MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Nitrosopumilus maritimus SCM1 chromosome

Total Repeats: 3847

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_010085	TGA	2	6	236030	236035	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
502	NC_010085	A	6	6	236035	236040	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
503	NC_010085	T	6	6	236877	236882	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
504	NC_010085	GAA	2	6	236899	236904	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
505	NC_010085	ATAA	2	8	236923	236930	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
506	NC_010085	T	8	8	239555	239562	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
507	NC_010085	T	7	7	239587	239593	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
508	NC_010085	AAAT	2	8	239595	239602	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
509	NC_010085	T	7	7	243221	243227	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
510	NC_010085	AGT	2	6	243720	243725	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
511	NC_010085	A	6	6	243730	243735	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
512	NC_010085	T	8	8	243738	243745	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
513	NC_010085	T	6	6	244183	244188	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
514	NC_010085	CAAAT	2	10	244192	244201	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
515	NC_010085	GA	3	6	252709	252714	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
516	NC_010085	A	6	6	255061	255066	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
517	NC_010085	TTAA	2	8	255078	255085	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
518	NC_010085	GATT	2	8	255115	255122	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
519	NC_010085	A	6	6	255920	255925	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
520	NC_010085	ATT	2	6	256011	256016	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
521	NC_010085	GAA	2	6	256064	256069	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
522	NC_010085	ATG	2	6	256086	256091	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
523	NC_010085	ATTT	2	8	256748	256755	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
524	NC_010085	TAT	2	6	256763	256768	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
525	NC_010085	GAAT	2	8	256769	256776	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
526	NC_010085	AATA	2	8	259538	259545	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
527	NC_010085	A	6	6	259552	259557	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
528	NC_010085	CGTTA	2	10	262464	262473	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
529	NC_010085	TGT	2	6	262568	262573	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
530	NC_010085	CTA	2	6	262575	262580	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
531	NC_010085	TAA	2	6	262637	262642	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
532	NC_010085	ATT	2	6	262647	262652	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
533	NC_010085	CTGTT	2	10	262672	262681	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
534	NC_010085	TGA	2	6	262713	262718	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
535	NC_010085	ATG	2	6	262724	262729	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
536	NC_010085	ATGG	2	8	262737	262744	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
537	NC_010085	GTAT	2	8	264263	264270	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
538	NC_010085	ATT	2	6	264462	264467	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
539	NC_010085	TTGA	2	8	264588	264595	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
540	NC_010085	T	8	8	264614	264621	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
541	NC_010085	A	6	6	264647	264652	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
542	NC_010085	T	6	6	264664	264669	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
543	NC_010085	A	6	6	264698	264703	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
544	NC_010085	CAA	2	6	264705	264710	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
545	NC_010085	A	6	6	264731	264736	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
546	NC_010085	ATT	2	6	264753	264758	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
547	NC_010085	T	7	7	265147	265153	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
548	NC_010085	TCT	2	6	265164	265169	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
549	NC_010085	TTA	2	6	265206	265211	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
550	NC_010085	CGAT	2	8	265227	265234	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
551	NC_010085	AGATC	2	10	268887	268896	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
552	NC_010085	ACA	2	6	269947	269952	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
553	NC_010085	CTA	2	6	270031	270036	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
554	NC_010085	CCA	2	6	270100	270105	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
555	NC_010085	ATA	2	6	270113	270118	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
556	NC_010085	TAA	3	9	270134	270142	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
557	NC_010085	A	6	6	270163	270168	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
558	NC_010085	ATT	2	6	270175	270180	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
559	NC_010085	GAT	2	6	270185	270190	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
560	NC_010085	GTA	2	6	270215	270220	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
561	NC_010085	TTTTA	2	10	270285	270294	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
562	NC_010085	ATT	2	6	270318	270323	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
563	NC_010085	TA	3	6	272254	272259	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
564	NC_010085	TAA	2	6	272583	272588	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
565	NC_010085	T	6	6	272598	272603	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
566	NC_010085	ATG	2	6	275979	275984	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
567	NC_010085	CTAT	2	8	278359	278366	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
568	NC_010085	TC	3	6	281547	281552	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
569	NC_010085	ATA	2	6	282227	282232	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
570	NC_010085	ATT	3	9	286403	286411	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
