MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Nitrosopumilus maritimus SCM1 chromosome

Total Repeats: 3847

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_010085	T	6	6	522608	522613	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1002	NC_010085	ATT	2	6	522618	522623	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1003	NC_010085	TAT	2	6	523125	523130	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1004	NC_010085	AAC	2	6	523154	523159	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1005	NC_010085	AAC	2	6	523229	523234	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1006	NC_010085	GAA	2	6	523311	523316	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1007	NC_010085	TAA	2	6	523317	523322	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1008	NC_010085	TGG	2	6	523326	523331	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1009	NC_010085	ATT	2	6	523339	523344	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1010	NC_010085	GCA	2	6	523354	523359	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1011	NC_010085	TTA	2	6	523860	523865	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1012	NC_010085	T	7	7	523878	523884	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1013	NC_010085	TCG	2	6	525588	525593	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1014	NC_010085	GATG	2	8	525606	525613	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
1015	NC_010085	T	6	6	525740	525745	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1016	NC_010085	TGT	2	6	525887	525892	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1017	NC_010085	TGTA	2	8	526796	526803	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
1018	NC_010085	TGACTA	2	12	530605	530616	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
1019	NC_010085	T	6	6	531778	531783	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1020	NC_010085	AT	3	6	533468	533473	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1021	NC_010085	TTC	2	6	533561	533566	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1022	NC_010085	TCAA	2	8	533575	533582	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
1023	NC_010085	GAAA	2	8	533588	533595	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
1024	NC_010085	ATT	2	6	533682	533687	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1025	NC_010085	A	6	6	533689	533694	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1026	NC_010085	T	6	6	534208	534213	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1029	NC_010085	TG	3	6	534268	534273	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1030	NC_010085	T	7	7	534891	534897	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1031	NC_010085	TAA	2	6	534910	534915	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1032	NC_010085	T	6	6	534930	534935	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1033	NC_010085	T	6	6	534950	534955	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1034	NC_010085	TG	3	6	537232	537237	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
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1043	NC_010085	TA	3	6	539116	539121	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1045	NC_010085	TTATTT	2	12	539162	539173	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1050	NC_010085	A	6	6	539253	539258	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1051	NC_010085	TTGT	2	8	539259	539266	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
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1053	NC_010085	T	7	7	539330	539336	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1054	NC_010085	T	6	6	539339	539344	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1055	NC_010085	ATT	2	6	539362	539367	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1058	NC_010085	T	6	6	543110	543115	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1059	NC_010085	GCA	2	6	543133	543138	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1061	NC_010085	TGT	2	6	544487	544492	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1062	NC_010085	T	7	7	544501	544507	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1063	NC_010085	TAT	2	6	550879	550884	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1064	NC_010085	TAT	2	6	550891	550896	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1065	NC_010085	TA	3	6	550901	550906	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1068	NC_010085	A	6	6	552840	552845	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1069	NC_010085	ATT	3	9	552859	552867	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1070	NC_010085	TAAT	2	8	552872	552879	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1071	NC_010085	GAT	2	6	552880	552885	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1072	NC_010085	T	6	6	552916	552921	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1073	NC_010085	ATTA	2	8	552931	552938	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1074	NC_010085	TCT	2	6	554168	554173	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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1081	NC_010085	ATA	2	6	560617	560622	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1082	NC_010085	TAC	2	6	563109	563114	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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1085	NC_010085	TCTA	2	8	563594	563601	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
1086	NC_010085	A	6	6	563601	563606	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1087	NC_010085	ATT	2	6	563611	563616	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1091	NC_010085	T	7	7	565985	565991	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1092	NC_010085	A	6	6	567615	567620	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1093	NC_010085	TTA	2	6	567645	567650	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1094	NC_010085	AAT	2	6	567656	567661	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1097	NC_010085	T	7	7	569557	569563	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1098	NC_010085	ATC	2	6	569578	569583	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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1100	NC_010085	AGC	2	6	569643	569648	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1101	NC_010085	TTGAAT	2	12	569688	569699	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
1102	NC_010085	T	7	7	570337	570343	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1103	NC_010085	TGA	2	6	570370	570375	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1104	NC_010085	ATGA	2	8	570381	570388	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1105	NC_010085	GT	3	6	570396	570401	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1106	NC_010085	ATA	2	6	570422	570427	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1107	NC_010085	TGA	2	6	570444	570449	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1108	NC_010085	AGA	2	6	570457	570462	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1109	NC_010085	TGG	2	6	570465	570470	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1110	NC_010085	TG	3	6	570571	570576	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1111	NC_010085	AATCA	2	10	570589	570598	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
1112	NC_010085	CTA	2	6	570627	570632	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1113	NC_010085	TGA	2	6	570674	570679	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1114	NC_010085	TTGT	2	8	570751	570758	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
1115	NC_010085	AAT	2	6	575340	575345	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1117	NC_010085	TTG	2	6	576712	576717	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1118	NC_010085	ATA	2	6	578025	578030	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1119	NC_010085	CAA	2	6	578039	578044	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1120	NC_010085	ATT	2	6	578075	578080	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1121	NC_010085	AAT	2	6	578812	578817	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1122	NC_010085	TTC	2	6	578895	578900	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1123	NC_010085	GTTT	2	8	578954	578961	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
1124	NC_010085	T	7	7	578993	578999	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1125	NC_010085	CTCAT	2	10	579002	579011	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
1126	NC_010085	TTC	2	6	579012	579017	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1127	NC_010085	TG	3	6	580242	580247	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1128	NC_010085	GA	3	6	580280	580285	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1129	NC_010085	T	6	6	580327	580332	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1130	NC_010085	TATT	2	8	580381	580388	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1131	NC_010085	ATT	2	6	582451	582456	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1132	NC_010085	ACT	2	6	582494	582499	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1133	NC_010085	GA	4	8	582763	582770	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1134	NC_010085	TTA	2	6	582777	582782	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1135	NC_010085	TAA	2	6	582801	582806	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1136	NC_010085	A	6	6	582808	582813	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1137	NC_010085	AGA	2	6	582825	582830	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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