MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Nostoc punctiforme PCC 73102 plasmid pNPUN01

Total Repeats: 213

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_010631	ACTT	2	8	6182	6189	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
2	NC_010631	ATAA	2	8	6208	6215	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_010631	TGTT	2	8	8278	8285	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
4	NC_010631	TTTA	2	8	11839	11846	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_010631	AACT	2	8	12157	12164	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
6	NC_010631	AGTT	2	8	12190	12197	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
7	NC_010631	AGTT	2	8	12253	12260	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
8	NC_010631	ATTC	2	8	12542	12549	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
9	NC_010631	AGTA	2	8	12638	12645	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
10	NC_010631	TAAG	2	8	12664	12671	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
11	NC_010631	AACA	2	8	12697	12704	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
12	NC_010631	AAAT	2	8	13373	13380	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_010631	TGCC	2	8	21554	21561	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
14	NC_010631	ATTT	2	8	21728	21735	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_010631	AAAG	2	8	24037	24044	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
16	NC_010631	ATTA	2	8	24568	24575	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_010631	AAAT	2	8	24791	24798	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_010631	ATAG	2	8	24812	24819	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
19	NC_010631	TAAT	2	8	25003	25010	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_010631	AAAG	2	8	26449	26456	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
21	NC_010631	TGCT	2	8	27292	27299	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
22	NC_010631	ATTA	2	8	32213	32220	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_010631	GAAA	2	8	32836	32843	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
24	NC_010631	AAAT	2	8	32962	32969	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_010631	CGTT	2	8	33447	33454	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
26	NC_010631	ACAG	2	8	33625	33632	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
27	NC_010631	AGTC	2	8	35038	35045	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
28	NC_010631	TCTA	2	8	36693	36700	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
29	NC_010631	GATT	2	8	37251	37258	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
30	NC_010631	GTTC	2	8	46741	46748	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
31	NC_010631	CAGC	2	8	58021	58028	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
32	NC_010631	ATAA	2	8	58086	58093	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_010631	TATT	2	8	59349	59356	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_010631	TTAG	2	8	59398	59405	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
35	NC_010631	AATC	2	8	60120	60127	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
36	NC_010631	GGCG	2	8	60184	60191	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
37	NC_010631	ATTT	2	8	62280	62287	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_010631	CAAC	2	8	62488	62495	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
39	NC_010631	TGGA	2	8	63133	63140	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
40	NC_010631	CCCG	2	8	63423	63430	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
41	NC_010631	AATG	2	8	63432	63439	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
42	NC_010631	ACTG	2	8	63894	63901	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
43	NC_010631	CGTC	2	8	63970	63977	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
44	NC_010631	GATT	2	8	64047	64054	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
45	NC_010631	ACTT	2	8	66039	66046	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
46	NC_010631	GGTA	2	8	66048	66055	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
47	NC_010631	AACT	2	8	66095	66102	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
48	NC_010631	ATCA	2	8	66143	66150	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
49	NC_010631	ATCA	2	8	66275	66282	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
50	NC_010631	GTTA	2	8	67186	67193	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
51	NC_010631	TTCA	2	8	71352	71359	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
52	NC_010631	AAAC	2	8	71417	71424	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
53	NC_010631	CAAA	2	8	75097	75104	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
54	NC_010631	TAAA	2	8	81893	81900	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_010631	ATAA	2	8	82230	82237	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_010631	AAAT	2	8	84154	84161	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_010631	CTTT	2	8	84310	84317	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
58	NC_010631	TAAG	2	8	86641	86648	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
59	NC_010631	CTAG	2	8	91857	91864	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
60	NC_010631	ATTG	2	8	93182	93189	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
61	NC_010631	AAAG	2	8	93533	93540	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
62	NC_010631	GACT	2	8	93564	93571	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
63	NC_010631	GAAA	2	8	98032	98039	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
64	NC_010631	ATAA	2	8	98118	98125	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_010631	GGGT	2	8	98187	98194	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
66	NC_010631	TAAA	2	8	98358	98365	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_010631	ATTG	2	8	99036	99043	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
68	NC_010631	CATA	2	8	99091	99098	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
69	NC_010631	TACC	2	8	100032	100039	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
70	NC_010631	AAAT	2	8	104095	104102	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_010631	GGCG	2	8	107568	107575	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
72	NC_010631	TTAA	2	8	114438	114445	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_010631	AGAC	2	8	118252	118259	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
74	NC_010631	AAAC	2	8	118394	118401	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
75	NC_010631	AGCT	2	8	118445	118452	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
76	NC_010631	CATA	2	8	121732	121739	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
77	NC_010631	TATT	2	8	132251	132258	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_010631	AATA	2	8	135675	135682	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_010631	ATAA	2	8	135683	135690	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_010631	TAAA	2	8	138095	138102	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_010631	ACTA	2	8	138201	138208	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
82	NC_010631	ATTT	2	8	138251	138258	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_010631	TAAA	2	8	140523	140530	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_010631	TACC	2	8	145296	145303	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
85	NC_010631	ATCA	2	8	145327	145334	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
86	NC_010631	CTTT	2	8	145592	145599	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
87	NC_010631	AGTC	2	8	146418	146425	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
88	NC_010631	CAAA	2	8	146684	146691	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
89	NC_010631	TCAA	2	8	146692	146699	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
90	NC_010631	AGGT	2	8	146821	146828	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
91	NC_010631	CAAA	2	8	147044	147051	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
92	NC_010631	GGAA	2	8	147188	147195	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
93	NC_010631	AATT	2	8	147392	147399	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_010631	TATT	2	8	148114	148121	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_010631	AAAT	2	8	154459	154466	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_010631	AGCA	2	8	158336	158343	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
97	NC_010631	ATTT	2	8	160186	160193	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_010631	TAAA	2	8	163585	163592	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_010631	AGTC	2	8	170061	170068	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
