MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Nitrobacter hamburgensis X14 plasmid 1

Total Repeats: 2234

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_007959	AAC	2	6	46	51	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_007959	ATCGGC	2	12	1457	1468	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_007959	GAT	2	6	1480	1485	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4	NC_007959	GA	3	6	1523	1528	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5	NC_007959	CGG	2	6	1539	1544	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_007959	GCG	2	6	1559	1564	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_007959	TCA	2	6	1628	1633	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_007959	CGG	2	6	1646	1651	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_007959	CGAG	2	8	1655	1662	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
10	NC_007959	CGA	2	6	1703	1708	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_007959	GCT	2	6	1718	1723	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12	NC_007959	CGG	2	6	1838	1843	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_007959	GCA	2	6	1872	1877	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_007959	GGC	2	6	1908	1913	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_007959	ACC	2	6	1937	1942	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
16	NC_007959	GTC	2	6	1948	1953	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_007959	TAA	2	6	1967	1972	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_007959	CCG	2	6	1982	1987	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
19	NC_007959	TCG	2	6	2031	2036	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
20	NC_007959	GTT	2	6	2046	2051	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
21	NC_007959	GCA	2	6	2078	2083	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_007959	GGCT	2	8	2106	2113	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
23	NC_007959	AATC	2	8	2120	2127	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
24	NC_007959	GTCA	2	8	2241	2248	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
25	NC_007959	ACA	2	6	2282	2287	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
26	NC_007959	GC	4	8	2304	2311	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
27	NC_007959	TCG	2	6	2339	2344	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_007959	A	6	6	3627	3632	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_007959	TAT	2	6	3647	3652	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_007959	ATC	2	6	3653	3658	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_007959	TAA	2	6	3678	3683	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_007959	ACGAT	2	10	3690	3699	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
33	NC_007959	CCG	2	6	3748	3753	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
34	NC_007959	AAG	2	6	3913	3918	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
35	NC_007959	GAT	2	6	4009	4014	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
36	NC_007959	CG	3	6	6068	6073	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
37	NC_007959	GGGA	2	8	6105	6112	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
38	NC_007959	CA	3	6	7230	7235	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
39	NC_007959	AG	3	6	7237	7242	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
40	NC_007959	AAC	2	6	7260	7265	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_007959	AGG	2	6	8733	8738	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
42	NC_007959	ATCC	2	8	9201	9208	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
43	NC_007959	CGT	2	6	9240	9245	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
44	NC_007959	ACCG	2	8	9295	9302	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
45	NC_007959	ACC	2	6	9314	9319	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
46	NC_007959	CGG	2	6	10318	10323	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
47	NC_007959	TCA	3	9	10368	10376	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
48	NC_007959	GAC	2	6	10390	10395	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
49	NC_007959	GTTCTC	2	12	10521	10532	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
50	NC_007959	GCG	2	6	10542	10547	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
51	NC_007959	TGG	2	6	10553	10558	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
52	NC_007959	TTG	2	6	10562	10567	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
53	NC_007959	ACA	2	6	10580	10585	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
54	NC_007959	GTT	2	6	10596	10601	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
55	NC_007959	CAGT	2	8	10661	10668	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
56	NC_007959	AAG	3	9	10680	10688	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
57	NC_007959	CTC	2	6	10699	10704	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
58	NC_007959	TGC	2	6	10797	10802	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
59	NC_007959	GC	3	6	10819	10824	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
60	NC_007959	CTC	2	6	10932	10937	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
61	NC_007959	CACG	2	8	10939	10946	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
62	NC_007959	GCT	2	6	11054	11059	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
63	NC_007959	TTC	2	6	11100	11105	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
64	NC_007959	CTG	2	6	11150	11155	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
65	NC_007959	AAG	2	6	11218	11223	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
66	NC_007959	CTT	2	6	11256	11261	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
67	NC_007959	GCAAGG	2	12	11288	11299	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
68	NC_007959	GCAAG	2	10	11345	11354	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
69	NC_007959	TGT	2	6	11362	11367	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
70	NC_007959	AATG	2	8	11393	11400	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
