MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Nitrosopumilus maritimus SCM1 chromosome

Total Repeats: 3847

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_010085	TAT	2	6	1506062	1506067	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3502	NC_010085	ATTT	2	8	1506079	1506086	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
3503	NC_010085	T	8	8	1507863	1507870	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3504	NC_010085	ATG	2	6	1507875	1507880	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3505	NC_010085	TTTA	2	8	1507889	1507896	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
3506	NC_010085	CAA	2	6	1508784	1508789	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3507	NC_010085	ATGA	2	8	1510338	1510345	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
3508	NC_010085	GAA	2	6	1510352	1510357	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3509	NC_010085	TAA	2	6	1515615	1515620	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3510	NC_010085	TAA	2	6	1515634	1515639	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3511	NC_010085	ATTA	2	8	1515641	1515648	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3512	NC_010085	TAAT	2	8	1515663	1515670	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3513	NC_010085	AAT	2	6	1516069	1516074	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3514	NC_010085	AAG	2	6	1516094	1516099	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3515	NC_010085	TAT	2	6	1516110	1516115	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3516	NC_010085	TAG	2	6	1516147	1516152	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3517	NC_010085	TAG	2	6	1516191	1516196	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3518	NC_010085	T	6	6	1516581	1516586	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3519	NC_010085	GT	3	6	1516588	1516593	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3520	NC_010085	ATT	2	6	1516795	1516800	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3521	NC_010085	ATCA	2	8	1516807	1516814	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
3522	NC_010085	AAAT	2	8	1516838	1516845	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
3523	NC_010085	AAAT	2	8	1516856	1516863	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
3524	NC_010085	T	6	6	1518182	1518187	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3525	NC_010085	TTG	2	6	1518257	1518262	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3526	NC_010085	ATT	2	6	1518263	1518268	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3527	NC_010085	ATC	2	6	1518277	1518282	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3528	NC_010085	A	7	7	1518303	1518309	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3529	NC_010085	AGATA	2	10	1518333	1518342	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
3530	NC_010085	A	7	7	1518348	1518354	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3531	NC_010085	AAC	2	6	1518364	1518369	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3532	NC_010085	GGA	2	6	1518420	1518425	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3533	NC_010085	TG	3	6	1519411	1519416	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3534	NC_010085	CTA	2	6	1519858	1519863	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3535	NC_010085	TTAAC	2	10	1519888	1519897	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
3536	NC_010085	ACTA	2	8	1519905	1519912	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
3537	NC_010085	TGAC	2	8	1519939	1519946	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
3538	NC_010085	ATTGTG	2	12	1519966	1519977	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3539	NC_010085	T	6	6	1520043	1520048	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3540	NC_010085	ATT	2	6	1520050	1520055	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3541	NC_010085	T	6	6	1520054	1520059	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3542	NC_010085	ATA	2	6	1520060	1520065	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3543	NC_010085	AAAAT	2	10	1520103	1520112	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
3544	NC_010085	AAT	2	6	1522393	1522398	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3545	NC_010085	T	6	6	1523000	1523005	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3546	NC_010085	T	6	6	1523085	1523090	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3547	NC_010085	T	7	7	1523675	1523681	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3548	NC_010085	AATT	2	8	1523685	1523692	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3549	NC_010085	A	6	6	1523700	1523705	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3550	NC_010085	TTG	2	6	1523746	1523751	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3551	NC_010085	T	6	6	1524795	1524800	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3552	NC_010085	GATTT	2	10	1524802	1524811	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
3553	NC_010085	TAA	2	6	1524830	1524835	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3554	NC_010085	A	6	6	1524834	1524839	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3555	NC_010085	TA	3	6	1524848	1524853	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3556	NC_010085	TAA	2	6	1524871	1524876	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3557	NC_010085	AAT	2	6	1524907	1524912	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3558	NC_010085	ATT	2	6	1524917	1524922	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3559	NC_010085	ATT	2	6	1524929	1524934	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3560	NC_010085	CA	3	6	1525081	1525086	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3561	NC_010085	ATA	2	6	1525101	1525106	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3562	NC_010085	AAAAG	2	10	1525107	1525116	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
