MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Nocardioides sp. JS614 chromosome

Total Repeats: 10685

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_008699	GGCC	2	8	1625365	1625372	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4002	NC_008699	CCCG	2	8	1625379	1625386	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
4003	NC_008699	TCG	2	6	1625403	1625408	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4004	NC_008699	CG	4	8	1625483	1625490	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4005	NC_008699	AGC	2	6	1625615	1625620	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4006	NC_008699	GA	3	6	1625714	1625719	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4007	NC_008699	GCC	2	6	1625727	1625732	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4008	NC_008699	CAG	2	6	1625759	1625764	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4009	NC_008699	CAG	2	6	1625770	1625775	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4010	NC_008699	CTCG	2	8	1625796	1625803	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
4011	NC_008699	CGC	2	6	1625820	1625825	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4012	NC_008699	GTCG	2	8	1625889	1625896	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
4013	NC_008699	CTT	2	6	1625908	1625913	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4014	NC_008699	CTC	2	6	1625934	1625939	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4015	NC_008699	GCT	2	6	1625961	1625966	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4016	NC_008699	CGG	2	6	1625974	1625979	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4017	NC_008699	AGC	2	6	1625995	1626000	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4018	NC_008699	AGG	2	6	1630797	1630802	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4019	NC_008699	GAG	2	6	1630813	1630818	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4020	NC_008699	GAG	2	6	1631159	1631164	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4021	NC_008699	GT	3	6	1631175	1631180	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4022	NC_008699	TCG	2	6	1631230	1631235	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4023	NC_008699	GCT	2	6	1637605	1637610	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4024	NC_008699	GTCC	2	8	1642002	1642009	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
4025	NC_008699	CGA	2	6	1642042	1642047	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4026	NC_008699	GCG	2	6	1642055	1642060	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4027	NC_008699	GTCC	2	8	1645228	1645235	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
4028	NC_008699	CCCG	2	8	1645936	1645943	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
4029	NC_008699	GC	3	6	1645964	1645969	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4030	NC_008699	GGT	2	6	1645970	1645975	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4031	NC_008699	GCC	2	6	1645979	1645984	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4032	NC_008699	GGCC	2	8	1646017	1646024	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4033	NC_008699	GATC	2	8	1646112	1646119	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
4034	NC_008699	GCT	2	6	1646128	1646133	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4035	NC_008699	GGA	2	6	1646190	1646195	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4036	NC_008699	ACGGG	2	10	1647579	1647588	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
4037	NC_008699	CG	3	6	1647606	1647611	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4038	NC_008699	GGC	2	6	1647639	1647644	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4039	NC_008699	GGC	2	6	1647678	1647683	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4040	NC_008699	CGTC	2	8	1647697	1647704	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
4041	NC_008699	CGG	2	6	1647754	1647759	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4042	NC_008699	ACCG	2	8	1649312	1649319	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
4043	NC_008699	AGCT	2	8	1649337	1649344	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
4044	NC_008699	CTTG	2	8	1650437	1650444	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
4045	NC_008699	CGGGG	2	10	1651524	1651533	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
4046	NC_008699	TGCT	2	8	1656525	1656532	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
4047	NC_008699	CGGTC	2	10	1656550	1656559	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
4048	NC_008699	TCT	2	6	1660520	1660525	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4049	NC_008699	CCG	2	6	1660562	1660567	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4050	NC_008699	CAT	2	6	1669196	1669201	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4051	NC_008699	CGCT	2	8	1669207	1669214	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
4052	NC_008699	CGC	2	6	1671598	1671603	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4053	NC_008699	GT	3	6	1673110	1673115	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4054	NC_008699	GT	3	6	1678588	1678593	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4055	NC_008699	AGG	2	6	1678624	1678629	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4056	NC_008699	GGTT	2	8	1681136	1681143	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4057	NC_008699	GCT	2	6	1681184	1681189	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4058	NC_008699	GA	3	6	1681208	1681213	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4059	NC_008699	CCT	2	6	1681238	1681243	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4060	NC_008699	GCT	2	6	1681245	1681250	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4061	NC_008699	CGCT	2	8	1681302	1681309	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
4062	NC_008699	TCGGT	2	10	1681431	1681440	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
4063	NC_008699	CGG	2	6	1681442	1681447	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4064	NC_008699	CCA	2	6	1681500	1681505	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4065	NC_008699	GGC	2	6	1681513	1681518	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4066	NC_008699	CTG	2	6	1681550	1681555	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4067	NC_008699	GTC	2	6	1681559	1681564	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4068	NC_008699	GCTG	2	8	1681597	1681604	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