71	NC_007959	CCG	2	6	11413	11418	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
72	NC_007959	AAC	2	6	11434	11439	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
73	NC_007959	CA	3	6	11443	11448	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
74	NC_007959	CGA	2	6	11471	11476	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
75	NC_007959	TCGA	2	8	11500	11507	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
76	NC_007959	CTC	2	6	11652	11657	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
77	NC_007959	CAT	2	6	11732	11737	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
78	NC_007959	GTGG	2	8	11745	11752	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
79	NC_007959	CTG	2	6	11769	11774	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
80	NC_007959	CAC	2	6	11777	11782	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
81	NC_007959	CAT	2	6	11871	11876	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
82	NC_007959	AT	3	6	11933	11938	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_007959	TA	4	8	11995	12002	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_007959	A	6	6	12373	12378	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_007959	CCGA	2	8	12440	12447	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
86	NC_007959	GAC	2	6	12464	12469	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
87	NC_007959	GA	3	6	12562	12567	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
88	NC_007959	GC	3	6	13041	13046	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
89	NC_007959	TA	3	6	13089	13094	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_007959	GCG	3	9	13119	13127	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
91	NC_007959	AAC	2	6	13159	13164	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
92	NC_007959	CG	3	6	13184	13189	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
93	NC_007959	CCT	2	6	13195	13200	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
94	NC_007959	GTC	2	6	13248	13253	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
95	NC_007959	AATCG	2	10	16800	16809	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
96	NC_007959	AC	3	6	16817	16822	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
97	NC_007959	TGT	2	6	16837	16842	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
98	NC_007959	GC	3	6	16844	16849	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
99	NC_007959	ACA	2	6	16856	16861	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
100	NC_007959	ACTG	2	8	16913	16920	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
101	NC_007959	GTG	2	6	16968	16973	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
102	NC_007959	CCGG	2	8	17385	17392	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
103	NC_007959	CGT	2	6	17440	17445	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
104	NC_007959	CGG	2	6	17453	17458	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
105	NC_007959	GCC	2	6	17534	17539	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
106	NC_007959	GCC	2	6	17591	17596	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
107	NC_007959	TTC	2	6	17598	17603	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
108	NC_007959	AGC	2	6	17730	17735	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
109	NC_007959	TAA	2	6	17736	17741	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_007959	CT	3	6	17840	17845	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
111	NC_007959	GCC	2	6	17897	17902	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
112	NC_007959	GCTCC	2	10	18038	18047	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
113	NC_007959	GTCG	2	8	18095	18102	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
114	NC_007959	CCAC	2	8	18106	18113	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
115	NC_007959	ACG	2	6	18126	18131	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
116	NC_007959	GC	3	6	18159	18164	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
117	NC_007959	ATG	2	6	18237	18242	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
118	NC_007959	GTC	2	6	18370	18375	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
119	NC_007959	CCG	2	6	18378	18383	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
120	NC_007959	TCA	2	6	18426	18431	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
121	NC_007959	GC	4	8	18452	18459	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
122	NC_007959	CAC	2	6	18497	18502	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
123	NC_007959	CGC	2	6	18514	18519	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
124	NC_007959	CTG	2	6	18558	18563	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
125	NC_007959	GC	3	6	18577	18582	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
126	NC_007959	GACT	2	8	18597	18604	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
127	NC_007959	TTCG	2	8	18632	18639	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
128	NC_007959	TCA	2	6	18720	18725	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
129	NC_007959	GCG	3	9	18747	18755	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
130	NC_007959	CGG	2	6	18811	18816	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
131	NC_007959	GC	3	6	18822	18827	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
132	NC_007959	AAT	2	6	19022	19027	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_007959	CAA	2	6	20958	20963	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
134	NC_007959	ACAA	2	8	22127	22134	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
135	NC_007959	GAAT	2	8	22187	22194	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
136	NC_007959	GC	3	6	23603	23608	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
137	NC_007959	GCC	2	6	23736	23741	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
138	NC_007959	CAG	2	6	23749	23754	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
139	NC_007959	AGCGC	2	10	23779	23788	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
