MICAS: Microsatellite Analysis Server

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Nitrobacter hamburgensis X14 chromosome

Total Repeats: 2459

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_007964	CGGA	2	8	1724	1731	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
2	NC_007964	GTTT	2	8	8534	8541	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
3	NC_007964	GCAG	2	8	14177	14184	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
4	NC_007964	CGCC	2	8	16755	16762	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
5	NC_007964	AGGC	2	8	21415	21422	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
6	NC_007964	CGAT	2	8	27372	27379	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
7	NC_007964	TCAG	2	8	28999	29006	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
8	NC_007964	ATCC	2	8	34968	34975	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
9	NC_007964	GATG	2	8	35003	35010	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
10	NC_007964	CGCC	2	8	39546	39553	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
11	NC_007964	ACCC	2	8	40698	40705	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
12	NC_007964	TGGA	2	8	43262	43269	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
13	NC_007964	ATGG	2	8	45316	45323	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
14	NC_007964	CCGG	2	8	46718	46725	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
15	NC_007964	TCGC	2	8	47615	47622	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
16	NC_007964	GGCG	2	8	47804	47811	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
17	NC_007964	TGAT	2	8	47857	47864	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
18	NC_007964	TCGG	2	8	53201	53208	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
19	NC_007964	TGGC	2	8	53212	53219	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
20	NC_007964	CAAT	2	8	56542	56549	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
21	NC_007964	CGAT	2	8	63388	63395	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
22	NC_007964	CGGC	2	8	71490	71497	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
23	NC_007964	GCCG	2	8	71503	71510	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
24	NC_007964	CTTT	2	8	71527	71534	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
25	NC_007964	CTTG	2	8	76285	76292	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
26	NC_007964	CCGG	2	8	77108	77115	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
27	NC_007964	GATC	2	8	77267	77274	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
28	NC_007964	CGTG	2	8	78096	78103	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
29	NC_007964	ATGG	2	8	79279	79286	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
30	NC_007964	AACC	2	8	79297	79304	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
31	NC_007964	AACC	2	8	79313	79320	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
32	NC_007964	CGAT	2	8	81775	81782	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
33	NC_007964	TCAA	2	8	84017	84024	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
34	NC_007964	CATC	2	8	87813	87820	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
35	NC_007964	AACG	2	8	92803	92810	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
36	NC_007964	GACA	2	8	92944	92951	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
37	NC_007964	GGAT	2	8	99518	99525	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
38	NC_007964	CCGG	2	8	99796	99803	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
39	NC_007964	ATCC	2	8	107904	107911	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
40	NC_007964	TCCC	2	8	108843	108850	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
41	NC_007964	GGGA	2	8	108858	108865	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
42	NC_007964	GGAT	2	8	110955	110962	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
43	NC_007964	GCGA	2	8	116845	116852	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
44	NC_007964	TTCG	2	8	120477	120484	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
45	NC_007964	GATC	2	8	120487	120494	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
46	NC_007964	CCCG	2	8	122472	122479	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
47	NC_007964	GAAA	2	8	122502	122509	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
48	NC_007964	GCGA	2	8	126268	126275	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
49	NC_007964	CGAG	2	8	129082	129089	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
50	NC_007964	CGGC	2	8	135071	135078	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
51	NC_007964	TACC	2	8	135291	135298	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
52	NC_007964	TTTG	2	8	138226	138233	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
53	NC_007964	AAGC	2	8	147850	147857	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
54	NC_007964	GGAT	2	8	151475	151482	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
55	NC_007964	GATC	2	8	156258	156265	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
56	NC_007964	GAAA	2	8	158839	158846	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
57	NC_007964	CGGA	2	8	161753	161760	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
58	NC_007964	AACT	2	8	164299	164306	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
59	NC_007964	CAAA	2	8	166777	166784	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
60	NC_007964	GAAT	2	8	172878	172885	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
61	NC_007964	GATC	2	8	174146	174153	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
62	NC_007964	CGGC	2	8	178680	178687	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
63	NC_007964	TTCG	2	8	178704	178711	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
64	NC_007964	GGAT	2	8	180414	180421	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
65	NC_007964	CATC	2	8	183037	183044	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
66	NC_007964	CGCT	2	8	183075	183082	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
67	NC_007964	CCGG	2	8	185157	185164	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
68	NC_007964	TTGA	2	8	192412	192419	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
69	NC_007964	CCGG	2	8	193058	193065	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
70	NC_007964	CCGG	2	8	193122	193129	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
71	NC_007964	CATC	2	8	193802	193809	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
72	NC_007964	CCGC	2	8	197713	197720	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
73	NC_007964	ATGA	2	8	197755	197762	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
74	NC_007964	AACG	2	8	197766	197773	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
75	NC_007964	ACGG	2	8	197844	197851	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
76	NC_007964	TGCG	2	8	202491	202498	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
77	NC_007964	TACC	2	8	202525	202532	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
78	NC_007964	TATT	2	8	209111	209118	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_007964	TGTC	2	8	209133	209140	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
80	NC_007964	ATTG	2	8	210632	210639	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
