MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Neorickettsia sennetsu str. Miyayama chromosome

Total Repeats: 2148

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_007798	TA	3	6	3611	3616	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_007798	TGT	2	6	7888	7893	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3	NC_007798	TATTT	2	10	7897	7906	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_007798	CAGC	2	8	8185	8192	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
5	NC_007798	GCA	2	6	8203	8208	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_007798	ACC	2	6	8818	8823	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7	NC_007798	T	6	6	8843	8848	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_007798	CTT	2	6	8877	8882	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_007798	T	7	7	10085	10091	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_007798	GTT	2	6	10110	10115	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11	NC_007798	TGG	2	6	10211	10216	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
12	NC_007798	TGGA	2	8	12351	12358	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
13	NC_007798	TACTT	2	10	12374	12383	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
14	NC_007798	ACT	2	6	12418	12423	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_007798	TAT	2	6	12434	12439	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_007798	TAT	2	6	14339	14344	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_007798	GA	3	6	14494	14499	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
18	NC_007798	AACC	2	8	14765	14772	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
19	NC_007798	GTA	2	6	14787	14792	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
20	NC_007798	CGA	2	6	14799	14804	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
21	NC_007798	ACC	2	6	14818	14823	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
22	NC_007798	GACC	2	8	14827	14834	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
23	NC_007798	GTG	2	6	14844	14849	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
24	NC_007798	ACC	2	6	14873	14878	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
25	NC_007798	CA	3	6	15057	15062	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
26	NC_007798	CGCTG	2	10	15109	15118	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
27	NC_007798	TTA	2	6	17084	17089	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_007798	T	6	6	17090	17095	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_007798	TGTT	2	8	17167	17174	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
30	NC_007798	AT	3	6	17215	17220	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_007798	CCT	2	6	17246	17251	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
32	NC_007798	GT	3	6	17256	17261	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
33	NC_007798	TAAG	2	8	18048	18055	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
34	NC_007798	TCT	2	6	18086	18091	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_007798	ACC	2	6	18709	18714	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
36	NC_007798	AGG	2	6	18749	18754	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
37	NC_007798	GGGT	2	8	21090	21097	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
38	NC_007798	TG	3	6	21112	21117	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
39	NC_007798	TG	3	6	21135	21140	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
40	NC_007798	TTGT	2	8	21184	21191	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
41	NC_007798	CG	3	6	21316	21321	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
42	NC_007798	TGTCG	2	10	21533	21542	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
43	NC_007798	AAG	2	6	21612	21617	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
44	NC_007798	TTG	2	6	22368	22373	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
45	NC_007798	GAA	2	6	22488	22493	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
46	NC_007798	AAT	2	6	23351	23356	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_007798	TCAT	2	8	23480	23487	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
48	NC_007798	CG	3	6	23538	23543	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
49	NC_007798	CTT	2	6	23554	23559	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
50	NC_007798	A	7	7	23652	23658	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_007798	CGG	2	6	23699	23704	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
52	NC_007798	TCCTC	2	10	23743	23752	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
53	NC_007798	ATC	2	6	23762	23767	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
54	NC_007798	AGC	2	6	23773	23778	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
55	NC_007798	AGA	2	6	23829	23834	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
56	NC_007798	AAG	2	6	23856	23861	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
57	NC_007798	AGT	2	6	23908	23913	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
58	NC_007798	AGA	2	6	24788	24793	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
59	NC_007798	CTG	2	6	24948	24953	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
60	NC_007798	GCG	2	6	25000	25005	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
61	NC_007798	TGC	2	6	26141	26146	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
62	NC_007798	TAA	2	6	26149	26154	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_007798	GCTC	2	8	26214	26221	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
64	NC_007798	AAT	2	6	26247	26252	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_007798	TA	3	6	26910	26915	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_007798	TAG	2	6	26984	26989	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
67	NC_007798	GAA	2	6	27121	27126	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
68	NC_007798	GAGT	2	8	27146	27153	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
69	NC_007798	TGC	2	6	27167	27172	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
70	NC_007798	CAAA	2	8	27238	27245	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
71	NC_007798	ATA	2	6	27246	27251	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_007798	AATAA	2	10	27319	27328	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_007798	ACA	2	6	27352	27357	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