4069	NC_008699	GCC	2	6	1681611	1681616	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4070	NC_008699	CGGC	2	8	1681714	1681721	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4071	NC_008699	GGAAG	2	10	1681765	1681774	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
4072	NC_008699	GCGG	2	8	1683395	1683402	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
4073	NC_008699	CCG	2	6	1684589	1684594	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4074	NC_008699	GAA	2	6	1684595	1684600	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4075	NC_008699	GCT	2	6	1684630	1684635	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4076	NC_008699	TCG	2	6	1684638	1684643	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4077	NC_008699	ATG	2	6	1685595	1685600	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4078	NC_008699	CGG	2	6	1685630	1685635	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4079	NC_008699	GCCG	2	8	1685698	1685705	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4080	NC_008699	CGG	2	6	1685738	1685743	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4081	NC_008699	CCT	2	6	1690797	1690802	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4082	NC_008699	GGC	2	6	1690846	1690851	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4083	NC_008699	GCG	2	6	1690879	1690884	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4084	NC_008699	TCG	2	6	1691839	1691844	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4085	NC_008699	CGA	2	6	1691852	1691857	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4086	NC_008699	GTCGA	2	10	1691880	1691889	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
4087	NC_008699	CGC	2	6	1691924	1691929	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4088	NC_008699	ACCA	2	8	1692000	1692007	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4089	NC_008699	CCTGG	2	10	1692017	1692026	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
4090	NC_008699	CAG	2	6	1693403	1693408	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4091	NC_008699	AGG	2	6	1693430	1693435	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4092	NC_008699	GAT	2	6	1693486	1693491	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4093	NC_008699	GT	3	6	1693649	1693654	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4094	NC_008699	CTG	2	6	1693673	1693678	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4095	NC_008699	GCA	2	6	1693721	1693726	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4096	NC_008699	TGCGG	2	10	1693798	1693807	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
4097	NC_008699	CAG	2	6	1694207	1694212	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4098	NC_008699	CGT	2	6	1694233	1694238	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4099	NC_008699	GTG	2	6	1694250	1694255	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4100	NC_008699	TCTCC	2	10	1694267	1694276	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
4101	NC_008699	TTGG	2	8	1694277	1694284	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4102	NC_008699	CGT	2	6	1694309	1694314	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4103	NC_008699	GTCG	2	8	1694325	1694332	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
4104	NC_008699	TCC	2	6	1694474	1694479	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4105	NC_008699	GGC	2	6	1694514	1694519	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4106	NC_008699	GTG	2	6	1694560	1694565	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4107	NC_008699	GC	3	6	1694604	1694609	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4108	NC_008699	TCG	2	6	1694610	1694615	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4109	NC_008699	G	6	6	1696038	1696043	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
4110	NC_008699	G	6	6	1696050	1696055	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
4111	NC_008699	CAG	2	6	1697048	1697053	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4112	NC_008699	GTCG	2	8	1697107	1697114	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
4113	NC_008699	GGGT	2	8	1699679	1699686	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
4114	NC_008699	TCG	2	6	1703044	1703049	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4115	NC_008699	GGGGA	2	10	1703050	1703059	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
4116	NC_008699	TCG	2	6	1703101	1703106	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4117	NC_008699	CAG	2	6	1703156	1703161	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4118	NC_008699	CCCG	2	8	1703176	1703183	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
4119	NC_008699	AAC	2	6	1704119	1704124	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4120	NC_008699	TGC	2	6	1704130	1704135	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4121	NC_008699	ATC	2	6	1704147	1704152	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4122	NC_008699	GCG	2	6	1704182	1704187	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4123	NC_008699	GCG	2	6	1709103	1709108	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4124	NC_008699	CG	3	6	1709147	1709152	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4125	NC_008699	TGG	2	6	1709176	1709181	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4126	NC_008699	CAGCA	2	10	1709188	1709197	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
4127	NC_008699	CTG	2	6	1709224	1709229	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4128	NC_008699	CTCTC	2	10	1709569	1709578	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
4129	NC_008699	TGT	2	6	1709644	1709649	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4130	NC_008699	GCG	2	6	1709668	1709673	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4131	NC_008699	CGG	2	6	1711774	1711779	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4132	NC_008699	CGC	2	6	1711798	1711803	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4133	NC_008699	CGG	2	6	1711810	1711815	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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4262	NC_008699	TC	3	6	1781149	1781154	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4263	NC_008699	CGA	2	6	1781206	1781211	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4264	NC_008699	GTC	3	9	1781235	1781243	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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4381	NC_008699	CAGC	2	8	1829162	1829169	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
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