MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Nitrosomonas eutropha C91 plasmid2

Total Repeats: 33

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008342	CTGG	2	8	270	277	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
2	NC_008342	ATTT	2	8	3566	3573	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_008342	ATCA	2	8	3641	3648	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
4	NC_008342	CGAA	2	8	3721	3728	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
5	NC_008342	CTTC	2	8	7595	7602	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
6	NC_008342	AGGC	2	8	7795	7802	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
7	NC_008342	GTGA	2	8	8576	8583	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
8	NC_008342	TAAA	2	8	9329	9336	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_008342	ACCG	2	8	9938	9945	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
10	NC_008342	TTTA	2	8	10647	10654	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_008342	CCCG	2	8	11496	11503	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
12	NC_008342	CCAG	2	8	12293	12300	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
13	NC_008342	TAAC	2	8	12646	12653	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
14	NC_008342	TACA	2	8	13604	13611	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
15	NC_008342	ATGT	2	8	13968	13975	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
16	NC_008342	CAGC	2	8	14187	14194	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
17	NC_008342	AAGG	2	8	27150	27157	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
18	NC_008342	TCAA	2	8	28646	28653	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
19	NC_008342	TAAT	2	8	30026	30033	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_008342	GTCC	2	8	32865	32872	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
21	NC_008342	CTTG	2	8	32970	32977	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
22	NC_008342	TCCC	2	8	33036	33043	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
23	NC_008342	TTTA	2	8	33794	33801	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_008342	TCCA	2	8	35946	35953	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
25	NC_008342	TTTA	2	8	36261	36268	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_008342	GGGC	2	8	36908	36915	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
27	NC_008342	CATA	2	8	39278	39285	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
28	NC_008342	TTCA	2	8	39286	39293	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
29	NC_008342	CCAG	2	8	39485	39492	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
30	NC_008342	TGTT	2	8	47549	47556	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
31	NC_008342	ACAA	2	8	53943	53950	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
32	NC_008342	CAGC	2	8	55423	55430	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
33	NC_008342	CCCG	2	8	55546	55553	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.