MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Neisseria meningitidis FAM18 chromosome

Total Repeats: 163

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008767	TGTCGG	2	12	3397	3408	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
2	NC_008767	GGCTTG	2	12	9972	9983	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
3	NC_008767	ATTTAA	2	12	10190	10201	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_008767	TTATTT	2	12	25545	25556	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_008767	ACAAAG	2	12	48606	48617	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
6	NC_008767	CAGGAG	2	12	73401	73412	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
7	NC_008767	AAATTT	2	12	91131	91142	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_008767	GGTCTC	2	12	97576	97587	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_008767	CGCGGT	2	12	98062	98073	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_008767	CTTATG	2	12	102220	102231	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
11	NC_008767	TACGCA	2	12	106570	106581	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
12	NC_008767	GGAAAA	2	12	119559	119570	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13	NC_008767	TAAACC	2	12	164757	164768	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_008767	TTCGGT	2	12	184230	184241	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
15	NC_008767	TTCGGT	2	12	184686	184697	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
16	NC_008767	TAGGGA	2	12	201258	201269	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
17	NC_008767	TTTCCG	2	12	201277	201288	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_008767	CAAAAA	2	12	207780	207791	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
19	NC_008767	CCGGTA	2	12	211114	211125	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
20	NC_008767	TTTCCT	2	12	222448	222459	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
21	NC_008767	TCCCTT	2	12	227549	227560	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
22	NC_008767	TTAAAT	2	12	272609	272620	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_008767	TAAAAA	2	12	303002	303013	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_008767	CAAAAA	2	12	304968	304979	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
25	NC_008767	GCAGGG	2	12	306352	306363	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
26	NC_008767	GGGGCG	2	12	314409	314420	0 %	0 %	83.33 %	16.67 %	Non-Coding
27	NC_008767	ATGCTG	2	12	333244	333255	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
28	NC_008767	TTTTGT	2	12	382877	382888	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
29	NC_008767	TTAAAT	2	12	397647	397658	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_008767	ATTTAA	2	12	414395	414406	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_008767	ACCGAA	2	12	423536	423547	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
32	NC_008767	ACCGAA	2	12	424059	424070	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
33	NC_008767	ACCGAA	2	12	424259	424270	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_008767	ACCGAA	2	12	424459	424470	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_008767	AACCGG	2	12	426892	426903	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_008767	TTAAAT	2	12	511094	511105	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_008767	CAAATC	2	12	511296	511307	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_008767	AATTTA	2	12	525972	525983	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_008767	ATGCCG	2	12	532823	532834	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_008767	CGAAAA	2	12	540750	540761	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
41	NC_008767	TCGGTT	2	12	552018	552029	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
42	NC_008767	AAAAAC	2	12	552283	552294	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
43	NC_008767	TTCAAA	2	12	561063	561074	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
44	NC_008767	GTATCC	2	12	570778	570789	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
45	NC_008767	TTAAAT	2	12	582725	582736	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_008767	CGGACA	2	12	591334	591345	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
47	NC_008767	TTATGT	2	12	623303	623314	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
48	NC_008767	TTCGGT	2	12	658523	658534	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
49	NC_008767	TTTTTG	2	12	674946	674957	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
50	NC_008767	ATTTAA	2	12	675766	675777	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_008767	CCTTAA	2	12	681217	681228	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
52	NC_008767	CCGAAC	2	12	681643	681654	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
53	NC_008767	TTAAAT	2	12	697551	697562	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_008767	CGTTTG	2	12	706300	706311	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
55	NC_008767	CGCCTG	2	12	718492	718503	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
56	NC_008767	AAAATA	2	12	722022	722033	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_008767	TTCGGA	2	12	731809	731820	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
58	NC_008767	GTTGGT	2	12	783657	783668	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
59	NC_008767	GTCGAT	2	12	803480	803491	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
60	NC_008767	ATATGG	2	12	815958	815969	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
61	NC_008767	AAGGAA	2	12	833891	833902	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
62	NC_008767	TTAAAT	2	12	834024	834035	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_008767	ATTTAT	2	12	834791	834802	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_008767	TTCAAT	2	12	834803	834814	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
65	NC_008767	CAGTTT	2	12	839048	839059	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
