MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Nitrosococcus oceani ATCC 19707 chromosome

Total Repeats: 10939

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_007484	CTT	2	6	98	103	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_007484	TAAT	2	8	1645	1652	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_007484	TATAAA	2	12	1654	1665	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_007484	ATG	2	6	1690	1695	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5	NC_007484	CACTAT	2	12	1696	1707	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_007484	AT	4	8	1715	1722	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_007484	CTT	2	6	1819	1824	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_007484	CGG	2	6	1864	1869	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_007484	GGA	2	6	1880	1885	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10	NC_007484	ATA	2	6	1963	1968	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_007484	TTCA	2	8	2079	2086	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
12	NC_007484	A	6	6	2217	2222	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_007484	ATC	2	6	2262	2267	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_007484	AGC	2	6	2282	2287	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_007484	AAT	2	6	2290	2295	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_007484	TA	3	6	2305	2310	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_007484	AAT	2	6	2342	2347	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_007484	CTTG	2	8	2365	2372	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
19	NC_007484	GGAA	2	8	3533	3540	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
20	NC_007484	GA	3	6	3542	3547	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
21	NC_007484	AAG	2	6	3558	3563	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
22	NC_007484	T	6	6	3596	3601	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_007484	GT	3	6	3645	3650	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
24	NC_007484	TCA	2	6	3651	3656	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_007484	TCGC	2	8	3658	3665	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
26	NC_007484	CCAG	2	8	3673	3680	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
27	NC_007484	ACG	2	6	3686	3691	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_007484	CGA	2	6	3694	3699	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
29	NC_007484	GCT	2	6	3815	3820	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_007484	CA	3	6	3823	3828	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
31	NC_007484	TTA	2	6	3852	3857	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_007484	CTT	2	6	3953	3958	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
33	NC_007484	CCGTGT	2	12	3986	3997	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_007484	T	7	7	4078	4084	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_007484	CAG	2	6	4096	4101	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_007484	CCT	2	6	4106	4111	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
37	NC_007484	GCC	2	6	4294	4299	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
38	NC_007484	GCGGTA	2	12	4338	4349	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
39	NC_007484	TCA	2	6	4449	4454	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_007484	CAA	2	6	4476	4481	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_007484	GCC	2	6	4484	4489	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
42	NC_007484	CTT	2	6	4524	4529	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_007484	GGC	2	6	4543	4548	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
44	NC_007484	GCGTTT	2	12	4581	4592	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
45	NC_007484	T	8	8	4779	4786	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_007484	CG	3	6	4846	4851	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
47	NC_007484	CTC	2	6	4876	4881	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
48	NC_007484	CTT	2	6	4888	4893	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
49	NC_007484	AGC	2	6	4897	4902	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
50	NC_007484	CTT	2	6	4933	4938	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
51	NC_007484	ATC	2	6	4948	4953	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
52	NC_007484	ACC	2	6	5020	5025	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
53	NC_007484	T	6	6	5027	5032	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_007484	AG	3	6	5038	5043	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
55	NC_007484	GGC	2	6	5044	5049	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
56	NC_007484	CT	3	6	5050	5055	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
57	NC_007484	TAA	2	6	5083	5088	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_007484	TTA	2	6	5098	5103	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_007484	ACT	2	6	5110	5115	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
60	NC_007484	CAA	2	6	5185	5190	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
61	NC_007484	AAG	2	6	5289	5294	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
62	NC_007484	ATT	3	9	5359	5367	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_007484	GCA	2	6	5404	5409	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
64	NC_007484	CAG	2	6	5432	5437	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
65	NC_007484	GGC	2	6	5468	5473	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
66	NC_007484	TAGCTA	2	12	5523	5534	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
67	NC_007484	CTTG	2	8	5539	5546	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
68	NC_007484	AACGG	2	10	5551	5560	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
69	NC_007484	TTAGCC	2	12	5604	5615	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
70	NC_007484	GGC	2	6	5641	5646	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
71	NC_007484	GGA	2	6	5772	5777	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
72	NC_007484	AAAT	2	8	6008	6015	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_007484	A	6	6	6019	6024	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_007484	AAG	2	6	6065	6070	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
