MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Non-Coding Repeats of Nitrosopumilus maritimus SCM1 chromosome

Total Repeats: 262

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_010085	CT	3	6	89	94	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
2	NC_010085	GT	3	6	136	141	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3	NC_010085	AT	3	6	8549	8554	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_010085	TA	3	6	9327	9332	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_010085	TC	3	6	22494	22499	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
6	NC_010085	AC	3	6	23615	23620	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
7	NC_010085	TA	3	6	26744	26749	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_010085	CT	3	6	59682	59687	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
9	NC_010085	AT	3	6	78855	78860	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_010085	GT	3	6	88043	88048	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
11	NC_010085	TA	3	6	96602	96607	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_010085	AT	3	6	101482	101487	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_010085	TA	3	6	102803	102808	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_010085	AT	3	6	116287	116292	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_010085	TA	3	6	120756	120761	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_010085	CA	3	6	120796	120801	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
17	NC_010085	TG	3	6	120828	120833	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
18	NC_010085	TA	3	6	123428	123433	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_010085	TC	3	6	127185	127190	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
20	NC_010085	CT	3	6	139757	139762	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
21	NC_010085	AT	3	6	141526	141531	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_010085	TA	3	6	152874	152879	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_010085	AT	3	6	170275	170280	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_010085	AT	3	6	174797	174802	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_010085	TA	3	6	174994	174999	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_010085	TA	3	6	188185	188190	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_010085	AT	3	6	203712	203717	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_010085	TC	3	6	206396	206401	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
29	NC_010085	GA	3	6	209492	209497	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
30	NC_010085	TG	3	6	210772	210777	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
31	NC_010085	CT	4	8	210803	210810	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
32	NC_010085	TG	3	6	211856	211861	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
33	NC_010085	TC	3	6	222859	222864	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
34	NC_010085	AT	3	6	224814	224819	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_010085	AT	4	8	227550	227557	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_010085	AT	3	6	236012	236017	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_010085	GA	3	6	252709	252714	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
38	NC_010085	TA	3	6	272254	272259	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_010085	TC	3	6	281547	281552	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
40	NC_010085	TA	3	6	300426	300431	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_010085	AT	4	8	309166	309173	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_010085	TG	3	6	309201	309206	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
43	NC_010085	TG	3	6	328365	328370	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
44	NC_010085	AT	3	6	328724	328729	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_010085	GT	3	6	328814	328819	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
46	NC_010085	GA	3	6	329477	329482	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
47	NC_010085	CT	3	6	347128	347133	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
48	NC_010085	AT	3	6	347213	347218	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_010085	TA	3	6	359550	359555	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_010085	GC	4	8	366417	366424	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
51	NC_010085	GT	3	6	383499	383504	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
52	NC_010085	TA	3	6	414781	414786	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_010085	TG	3	6	419998	420003	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
54	NC_010085	TA	3	6	430835	430840	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_010085	GA	3	6	432759	432764	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
56	NC_010085	TA	3	6	432785	432790	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_010085	TA	3	6	432880	432885	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_010085	TA	3	6	434567	434572	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_010085	TA	3	6	439771	439776	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_010085	CT	3	6	440898	440903	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
61	NC_010085	AT	3	6	452153	452158	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_010085	TC	3	6	454378	454383	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
63	NC_010085	CT	3	6	454408	454413	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
64	NC_010085	GT	3	6	459310	459315	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
65	NC_010085	TA	4	8	463305	463312	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_010085	GT	3	6	463341	463346	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
67	NC_010085	GT	3	6	470177	470182	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
68	NC_010085	AG	3	6	482577	482582	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
69	NC_010085	AT	3	6	488124	488129	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_010085	AT	3	6	488156	488161	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_010085	TC	3	6	496578	496583	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
72	NC_010085	TC	3	6	500654	500659	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
73	NC_010085	CA	3	6	504296	504301	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
74	NC_010085	AT	3	6	533468	533473	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_010085	TC	3	6	534218	534223	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
76	NC_010085	TG	3	6	534268	534273	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
77	NC_010085	TG	3	6	537232	537237	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