81	NC_007964	TCAG	2	8	210642	210649	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
82	NC_007964	GCAA	2	8	210710	210717	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
83	NC_007964	CGGT	2	8	218845	218852	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
84	NC_007964	AGGC	2	8	222168	222175	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
85	NC_007964	CGAG	2	8	223044	223051	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
86	NC_007964	TTGA	2	8	225828	225835	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
87	NC_007964	ATGG	2	8	228291	228298	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
88	NC_007964	ACCT	2	8	228809	228816	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
89	NC_007964	CGGC	2	8	233716	233723	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
90	NC_007964	TGGA	2	8	234442	234449	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
91	NC_007964	CGCC	2	8	236925	236932	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
92	NC_007964	CCGG	2	8	236965	236972	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
93	NC_007964	TCAA	2	8	237794	237801	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
94	NC_007964	CGAT	2	8	237932	237939	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
95	NC_007964	GCGG	2	8	237963	237970	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
96	NC_007964	TGGC	2	8	239235	239242	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
97	NC_007964	GCCG	2	8	239358	239365	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
98	NC_007964	GCGA	2	8	240695	240702	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
99	NC_007964	ATGT	2	8	240718	240725	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
100	NC_007964	ATGA	2	8	249406	249413	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
101	NC_007964	TTGA	2	8	254839	254846	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
102	NC_007964	CTGG	2	8	261844	261851	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
103	NC_007964	GCGA	2	8	266364	266371	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
104	NC_007964	CGGC	3	12	273479	273490	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
105	NC_007964	AATT	2	8	273635	273642	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_007964	GCGG	2	8	273804	273811	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
107	NC_007964	TGAT	2	8	278560	278567	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
108	NC_007964	TCGA	2	8	279308	279315	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
109	NC_007964	GGAT	2	8	289565	289572	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
110	NC_007964	GCGA	2	8	291127	291134	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
111	NC_007964	CAGC	2	8	295850	295857	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
112	NC_007964	CAGC	2	8	297014	297021	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
113	NC_007964	CTGC	2	8	298713	298720	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
114	NC_007964	ACGC	2	8	298744	298751	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
115	NC_007964	CCGC	2	8	299716	299723	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
116	NC_007964	AGCG	2	8	305745	305752	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
117	NC_007964	TTCA	2	8	309635	309642	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
118	NC_007964	GACA	2	8	309734	309741	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
119	NC_007964	GCCA	2	8	310093	310100	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
120	NC_007964	TGCC	2	8	310516	310523	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
121	NC_007964	CGAT	2	8	310725	310732	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
122	NC_007964	GCCG	2	8	310994	311001	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
123	NC_007964	CATC	2	8	311012	311019	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
124	NC_007964	CGGT	2	8	313309	313316	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
125	NC_007964	AGCG	2	8	313489	313496	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
126	NC_007964	GCGA	2	8	313499	313506	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
127	NC_007964	GGAT	2	8	316241	316248	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
128	NC_007964	ATGC	2	8	319720	319727	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
129	NC_007964	CACC	2	8	322833	322840	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
130	NC_007964	CAAG	2	8	323284	323291	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
131	NC_007964	GGCC	2	8	323625	323632	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
132	NC_007964	GTTC	2	8	323831	323838	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
133	NC_007964	TCGT	2	8	324744	324751	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
134	NC_007964	TTTC	2	8	326282	326289	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
135	NC_007964	CCTG	2	8	326319	326326	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
136	NC_007964	TTTC	2	8	326390	326397	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
137	NC_007964	TTGT	2	8	326674	326681	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
138	NC_007964	GCCA	2	8	327227	327234	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
139	NC_007964	AGGG	2	8	327307	327314	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
140	NC_007964	AGGG	2	8	328773	328780	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
141	NC_007964	GCGT	2	8	333720	333727	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
142	NC_007964	CGAA	2	8	333875	333882	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
143	NC_007964	GCCG	2	8	333980	333987	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
144	NC_007964	AGCG	2	8	334032	334039	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
145	NC_007964	CCCA	2	8	334992	334999	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
146	NC_007964	ACCA	2	8	336346	336353	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
147	NC_007964	GCCA	2	8	336718	336725	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
148	NC_007964	TTTC	2	8	340962	340969	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
149	NC_007964	CTGC	2	8	350693	350700	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
150	NC_007964	CAGG	2	8	353148	353155	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
151	NC_007964	CACG	2	8	354896	354903	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
152	NC_007964	AGGA	2	8	355324	355331	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
153	NC_007964	TGAA	2	8	355366	355373	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
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162	NC_007964	GTTT	2	8	374204	374211	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
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172	NC_007964	GCCG	2	8	405618	405625	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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186	NC_007964	AGGG	2	8	411701	411708	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
187	NC_007964	ACCC	2	8	412014	412021	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
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189	NC_007964	TCGA	2	8	413217	413224	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
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