MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Neisseria gonorrhoeae NCCP11945 chromosome

Total Repeats: 6102

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_011035	GGA	2	6	1836387	1836392	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5002	NC_011035	TTCT	2	8	1836415	1836422	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
5003	NC_011035	TGA	2	6	1836497	1836502	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5004	NC_011035	T	6	6	1836535	1836540	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5005	NC_011035	ATTT	2	8	1836600	1836607	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
5006	NC_011035	A	6	6	1836619	1836624	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5007	NC_011035	TAT	2	6	1836629	1836634	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5008	NC_011035	ATT	2	6	1836651	1836656	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5009	NC_011035	TAA	2	6	1836670	1836675	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5010	NC_011035	GA	3	6	1836676	1836681	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5011	NC_011035	ATA	2	6	1836699	1836704	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5012	NC_011035	TAA	2	6	1836728	1836733	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5013	NC_011035	A	6	6	1836763	1836768	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5014	NC_011035	TA	3	6	1836824	1836829	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5015	NC_011035	CGG	3	9	1836881	1836889	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5016	NC_011035	T	6	6	1836952	1836957	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5017	NC_011035	TAAA	2	8	1836967	1836974	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
5018	NC_011035	AGAT	2	8	1838020	1838027	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
5019	NC_011035	GATTT	2	10	1838055	1838064	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
5020	NC_011035	CGGG	2	8	1838130	1838137	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
5021	NC_011035	GCG	2	6	1838138	1838143	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5022	NC_011035	GGC	2	6	1838238	1838243	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5023	NC_011035	ACT	2	6	1838290	1838295	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5024	NC_011035	AT	3	6	1838335	1838340	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5025	NC_011035	TGTT	2	8	1839060	1839067	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
5026	NC_011035	GTC	2	6	1840062	1840067	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5027	NC_011035	GCC	2	6	1843827	1843832	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5028	NC_011035	GCG	2	6	1843857	1843862	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5029	NC_011035	A	8	8	1843901	1843908	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5030	NC_011035	CGG	2	6	1844166	1844171	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5031	NC_011035	TTTA	2	8	1844189	1844196	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
5032	NC_011035	CGG	2	6	1844211	1844216	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5033	NC_011035	CATT	2	8	1845828	1845835	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
5034	NC_011035	CAT	2	6	1845877	1845882	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5035	NC_011035	TA	3	6	1846831	1846836	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5036	NC_011035	CAAA	2	8	1847148	1847155	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
5037	NC_011035	AC	3	6	1848051	1848056	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5038	NC_011035	GAC	2	6	1848059	1848064	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5039	NC_011035	A	6	6	1850257	1850262	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5040	NC_011035	GCCGT	2	10	1851818	1851827	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
5041	NC_011035	CTT	2	6	1851879	1851884	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5042	NC_011035	GCC	2	6	1851893	1851898	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5043	NC_011035	GGC	2	6	1851904	1851909	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5044	NC_011035	CCTT	2	8	1852021	1852028	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5045	NC_011035	GCC	2	6	1854372	1854377	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5046	NC_011035	AGA	2	6	1855017	1855022	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5047	NC_011035	CCGG	2	8	1855213	1855220	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5048	NC_011035	A	6	6	1855230	1855235	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5049	NC_011035	GGC	2	6	1855282	1855287	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5050	NC_011035	CGGGG	2	10	1855366	1855375	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
5051	NC_011035	GTT	2	6	1856844	1856849	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5052	NC_011035	CTT	2	6	1856863	1856868	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5053	NC_011035	ATT	4	12	1857030	1857041	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5054	NC_011035	CCGT	2	8	1857068	1857075	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
5055	NC_011035	ACAT	2	8	1857141	1857148	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
5056	NC_011035	ACCC	2	8	1857186	1857193	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
5057	NC_011035	CGCC	2	8	1858076	1858083	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
5058	NC_011035	GGC	2	6	1858086	1858091	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5059	NC_011035	GGC	2	6	1858101	1858106	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5060	NC_011035	CGGA	2	8	1858123	1858130	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
5061	NC_011035	GCC	2	6	1858132	1858137	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5062	NC_011035	A	6	6	1858146	1858151	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5063	NC_011035	CGG	2	6	1860516	1860521	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5064	NC_011035	CCGGC	2	10	1860554	1860563	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
