MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF chromosome

Total Repeats: 194

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_010718	AATTGA	2	12	10435	10446	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
2	NC_010718	TGAAAT	2	12	14743	14754	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
3	NC_010718	TTATAA	2	12	92304	92315	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_010718	TGCTTT	2	12	102001	102012	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
5	NC_010718	AATGAC	2	12	122279	122290	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
6	NC_010718	TTTAGA	2	12	126325	126336	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
7	NC_010718	AATTGA	2	12	135825	135836	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
8	NC_010718	TGAAAT	2	12	140133	140144	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
9	NC_010718	TAGTTG	2	12	154049	154060	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10	NC_010718	CTTGGA	2	12	162772	162783	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
11	NC_010718	AAATTT	2	12	166828	166839	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_010718	AAATAA	2	12	185408	185419	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_010718	TTTATT	2	12	185436	185447	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_010718	ATTTCA	2	12	191249	191260	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
15	NC_010718	ATTTAA	2	12	200565	200576	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_010718	AATTAT	2	12	200840	200851	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_010718	AAGCTT	2	12	211227	211238	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
18	NC_010718	AAATTT	2	12	232406	232417	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_010718	TTTTTA	2	12	253743	253754	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_010718	ATGATT	2	12	273829	273840	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
21	NC_010718	AAGTTA	2	12	281499	281510	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
22	NC_010718	GCCAAT	2	12	293057	293068	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_010718	TTTAAT	2	12	303400	303411	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_010718	AATTGA	2	12	312026	312037	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
25	NC_010718	TGAAAT	2	12	316081	316092	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
26	NC_010718	ATAATG	2	12	325884	325895	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
27	NC_010718	TCCTTG	2	12	325911	325922	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_010718	TAAAAA	2	12	340859	340870	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_010718	TAAAGC	2	12	355196	355207	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
30	NC_010718	ATAAAA	2	12	369786	369797	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_010718	GGTAAA	2	12	385349	385360	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
32	NC_010718	TTTTAT	2	12	392376	392387	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_010718	TTTATA	2	12	395344	395355	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_010718	ATCAAG	2	12	399277	399288	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
35	NC_010718	TATTTT	2	12	407569	407580	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_010718	TATTTC	2	12	411494	411505	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
37	NC_010718	TTTAAT	2	12	419395	419406	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_010718	CTATTT	2	12	448367	448378	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
39	NC_010718	ATTTCA	2	12	458543	458554	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
40	NC_010718	ATTTTA	2	12	468999	469010	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_010718	TAAAAA	2	12	469037	469048	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_010718	TAGAGG	2	12	526871	526882	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
43	NC_010718	CCGAAG	2	12	567866	567877	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
44	NC_010718	ATTTTT	2	12	613382	613393	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_010718	ACTGAT	2	12	614246	614257	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
46	NC_010718	GTGCTT	2	12	621104	621115	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
47	NC_010718	TAAAAT	2	12	632705	632716	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_010718	ATTTTA	2	12	641042	641053	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_010718	GTGTTT	2	12	647414	647425	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
50	NC_010718	CTTATA	2	12	657149	657160	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
51	NC_010718	AAAGGC	2	12	657199	657210	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
52	NC_010718	AGTAAT	2	12	682373	682384	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
53	NC_010718	CAAAAA	2	12	682707	682718	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
54	NC_010718	AAAATT	2	12	683252	683263	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_010718	AGAATT	2	12	695069	695080	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
56	NC_010718	CATTTT	2	12	739518	739529	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
57	NC_010718	CAATTC	2	12	746134	746145	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
58	NC_010718	CAAATT	2	12	762892	762903	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
59	NC_010718	AGGATA	2	12	797173	797184	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
60	NC_010718	AATATA	2	12	824656	824667	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_010718	ATATAG	2	12	855064	855075	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
62	NC_010718	TAATGC	2	12	868343	868354	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
63	NC_010718	TTGAAA	2	12	874827	874838	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
64	NC_010718	TTACAT	2	12	902385	902396	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
