MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Nitrobacter hamburgensis X14 chromosome

Total Repeats: 17318

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_007964	TGA	2	6	1117924	1117929	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4002	NC_007964	CG	3	6	1117944	1117949	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4003	NC_007964	AGG	2	6	1117987	1117992	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4004	NC_007964	GCC	2	6	1118002	1118007	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4005	NC_007964	GCA	2	6	1118008	1118013	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4006	NC_007964	CGGATG	2	12	1118201	1118212	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
4007	NC_007964	CCG	2	6	1118213	1118218	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4008	NC_007964	CG	3	6	1118313	1118318	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4009	NC_007964	GCG	2	6	1118402	1118407	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4010	NC_007964	TGC	2	6	1118463	1118468	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4011	NC_007964	GCGCG	2	10	1118493	1118502	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
4012	NC_007964	CGG	2	6	1118508	1118513	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4013	NC_007964	CG	3	6	1118577	1118582	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4014	NC_007964	ATCGAC	2	12	1118587	1118598	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
4015	NC_007964	CG	3	6	1118627	1118632	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4016	NC_007964	GAT	2	6	1118647	1118652	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4017	NC_007964	CGGCG	2	10	1118673	1118682	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
4018	NC_007964	CGG	2	6	1118688	1118693	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4019	NC_007964	TCG	2	6	1118705	1118710	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4020	NC_007964	CG	3	6	1118709	1118714	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4021	NC_007964	CCG	2	6	1118726	1118731	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4022	NC_007964	AGC	2	6	1118783	1118788	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4023	NC_007964	GGC	2	6	1118808	1118813	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4024	NC_007964	CGG	3	9	1118833	1118841	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4025	NC_007964	CCTG	2	8	1118844	1118851	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
4026	NC_007964	TTC	2	6	1118900	1118905	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4027	NC_007964	CGATA	2	10	1118939	1118948	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
4028	NC_007964	CGG	3	9	1118965	1118973	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4029	NC_007964	CG	3	6	1119007	1119012	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4030	NC_007964	CCAG	2	8	1119031	1119038	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
4031	NC_007964	GGC	2	6	1119049	1119054	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4032	NC_007964	GCCGC	2	10	1119075	1119084	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
4033	NC_007964	CTT	2	6	1119095	1119100	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4034	NC_007964	GCA	2	6	1119138	1119143	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4035	NC_007964	ATT	2	6	1119155	1119160	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4036	NC_007964	T	6	6	1119279	1119284	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4037	NC_007964	CT	3	6	1120259	1120264	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4038	NC_007964	CCG	2	6	1120315	1120320	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4039	NC_007964	CTG	2	6	1120340	1120345	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4040	NC_007964	ACA	2	6	1120374	1120379	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4041	NC_007964	GAA	2	6	1126399	1126404	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4042	NC_007964	GAA	2	6	1126508	1126513	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4043	NC_007964	GGC	2	6	1126514	1126519	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4044	NC_007964	CAT	2	6	1126547	1126552	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4045	NC_007964	T	7	7	1126599	1126605	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4046	NC_007964	CGG	2	6	1126653	1126658	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4047	NC_007964	CGC	2	6	1126661	1126666	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4048	NC_007964	GGT	2	6	1126827	1126832	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4049	NC_007964	GACC	2	8	1126883	1126890	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
4050	NC_007964	GCCG	2	8	1127006	1127013	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4051	NC_007964	CG	3	6	1127012	1127017	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4052	NC_007964	GC	3	6	1127056	1127061	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4053	NC_007964	GCG	2	6	1127120	1127125	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4054	NC_007964	CGC	2	6	1127126	1127131	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4055	NC_007964	CGC	2	6	1127160	1127165	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4056	NC_007964	GAGC	2	8	1127226	1127233	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
4057	NC_007964	CGC	2	6	1127258	1127263	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4058	NC_007964	CTG	2	6	1127296	1127301	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4059	NC_007964	GC	3	6	1127312	1127317	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4060	NC_007964	TGC	2	6	1127348	1127353	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4061	NC_007964	CGC	3	9	1127492	1127500	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4062	NC_007964	GCC	2	6	1127565	1127570	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4063	NC_007964	CTT	2	6	1127632	1127637	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4064	NC_007964	TCGGA	2	10	1127681	1127690	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
4065	NC_007964	TCGG	2	8	1127728	1127735	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
4066	NC_007964	TCG	2	6	1127788	1127793	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4067	NC_007964	CTGGGC	2	12	1127856	1127867	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
4068	NC_007964	CG	3	6	1127894	1127899	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4069	NC_007964	ACG	2	6	1127917	1127922	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4070	NC_007964	GAC	3	9	1127979	1127987	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4071	NC_007964	AGC	2	6	1127994	1127999	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4072	NC_007964	GC	3	6	1128032	1128037	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4073	NC_007964	GCCGT	2	10	1128055	1128064	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
4074	NC_007964	CGG	2	6	1128072	1128077	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4075	NC_007964	GCC	2	6	1128230	1128235	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4076	NC_007964	CGG	2	6	1128265	1128270	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4077	NC_007964	GC	3	6	1128275	1128280	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4078	NC_007964	TGG	2	6	1128298	1128303	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4079	NC_007964	GAC	2	6	1128311	1128316	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4080	NC_007964	GCC	2	6	1128330	1128335	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4081	NC_007964	GCCGGT	2	12	1128371	1128382	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
4082	NC_007964	CCG	2	6	1128391	1128396	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4083	NC_007964	GCC	2	6	1128398	1128403	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4084	NC_007964	TCG	2	6	1128439	1128444	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4085	NC_007964	GCC	2	6	1128488	1128493	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4086	NC_007964	ACCGCG	2	12	1128504	1128515	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