3563	NC_010085	TA	3	6	1526565	1526570	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3564	NC_010085	CAC	2	6	1526599	1526604	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3565	NC_010085	T	7	7	1526626	1526632	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3566	NC_010085	T	6	6	1526668	1526673	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3567	NC_010085	A	7	7	1526683	1526689	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3568	NC_010085	AAG	2	6	1526730	1526735	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3569	NC_010085	ACA	2	6	1528419	1528424	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3570	NC_010085	CAT	2	6	1528497	1528502	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3571	NC_010085	A	6	6	1528514	1528519	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3572	NC_010085	A	7	7	1528545	1528551	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3573	NC_010085	AAT	2	6	1528559	1528564	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3574	NC_010085	TAAAA	2	10	1528598	1528607	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
3575	NC_010085	ACA	2	6	1528614	1528619	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3576	NC_010085	AT	3	6	1528642	1528647	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3577	NC_010085	T	6	6	1528654	1528659	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3578	NC_010085	TGT	2	6	1528686	1528691	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3579	NC_010085	GCA	2	6	1528719	1528724	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3580	NC_010085	AT	3	6	1528754	1528759	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3581	NC_010085	T	6	6	1528804	1528809	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3582	NC_010085	T	7	7	1528812	1528818	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3583	NC_010085	A	7	7	1528858	1528864	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3584	NC_010085	T	6	6	1528888	1528893	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3585	NC_010085	TAT	2	6	1528955	1528960	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3586	NC_010085	ACAA	2	8	1528964	1528971	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
3587	NC_010085	ATT	2	6	1528977	1528982	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3588	NC_010085	A	6	6	1528983	1528988	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3589	NC_010085	ATTG	2	8	1529731	1529738	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
3590	NC_010085	ATG	2	6	1529754	1529759	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3591	NC_010085	TAGAT	2	10	1529764	1529773	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
3592	NC_010085	A	6	6	1529807	1529812	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3593	NC_010085	AAC	2	6	1529826	1529831	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3594	NC_010085	A	6	6	1529874	1529879	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3595	NC_010085	A	6	6	1529889	1529894	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3596	NC_010085	A	7	7	1529944	1529950	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3597	NC_010085	AAT	2	6	1529964	1529969	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3598	NC_010085	A	6	6	1529976	1529981	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3599	NC_010085	CTA	2	6	1529985	1529990	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3600	NC_010085	AGT	2	6	1531650	1531655	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3601	NC_010085	AATA	2	8	1531678	1531685	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
3602	NC_010085	TTTA	2	8	1531691	1531698	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
3603	NC_010085	CTAA	2	8	1531728	1531735	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
3604	NC_010085	ATTT	2	8	1533435	1533442	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
3605	NC_010085	T	6	6	1533440	1533445	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3606	NC_010085	TAG	2	6	1533447	1533452	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3607	NC_010085	A	6	6	1533457	1533462	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3608	NC_010085	TGT	3	9	1533480	1533488	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3609	NC_010085	ACA	2	6	1533511	1533516	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3610	NC_010085	AACA	3	12	1533513	1533524	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
3611	NC_010085	ATTAG	2	10	1533537	1533546	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
3612	NC_010085	CAT	2	6	1534351	1534356	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3613	NC_010085	T	7	7	1534446	1534452	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3614	NC_010085	ATT	2	6	1534470	1534475	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3615	NC_010085	GAA	2	6	1534512	1534517	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3616	NC_010085	AATT	2	8	1534935	1534942	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3617	NC_010085	GTT	2	6	1534955	1534960	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3618	NC_010085	CTA	2	6	1534976	1534981	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3619	NC_010085	T	6	6	1534982	1534987	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3620	NC_010085	TAAT	2	8	1538403	1538410	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3621	NC_010085	ATG	2	6	1538506	1538511	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3622	NC_010085	ATT	2	6	1538598	1538603	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3623	NC_010085	AGA	2	6	1538674	1538679	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3624	NC_010085	CAT	2	6	1538689	1538694	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3625	NC_010085	GATA	2	8	1538701	1538708	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
3626	NC_010085	T	7	7	1538797	1538803	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3627	NC_010085	A	6	6	1538872	1538877	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3628	NC_010085	ATTT	2	8	1538916	1538923	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
3629	NC_010085	ATGAA	2	10	1538937	1538946	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
3630	NC_010085	T	7	7	1538985	1538991	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3631	NC_010085	TTG	2	6	1539025	1539030	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3632	NC_010085	T	7	7	1539048	1539054	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3633	NC_010085	ATA	2	6	1539113	1539118	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3635	NC_010085	ATT	2	6	1539242	1539247	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.