MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Nitrosospira multiformis ATCC 25196 chromosome

Total Repeats: 168

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_007614	ACTAAA	2	12	27963	27974	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
2	NC_007614	CCTCGG	2	12	29575	29586	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
3	NC_007614	GAACTA	2	12	60635	60646	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
4	NC_007614	GCGAAT	2	12	68289	68300	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
5	NC_007614	CATGTA	2	12	130077	130088	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
6	NC_007614	GCGGGA	2	12	133113	133124	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
7	NC_007614	CCCAGG	2	12	163827	163838	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
8	NC_007614	AATAAA	2	12	166461	166472	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_007614	GAGAAA	2	12	169395	169406	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10	NC_007614	GAGAAA	2	12	171306	171317	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11	NC_007614	ATCATT	2	12	173006	173017	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
12	NC_007614	AAATAA	2	12	174008	174019	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_007614	GTCCTT	2	12	176858	176869	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_007614	AAAAAC	2	12	188741	188752	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
15	NC_007614	CTTCCG	2	12	206738	206749	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
16	NC_007614	CCTGCG	2	12	235515	235526	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
17	NC_007614	AATGCG	2	12	242348	242359	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
18	NC_007614	CAAAAA	2	12	246759	246770	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
19	NC_007614	TGCCCT	2	12	248932	248943	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
20	NC_007614	ATTTAT	2	12	254005	254016	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_007614	GCTCTT	2	12	254095	254106	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_007614	GTTGAA	2	12	275405	275416	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
23	NC_007614	ATAGGG	2	12	326300	326311	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
24	NC_007614	AGTTGC	2	12	338176	338187	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
25	NC_007614	ATCTTT	2	12	349732	349743	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
26	NC_007614	GATCTC	2	12	353421	353432	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_007614	TTTGCA	2	12	367630	367641	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
28	NC_007614	CTCGGG	2	12	407230	407241	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
29	NC_007614	TGCAAG	2	12	421785	421796	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
30	NC_007614	AATAGA	2	12	454720	454731	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
31	NC_007614	CAATAT	2	12	498325	498336	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
32	NC_007614	AAAAGA	2	12	519835	519846	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
33	NC_007614	TGTACC	2	12	548577	548588	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_007614	GAAGGC	2	12	581126	581137	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
35	NC_007614	CGACTC	2	12	585789	585800	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
36	NC_007614	CTCATG	2	12	588356	588367	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_007614	TGTACT	2	12	597189	597200	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
38	NC_007614	GCTTGA	2	12	603539	603550	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
39	NC_007614	CTGAGT	2	12	603853	603864	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
40	NC_007614	GTCTGC	2	12	609119	609130	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_007614	CGGCTT	2	12	609978	609989	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
42	NC_007614	GAATGC	2	12	613719	613730	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
43	NC_007614	TAAGTA	2	12	625386	625397	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
44	NC_007614	CGTGGT	2	12	662460	662471	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
45	NC_007614	GAGGTG	2	12	707943	707954	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
46	NC_007614	CTTTTA	2	12	752417	752428	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
47	NC_007614	ATGTTC	2	12	808309	808320	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
48	NC_007614	GCGCTT	2	12	832802	832813	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
49	NC_007614	AGGATG	2	12	868087	868098	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
50	NC_007614	TAACTC	2	12	872409	872420	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
51	NC_007614	CTTGTT	3	18	920249	920266	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
52	NC_007614	GCAGTT	2	12	934966	934977	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
53	NC_007614	TTGACC	2	12	940614	940625	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
54	NC_007614	CGGCAG	2	12	941044	941055	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
55	NC_007614	ACCCTG	2	12	943840	943851	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
56	NC_007614	ACCCGC	2	12	954209	954220	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
57	NC_007614	GCCACC	2	12	955208	955219	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
58	NC_007614	GCCACC	2	12	955256	955267	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
59	NC_007614	GTATTC	2	12	968866	968877	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
60	NC_007614	TACTTA	2	12	1022597	1022608	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
61	NC_007614	AGAGAT	2	12	1024468	1024479	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
62	NC_007614	AGTCAG	2	12	1050294	1050305	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
63	NC_007614	ATTTTA	2	12	1080337	1080348	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_007614	GTAATA	2	12	1111373	1111384	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
65	NC_007614	CCCGTT	2	12	1146097	1146108	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
66	NC_007614	ACTTTC	2	12	1160253	1160264	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
67	NC_007614	GAGATT	2	12	1197382	1197393	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
68	NC_007614	GGAGAA	2	12	1216129	1216140	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
69	NC_007614	ATAAGT	2	12	1232570	1232581	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
70	NC_007614	GAACAA	3	18	1251655	1251672	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
71	NC_007614	CAAAAA	2	12	1267754	1267765	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
72	NC_007614	TCAAGC	2	12	1274526	1274537	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
73	NC_007614	CATGAT	2	12	1275158	1275169	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
74	NC_007614	GAGTGA	2	12	1289882	1289893	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
75	NC_007614	TCAGGA	2	12	1311154	1311165	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
76	NC_007614	TTTCCT	2	12	1312186	1312197	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
77	NC_007614	CTTTTG	2	12	1340973	1340984	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
78	NC_007614	TATGGG	2	12	1346267	1346278	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
