MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Nitrosococcus oceani ATCC 19707 chromosome

Total Repeats: 172

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_007484	TATAAA	2	12	1654	1665	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_007484	CACTAT	2	12	1696	1707	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_007484	CCGTGT	2	12	3986	3997	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_007484	GCGGTA	2	12	4338	4349	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
5	NC_007484	GCGTTT	2	12	4581	4592	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
6	NC_007484	TAGCTA	2	12	5523	5534	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
7	NC_007484	TTAGCC	2	12	5604	5615	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_007484	TCGACC	2	12	7989	8000	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
9	NC_007484	ATAAGA	2	12	16270	16281	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
10	NC_007484	TCTTTT	2	12	45140	45151	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
11	NC_007484	TAAATA	2	12	52731	52742	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_007484	TAATCG	2	12	86425	86436	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
13	NC_007484	AACTTG	2	12	86915	86926	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
14	NC_007484	CAAACC	2	12	91584	91595	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
15	NC_007484	TATTTC	2	12	113173	113184	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
16	NC_007484	AGGATA	2	12	120922	120933	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17	NC_007484	ATAAGT	2	12	142798	142809	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
18	NC_007484	TATTTT	2	12	145922	145933	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_007484	TTAAAT	2	12	167399	167410	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_007484	TAATTT	2	12	170155	170166	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_007484	GCTTTA	2	12	182374	182385	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
22	NC_007484	GCGATT	2	12	186143	186154	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
23	NC_007484	CATTTT	2	12	209409	209420	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
24	NC_007484	TTTTAT	2	12	212062	212073	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_007484	ATAAAA	2	12	212094	212105	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_007484	ATTTTT	2	12	240870	240881	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_007484	AAATAT	2	12	307939	307950	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_007484	TCGTGT	2	12	313835	313846	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
29	NC_007484	ACGGGA	2	12	317576	317587	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
30	NC_007484	TGACGG	2	12	351224	351235	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
31	NC_007484	CCGGTT	2	12	425788	425799	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
32	NC_007484	TTCTTT	2	12	448055	448066	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
33	NC_007484	GCCCTC	2	12	489773	489784	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
34	NC_007484	TCTCTA	2	12	522332	522343	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_007484	CCCGCT	2	12	568698	568709	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
36	NC_007484	CGGAGG	2	12	596760	596771	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
37	NC_007484	TGCTAT	2	12	658339	658350	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
38	NC_007484	AACAGA	2	12	731386	731397	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
39	NC_007484	GCAGGA	2	12	742570	742581	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
40	NC_007484	GCTATG	2	12	745000	745011	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
41	NC_007484	GCGAAG	2	12	748508	748519	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
42	NC_007484	GATAGA	2	12	750417	750428	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
43	NC_007484	CTTAAT	2	12	750991	751002	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
44	NC_007484	TTTTTA	2	12	751040	751051	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_007484	TTACAG	2	12	785034	785045	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
46	NC_007484	AGATGG	2	12	797790	797801	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
47	NC_007484	TTGATT	2	12	798229	798240	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
48	NC_007484	CCCTCT	2	12	798387	798398	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
49	NC_007484	CCCATC	2	12	801642	801653	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
50	NC_007484	TTTATT	2	12	903313	903324	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_007484	TGTGCG	2	12	942363	942374	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
52	NC_007484	ATAAAA	2	12	960029	960040	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_007484	GTTGAT	2	12	964646	964657	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
54	NC_007484	CTAAGC	2	12	973002	973013	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
55	NC_007484	GCCCCT	2	12	1005567	1005578	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
56	NC_007484	TTTTTG	2	12	1037260	1037271	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
57	NC_007484	ATAAAT	2	12	1053307	1053318	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_007484	CAAGCG	2	12	1054610	1054621	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
59	NC_007484	AGCTTC	2	12	1063921	1063932	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
60	NC_007484	CGGGAA	2	12	1067223	1067234	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
61	NC_007484	AGGGAT	2	12	1077050	1077061	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
62	NC_007484	GATAGC	2	12	1079150	1079161	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
63	NC_007484	TGGTTT	2	12	1166038	1166049	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
64	NC_007484	CCAGGC	2	12	1178912	1178923	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
65	NC_007484	TTAAGT	2	12	1190409	1190420	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
66	NC_007484	TAATCG	2	12	1202174	1202185	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