78	NC_010085	CG	3	6	537339	537344	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
79	NC_010085	TA	3	6	539116	539121	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_010085	TA	3	6	550901	550906	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_010085	TG	3	6	569387	569392	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
82	NC_010085	GT	3	6	570396	570401	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
83	NC_010085	TG	3	6	570571	570576	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
84	NC_010085	TG	3	6	580242	580247	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
85	NC_010085	GA	3	6	580280	580285	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
86	NC_010085	GA	4	8	582763	582770	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
87	NC_010085	CA	3	6	588070	588075	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
88	NC_010085	AT	3	6	630009	630014	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_010085	AC	3	6	630626	630631	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
90	NC_010085	TA	3	6	630721	630726	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_010085	TC	3	6	630896	630901	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
92	NC_010085	CT	3	6	630985	630990	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
93	NC_010085	CT	3	6	631065	631070	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
94	NC_010085	AC	3	6	639532	639537	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
95	NC_010085	TC	3	6	647882	647887	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
96	NC_010085	TC	3	6	655766	655771	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
97	NC_010085	AT	3	6	656754	656759	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_010085	AT	3	6	671544	671549	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_010085	AT	3	6	673307	673312	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_010085	TC	3	6	689278	689283	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
101	NC_010085	TC	3	6	690265	690270	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
102	NC_010085	AG	4	8	691617	691624	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
103	NC_010085	TG	3	6	703799	703804	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
104	NC_010085	CA	3	6	703820	703825	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
105	NC_010085	AT	3	6	704391	704396	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_010085	TC	3	6	718188	718193	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
107	NC_010085	TC	3	6	728945	728950	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
108	NC_010085	AT	3	6	734083	734088	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_010085	CT	3	6	745442	745447	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
110	NC_010085	TC	3	6	753117	753122	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
111	NC_010085	CG	3	6	753984	753989	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
112	NC_010085	GT	3	6	754071	754076	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
113	NC_010085	GA	3	6	785304	785309	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
114	NC_010085	TG	3	6	787729	787734	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
115	NC_010085	AC	3	6	787771	787776	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
116	NC_010085	AT	3	6	787824	787829	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_010085	TA	3	6	790802	790807	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_010085	GA	3	6	791088	791093	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
119	NC_010085	GA	3	6	792629	792634	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
120	NC_010085	TA	3	6	793425	793430	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_010085	CA	4	8	794711	794718	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
122	NC_010085	TC	4	8	801956	801963	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
123	NC_010085	AG	3	6	801994	801999	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
124	NC_010085	AC	3	6	821276	821281	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
125	NC_010085	AG	3	6	823472	823477	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
126	NC_010085	TA	3	6	850676	850681	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_010085	TA	3	6	855076	855081	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_010085	GA	3	6	856405	856410	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
129	NC_010085	AC	3	6	863127	863132	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
130	NC_010085	TA	3	6	867542	867547	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_010085	TG	3	6	868473	868478	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
132	NC_010085	AT	3	6	869625	869630	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_010085	AG	3	6	870781	870786	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
134	NC_010085	TC	3	6	885206	885211	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
135	NC_010085	AT	3	6	885245	885250	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_010085	GT	3	6	886499	886504	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
137	NC_010085	AC	3	6	888117	888122	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
138	NC_010085	AC	3	6	890357	890362	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
139	NC_010085	AG	3	6	890446	890451	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
140	NC_010085	AG	3	6	894072	894077	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
141	NC_010085	AC	3	6	894884	894889	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
142	NC_010085	GA	3	6	895632	895637	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
143	NC_010085	TC	3	6	896043	896048	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
144	NC_010085	GT	3	6	896372	896377	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
145	NC_010085	CG	3	6	896401	896406	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
146	NC_010085	TC	3	6	896780	896785	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
147	NC_010085	AG	3	6	899881	899886	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
148	NC_010085	AC	3	6	905823	905828	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
149	NC_010085	GA	3	6	906390	906395	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
150	NC_010085	TC	3	6	945722	945727	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
151	NC_010085	AG	3	6	974878	974883	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
152	NC_010085	TA	3	6	981866	981871	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
153	NC_010085	AT	3	6	998073	998078	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.