140	NC_007959	GGC	2	6	23822	23827	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
141	NC_007959	GCG	2	6	23829	23834	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
142	NC_007959	AGC	2	6	23847	23852	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
143	NC_007959	CTG	2	6	23878	23883	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
144	NC_007959	CGG	2	6	23896	23901	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
145	NC_007959	GAA	2	6	23918	23923	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
146	NC_007959	GCT	2	6	24065	24070	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
147	NC_007959	CCA	2	6	24111	24116	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
148	NC_007959	GCCT	2	8	24130	24137	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
149	NC_007959	CCTGG	2	10	24162	24171	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
150	NC_007959	CCG	2	6	24189	24194	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
151	NC_007959	GTC	2	6	24205	24210	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
152	NC_007959	TG	3	6	24249	24254	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
153	NC_007959	GAC	2	6	24283	24288	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
154	NC_007959	GC	4	8	24290	24297	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
155	NC_007959	CGA	2	6	24322	24327	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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159	NC_007959	TG	3	6	25316	25321	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
160	NC_007959	GTGGCC	2	12	25336	25347	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
161	NC_007959	GA	3	6	25370	25375	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
162	NC_007959	GCG	2	6	25398	25403	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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164	NC_007959	CGC	2	6	25459	25464	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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166	NC_007959	GCCT	2	8	25501	25508	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
167	NC_007959	CG	3	6	25528	25533	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
168	NC_007959	TC	3	6	25539	25544	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
169	NC_007959	CTC	2	6	25638	25643	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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172	NC_007959	CGA	2	6	25670	25675	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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175	NC_007959	GTC	2	6	25801	25806	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
176	NC_007959	CGAT	2	8	25899	25906	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
177	NC_007959	GCT	2	6	25927	25932	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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184	NC_007959	GCG	2	6	26223	26228	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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199	NC_007959	GGC	2	6	26784	26789	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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252	NC_007959	CG	3	6	31884	31889	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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268	NC_007959	GC	3	6	32969	32974	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
269	NC_007959	GCA	2	6	32982	32987	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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272	NC_007959	GGT	2	6	33046	33051	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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274	NC_007959	AT	4	8	33194	33201	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
275	NC_007959	GC	3	6	33213	33218	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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277	NC_007959	TGG	2	6	33284	33289	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
278	NC_007959	GAGG	2	8	33312	33319	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
279	NC_007959	TAGA	2	8	33509	33516	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
280	NC_007959	CATG	2	8	33526	33533	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
281	NC_007959	GCG	2	6	33599	33604	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
282	NC_007959	CAA	2	6	33640	33645	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
283	NC_007959	AAT	2	6	33657	33662	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
284	NC_007959	CCG	2	6	33686	33691	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
285	NC_007959	ACGCT	2	10	33735	33744	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
286	NC_007959	CTG	2	6	33893	33898	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
287	NC_007959	ATC	2	6	33908	33913	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
288	NC_007959	GCCG	2	8	33934	33941	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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293	NC_007959	TCC	2	6	36552	36557	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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326	NC_007959	TGG	2	6	44172	44177	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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332	NC_007959	GCG	2	6	46324	46329	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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420	NC_007959	ATC	2	6	53357	53362	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
421	NC_007959	CGA	2	6	53526	53531	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
422	NC_007959	AT	3	6	53567	53572	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
423	NC_007959	TTG	2	6	53662	53667	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
424	NC_007959	GCC	2	6	55025	55030	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
425	NC_007959	GGC	2	6	55068	55073	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
426	NC_007959	ACA	2	6	55139	55144	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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