66	NC_008767	AAACCG	2	12	877413	877424	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
67	NC_008767	CGGCAT	2	12	884444	884455	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
68	NC_008767	GGTTTT	2	12	892556	892567	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
69	NC_008767	TAATCA	2	12	893721	893732	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
70	NC_008767	TTTAAA	2	12	896257	896268	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_008767	ATTTAA	2	12	896335	896346	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_008767	CGAAAT	2	12	907424	907435	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
73	NC_008767	ATTTAA	2	12	933963	933974	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_008767	TTTTTG	2	12	938888	938899	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
75	NC_008767	ATCATA	2	12	939252	939263	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
76	NC_008767	ATTTAA	2	12	945847	945858	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_008767	TCTTTG	2	12	947183	947194	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
78	NC_008767	ATTTTT	2	12	954619	954630	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_008767	TTAAAT	2	12	960140	960151	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_008767	TTGTTT	2	12	977606	977617	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
81	NC_008767	ATTTAA	2	12	978880	978891	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_008767	TTAAAT	2	12	986483	986494	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_008767	TTCGGC	2	12	995683	995694	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
84	NC_008767	AATTTG	2	12	1015610	1015621	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
85	NC_008767	ATTTAA	2	12	1025309	1025320	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_008767	TTTCCG	2	12	1052045	1052056	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
87	NC_008767	TTAAAT	2	12	1100653	1100664	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_008767	TGCGGG	2	12	1132838	1132849	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
89	NC_008767	TGCCGA	2	12	1151734	1151745	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
90	NC_008767	TTTCAG	2	12	1206325	1206336	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
91	NC_008767	CCGGCT	2	12	1206438	1206449	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
92	NC_008767	AAACAC	2	12	1222611	1222622	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
93	NC_008767	GCTGCC	2	12	1240201	1240212	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
94	NC_008767	GCCAAA	2	12	1280951	1280962	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
95	NC_008767	CAAAAA	2	12	1294355	1294366	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
96	NC_008767	AGATTT	2	12	1305852	1305863	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
97	NC_008767	TGCCTT	2	12	1306895	1306906	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
98	NC_008767	TAAATA	2	12	1323261	1323272	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_008767	GACAAA	2	12	1324513	1324524	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
100	NC_008767	GACGGC	2	12	1333347	1333358	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
101	NC_008767	AACGGC	2	12	1333476	1333487	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
102	NC_008767	CGGTAA	2	12	1333751	1333762	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
103	NC_008767	TTAATT	2	12	1334674	1334685	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_008767	AACGGC	2	12	1335774	1335785	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
105	NC_008767	CGGTAA	2	12	1336049	1336060	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
106	NC_008767	TAAAGC	2	12	1336484	1336495	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
107	NC_008767	TGGCAA	2	12	1337513	1337524	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
108	NC_008767	TTTAAT	2	12	1342729	1342740	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_008767	TTAAAT	2	12	1347708	1347719	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_008767	ACAGGC	2	12	1400629	1400640	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
111	NC_008767	ATTTAA	2	12	1400980	1400991	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_008767	ATTTAA	2	12	1401448	1401459	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_008767	TTCGGT	2	12	1435110	1435121	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
114	NC_008767	TTCGGT	2	12	1435260	1435271	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
115	NC_008767	TTCGGT	2	12	1435738	1435749	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
116	NC_008767	TTAAAT	2	12	1454808	1454819	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_008767	ATTTAA	2	12	1454885	1454896	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_008767	GTGTGG	2	12	1542689	1542700	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
119	NC_008767	GGTTTT	2	12	1543162	1543173	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
120	NC_008767	GATTCA	2	12	1545180	1545191	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
121	NC_008767	ACCGAA	2	12	1550789	1550800	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
122	NC_008767	ACCGAA	2	12	1550973	1550984	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
123	NC_008767	ACCGAA	2	12	1551171	1551182	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
124	NC_008767	ACCGAA	2	12	1551369	1551380	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
125	NC_008767	ACCGAA	2	12	1551698	1551709	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
126	NC_008767	ACCGAA	2	12	1551854	1551865	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
127	NC_008767	GCCCAA	2	12	1552132	1552143	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
128	NC_008767	CTTTGT	2	12	1603106	1603117	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
129	NC_008767	CATTTC	2	12	1638258	1638269	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
130	NC_008767	GAAGCC	2	12	1696253	1696264	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.