100	NC_010631	AATT	2	8	170625	170632	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_010631	TGTT	2	8	170875	170882	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
102	NC_010631	GATT	2	8	170889	170896	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
103	NC_010631	ATTT	2	8	171080	171087	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_010631	ATAG	2	8	172076	172083	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
105	NC_010631	ATCA	2	8	172106	172113	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
106	NC_010631	AACT	2	8	172160	172167	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
107	NC_010631	TTGG	2	8	172617	172624	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
108	NC_010631	ACCA	2	8	172889	172896	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
109	NC_010631	TGAG	2	8	173349	173356	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
110	NC_010631	TGGT	2	8	173489	173496	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
111	NC_010631	TTAT	2	8	179349	179356	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_010631	CAAC	2	8	179483	179490	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
113	NC_010631	TTTG	2	8	179892	179899	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
114	NC_010631	TTAA	2	8	180510	180517	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_010631	ATGA	2	8	182797	182804	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
116	NC_010631	ATTT	2	8	188851	188858	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_010631	TAGT	2	8	188865	188872	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
118	NC_010631	TCAT	2	8	188973	188980	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
119	NC_010631	TATC	2	8	189633	189640	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
120	NC_010631	ATCA	2	8	189643	189650	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
121	NC_010631	CTCG	2	8	189776	189783	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
122	NC_010631	GGAT	2	8	189796	189803	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
123	NC_010631	CTGA	2	8	189819	189826	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
124	NC_010631	TGCT	2	8	190102	190109	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
125	NC_010631	TAAC	2	8	192812	192819	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
126	NC_010631	TGAT	2	8	193093	193100	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
127	NC_010631	AAAC	2	8	196344	196351	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
128	NC_010631	CGTT	2	8	196365	196372	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
129	NC_010631	GTAG	2	8	196427	196434	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
130	NC_010631	AAGC	2	8	196648	196655	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
131	NC_010631	TTGA	2	8	196755	196762	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
132	NC_010631	TAAT	2	8	197476	197483	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_010631	ATCA	2	8	205231	205238	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
134	NC_010631	CTGA	2	8	207765	207772	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
135	NC_010631	TTAA	2	8	215078	215085	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_010631	AATA	2	8	216131	216138	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_010631	CTAA	2	8	217129	217136	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
138	NC_010631	AAAC	2	8	217934	217941	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
139	NC_010631	AATA	2	8	217978	217985	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_010631	TCAA	2	8	219573	219580	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
141	NC_010631	TAAA	2	8	219683	219690	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_010631	ATTT	2	8	221934	221941	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_010631	AGCA	2	8	222646	222653	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
144	NC_010631	GTCA	2	8	223267	223274	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
145	NC_010631	CCAA	2	8	223550	223557	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
146	NC_010631	AGAA	2	8	223849	223856	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
147	NC_010631	CTTC	2	8	223870	223877	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
148	NC_010631	TCAT	2	8	223951	223958	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
149	NC_010631	TTGG	2	8	224470	224477	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
150	NC_010631	ATTT	2	8	224495	224502	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
151	NC_010631	ATAG	2	8	224591	224598	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
152	NC_010631	ACGA	2	8	227789	227796	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
153	NC_010631	TGTC	2	8	234448	234455	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
154	NC_010631	GCTT	2	8	236513	236520	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
155	NC_010631	TAAC	2	8	236524	236531	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
156	NC_010631	GAAG	2	8	237265	237272	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
157	NC_010631	TAAG	2	8	238770	238777	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
158	NC_010631	TCTT	2	8	239001	239008	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
159	NC_010631	AAAG	2	8	239031	239038	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
160	NC_010631	GTTT	2	8	239095	239102	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
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165	NC_010631	TAGC	2	8	244495	244502	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
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171	NC_010631	TTAA	2	8	257383	257390	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
172	NC_010631	ATCT	2	8	258916	258923	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
173	NC_010631	AATT	2	8	259136	259143	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
174	NC_010631	GATT	2	8	260105	260112	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
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177	NC_010631	AATT	2	8	260608	260615	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
178	NC_010631	CTTC	2	8	261558	261565	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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181	NC_010631	TCTT	2	8	271087	271094	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
182	NC_010631	CTCA	2	8	273705	273712	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
183	NC_010631	AATA	2	8	273846	273853	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
184	NC_010631	GCAA	2	8	285365	285372	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
185	NC_010631	AGCT	2	8	285504	285511	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
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190	NC_010631	TTAA	2	8	298511	298518	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
191	NC_010631	GGTT	2	8	299440	299447	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
192	NC_010631	TCTT	2	8	300087	300094	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
193	NC_010631	TGAG	2	8	304318	304325	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
194	NC_010631	CTAG	2	8	310925	310932	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
195	NC_010631	TTTA	2	8	312049	312056	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
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197	NC_010631	AAAG	2	8	315394	315401	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
198	NC_010631	ATTA	2	8	319786	319793	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
199	NC_010631	GATT	2	8	321018	321025	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
200	NC_010631	CAGA	2	8	321057	321064	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
201	NC_010631	ATTT	2	8	321352	321359	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
202	NC_010631	AGCT	2	8	325123	325130	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
203	NC_010631	ATTC	2	8	327539	327546	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
204	NC_010631	AAAC	2	8	327631	327638	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
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210	NC_010631	ATCA	2	8	352681	352688	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
211	NC_010631	TCTA	2	8	352701	352708	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
212	NC_010631	GTAT	2	8	353065	353072	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
213	NC_010631	ATTA	2	8	353157	353164	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.