75	NC_007484	CGGG	2	8	6111	6118	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
76	NC_007484	GCC	2	6	6126	6131	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
77	NC_007484	TCA	2	6	6161	6166	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
78	NC_007484	CAG	2	6	6189	6194	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
79	NC_007484	T	7	7	6246	6252	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_007484	CTT	2	6	6270	6275	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
81	NC_007484	GC	3	6	6295	6300	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
82	NC_007484	TTC	2	6	6373	6378	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
83	NC_007484	G	6	6	6421	6426	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
84	NC_007484	GCT	2	6	6437	6442	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
85	NC_007484	CCG	2	6	6458	6463	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
86	NC_007484	CAT	2	6	6485	6490	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
87	NC_007484	AAGG	2	8	6555	6562	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
88	NC_007484	GCTC	2	8	6616	6623	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
89	NC_007484	CTG	2	6	6670	6675	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
90	NC_007484	GGC	2	6	6726	6731	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
91	NC_007484	TCA	2	6	6735	6740	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
92	NC_007484	GAA	2	6	6802	6807	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
93	NC_007484	CAG	2	6	6830	6835	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
94	NC_007484	CAG	2	6	6879	6884	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
95	NC_007484	GCC	2	6	6956	6961	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
96	NC_007484	GAT	2	6	6997	7002	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
97	NC_007484	CCG	2	6	7025	7030	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
98	NC_007484	CAC	2	6	7046	7051	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
99	NC_007484	ATAG	2	8	7081	7088	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
100	NC_007484	GGC	2	6	7118	7123	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
101	NC_007484	AAG	2	6	7142	7147	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
102	NC_007484	GTG	2	6	7182	7187	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
103	NC_007484	CTT	2	6	7199	7204	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
104	NC_007484	ACC	2	6	7212	7217	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
105	NC_007484	GTT	2	6	7283	7288	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
106	NC_007484	TCCC	2	8	7313	7320	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
107	NC_007484	TTC	2	6	7323	7328	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
108	NC_007484	TAG	2	6	7399	7404	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
109	NC_007484	CAG	2	6	7434	7439	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
110	NC_007484	CTT	2	6	7455	7460	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
111	NC_007484	GAA	2	6	7502	7507	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
112	NC_007484	GCC	2	6	7512	7517	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
113	NC_007484	T	6	6	7518	7523	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_007484	GCT	2	6	7546	7551	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
115	NC_007484	CT	3	6	7581	7586	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
116	NC_007484	GCC	2	6	7656	7661	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
117	NC_007484	CTT	2	6	7733	7738	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
118	NC_007484	TGGA	2	8	7742	7749	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
119	NC_007484	TC	3	6	7761	7766	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
120	NC_007484	T	6	6	7776	7781	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_007484	TCC	2	6	7837	7842	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
122	NC_007484	TGC	2	6	7890	7895	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
123	NC_007484	GCA	2	6	7909	7914	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
124	NC_007484	GAG	2	6	7943	7948	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
125	NC_007484	TCGACC	2	12	7989	8000	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
126	NC_007484	TGG	2	6	8007	8012	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
127	NC_007484	GC	3	6	8022	8027	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
128	NC_007484	TGA	2	6	8046	8051	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
129	NC_007484	TCAA	2	8	8088	8095	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
130	NC_007484	TCG	2	6	8136	8141	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
131	NC_007484	ATC	2	6	8150	8155	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
132	NC_007484	AAC	2	6	8185	8190	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
133	NC_007484	CCA	2	6	8224	8229	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
134	NC_007484	GC	3	6	8249	8254	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
135	NC_007484	CGG	2	6	8301	8306	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
136	NC_007484	CGG	2	6	8332	8337	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
137	NC_007484	TTG	2	6	8339	8344	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
138	NC_007484	T	6	6	8494	8499	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_007484	T	6	6	8509	8514	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_007484	GAT	2	6	8568	8573	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
141	NC_007484	G	6	6	8575	8580	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
142	NC_007484	ACC	2	6	8588	8593	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
143	NC_007484	TCGCT	2	10	8609	8618	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
144	NC_007484	GCG	2	6	8642	8647	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
145	NC_007484	CAT	2	6	8706	8711	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
146	NC_007484	CTC	2	6	8805	8810	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
147	NC_007484	GGTCA	2	10	8866	8875	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
