MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Nitrobacter hamburgensis X14 chromosome

Total Repeats: 878

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_007964	TCGCA	2	10	68	77	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
2	NC_007964	GGGTT	2	10	8237	8246	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
3	NC_007964	CGCGC	2	10	10334	10343	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
4	NC_007964	CAGCA	2	10	10434	10443	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
5	NC_007964	TCCAT	2	10	16694	16703	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
6	NC_007964	ACGAC	2	10	32254	32263	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
7	NC_007964	ACAGC	2	10	40816	40825	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
8	NC_007964	CGGCA	2	10	43224	43233	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
9	NC_007964	GCACG	2	10	43606	43615	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
10	NC_007964	TCTTG	2	10	49223	49232	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
11	NC_007964	GGATT	2	10	50752	50761	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
12	NC_007964	TTTTA	2	10	62908	62917	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_007964	CGGCT	2	10	74120	74129	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
14	NC_007964	ATCGA	2	10	77240	77249	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
15	NC_007964	ACGGG	2	10	89662	89671	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
16	NC_007964	TCAAA	2	10	97545	97554	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
17	NC_007964	CGGCT	2	10	99704	99713	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
18	NC_007964	TCAAA	2	10	106780	106789	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
19	NC_007964	ACCGC	2	10	112492	112501	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
20	NC_007964	GCTTC	2	10	117344	117353	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
21	NC_007964	GCTTC	2	10	118398	118407	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
22	NC_007964	TTGTC	2	10	123986	123995	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
23	NC_007964	TCAAA	2	10	134394	134403	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
24	NC_007964	GTGCG	2	10	147720	147729	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
25	NC_007964	CGTCC	2	10	152292	152301	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
26	NC_007964	GGTCC	2	10	174455	174464	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
27	NC_007964	TTTGA	2	10	181490	181499	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
28	NC_007964	CAAAA	2	10	183152	183161	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
29	NC_007964	GCATG	2	10	188068	188077	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
30	NC_007964	CCCGA	2	10	188166	188175	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
31	NC_007964	CGGCC	2	10	189315	189324	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
32	NC_007964	TCAAA	2	10	191557	191566	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
33	NC_007964	GAGGT	2	10	192956	192965	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
34	NC_007964	ATGGC	2	10	202460	202469	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
35	NC_007964	GAGCG	2	10	205753	205762	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
36	NC_007964	GATCC	2	10	208280	208289	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
37	NC_007964	CAAAA	2	10	223280	223289	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
38	NC_007964	TCGGG	2	10	225885	225894	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
39	NC_007964	TTCCC	2	10	229070	229079	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
40	NC_007964	TGCGC	2	10	235269	235278	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
41	NC_007964	ATCGA	2	10	237906	237915	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
42	NC_007964	GCATC	2	10	249491	249500	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
43	NC_007964	TGCCG	2	10	252888	252897	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
44	NC_007964	TTTTG	2	10	254590	254599	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
45	NC_007964	TGCGG	2	10	256278	256287	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
46	NC_007964	GACCA	2	10	257412	257421	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
47	NC_007964	GACGC	2	10	263082	263091	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
48	NC_007964	CGCGG	2	10	273516	273525	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
49	NC_007964	TCAAA	2	10	273691	273700	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
50	NC_007964	ATGGA	2	10	273781	273790	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
51	NC_007964	GCGAT	2	10	281465	281474	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
52	NC_007964	CCCGG	2	10	284715	284724	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
53	NC_007964	GCGCG	2	10	287650	287659	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
54	NC_007964	GTTTT	2	10	289553	289562	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
55	NC_007964	CCTCT	2	10	296970	296979	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
56	NC_007964	GTCAA	2	10	298598	298607	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
57	NC_007964	ATTTT	2	10	298645	298654	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_007964	AAATC	2	10	298658	298667	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
59	NC_007964	TCGCG	2	10	298992	299001	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
60	NC_007964	TTTTG	2	10	305650	305659	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
61	NC_007964	TTTGA	2	10	309823	309832	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
62	NC_007964	GCAAT	2	10	313289	313298	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
63	NC_007964	GCACG	2	10	323752	323761	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
64	NC_007964	GCCTT	2	10	326794	326803	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
