MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Nitrosomonas eutropha C91 chromosome

Total Repeats: 7675

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_008344	GCT	2	6	173647	173652	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
502	NC_008344	TGAT	2	8	173661	173668	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
503	NC_008344	TGA	2	6	173687	173692	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
504	NC_008344	GCCA	2	8	173698	173705	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
505	NC_008344	CCCT	2	8	173728	173735	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
506	NC_008344	TTG	2	6	173764	173769	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
507	NC_008344	GTT	2	6	173778	173783	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
508	NC_008344	CGT	2	6	173858	173863	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
509	NC_008344	CG	3	6	173891	173896	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
510	NC_008344	GCG	2	6	174067	174072	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
511	NC_008344	AAT	2	6	175725	175730	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
512	NC_008344	ATG	2	6	175789	175794	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
513	NC_008344	GAT	2	6	177715	177720	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
514	NC_008344	TGTC	2	8	177723	177730	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
515	NC_008344	TTG	2	6	177744	177749	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
516	NC_008344	TGT	2	6	177799	177804	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
517	NC_008344	TCC	2	6	177841	177846	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
518	NC_008344	ATG	2	6	177910	177915	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
519	NC_008344	ATCT	2	8	177916	177923	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
520	NC_008344	ACA	2	6	177964	177969	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
521	NC_008344	ATA	2	6	181472	181477	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
522	NC_008344	TGA	2	6	181484	181489	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
523	NC_008344	TGT	2	6	183761	183766	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
524	NC_008344	TGA	2	6	183771	183776	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
525	NC_008344	GTT	2	6	183886	183891	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
526	NC_008344	T	6	6	183902	183907	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
527	NC_008344	TGC	2	6	184774	184779	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
528	NC_008344	ATC	2	6	184844	184849	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
529	NC_008344	TGT	2	6	184859	184864	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
530	NC_008344	GATAT	2	10	185339	185348	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
531	NC_008344	AGTA	2	8	187942	187949	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
532	NC_008344	T	7	7	188634	188640	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
533	NC_008344	AGC	2	6	188708	188713	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
534	NC_008344	AG	3	6	192800	192805	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
535	NC_008344	TTATT	2	10	192823	192832	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
536	NC_008344	ATAA	2	8	194071	194078	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
537	NC_008344	AAT	2	6	194095	194100	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
538	NC_008344	CGG	2	6	197426	197431	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
539	NC_008344	AAT	2	6	197531	197536	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
540	NC_008344	ATC	2	6	198290	198295	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
541	NC_008344	TTC	2	6	199658	199663	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
542	NC_008344	A	6	6	199679	199684	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
543	NC_008344	GTA	2	6	199708	199713	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
544	NC_008344	GAA	2	6	199714	199719	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
545	NC_008344	CAGG	2	8	202262	202269	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
546	NC_008344	ATAG	2	8	202274	202281	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
547	NC_008344	ATC	2	6	202349	202354	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
548	NC_008344	TGG	2	6	202381	202386	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
549	NC_008344	GGT	2	6	202426	202431	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
550	NC_008344	A	7	7	202513	202519	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
551	NC_008344	ATG	2	6	202536	202541	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
552	NC_008344	AGC	3	9	202698	202706	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
553	NC_008344	TGAA	2	8	203952	203959	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
554	NC_008344	TGT	2	6	203962	203967	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
555	NC_008344	TGG	2	6	204028	204033	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
556	NC_008344	AGC	2	6	204187	204192	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
557	NC_008344	GGATA	2	10	206701	206710	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
558	NC_008344	AAAC	2	8	206756	206763	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
559	NC_008344	ATC	2	6	208079	208084	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
560	NC_008344	CAG	2	6	208105	208110	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
561	NC_008344	GTG	2	6	210147	210152	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
562	NC_008344	G	6	6	210158	210163	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
563	NC_008344	CG	3	6	210231	210236	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
564	NC_008344	GAT	2	6	210282	210287	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
565	NC_008344	CA	3	6	210295	210300	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
566	NC_008344	CACAC	2	10	210330	210339	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
567	NC_008344	AAC	2	6	210368	210373	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
568	NC_008344	T	6	6	211207	211212	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
569	NC_008344	ATT	2	6	211235	211240	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
570	NC_008344	TCA	2	6	213312	213317	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
571	NC_008344	AAC	2	6	213336	213341	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