4087	NC_007964	CGG	2	6	1128523	1128528	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4088	NC_007964	CGT	2	6	1128542	1128547	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4089	NC_007964	TGG	2	6	1128556	1128561	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4090	NC_007964	GAC	2	6	1128569	1128574	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4091	NC_007964	GCC	2	6	1128588	1128593	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4092	NC_007964	GCCGGT	2	12	1128629	1128640	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
4093	NC_007964	CCG	2	6	1128649	1128654	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4094	NC_007964	GCC	2	6	1128656	1128661	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4095	NC_007964	TCG	2	6	1128697	1128702	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4096	NC_007964	GCC	2	6	1128746	1128751	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4097	NC_007964	ACCGCG	2	12	1128762	1128773	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
4098	NC_007964	CGG	2	6	1128781	1128786	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4099	NC_007964	CGT	2	6	1128800	1128805	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4100	NC_007964	TGG	2	6	1128814	1128819	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4101	NC_007964	GAC	2	6	1128827	1128832	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4102	NC_007964	CCG	2	6	1128907	1128912	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4103	NC_007964	GCC	2	6	1128914	1128919	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4104	NC_007964	GCC	2	6	1129004	1129009	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4105	NC_007964	ACCGCG	2	12	1129020	1129031	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
4106	NC_007964	CGG	2	6	1129039	1129044	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4107	NC_007964	TGG	2	6	1129072	1129077	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4108	NC_007964	GAC	2	6	1129085	1129090	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4109	NC_007964	CCG	2	6	1129165	1129170	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4110	NC_007964	GCC	2	6	1129172	1129177	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4111	NC_007964	GCG	2	6	1129221	1129226	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4112	NC_007964	CGTCAC	2	12	1129238	1129249	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
4113	NC_007964	GTAC	2	8	1129319	1129326	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
4114	NC_007964	CCG	2	6	1129327	1129332	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4115	NC_007964	TCG	2	6	1129333	1129338	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4116	NC_007964	CGC	2	6	1129418	1129423	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4117	NC_007964	GCC	2	6	1129424	1129429	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4118	NC_007964	CGG	2	6	1129508	1129513	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4119	NC_007964	TGG	2	6	1129561	1129566	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4120	NC_007964	GCC	2	6	1129656	1129661	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4121	NC_007964	GCCGC	2	10	1129683	1129692	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
4122	NC_007964	GCG	3	9	1129767	1129775	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4123	NC_007964	CTGT	2	8	1129833	1129840	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
4124	NC_007964	CGTGC	2	10	1129877	1129886	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
4125	NC_007964	GCGCC	2	10	1129954	1129963	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
4126	NC_007964	GACT	2	8	1129983	1129990	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
4127	NC_007964	GCG	2	6	1130047	1130052	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4128	NC_007964	CGC	3	9	1130072	1130080	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4129	NC_007964	CGG	2	6	1130137	1130142	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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4243	NC_007964	CCT	2	6	1168755	1168760	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4244	NC_007964	TTC	2	6	1168811	1168816	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4245	NC_007964	T	6	6	1168862	1168867	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4246	NC_007964	CG	3	6	1168987	1168992	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4247	NC_007964	GCTT	2	8	1169085	1169092	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
4248	NC_007964	CGA	2	6	1169107	1169112	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4249	NC_007964	CTG	2	6	1171215	1171220	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4250	NC_007964	GCAG	2	8	1171235	1171242	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
4251	NC_007964	GC	3	6	1171283	1171288	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4252	NC_007964	AGGG	2	8	1171295	1171302	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
4253	NC_007964	ATCGG	2	10	1171303	1171312	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
4254	NC_007964	AG	3	6	1171358	1171363	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4255	NC_007964	TGG	2	6	1171399	1171404	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4256	NC_007964	CGA	2	6	1171445	1171450	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4257	NC_007964	TTG	2	6	1171451	1171456	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4258	NC_007964	GAT	3	9	1171526	1171534	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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4260	NC_007964	CGG	2	6	1172105	1172110	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4261	NC_007964	TCGG	2	8	1172867	1172874	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
4262	NC_007964	CATG	2	8	1172914	1172921	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
4263	NC_007964	ACTG	2	8	1172964	1172971	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
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4391	NC_007964	GC	3	6	1209856	1209861	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4392	NC_007964	GCA	2	6	1209920	1209925	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4393	NC_007964	CGGC	2	8	1209943	1209950	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4394	NC_007964	AG	3	6	1209974	1209979	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4395	NC_007964	CGG	2	6	1210088	1210093	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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4397	NC_007964	GGT	2	6	1211157	1211162	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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4399	NC_007964	CGG	2	6	1212619	1212624	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4400	NC_007964	GGCG	2	8	1212635	1212642	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
4401	NC_007964	CCGCG	2	10	1213642	1213651	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
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4403	NC_007964	A	7	7	1213821	1213827	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4411	NC_007964	GA	3	6	1216525	1216530	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4412	NC_007964	CGG	2	6	1216565	1216570	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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4425	NC_007964	GCTG	2	8	1223554	1223561	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
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4499	NC_007964	CGCCC	2	10	1245535	1245544	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
4500	NC_007964	TGA	2	6	1245588	1245593	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding

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