65	NC_010718	TTTATT	2	12	903497	903508	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_010718	ATCATA	2	12	912936	912947	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
67	NC_010718	CACTTT	2	12	925520	925531	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
68	NC_010718	AGTGAG	2	12	926073	926084	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
69	NC_010718	ATCATT	2	12	930836	930847	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
70	NC_010718	ATGTTG	2	12	983705	983716	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
71	NC_010718	TCACAT	2	12	986588	986599	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
72	NC_010718	AGGTAA	2	12	986820	986831	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
73	NC_010718	AGGGGA	2	12	994671	994682	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
74	NC_010718	TAAAAT	2	12	1005961	1005972	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_010718	TAGTTA	2	12	1013480	1013491	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
76	NC_010718	ATTTCA	2	12	1030631	1030642	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
77	NC_010718	GTAATT	2	12	1032928	1032939	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
78	NC_010718	CTTTTT	2	12	1052158	1052169	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
79	NC_010718	AAAAAT	2	12	1052631	1052642	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_010718	TAGTAT	2	12	1057471	1057482	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
81	NC_010718	ATAAAA	2	12	1065701	1065712	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_010718	TAAGTT	2	12	1105173	1105184	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
83	NC_010718	TTAATT	2	12	1106298	1106309	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_010718	GTTTAC	2	12	1107751	1107762	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
85	NC_010718	GAAAGG	2	12	1121419	1121430	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
86	NC_010718	CTGCTT	2	12	1124213	1124224	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
87	NC_010718	TGAAAA	2	12	1134141	1134152	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
88	NC_010718	TAAATA	2	12	1149931	1149942	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_010718	AAAGAA	2	12	1165706	1165717	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
90	NC_010718	ACAATA	2	12	1219948	1219959	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
91	NC_010718	AAATTA	2	12	1227976	1227987	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_010718	TAAATA	2	12	1279291	1279302	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_010718	GTATTT	2	12	1329251	1329262	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
94	NC_010718	CCCTCA	2	12	1499360	1499371	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
95	NC_010718	ATTTCA	2	12	1546159	1546170	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
96	NC_010718	AAATCA	2	12	1579231	1579242	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
97	NC_010718	TAACAC	2	12	1615373	1615384	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
98	NC_010718	AGCGTC	2	12	1638374	1638385	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
99	NC_010718	TGGTAA	2	12	1638589	1638600	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
100	NC_010718	TCATTT	2	12	1646088	1646099	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
101	NC_010718	TCAAAC	2	12	1647428	1647439	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
102	NC_010718	TTAATT	2	12	1666640	1666651	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_010718	TATAAA	2	12	1706560	1706571	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_010718	TAAAAA	2	12	1798755	1798766	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_010718	AATTTC	2	12	1801087	1801098	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
106	NC_010718	TTTTTG	2	12	1804898	1804909	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
107	NC_010718	TGCAAT	2	12	1821812	1821823	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
108	NC_010718	ATTTTA	2	12	1844618	1844629	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_010718	ATTTCA	2	12	1874259	1874270	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
110	NC_010718	GCTTCT	2	12	1896933	1896944	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
111	NC_010718	CTAATT	2	12	1927937	1927948	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
112	NC_010718	AATTTT	2	12	1953813	1953824	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_010718	ATAATT	2	12	1965900	1965911	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_010718	TAAATC	2	12	1995348	1995359	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
115	NC_010718	CAACAT	2	12	2014227	2014238	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
116	NC_010718	TTAAAT	2	12	2044783	2044794	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_010718	AAATTA	2	12	2053232	2053243	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_010718	GATTTA	2	12	2056193	2056204	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
119	NC_010718	TAAAAG	2	12	2056476	2056487	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
120	NC_010718	TAACAA	2	12	2093732	2093743	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
121	NC_010718	AATTTA	2	12	2116480	2116491	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_010718	ATCTTA	2	12	2142709	2142720	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
123	NC_010718	TTATTT	2	12	2162683	2162694	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_010718	AGGGAA	2	12	2180043	2180054	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
125	NC_010718	TAAAAA	2	12	2180753	2180764	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_010718	CTTCAA	2	12	2182027	2182038	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
127	NC_010718	AATAAA	2	12	2187933	2187944	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_010718	CAAAAG	2	12	2207946	2207957	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
129	NC_010718	TACAAA	2	12	2228675	2228686	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.