65	NC_007964	CTTTT	2	10	335747	335756	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
66	NC_007964	AGCAA	2	10	335921	335930	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
67	NC_007964	GACGC	2	10	349593	349602	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
68	NC_007964	TCCAT	2	10	355429	355438	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
69	NC_007964	AGCCT	2	10	360148	360157	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
70	NC_007964	CACGT	2	10	365756	365765	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
71	NC_007964	CGGCG	2	10	369262	369271	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
72	NC_007964	ATGAT	2	10	373989	373998	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
73	NC_007964	TATAA	2	10	381074	381083	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_007964	GAAGC	2	10	394421	394430	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
75	NC_007964	GCGAT	2	10	406550	406559	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
76	NC_007964	GGCGT	2	10	407626	407635	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
77	NC_007964	TCCGA	2	10	407829	407838	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
78	NC_007964	ATCCG	2	10	410377	410386	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
79	NC_007964	AGACC	2	10	413960	413969	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
80	NC_007964	GGAGC	2	10	414336	414345	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
81	NC_007964	ATCGA	2	10	416497	416506	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
82	NC_007964	GGTGG	2	10	416659	416668	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
83	NC_007964	GACGT	2	10	438459	438468	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
84	NC_007964	TCAAA	2	10	442169	442178	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
85	NC_007964	TCAAA	2	10	445682	445691	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
86	NC_007964	TCAAA	2	10	446396	446405	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
87	NC_007964	CGCCA	2	10	451382	451391	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
88	NC_007964	TCGAT	2	10	461332	461341	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
89	NC_007964	TCAAA	2	10	465847	465856	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
90	NC_007964	CTAAT	2	10	475598	475607	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
91	NC_007964	ACGGC	2	10	480879	480888	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
92	NC_007964	TCAAA	2	10	484123	484132	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
93	NC_007964	TCCGC	2	10	485256	485265	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
94	NC_007964	GTTAT	2	10	489612	489621	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
95	NC_007964	GGCCG	2	10	497734	497743	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
96	NC_007964	TTCGC	2	10	517924	517933	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
97	NC_007964	ACCCA	2	10	533908	533917	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
98	NC_007964	TGAGT	2	10	533984	533993	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
99	NC_007964	TCAAA	2	10	537149	537158	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
100	NC_007964	AGCGA	2	10	537205	537214	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
101	NC_007964	CGGAT	2	10	545113	545122	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
102	NC_007964	CGAAG	2	10	550073	550082	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
103	NC_007964	TCAAA	2	10	552157	552166	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
104	NC_007964	TTTTG	2	10	560423	560432	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
105	NC_007964	ATGGA	2	10	566505	566514	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
106	NC_007964	GGGGA	2	10	568463	568472	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
107	NC_007964	GTCCG	2	10	571684	571693	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
108	NC_007964	ATGGA	2	10	571795	571804	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
109	NC_007964	TCAAA	2	10	583432	583441	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
110	NC_007964	TGATC	2	10	585721	585730	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
111	NC_007964	TACAG	2	10	589734	589743	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
112	NC_007964	AGACA	2	10	597779	597788	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
113	NC_007964	GCGGA	2	10	601878	601887	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
114	NC_007964	GATCA	2	10	611655	611664	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
115	NC_007964	AAAAG	2	10	615080	615089	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
116	NC_007964	CTAGA	2	10	622328	622337	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
117	NC_007964	TGCGG	2	10	627222	627231	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
118	NC_007964	TCGCT	2	10	630245	630254	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
119	NC_007964	TCTGT	2	10	632081	632090	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
120	NC_007964	CGCGG	2	10	633437	633446	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
121	NC_007964	AAAAT	2	10	648579	648588	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_007964	AGCGT	2	10	662684	662693	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
123	NC_007964	CTATG	2	10	666197	666206	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
124	NC_007964	CGGCG	2	10	667235	667244	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
125	NC_007964	GGACC	2	10	671066	671075	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
126	NC_007964	TTGCA	2	10	680491	680500	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
127	NC_007964	AGGCG	2	10	680503	680512	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
128	NC_007964	TGATC	2	10	690970	690979	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