148	NC_007484	TC	3	6	8932	8937	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
149	NC_007484	T	8	8	8997	9004	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
150	NC_007484	CA	3	6	9052	9057	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
151	NC_007484	C	7	7	9111	9117	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
152	NC_007484	CT	3	6	9167	9172	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
153	NC_007484	AAC	2	6	9198	9203	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
154	NC_007484	C	6	6	9249	9254	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
155	NC_007484	CCA	2	6	9269	9274	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
156	NC_007484	TCT	2	6	9275	9280	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
157	NC_007484	ATTC	2	8	9327	9334	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
158	NC_007484	TAT	2	6	9341	9346	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
159	NC_007484	TCC	2	6	9354	9359	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
160	NC_007484	T	7	7	9360	9366	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
161	NC_007484	TGG	2	6	9370	9375	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
162	NC_007484	GAT	2	6	9404	9409	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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164	NC_007484	GTTT	2	8	9443	9450	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
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166	NC_007484	TG	3	6	9526	9531	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
167	NC_007484	GCT	2	6	9533	9538	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
168	NC_007484	TTCG	2	8	9725	9732	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
169	NC_007484	GT	3	6	9792	9797	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
170	NC_007484	GGC	2	6	9799	9804	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
171	NC_007484	TAT	2	6	9806	9811	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
172	NC_007484	TCA	2	6	9826	9831	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
173	NC_007484	TTG	2	6	9852	9857	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
174	NC_007484	T	8	8	9926	9933	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
175	NC_007484	GCTC	2	8	9999	10006	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
176	NC_007484	CGCT	2	8	10123	10130	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
177	NC_007484	CA	3	6	10136	10141	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
178	NC_007484	CTT	2	6	10171	10176	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
179	NC_007484	CTT	2	6	10178	10183	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
180	NC_007484	TAA	2	6	10230	10235	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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182	NC_007484	GAA	2	6	10365	10370	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
183	NC_007484	CAT	2	6	10375	10380	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
184	NC_007484	CTG	2	6	10389	10394	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
185	NC_007484	AGA	2	6	10420	10425	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
186	NC_007484	CTG	2	6	10428	10433	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
187	NC_007484	GCGAT	2	10	10436	10445	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
188	NC_007484	GGT	2	6	10450	10455	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
189	NC_007484	GAC	2	6	10468	10473	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
190	NC_007484	TCA	2	6	10497	10502	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
191	NC_007484	GCA	2	6	11103	11108	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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193	NC_007484	TTC	2	6	11135	11140	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
194	NC_007484	TTC	2	6	11179	11184	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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196	NC_007484	CTT	2	6	11246	11251	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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199	NC_007484	ATT	2	6	11298	11303	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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280	NC_007484	ATA	2	6	32105	32110	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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282	NC_007484	TA	4	8	32168	32175	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
283	NC_007484	ATAG	2	8	32176	32183	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
284	NC_007484	ACTT	2	8	32186	32193	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
285	NC_007484	GGC	2	6	32224	32229	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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287	NC_007484	T	6	6	32475	32480	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
288	NC_007484	AAT	2	6	32482	32487	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
289	NC_007484	CTT	2	6	32514	32519	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
290	NC_007484	T	6	6	32572	32577	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
291	NC_007484	ATC	2	6	32632	32637	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
292	NC_007484	ATTT	2	8	33712	33719	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
293	NC_007484	TTTG	2	8	37485	37492	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
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456	NC_007484	TAGT	2	8	86770	86777	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
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460	NC_007484	AAT	2	6	88877	88882	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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474	NC_007484	AAC	2	6	91227	91232	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
475	NC_007484	CTC	2	6	91282	91287	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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488	NC_007484	TA	3	6	93392	93397	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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500	NC_007484	TAT	2	6	93766	93771	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding

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