67	NC_007484	ATCCCT	2	12	1212914	1212925	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
68	NC_007484	GGCGCC	2	12	1230790	1230801	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
69	NC_007484	ATATTC	2	12	1272433	1272444	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
70	NC_007484	CGAAGA	2	12	1315603	1315614	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
71	NC_007484	CAGAAT	2	12	1325149	1325160	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
72	NC_007484	GGGTTT	2	12	1341290	1341301	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
73	NC_007484	ATTAAA	2	12	1366083	1366094	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_007484	AGGGCG	2	12	1390133	1390144	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
75	NC_007484	TGAGAT	2	12	1418927	1418938	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
76	NC_007484	GCTTTC	2	12	1428041	1428052	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
77	NC_007484	ATCCTC	2	12	1430174	1430185	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
78	NC_007484	GTTTTT	2	12	1453935	1453946	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
79	NC_007484	CTTTTT	2	12	1484307	1484318	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
80	NC_007484	GCTCTT	2	12	1554312	1554323	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
81	NC_007484	CATTTA	2	12	1564702	1564713	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
82	NC_007484	ATCGTG	2	12	1604176	1604187	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
83	NC_007484	GCTCTG	2	12	1609245	1609256	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
84	NC_007484	GGAAGG	2	12	1666691	1666702	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
85	NC_007484	CCCTCT	2	12	1669398	1669409	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
86	NC_007484	GAGGGT	2	12	1669512	1669523	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
87	NC_007484	CCCTCT	2	12	1672145	1672156	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
88	NC_007484	CATCGA	2	12	1685147	1685158	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
89	NC_007484	CAGATC	2	12	1726484	1726495	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
90	NC_007484	TTAATC	2	12	1736930	1736941	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
91	NC_007484	AACGGC	2	12	1739600	1739611	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
92	NC_007484	TGGTGT	2	12	1760395	1760406	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
93	NC_007484	AGCGTA	2	12	1777882	1777893	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
94	NC_007484	TAAAAT	2	12	1780768	1780779	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_007484	GTCTCC	2	12	1822697	1822708	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
96	NC_007484	TTCTTA	2	12	1825590	1825601	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
97	NC_007484	TAAATG	2	12	1840081	1840092	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
98	NC_007484	TAAAAA	2	12	1872758	1872769	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_007484	GATAAA	2	12	1981654	1981665	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
100	NC_007484	TCCCTC	2	12	1984006	1984017	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
101	NC_007484	TAAAAT	2	12	2004557	2004568	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_007484	ATTTTA	2	12	2031747	2031758	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_007484	CCCTGC	2	12	2078497	2078508	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
104	NC_007484	CAAAGC	2	12	2089882	2089893	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
105	NC_007484	ACTAGT	2	12	2091318	2091329	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
106	NC_007484	CAACAT	2	12	2107806	2107817	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
107	NC_007484	GAGCTT	2	12	2110708	2110719	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
108	NC_007484	TCTCCC	2	12	2112899	2112910	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
109	NC_007484	ATGAGT	2	12	2162020	2162031	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
110	NC_007484	CGCAAG	2	12	2165629	2165640	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
111	NC_007484	ATAAAT	2	12	2178667	2178678	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_007484	GGTTAA	2	12	2216888	2216899	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
113	NC_007484	ATTATA	2	12	2282765	2282776	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_007484	TGAACA	2	12	2289444	2289455	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
115	NC_007484	TTAATC	2	12	2307974	2307985	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
116	NC_007484	AGCCTG	2	12	2343565	2343576	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
117	NC_007484	AACAGA	2	12	2359106	2359117	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
118	NC_007484	TATAGT	2	12	2367993	2368004	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
119	NC_007484	TCTCAA	2	12	2396055	2396066	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
120	NC_007484	ATGGGC	2	12	2407745	2407756	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
121	NC_007484	CTAATT	2	12	2428008	2428019	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
122	NC_007484	TTGTTT	2	12	2457358	2457369	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
123	NC_007484	CTTGGA	2	12	2472905	2472916	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
124	NC_007484	CCTCCA	2	12	2489503	2489514	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
125	NC_007484	ATTTCC	2	12	2489641	2489652	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
126	NC_007484	AATATT	2	12	2553819	2553830	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_007484	CTTTGA	2	12	2563438	2563449	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
128	NC_007484	GTACTC	2	12	2584694	2584705	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
129	NC_007484	ATGAAA	2	12	2629594	2629605	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
130	NC_007484	CTAGCA	2	12	2737521	2737532	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
131	NC_007484	TGGCGC	2	12	2761542	2761553	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.