	2206116	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
6048	NC_011035	CGT	2	6	2207032	2207037	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6049	NC_011035	GGC	2	6	2209242	2209247	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6050	NC_011035	GCC	2	6	2209336	2209341	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6051	NC_011035	TTGCCA	2	12	2209409	2209420	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
6052	NC_011035	G	11	11	2209524	2209534	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
6053	NC_011035	AT	3	6	2209535	2209540	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6054	NC_011035	GC	3	6	2209542	2209547	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6055	NC_011035	CGA	2	6	2209556	2209561	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6056	NC_011035	G	16	16	2212397	2212412	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
6057	NC_011035	AT	3	6	2212414	2212419	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6058	NC_011035	GC	3	6	2212421	2212426	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6059	NC_011035	CGA	2	6	2212435	2212440	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6060	NC_011035	CGG	2	6	2214239	2214244	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6061	NC_011035	TGT	2	6	2214253	2214258	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6062	NC_011035	CGG	2	6	2214314	2214319	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6063	NC_011035	GCG	2	6	2215471	2215476	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6064	NC_011035	CG	3	6	2215501	2215506	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6065	NC_011035	AT	3	6	2216340	2216345	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6066	NC_011035	AT	3	6	2216352	2216357	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6067	NC_011035	T	6	6	2216372	2216377	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6068	NC_011035	TAA	2	6	2216383	2216388	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6069	NC_011035	GCA	2	6	2216440	2216445	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6070	NC_011035	T	11	11	2216503	2216513	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6071	NC_011035	CGG	2	6	2216936	2216941	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6072	NC_011035	GGC	2	6	2216944	2216949	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6073	NC_011035	GCA	2	6	2216976	2216981	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6074	NC_011035	T	6	6	2217851	2217856	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6075	NC_011035	T	6	6	2217859	2217864	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6076	NC_011035	GGT	2	6	2219489	2219494	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6077	NC_011035	CGG	2	6	2219514	2219519	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6078	NC_011035	GGT	2	6	2221481	2221486	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6079	NC_011035	GGAT	2	8	2221494	2221501	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
6080	NC_011035	AGC	2	6	2221543	2221548	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6081	NC_011035	GCT	2	6	2221562	2221567	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6082	NC_011035	GTTGG	2	10	2222521	2222530	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
6083	NC_011035	AG	3	6	2223931	2223936	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
6084	NC_011035	TTG	2	6	2224151	2224156	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6085	NC_011035	ATT	2	6	2224169	2224174	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6086	NC_011035	GTTT	2	8	2224185	2224192	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
6087	NC_011035	T	6	6	2224314	2224319	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6088	NC_011035	ATT	2	6	2224353	2224358	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6089	NC_011035	GGC	2	6	2224393	2224398	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6090	NC_011035	CGTG	2	8	2225143	2225150	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
6091	NC_011035	TGG	2	6	2226826	2226831	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6092	NC_011035	TAT	2	6	2226860	2226865	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6093	NC_011035	TG	3	6	2226883	2226888	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
6094	NC_011035	A	7	7	2226931	2226937	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6095	NC_011035	TCAG	2	8	2226970	2226977	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
6096	NC_011035	ATAA	2	8	2227182	2227189	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
6097	NC_011035	GGCG	2	8	2227773	2227780	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
6098	NC_011035	TGAG	2	8	2228488	2228495	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
6099	NC_011035	TGC	2	6	2229282	2229287	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6100	NC_011035	TCAA	2	8	2231958	2231965	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
6101	NC_011035	AGG	2	6	2231980	2231985	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6102	NC_011035	GCC	2	6	2232011	2232016	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding

< Previous12345678910111213Next >

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.