MICAS: Microsatellite Analysis Server

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Nostoc punctiforme PCC 73102 chromosome

Total Repeats: 1732

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_010628	AAAAT	2	10	1745	1754	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_010628	GTAAA	2	10	4913	4922	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
3	NC_010628	TTCAG	2	10	18304	18313	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
4	NC_010628	AAAAT	2	10	25725	25734	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_010628	TTTAG	2	10	30345	30354	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
6	NC_010628	AAATT	2	10	36928	36937	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_010628	ACCTA	2	10	39644	39653	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
8	NC_010628	TTCCC	2	10	45335	45344	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
9	NC_010628	TCGCT	2	10	50714	50723	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
10	NC_010628	AAATT	2	10	50747	50756	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_010628	AAACT	2	10	55236	55245	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
12	NC_010628	AAATC	2	10	56226	56235	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
13	NC_010628	TTGTT	2	10	58320	58329	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
14	NC_010628	TATCT	2	10	74329	74338	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
15	NC_010628	TTTAA	2	10	74900	74909	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_010628	GTTAA	2	10	75041	75050	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
17	NC_010628	CAAGT	2	10	78804	78813	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
18	NC_010628	AGAGG	2	10	81595	81604	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
19	NC_010628	ATTAT	2	10	83074	83083	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_010628	GTTAT	2	10	87568	87577	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
21	NC_010628	GACTG	2	10	102744	102753	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
22	NC_010628	TAAAA	2	10	110937	110946	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_010628	TGGCA	2	10	118879	118888	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
24	NC_010628	CTACC	2	10	120014	120023	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
25	NC_010628	TTAAA	2	10	122169	122178	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_010628	TGTGG	2	10	124162	124171	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
27	NC_010628	AAATA	2	10	125151	125160	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_010628	TAAGG	2	10	128694	128703	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
29	NC_010628	CCTAG	2	10	133246	133255	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
30	NC_010628	AATTC	2	10	133305	133314	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
31	NC_010628	TTAAG	2	10	137512	137521	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
32	NC_010628	TCCTT	2	10	147851	147860	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
33	NC_010628	CTAAA	2	10	148124	148133	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
34	NC_010628	ACCAC	2	10	149674	149683	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
35	NC_010628	AAGAT	2	10	153880	153889	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
36	NC_010628	AAACT	2	10	158255	158264	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
37	NC_010628	GCAGC	2	10	160251	160260	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
38	NC_010628	ATTTT	2	10	160918	160927	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_010628	CCATT	2	10	162152	162161	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
40	NC_010628	ACTCA	2	10	178282	178291	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
41	NC_010628	GTACT	2	10	181746	181755	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
42	NC_010628	GAAAT	2	10	185208	185217	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
43	NC_010628	CCTAA	2	10	186646	186655	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
44	NC_010628	TCCCT	2	10	187179	187188	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
45	NC_010628	TAGTT	2	10	188888	188897	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
46	NC_010628	TATTT	2	10	197205	197214	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_010628	TGATT	2	10	197312	197321	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
48	NC_010628	AAAAT	2	10	199646	199655	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_010628	ACTAA	2	10	205722	205731	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
50	NC_010628	TGCTT	2	10	207182	207191	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
51	NC_010628	CAATT	2	10	209780	209789	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
52	NC_010628	AGCAT	2	10	212226	212235	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
53	NC_010628	TAAAA	2	10	225528	225537	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_010628	AACCG	2	10	226071	226080	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
55	NC_010628	AATAT	2	10	226177	226186	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_010628	AGAGC	2	10	230908	230917	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
57	NC_010628	AGTGA	2	10	237435	237444	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
58	NC_010628	TTCTG	2	10	243596	243605	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
59	NC_010628	GGTTG	2	10	245744	245753	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
60	NC_010628	ATTTT	2	10	247101	247110	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_010628	ATTAA	2	10	248820	248829	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_010628	GGATT	2	10	249692	249701	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
63	NC_010628	GCTTT	2	10	256522	256531	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
64	NC_010628	TGGGG	2	10	256686	256695	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
65	NC_010628	CCTAT	2	10	258275	258284	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
66	NC_010628	ATCTA	2	10	259928	259937	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
67	NC_010628	TAATT	2	10	262929	262938	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_010628	GTTAG	2	10	263960	263969	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
69	NC_010628	TAGCG	2	10	274066	274075	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
70	NC_010628	TGAAT	2	10	274371	274380	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
71	NC_010628	TACCC	2	10	274414	274423	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
72	NC_010628	CGCTA	2	10	277557	277566	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
73	NC_010628	AAATA	2	10	277950	277959	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_010628	TTAAA	2	10	281355	281364	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_010628	AAACT	2	10	282579	282588	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
76	NC_010628	CGCTA	2	10	285210	285219	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
77	NC_010628	AACCC	2	10	288528	288537	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
78	NC_010628	TAAAA	2	10	288827	288836	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_010628	AGTTT	2	10	292869	292878	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
80	NC_010628	TTAGT	2	10	294804	294813	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
81	NC_010628	ATAAA	2	10	296991	297000	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_010628	TTAAA	2	10	298054	298063	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_010628	AGATT	2	10	299420	299429	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
