MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Nitrobacter hamburgensis X14 plasmid 3

Total Repeats: 80

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_007961	GGGC	2	8	67	74	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
2	NC_007961	GTTC	2	8	94	101	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
3	NC_007961	GTTG	2	8	5781	5788	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4	NC_007961	TCGA	2	8	5858	5865	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
5	NC_007961	CCGC	2	8	5878	5885	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
6	NC_007961	GCGG	2	8	6010	6017	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
7	NC_007961	CGAT	2	8	6068	6075	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
8	NC_007961	TCTT	2	8	6212	6219	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
9	NC_007961	ACCC	2	8	6349	6356	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
10	NC_007961	CTGC	2	8	6738	6745	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
11	NC_007961	GGGC	2	8	8417	8424	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
12	NC_007961	GCCG	2	8	12643	12650	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
13	NC_007961	AACA	2	8	12911	12918	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
14	NC_007961	CCGA	2	8	12981	12988	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
15	NC_007961	AGTC	2	8	14807	14814	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
16	NC_007961	TCTG	2	8	15677	15684	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
17	NC_007961	GGAC	2	8	26217	26224	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
18	NC_007961	GAAT	2	8	26563	26570	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
19	NC_007961	AAAG	2	8	28937	28944	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
20	NC_007961	GCGA	2	8	37029	37036	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
21	NC_007961	TCGG	2	8	38833	38840	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
22	NC_007961	CGAT	2	8	39134	39141	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
23	NC_007961	AGAT	2	8	39211	39218	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
24	NC_007961	CTGC	2	8	40965	40972	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
25	NC_007961	ATCA	2	8	43014	43021	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
26	NC_007961	CCCT	2	8	43610	43617	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
27	NC_007961	GACT	2	8	43662	43669	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
28	NC_007961	ATGG	2	8	44398	44405	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
29	NC_007961	CCGG	2	8	44695	44702	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
30	NC_007961	TCGC	2	8	45572	45579	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
31	NC_007961	AGCA	2	8	45687	45694	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
32	NC_007961	GCCA	2	8	48324	48331	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
33	NC_007961	TTGC	2	8	48608	48615	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
34	NC_007961	TGGA	2	8	50570	50577	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
35	NC_007961	GGCT	2	8	54531	54538	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
36	NC_007961	AAGC	2	8	54767	54774	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
37	NC_007961	TCCA	2	8	57022	57029	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
38	NC_007961	TCAT	2	8	64032	64039	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
39	NC_007961	GGCG	2	8	65424	65431	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
40	NC_007961	CAGC	2	8	65688	65695	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
41	NC_007961	TGCA	2	8	65996	66003	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
42	NC_007961	GTAA	2	8	66338	66345	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
43	NC_007961	CAGA	2	8	68282	68289	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
44	NC_007961	TCAC	2	8	68550	68557	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
45	NC_007961	TTGG	2	8	68637	68644	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
46	NC_007961	ACGG	2	8	68838	68845	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
47	NC_007961	CTGC	2	8	68869	68876	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
48	NC_007961	TGCA	2	8	71337	71344	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
49	NC_007961	AGCG	2	8	72161	72168	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
50	NC_007961	CGGT	2	8	72455	72462	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
51	NC_007961	CAAT	2	8	74597	74604	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
52	NC_007961	TCCA	2	8	74707	74714	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
53	NC_007961	CGTG	2	8	78158	78165	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
54	NC_007961	ACCA	2	8	78692	78699	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
55	NC_007961	AAGC	2	8	78807	78814	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
56	NC_007961	GCCA	2	8	78910	78917	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
57	NC_007961	TGGT	2	8	79065	79072	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
58	NC_007961	GGCC	2	8	80415	80422	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
59	NC_007961	CGGG	2	8	80796	80803	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
60	NC_007961	TTGA	2	8	80931	80938	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
61	NC_007961	GAAA	2	8	87803	87810	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
62	NC_007961	CTTT	2	8	94791	94798	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
63	NC_007961	CTGG	2	8	98101	98108	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
64	NC_007961	AGCG	2	8	98712	98719	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
65	NC_007961	GAGC	2	8	99171	99178	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
66	NC_007961	CTGA	2	8	100017	100024	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
67	NC_007961	GACG	2	8	100315	100322	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
68	NC_007961	GCGG	2	8	100587	100594	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
69	NC_007961	ACCG	2	8	102520	102527	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
70	NC_007961	CCGA	2	8	103147	103154	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
71	NC_007961	GCCA	2	8	103172	103179	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
72	NC_007961	TCGA	2	8	114361	114368	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
73	NC_007961	GCGT	2	8	114568	114575	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
74	NC_007961	GCTT	2	8	115682	115689	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
75	NC_007961	GGTT	2	8	115770	115777	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
76	NC_007961	AGCG	2	8	116598	116605	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
77	NC_007961	TTGC	2	8	116876	116883	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
78	NC_007961	CCGC	2	8	116998	117005	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
79	NC_007961	GACT	2	8	117024	117031	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
80	NC_007961	TTAA	2	8	121358	121365	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.