129	NC_007964	CGTTT	2	10	703608	703617	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
130	NC_007964	GTCAA	2	10	710371	710380	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
131	NC_007964	GCGCC	2	10	716528	716537	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
132	NC_007964	ATACT	2	10	718367	718376	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
133	NC_007964	TCGTG	2	10	724644	724653	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
134	NC_007964	GGGCT	2	10	724789	724798	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
135	NC_007964	CGCAA	2	10	725716	725725	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
136	NC_007964	ATTGG	2	10	727460	727469	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
137	NC_007964	TTGAA	2	10	727768	727777	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
138	NC_007964	ATCCC	2	10	728890	728899	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
139	NC_007964	CCGGC	2	10	731753	731762	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
140	NC_007964	TCAAA	2	10	739845	739854	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
141	NC_007964	TTTGA	2	10	747344	747353	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
142	NC_007964	CGCTC	2	10	747768	747777	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
143	NC_007964	TATCG	2	10	748070	748079	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
144	NC_007964	CGACC	2	10	753013	753022	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
145	NC_007964	TCAAA	2	10	756705	756714	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
146	NC_007964	TCGAT	2	10	756848	756857	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
147	NC_007964	CTGCG	2	10	756937	756946	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
148	NC_007964	TCCAT	2	10	775605	775614	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
149	NC_007964	ATCGC	2	10	775665	775674	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
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151	NC_007964	AACAA	2	10	789759	789768	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
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176	NC_007964	TGCCG	2	10	951946	951955	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
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192	NC_007964	AGGCG	2	10	1034919	1034928	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
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257	NC_007964	GAGCG	2	10	1322883	1322892	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
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279	NC_007964	TCGCT	2	10	1393033	1393042	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
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281	NC_007964	CAGGG	2	10	1400926	1400935	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
282	NC_007964	TCAGG	2	10	1401798	1401807	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
283	NC_007964	GGCCG	2	10	1403666	1403675	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
284	NC_007964	GAAAT	2	10	1406611	1406620	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
285	NC_007964	GGTTT	2	10	1412987	1412996	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
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287	NC_007964	GCGGG	2	10	1444548	1444557	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
288	NC_007964	TAACT	2	10	1448956	1448965	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
289	NC_007964	CAAAA	2	10	1450491	1450500	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
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294	NC_007964	TTTTG	2	10	1487217	1487226	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
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321	NC_007964	CATCC	2	10	1631738	1631747	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
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352	NC_007964	CTGTC	2	10	1833769	1833778	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
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361	NC_007964	TCTCC	2	10	1862867	1862876	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
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402	NC_007964	ACGTT	2	10	2141652	2141661	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
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406	NC_007964	CAAGC	2	10	2157503	2157512	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
407	NC_007964	ATCCG	2	10	2163731	2163740	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
408	NC_007964	TGACC	2	10	2163834	2163843	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
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410	NC_007964	GACCG	2	10	2175343	2175352	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
411	NC_007964	GAGTA	2	10	2176019	2176028	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
412	NC_007964	GAGCG	2	10	2176315	2176324	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
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419	NC_007964	GCGCC	2	10	2191880	2191889	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
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421	NC_007964	CATCG	2	10	2208317	2208326	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
422	NC_007964	CTCGG	2	10	2214503	2214512	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
423	NC_007964	GCGTA	2	10	2214618	2214627	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
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425	NC_007964	CACGT	2	10	2248562	2248571	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
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444	NC_007964	GGCGC	2	10	2381752	2381761	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
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472	NC_007964	ATTGC	2	10	2492705	2492714	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
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