84	NC_010628	TTATT	2	10	300561	300570	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_010628	TAAGT	2	10	300625	300634	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
86	NC_010628	CAGAG	2	10	305307	305316	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
87	NC_010628	TGAAA	2	10	307324	307333	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
88	NC_010628	AAAGG	2	10	309941	309950	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
89	NC_010628	TCGCT	2	10	312324	312333	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
90	NC_010628	TAGTT	2	10	319713	319722	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
91	NC_010628	AGTTT	2	10	323417	323426	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
92	NC_010628	GAAAT	2	10	324088	324097	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
93	NC_010628	ATTAT	2	10	329322	329331	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_010628	ATTTT	2	10	329996	330005	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_010628	TAATA	2	10	347334	347343	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_010628	GATTG	2	10	351290	351299	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
97	NC_010628	ATATC	2	10	364220	364229	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
98	NC_010628	TTTGT	2	10	367370	367379	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
99	NC_010628	CGTTA	2	10	369513	369522	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
100	NC_010628	TCAAA	2	10	371434	371443	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
101	NC_010628	AATTT	2	10	384726	384735	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_010628	AAAAC	2	10	385082	385091	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
103	NC_010628	TTTAA	2	10	397370	397379	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_010628	TTGGA	2	10	398009	398018	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
105	NC_010628	TAATT	2	10	402156	402165	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_010628	ATTAA	2	10	402216	402225	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_010628	CTTTT	2	10	403026	403035	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
108	NC_010628	GTTTT	2	10	406024	406033	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
109	NC_010628	AAATA	2	10	408570	408579	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_010628	TTTTA	2	10	411232	411241	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_010628	TAAAA	2	10	411370	411379	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_010628	AACCG	2	10	420279	420288	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
113	NC_010628	AAATT	2	10	420621	420630	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_010628	TTTTA	2	10	434738	434747	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_010628	CAAAA	2	10	435983	435992	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
116	NC_010628	TTCGG	2	10	451959	451968	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
117	NC_010628	ATTTT	2	10	451981	451990	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_010628	TAAAG	2	10	452465	452474	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
119	NC_010628	GTAGG	2	10	455632	455641	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
120	NC_010628	ATTGA	2	10	466852	466861	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
121	NC_010628	TACTA	2	10	472893	472902	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
122	NC_010628	TTAAG	2	10	478573	478582	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
123	NC_010628	GATTT	2	10	482249	482258	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
124	NC_010628	AACTG	2	10	482339	482348	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
125	NC_010628	TGCAA	2	10	490876	490885	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
126	NC_010628	TGAGG	2	10	492902	492911	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
127	NC_010628	ATCAA	2	10	493631	493640	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
128	NC_010628	AAAAT	2	10	493975	493984	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_010628	ATGTA	2	10	494696	494705	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
130	NC_010628	ATTTG	2	10	496993	497002	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
131	NC_010628	TTATG	2	10	507825	507834	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
132	NC_010628	TTCTT	2	10	512701	512710	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
133	NC_010628	CTTCA	2	10	519112	519121	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
134	NC_010628	TTTGT	2	10	519159	519168	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
135	NC_010628	AATTC	2	10	519571	519580	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
136	NC_010628	CTCAA	2	10	527691	527700	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
137	NC_010628	AAATC	2	10	532307	532316	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
138	NC_010628	TCAAC	2	10	532393	532402	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
139	NC_010628	TGGTG	3	15	545736	545750	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
140	NC_010628	ATTTG	2	10	548476	548485	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
141	NC_010628	CTCAG	2	10	550478	550487	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
142	NC_010628	TAAGT	2	10	550593	550602	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
143	NC_010628	ATACA	2	10	555417	555426	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
144	NC_010628	AGAGA	2	10	557924	557933	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
145	NC_010628	AGCGA	2	10	560733	560742	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
146	NC_010628	AAGAA	2	10	567356	567365	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
147	NC_010628	TTCTT	2	10	571553	571562	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
148	NC_010628	CTATT	2	10	575577	575586	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
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182	NC_010628	CCCAG	2	10	711143	711152	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
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194	NC_010628	GATCG	2	10	751550	751559	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
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281	NC_010628	TTCAA	2	10	1264111	1264120	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
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285	NC_010628	CTTAA	2	10	1272458	1272467	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
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287	NC_010628	CTACC	2	10	1279130	1279139	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
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473	NC_010628	GTATC	2	10	2122439	2122448	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
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488	NC_010628	TTTGA	2	10	2193708	2193717	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
489	NC_010628	TTTTA	2	10	2194156	2194165	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
490	NC_010628	TAATT	2	10	2227345	2227354	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
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492	NC_010628	TACTC	2	10	2260125	2260134	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
493	NC_010628	CTTTT	2	10	2261586	2261595	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
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500	NC_010628	AATTT	2	10	2298519	2298528	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding

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