572	NC_008344	TAT	2	6	213343	213348	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
573	NC_008344	ACG	2	6	213358	213363	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
574	NC_008344	TAA	2	6	213372	213377	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
575	NC_008344	TAT	2	6	213385	213390	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
576	NC_008344	CTT	2	6	216170	216175	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
577	NC_008344	ATT	2	6	216184	216189	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
578	NC_008344	AGC	2	6	216217	216222	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
579	NC_008344	TC	3	6	216541	216546	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
580	NC_008344	TTAAT	2	10	216584	216593	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
581	NC_008344	TGC	2	6	216597	216602	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
582	NC_008344	CT	3	6	216677	216682	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
583	NC_008344	TG	3	6	217486	217491	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
584	NC_008344	T	6	6	218702	218707	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
585	NC_008344	TTG	2	6	218736	218741	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
586	NC_008344	TCC	2	6	219287	219292	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
587	NC_008344	T	6	6	219293	219298	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
588	NC_008344	T	7	7	221938	221944	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
589	NC_008344	CAG	2	6	221956	221961	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
590	NC_008344	CCT	2	6	221966	221971	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
591	NC_008344	CG	3	6	221973	221978	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
592	NC_008344	A	6	6	222084	222089	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
593	NC_008344	TCG	2	6	222106	222111	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
594	NC_008344	GC	4	8	222127	222134	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
595	NC_008344	CTT	2	6	222191	222196	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
596	NC_008344	GAT	2	6	222246	222251	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
597	NC_008344	GCC	2	6	222264	222269	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
598	NC_008344	GCA	2	6	222340	222345	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
599	NC_008344	AT	3	6	222364	222369	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
600	NC_008344	GCA	2	6	222445	222450	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
601	NC_008344	CCA	2	6	222455	222460	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
602	NC_008344	CCTC	2	8	222526	222533	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
603	NC_008344	T	7	7	222536	222542	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
604	NC_008344	GGC	2	6	222625	222630	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
605	NC_008344	AAGC	2	8	222656	222663	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
606	NC_008344	TTGC	2	8	222743	222750	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
607	NC_008344	GAAA	2	8	222757	222764	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
608	NC_008344	TAA	2	6	222783	222788	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
609	NC_008344	A	6	6	229374	229379	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
610	NC_008344	AAGC	2	8	231258	231265	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
611	NC_008344	CA	3	6	231283	231288	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
612	NC_008344	AAG	2	6	231318	231323	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
613	NC_008344	GAT	2	6	231384	231389	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
614	NC_008344	T	6	6	231426	231431	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
615	NC_008344	TAAA	2	8	231439	231446	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
616	NC_008344	ATG	2	6	231485	231490	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
617	NC_008344	TA	3	6	231522	231527	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
618	NC_008344	CAAAG	2	10	231557	231566	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
619	NC_008344	A	7	7	231573	231579	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
620	NC_008344	GGC	2	6	231746	231751	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
621	NC_008344	TC	3	6	231884	231889	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
622	NC_008344	AGG	2	6	231890	231895	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
623	NC_008344	TGG	2	6	231954	231959	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
624	NC_008344	GAC	2	6	232003	232008	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
625	NC_008344	GCA	2	6	232052	232057	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
626	NC_008344	GTGA	2	8	232105	232112	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
627	NC_008344	GAAA	2	8	232147	232154	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
628	NC_008344	CAG	2	6	232220	232225	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
629	NC_008344	GGC	2	6	232285	232290	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
630	NC_008344	GCA	2	6	232359	232364	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
631	NC_008344	GAA	2	6	232412	232417	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
632	NC_008344	TACC	2	8	232684	232691	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
633	NC_008344	TGC	2	6	232753	232758	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
634	NC_008344	GTC	2	6	232765	232770	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
635	NC_008344	TCGTG	2	10	232774	232783	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
636	NC_008344	GGA	2	6	232877	232882	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
637	NC_008344	GAG	3	9	232971	232979	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
638	NC_008344	CGT	2	6	232996	233001	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
639	NC_008344	AC	3	6	233097	233102	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
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647	NC_008344	CCA	2	6	233489	233494	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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652	NC_008344	TGG	3	9	233615	233623	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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660	NC_008344	GAT	2	6	234315	234320	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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662	NC_008344	AT	3	6	234475	234480	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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675	NC_008344	ACCGT	2	10	235231	235240	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