79	NC_007614	TTATAT	2	12	1359453	1359464	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_007614	AAATGT	2	12	1376881	1376892	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
81	NC_007614	GAGCAG	2	12	1381784	1381795	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
82	NC_007614	TGAGCC	8	48	1391629	1391676	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
83	NC_007614	AGTGGA	2	12	1404096	1404107	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
84	NC_007614	CAGTAT	2	12	1447652	1447663	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
85	NC_007614	GGGCTG	2	12	1449717	1449728	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
86	NC_007614	TCTCCC	2	12	1452261	1452272	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
87	NC_007614	CCCGCA	2	12	1458174	1458185	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
88	NC_007614	TTTAAC	2	12	1476407	1476418	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
89	NC_007614	AAATAG	2	12	1484527	1484538	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
90	NC_007614	TCGCTT	2	12	1526298	1526309	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
91	NC_007614	TGGATT	2	12	1548154	1548165	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
92	NC_007614	TCCAAA	2	12	1554716	1554727	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
93	NC_007614	TTTCCT	2	12	1556751	1556762	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
94	NC_007614	ACTTAT	2	12	1580054	1580065	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
95	NC_007614	CTTTCT	2	12	1593501	1593512	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
96	NC_007614	ACAATA	2	12	1593673	1593684	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
97	NC_007614	CACATT	2	12	1629131	1629142	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
98	NC_007614	TTGAAT	2	12	1694889	1694900	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
99	NC_007614	ATTTCT	2	12	1695107	1695118	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
100	NC_007614	GGGAAA	2	12	1698451	1698462	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
101	NC_007614	AAGCGC	2	12	1730128	1730139	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
102	NC_007614	TACCAT	2	12	1744524	1744535	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
103	NC_007614	GCGAAA	2	12	1750412	1750423	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
104	NC_007614	TCCCTC	2	12	1760354	1760365	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
105	NC_007614	TACATG	2	12	1796480	1796491	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
106	NC_007614	TACTTC	2	12	1796497	1796508	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
107	NC_007614	AGAACG	2	12	1834588	1834599	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
108	NC_007614	AGCAGG	2	12	1858147	1858158	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
109	NC_007614	TGAGTA	2	12	1872288	1872299	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
110	NC_007614	ATAAAG	2	12	1882800	1882811	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
111	NC_007614	GTTAGT	2	12	1884320	1884331	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
112	NC_007614	GTTTGC	2	12	1899603	1899614	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
113	NC_007614	ACTCTT	2	12	1899896	1899907	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
114	NC_007614	TTAAAC	2	12	1936754	1936765	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
115	NC_007614	TCACCG	2	12	1969982	1969993	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
116	NC_007614	CCCTCA	2	12	2013400	2013411	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
117	NC_007614	ACAGCG	2	12	2083457	2083468	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
118	NC_007614	AACAAT	2	12	2130929	2130940	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
119	NC_007614	TCAACT	2	12	2143476	2143487	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
120	NC_007614	GTATCA	2	12	2215589	2215600	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
121	NC_007614	AATCAG	2	12	2278318	2278329	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
122	NC_007614	GTTATT	2	12	2278395	2278406	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
123	NC_007614	CATTTG	2	12	2282754	2282765	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
124	NC_007614	TACACT	2	12	2326298	2326309	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
125	NC_007614	AAATGA	2	12	2326715	2326726	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
126	NC_007614	TAGGAT	2	12	2344317	2344328	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
127	NC_007614	GTCGAT	2	12	2344618	2344629	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
128	NC_007614	TACAGT	2	12	2398069	2398080	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
129	NC_007614	CCCGCC	2	12	2460021	2460032	0 %	0 %	16.67 %	83.33 %	Non-Coding
130	NC_007614	GGGTGG	2	12	2463185	2463196	0 %	16.67 %	83.33 %	0 %	Non-Coding
131	NC_007614	TAACTG	2	12	2476201	2476212	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
132	NC_007614	AAAACG	2	12	2497071	2497082	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
133	NC_007614	TCAAGA	2	12	2509680	2509691	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
134	NC_007614	CCTACC	2	12	2548878	2548889	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
135	NC_007614	GGGCGC	2	12	2588755	2588766	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
136	NC_007614	TGGATT	2	12	2621380	2621391	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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138	NC_007614	AAGGGG	2	12	2719404	2719415	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
139	NC_007614	CTTTTC	2	12	2727098	2727109	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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142	NC_007614	AATCAC	2	12	2789984	2789995	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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144	NC_007614	GAGTCC	2	12	2816493	2816504	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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146	NC_007614	AAGAAA	2	12	2829523	2829534	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
147	NC_007614	TTCTAT	2	12	2840538	2840549	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
148	NC_007614	GTCTTG	2	12	2892792	2892803	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
149	NC_007614	ATTCTT	2	12	2911302	2911313	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
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152	NC_007614	AGTGTA	2	12	2976646	2976657	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
153	NC_007614	TGCTCC	2	12	2988107	2988118	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
154	NC_007614	GTGGCT	2	12	3023039	3023050	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
155	NC_007614	TCCCGC	2	12	3030946	3030957	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
156	NC_007614	CATTGG	2	12	3033360	3033371	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
157	NC_007614	GAAGAG	2	12	3038685	3038696	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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160	NC_007614	CGTAAT	2	12	3085900	3085911	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
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163	NC_007614	CAGCAT	2	12	3127955	3127966	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.