571	NC_010085	ATT	2	6	286446	286451	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
572	NC_010085	ACA	2	6	287809	287814	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
573	NC_010085	T	6	6	287815	287820	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
574	NC_010085	T	6	6	287918	287923	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
575	NC_010085	CTTTA	2	10	288805	288814	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
576	NC_010085	TTAAAT	2	12	288888	288899	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
577	NC_010085	CTT	2	6	288913	288918	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
578	NC_010085	TAA	2	6	294107	294112	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
579	NC_010085	T	6	6	294180	294185	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
580	NC_010085	TAATTC	2	12	294230	294241	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
581	NC_010085	TTTC	2	8	297387	297394	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
582	NC_010085	TCT	2	6	298453	298458	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
583	NC_010085	TTA	2	6	298473	298478	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
584	NC_010085	TA	3	6	300426	300431	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
585	NC_010085	A	7	7	301274	301280	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
586	NC_010085	AAT	2	6	302219	302224	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
587	NC_010085	AAT	2	6	302274	302279	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
588	NC_010085	A	6	6	306341	306346	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
589	NC_010085	A	6	6	306349	306354	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
590	NC_010085	TTG	2	6	307250	307255	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
591	NC_010085	A	6	6	307288	307293	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
592	NC_010085	A	6	6	307296	307301	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
593	NC_010085	A	6	6	308209	308214	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
594	NC_010085	A	6	6	308217	308222	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
595	NC_010085	ACT	2	6	309138	309143	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
596	NC_010085	AT	4	8	309166	309173	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
597	NC_010085	TG	3	6	309201	309206	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
598	NC_010085	ATT	2	6	318125	318130	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
599	NC_010085	T	6	6	318148	318153	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
600	NC_010085	T	6	6	319828	319833	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
601	NC_010085	GCGT	2	8	319834	319841	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
602	NC_010085	T	6	6	320245	320250	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
603	NC_010085	ATT	2	6	321790	321795	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
604	NC_010085	GAAA	2	8	321895	321902	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
605	NC_010085	TGT	2	6	321929	321934	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
606	NC_010085	TAA	2	6	324484	324489	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
607	NC_010085	TAG	2	6	324525	324530	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
608	NC_010085	GTC	2	6	324591	324596	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
609	NC_010085	TCA	2	6	324635	324640	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
610	NC_010085	TCA	2	6	324678	324683	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
611	NC_010085	TGGTCT	2	12	324693	324704	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
612	NC_010085	ATTT	2	8	324729	324736	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
613	NC_010085	ATC	2	6	325363	325368	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
614	NC_010085	ATA	2	6	325388	325393	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
615	NC_010085	T	6	6	325458	325463	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
616	NC_010085	ATT	3	9	325481	325489	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
617	NC_010085	GTT	2	6	325502	325507	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
618	NC_010085	A	6	6	325920	325925	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
619	NC_010085	TGG	2	6	326318	326323	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
620	NC_010085	AACT	2	8	326450	326457	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
621	NC_010085	A	6	6	326479	326484	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
622	NC_010085	A	7	7	326489	326495	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
623	NC_010085	T	7	7	328089	328095	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
624	NC_010085	TAT	2	6	328141	328146	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
625	NC_010085	TGA	2	6	328159	328164	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
626	NC_010085	GGAAA	2	10	328234	328243	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
627	NC_010085	A	6	6	328290	328295	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
628	NC_010085	GAA	2	6	328338	328343	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
629	NC_010085	TG	3	6	328365	328370	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
630	NC_010085	AAAT	2	8	328415	328422	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
631	NC_010085	TGA	2	6	328472	328477	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
632	NC_010085	A	6	6	328509	328514	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
633	NC_010085	GAA	2	6	328518	328523	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
634	NC_010085	A	6	6	328570	328575	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
635	NC_010085	AAG	2	6	328583	328588	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
636	NC_010085	ACTA	2	8	328626	328633	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
637	NC_010085	AT	3	6	328724	328729	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
638	NC_010085	ATT	2	6	328749	328754	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
639	NC_010085	A	6	6	328759	328764	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
640	NC_010085	GT	3	6	328814	328819	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
641	NC_010085	GGT	2	6	328828	328833	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
642	NC_010085	GAT	2	6	328861	328866	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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