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683	NC_008344	ACC	2	6	235796	235801	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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685	NC_008344	GGA	2	6	235899	235904	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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702	NC_008344	TA	4	8	236803	236810	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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762	NC_008344	TAA	2	6	251934	251939	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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772	NC_008344	TG	3	6	270971	270976	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
773	NC_008344	CTT	2	6	270998	271003	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
774	NC_008344	GAA	2	6	271059	271064	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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777	NC_008344	GATA	2	8	272346	272353	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
778	NC_008344	CATA	2	8	272912	272919	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
779	NC_008344	TGC	2	6	273005	273010	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
780	NC_008344	T	6	6	273019	273024	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
781	NC_008344	GGT	3	9	273037	273045	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
782	NC_008344	AGC	2	6	273114	273119	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
783	NC_008344	GGA	2	6	273143	273148	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
784	NC_008344	ATA	2	6	273769	273774	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
785	NC_008344	GCA	2	6	273795	273800	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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787	NC_008344	A	6	6	273910	273915	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
788	NC_008344	CAA	2	6	274425	274430	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
789	NC_008344	CAT	2	6	274435	274440	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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792	NC_008344	GCA	2	6	275104	275109	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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799	NC_008344	TGG	2	6	281924	281929	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
800	NC_008344	CGG	2	6	281946	281951	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
801	NC_008344	TCCC	2	8	281956	281963	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
802	NC_008344	TCA	2	6	281991	281996	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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806	NC_008344	TAA	2	6	282618	282623	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
807	NC_008344	T	6	6	283453	283458	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
808	NC_008344	TTA	2	6	283460	283465	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
809	NC_008344	ATT	2	6	283760	283765	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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811	NC_008344	T	7	7	289173	289179	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
812	NC_008344	TTAT	2	8	289208	289215	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
813	NC_008344	CCCTTT	2	12	289220	289231	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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815	NC_008344	GATA	2	8	289281	289288	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
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822	NC_008344	ACA	2	6	298187	298192	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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825	NC_008344	TGG	2	6	304412	304417	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
826	NC_008344	T	6	6	304424	304429	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
827	NC_008344	CTTT	2	8	304442	304449	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
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829	NC_008344	TGAT	2	8	304461	304468	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
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833	NC_008344	ATT	2	6	304666	304671	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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841	NC_008344	TCA	2	6	309735	309740	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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843	NC_008344	TA	3	6	309839	309844	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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853	NC_008344	AGCT	2	8	310271	310278	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
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855	NC_008344	TTTTA	2	10	310356	310365	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
856	NC_008344	TA	3	6	310399	310404	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
857	NC_008344	T	6	6	310499	310504	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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898	NC_008344	TGAG	2	8	323671	323678	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
899	NC_008344	ATG	2	6	323692	323697	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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902	NC_008344	GAT	2	6	323790	323795	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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907	NC_008344	TGA	2	6	324076	324081	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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910	NC_008344	TTG	2	6	324227	324232	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
911	NC_008344	TGG	2	6	324237	324242	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
912	NC_008344	TG	3	6	324372	324377	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
913	NC_008344	CTT	2	6	324387	324392	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
914	NC_008344	CA	3	6	324403	324408	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
915	NC_008344	GA	3	6	324458	324463	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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952	NC_008344	AT	3	6	335708	335713	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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