5065	NC_011035	CCG	2	6	1860578	1860583	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5066	NC_011035	ACG	2	6	1860591	1860596	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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5068	NC_011035	TCAA	2	8	1860745	1860752	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
5069	NC_011035	TGAT	2	8	1860851	1860858	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
5070	NC_011035	CTG	2	6	1862705	1862710	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5071	NC_011035	CTTT	2	8	1862778	1862785	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
5072	NC_011035	CATA	2	8	1862790	1862797	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
5073	NC_011035	TTA	2	6	1862801	1862806	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5074	NC_011035	GCC	2	6	1865741	1865746	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5075	NC_011035	CCTG	2	8	1865765	1865772	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
5076	NC_011035	CGG	2	6	1865780	1865785	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5077	NC_011035	A	6	6	1865817	1865822	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5079	NC_011035	CGGCA	2	10	1874545	1874554	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
5080	NC_011035	CAA	2	6	1876374	1876379	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5081	NC_011035	A	6	6	1876378	1876383	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5082	NC_011035	T	6	6	1876410	1876415	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5083	NC_011035	ATT	2	6	1876425	1876430	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5084	NC_011035	A	6	6	1876441	1876446	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5085	NC_011035	CCTGC	2	10	1876472	1876481	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
5086	NC_011035	A	6	6	1878033	1878038	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5087	NC_011035	TCT	2	6	1878045	1878050	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5088	NC_011035	TAC	2	6	1878071	1878076	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5089	NC_011035	GT	4	8	1878115	1878122	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
5090	NC_011035	T	6	6	1878381	1878386	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5091	NC_011035	CA	3	6	1879709	1879714	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5092	NC_011035	AC	3	6	1880005	1880010	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5093	NC_011035	GCC	2	6	1880061	1880066	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5094	NC_011035	TG	3	6	1880089	1880094	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
5095	NC_011035	AGA	2	6	1880860	1880865	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5096	NC_011035	AAAG	2	8	1881845	1881852	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
5097	NC_011035	T	8	8	1881881	1881888	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5098	NC_011035	GAC	2	6	1881918	1881923	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5099	NC_011035	AAAAC	2	10	1881943	1881952	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
5100	NC_011035	AAT	2	6	1881953	1881958	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5101	NC_011035	AC	3	6	1881965	1881970	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5102	NC_011035	CCGA	2	8	1882015	1882022	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
5103	NC_011035	TGA	2	6	1882770	1882775	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5104	NC_011035	TAT	2	6	1882827	1882832	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5105	NC_011035	TCA	2	6	1882940	1882945	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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5107	NC_011035	ACA	2	6	1886081	1886086	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5108	NC_011035	TGC	2	6	1886126	1886131	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5109	NC_011035	TGG	2	6	1888009	1888014	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5110	NC_011035	TGA	2	6	1888051	1888056	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5111	NC_011035	TAAAA	2	10	1888062	1888071	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
5112	NC_011035	ATT	2	6	1888075	1888080	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5113	NC_011035	CTAAT	2	10	1889596	1889605	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
5114	NC_011035	AGCA	2	8	1889626	1889633	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
5115	NC_011035	A	7	7	1889680	1889686	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5116	NC_011035	CAC	2	6	1889706	1889711	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5117	NC_011035	GTA	2	6	1889739	1889744	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5118	NC_011035	ATT	2	6	1889770	1889775	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5119	NC_011035	AATTT	2	10	1889783	1889792	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
5120	NC_011035	TGG	2	6	1889899	1889904	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5121	NC_011035	TA	3	6	1889941	1889946	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5122	NC_011035	CCTG	2	8	1889961	1889968	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
5123	NC_011035	ATG	2	6	1890026	1890031	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5124	NC_011035	GTTATT	2	12	1890049	1890060	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
5125	NC_011035	ATA	2	6	1890068	1890073	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5126	NC_011035	T	6	6	1890088	1890093	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5127	NC_011035	AGC	2	6	1890141	1890146	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5128	NC_011035	ATA	2	6	1890485	1890490	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5129	NC_011035	TA	3	6	1890540	1890545	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5130	NC_011035	AAG	2	6	1890556	1890561	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5131	NC_011035	TTA	2	6	1891023	1891028	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5133	NC_011035	AGC	2	6	1891188	1891193	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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5261	NC_011035	TTGG	2	8	1951297	1951304	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
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