74	NC_007798	CTG	2	6	27401	27406	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
75	NC_007798	ATA	2	6	27450	27455	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_007798	GCA	2	6	27478	27483	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
77	NC_007798	AAT	2	6	27553	27558	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_007798	GCCCA	2	10	27608	27617	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
79	NC_007798	CTG	2	6	27674	27679	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
80	NC_007798	CATT	2	8	27680	27687	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
81	NC_007798	GAA	2	6	27708	27713	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
82	NC_007798	AGAT	2	8	27727	27734	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
83	NC_007798	GGT	2	6	27771	27776	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
84	NC_007798	CA	3	6	28135	28140	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
85	NC_007798	AAG	2	6	28227	28232	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
86	NC_007798	TAT	2	6	28305	28310	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_007798	TG	3	6	28317	28322	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
88	NC_007798	GAG	2	6	29049	29054	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
89	NC_007798	ATG	2	6	29086	29091	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
90	NC_007798	TAA	2	6	29275	29280	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_007798	TAA	2	6	29317	29322	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_007798	GCT	2	6	29330	29335	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
93	NC_007798	AAG	2	6	29448	29453	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
94	NC_007798	AT	4	8	29463	29470	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_007798	GTA	2	6	29516	29521	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
96	NC_007798	GAAA	2	8	29531	29538	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
97	NC_007798	GTT	2	6	29844	29849	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
98	NC_007798	T	6	6	29858	29863	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_007798	CTTT	2	8	29878	29885	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
100	NC_007798	TTC	2	6	31242	31247	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
101	NC_007798	TAGTT	2	10	31268	31277	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
102	NC_007798	TTA	2	6	31333	31338	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_007798	TAA	2	6	31367	31372	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_007798	GAA	2	6	31386	31391	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
105	NC_007798	TAT	2	6	34062	34067	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_007798	CTT	2	6	34222	34227	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
107	NC_007798	TGG	2	6	34295	34300	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
108	NC_007798	ATCT	2	8	35120	35127	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
109	NC_007798	TTG	2	6	35973	35978	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
110	NC_007798	GGTA	2	8	35991	35998	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
111	NC_007798	GTT	2	6	36032	36037	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
112	NC_007798	TG	4	8	36082	36089	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
113	NC_007798	GTA	2	6	36145	36150	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
114	NC_007798	CT	3	6	36173	36178	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
115	NC_007798	AGC	2	6	36181	36186	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
116	NC_007798	CGGT	2	8	36188	36195	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
117	NC_007798	AGT	2	6	36202	36207	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
118	NC_007798	AGTA	2	8	36213	36220	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
119	NC_007798	GAAC	2	8	36295	36302	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
120	NC_007798	GCT	2	6	36345	36350	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
121	NC_007798	GTA	2	6	36403	36408	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
122	NC_007798	TGG	2	6	36502	36507	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
123	NC_007798	CGA	2	6	36526	36531	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
124	NC_007798	GAT	2	6	36551	36556	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
125	NC_007798	GCA	2	6	36600	36605	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
126	NC_007798	TGA	2	6	36658	36663	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
127	NC_007798	AGA	2	6	36717	36722	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
128	NC_007798	CAG	2	6	36743	36748	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
129	NC_007798	GTT	2	6	36774	36779	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
130	NC_007798	GA	3	6	36884	36889	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
131	NC_007798	AGGG	2	8	37236	37243	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
132	NC_007798	GTC	2	6	37283	37288	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
133	NC_007798	TCGTG	2	10	37292	37301	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
134	NC_007798	GGA	2	6	37396	37401	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
135	NC_007798	GAC	2	6	37409	37414	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
136	NC_007798	TCA	2	6	37421	37426	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
137	NC_007798	TATGG	2	10	37434	37443	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
138	NC_007798	AC	3	6	37447	37452	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
139	NC_007798	TAC	2	6	37454	37459	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
140	NC_007798	GCTA	2	8	37477	37484	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
141	NC_007798	TGC	2	6	37587	37592	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
142	NC_007798	AC	3	6	37617	37622	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
143	NC_007798	AGG	2	6	37676	37681	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
144	NC_007798	GGTGG	2	10	37693	37702	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
145	NC_007798	CCT	2	6	37758	37763	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
146	NC_007798	TTTA	2	8	37764	37771	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
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