MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Nitrosopumilus maritimus SCM1 chromosome

Total Repeats: 3847

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_010085	AATA	3	12	1243179	1243190	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
3002	NC_010085	TTG	2	6	1243901	1243906	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3003	NC_010085	ACAT	2	8	1243934	1243941	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
3004	NC_010085	CAA	2	6	1243983	1243988	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3005	NC_010085	CAG	2	6	1244027	1244032	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3006	NC_010085	GGGA	2	8	1244072	1244079	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
3007	NC_010085	TGC	2	6	1244092	1244097	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3008	NC_010085	A	6	6	1244169	1244174	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3009	NC_010085	AAAT	2	8	1244185	1244192	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
3010	NC_010085	GCT	2	6	1244231	1244236	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3011	NC_010085	AGA	2	6	1244271	1244276	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3012	NC_010085	AGA	2	6	1244280	1244285	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3013	NC_010085	TGA	2	6	1244291	1244296	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3014	NC_010085	A	6	6	1244296	1244301	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3015	NC_010085	GATGA	2	10	1244332	1244341	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
3016	NC_010085	T	6	6	1244389	1244394	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3017	NC_010085	AGA	2	6	1245961	1245966	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3018	NC_010085	ATT	2	6	1246008	1246013	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3019	NC_010085	TGA	2	6	1246022	1246027	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3020	NC_010085	A	7	7	1246744	1246750	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3021	NC_010085	TAT	2	6	1246766	1246771	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3022	NC_010085	CTT	2	6	1246777	1246782	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3023	NC_010085	CA	4	8	1246825	1246832	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3024	NC_010085	T	6	6	1247612	1247617	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3025	NC_010085	T	6	6	1247619	1247624	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3026	NC_010085	AAT	2	6	1247652	1247657	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3027	NC_010085	ATTTTC	2	12	1247717	1247728	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
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3029	NC_010085	GTG	2	6	1247757	1247762	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3030	NC_010085	TAA	2	6	1247808	1247813	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3031	NC_010085	A	6	6	1247824	1247829	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3032	NC_010085	TAG	2	6	1247871	1247876	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3033	NC_010085	GGA	2	6	1247897	1247902	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3034	NC_010085	A	8	8	1247912	1247919	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3035	NC_010085	A	6	6	1247938	1247943	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3036	NC_010085	A	7	7	1247945	1247951	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3037	NC_010085	GAT	2	6	1248295	1248300	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3038	NC_010085	TAGAA	2	10	1248337	1248346	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
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3040	NC_010085	TTA	2	6	1248367	1248372	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3041	NC_010085	T	6	6	1248424	1248429	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3042	NC_010085	GCAA	2	8	1248430	1248437	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
3043	NC_010085	T	7	7	1248588	1248594	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3044	NC_010085	ATTT	2	8	1248602	1248609	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
3045	NC_010085	TG	3	6	1248996	1249001	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3046	NC_010085	AT	3	6	1249016	1249021	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3047	NC_010085	GA	3	6	1249101	1249106	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3048	NC_010085	CTT	2	6	1249153	1249158	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3049	NC_010085	ATG	2	6	1249177	1249182	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3050	NC_010085	TTG	2	6	1249196	1249201	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3051	NC_010085	TGT	2	6	1249291	1249296	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3052	NC_010085	A	7	7	1249302	1249308	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3053	NC_010085	ATC	2	6	1250870	1250875	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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3059	NC_010085	ACTC	2	8	1251428	1251435	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
3060	NC_010085	T	6	6	1251441	1251446	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3061	NC_010085	T	7	7	1251531	1251537	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3062	NC_010085	ATT	2	6	1251562	1251567	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3063	NC_010085	AATT	2	8	1251576	1251583	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3064	NC_010085	CA	3	6	1251640	1251645	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3065	NC_010085	TAT	2	6	1251657	1251662	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3066	NC_010085	CAT	2	6	1251713	1251718	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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3068	NC_010085	GTA	2	6	1253125	1253130	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3069	NC_010085	TATC	2	8	1255339	1255346	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
3070	NC_010085	A	6	6	1255350	1255355	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3071	NC_010085	AAT	2	6	1255378	1255383	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3072	NC_010085	TGAC	2	8	1255448	1255455	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
3073	NC_010085	CTA	2	6	1255464	1255469	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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3079	NC_010085	TAT	2	6	1257937	1257942	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3080	NC_010085	AATT	2	8	1257951	1257958	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3081	NC_010085	T	6	6	1258463	1258468	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3082	NC_010085	TAAAA	2	10	1258536	1258545	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3085	NC_010085	ACATTC	2	12	1260005	1260016	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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3088	NC_010085	TACA	2	8	1260089	1260096	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
3089	NC_010085	ATA	2	6	1262913	1262918	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3092	NC_010085	T	6	6	1263076	1263081	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3093	NC_010085	TTC	2	6	1263088	1263093	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3094	NC_010085	A	6	6	1263102	1263107	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3095	NC_010085	ATC	2	6	1264067	1264072	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3096	NC_010085	ATA	2	6	1264119	1264124	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3097	NC_010085	CTC	2	6	1264127	1264132	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3098	NC_010085	A	6	6	1268764	1268769	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3099	NC_010085	GGTAC	2	10	1269966	1269975	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
3100	NC_010085	AATT	2	8	1271999	1272006	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3101	NC_010085	ATTT	2	8	1272012	1272019	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
3102	NC_010085	T	6	6	1273801	1273806	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3103	NC_010085	GGT	2	6	1273810	1273815	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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3105	NC_010085	T	8	8	1279193	1279200	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3106	NC_010085	AATTT	2	10	1279202	1279211	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
3107	NC_010085	TAGAAA	2	12	1281935	1281946	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
3108	NC_010085	A	6	6	1281953	1281958	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3109	NC_010085	AGC	2	6	1284178	1284183	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3110	NC_010085	GTA	2	6	1286195	1286200	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3111	NC_010085	T	6	6	1291697	1291702	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3112	NC_010085	A	6	6	1292437	1292442	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3113	NC_010085	AGA	2	6	1292477	1292482	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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3115	NC_010085	T	7	7	1292731	1292737	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3116	NC_010085	A	7	7	1292745	1292751	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3117	NC_010085	A	6	6	1292815	1292820	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3118	NC_010085	TAA	2	6	1292842	1292847	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3119	NC_010085	TTC	2	6	1292856	1292861	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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3121	NC_010085	AGA	2	6	1292895	1292900	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3122	NC_010085	TAA	2	6	1293418	1293423	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3123	NC_010085	CGAT	2	8	1297298	1297305	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
3124	NC_010085	TTTA	2	8	1298360	1298367	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
3125	NC_010085	GTG	2	6	1298375	1298380	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3126	NC_010085	CAT	2	6	1298384	1298389	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3127	NC_010085	A	6	6	1299209	1299214	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3128	NC_010085	T	6	6	1299670	1299675	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3129	NC_010085	TAA	3	9	1299772	1299780	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3130	NC_010085	TCAT	2	8	1300026	1300033	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
3131	NC_010085	TTAGT	2	10	1300047	1300056	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
3132	NC_010085	T	6	6	1300772	1300777	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3133	NC_010085	ATC	2	6	1300792	1300797	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3134	NC_010085	ATC	2	6	1301134	1301139	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3135	NC_010085	TCA	3	9	1301144	1301152	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3136	NC_010085	A	6	6	1301209	1301214	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3137	NC_010085	A	7	7	1301256	1301262	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3138	NC_010085	ATG	2	6	1303157	1303162	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3139	NC_010085	TGT	2	6	1303163	1303168	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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3141	NC_010085	TAAAA	2	10	1309684	1309693	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
3142	NC_010085	A	6	6	1310108	1310113	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3143	NC_010085	AAT	2	6	1310116	1310121	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3144	NC_010085	TGCA	2	8	1310215	1310222	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
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3152	NC_010085	GATT	2	8	1311765	1311772	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
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3155	NC_010085	TTCCA	2	10	1312882	1312891	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
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3253	NC_010085	A	6	6	1363573	1363578	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3254	NC_010085	CGGA	2	8	1363655	1363662	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
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3259	NC_010085	TCT	2	6	1363761	1363766	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3260	NC_010085	ACT	2	6	1363797	1363802	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3261	NC_010085	T	6	6	1365414	1365419	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3262	NC_010085	AAAAT	2	10	1365420	1365429	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
3263	NC_010085	TA	3	6	1365432	1365437	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3264	NC_010085	GGA	2	6	1365865	1365870	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3265	NC_010085	GA	3	6	1365897	1365902	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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