MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Nitrosococcus oceani ATCC 19707 chromosome

Total Repeats: 10939

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
10001	NC_007484	TTAAGA	2	12	3196558	3196569	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
10002	NC_007484	ATT	2	6	3196655	3196660	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10003	NC_007484	AT	3	6	3196735	3196740	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10004	NC_007484	TA	3	6	3196758	3196763	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10005	NC_007484	CT	3	6	3196779	3196784	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
10006	NC_007484	AT	3	6	3201090	3201095	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10007	NC_007484	CTC	2	6	3202551	3202556	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10008	NC_007484	TTA	2	6	3202566	3202571	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10009	NC_007484	TCGAA	2	10	3202586	3202595	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
10010	NC_007484	GCT	2	6	3203956	3203961	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10011	NC_007484	A	7	7	3203965	3203971	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10012	NC_007484	ATA	2	6	3203979	3203984	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10013	NC_007484	T	6	6	3204033	3204038	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10014	NC_007484	GTA	2	6	3204078	3204083	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10015	NC_007484	AGC	2	6	3204098	3204103	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10016	NC_007484	GA	3	6	3204179	3204184	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
10017	NC_007484	GCC	2	6	3204256	3204261	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10018	NC_007484	CTTTGC	2	12	3206176	3206187	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
10019	NC_007484	CTT	2	6	3206228	3206233	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10020	NC_007484	CAAA	2	8	3206243	3206250	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
10021	NC_007484	A	6	6	3206248	3206253	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10022	NC_007484	ACA	2	6	3206282	3206287	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10023	NC_007484	TA	3	6	3206498	3206503	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10024	NC_007484	CATC	2	8	3206590	3206597	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
10025	NC_007484	GGT	2	6	3206630	3206635	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10026	NC_007484	T	7	7	3206652	3206658	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10027	NC_007484	CTT	2	6	3206694	3206699	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10028	NC_007484	AAT	2	6	3206711	3206716	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10029	NC_007484	GC	3	6	3206766	3206771	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10030	NC_007484	GC	3	6	3206832	3206837	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10031	NC_007484	CGG	2	6	3206842	3206847	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10032	NC_007484	GAGTG	2	10	3206861	3206870	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
10033	NC_007484	CG	3	6	3206887	3206892	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10034	NC_007484	CG	4	8	3206903	3206910	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10035	NC_007484	GCG	2	6	3207008	3207013	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10036	NC_007484	CGT	2	6	3207014	3207019	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10037	NC_007484	GCGTGC	2	12	3207021	3207032	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
10038	NC_007484	GCT	3	9	3207034	3207042	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10039	NC_007484	GAT	2	6	3207044	3207049	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10040	NC_007484	CGC	2	6	3207079	3207084	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10041	NC_007484	TCG	2	6	3207150	3207155	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10042	NC_007484	CAA	2	6	3207196	3207201	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10043	NC_007484	ACA	2	6	3207216	3207221	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10044	NC_007484	CCA	2	6	3207225	3207230	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10045	NC_007484	GGGC	2	8	3207235	3207242	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
10046	NC_007484	CGATGT	2	12	3207292	3207303	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
10047	NC_007484	GCC	2	6	3207394	3207399	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10048	NC_007484	CGC	2	6	3207430	3207435	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10049	NC_007484	CG	4	8	3207439	3207446	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10050	NC_007484	GCT	2	6	3207511	3207516	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10051	NC_007484	CA	3	6	3207517	3207522	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
10052	NC_007484	CGA	2	6	3207562	3207567	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10053	NC_007484	ATC	2	6	3207629	3207634	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10054	NC_007484	TGGCCC	2	12	3207708	3207719	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
10055	NC_007484	CGC	2	6	3207772	3207777	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10056	NC_007484	GC	3	6	3207794	3207799	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10057	NC_007484	GCT	2	6	3207811	3207816	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10058	NC_007484	GCC	2	6	3207890	3207895	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10059	NC_007484	TCG	2	6	3207939	3207944	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10060	NC_007484	CCGCG	2	10	3208047	3208056	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
10061	NC_007484	GGA	2	6	3208081	3208086	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10062	NC_007484	ACG	2	6	3208134	3208139	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10063	NC_007484	TCT	2	6	3208230	3208235	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10064	NC_007484	TCG	2	6	3208241	3208246	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10065	NC_007484	AGA	2	6	3208301	3208306	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10066	NC_007484	CAC	2	6	3208321	3208326	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10067	NC_007484	CTC	2	6	3211270	3211275	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10068	NC_007484	T	6	6	3213882	3213887	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10069	NC_007484	A	6	6	3213963	3213968	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10070	NC_007484	AGT	2	6	3213977	3213982	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10071	NC_007484	ATCC	2	8	3214702	3214709	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
10072	NC_007484	A	6	6	3214792	3214797	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10073	NC_007484	AAG	2	6	3214818	3214823	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10074	NC_007484	CTG	2	6	3214919	3214924	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10075	NC_007484	T	6	6	3214970	3214975	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10076	NC_007484	CAG	2	6	3215041	3215046	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10077	NC_007484	T	6	6	3215047	3215052	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10078	NC_007484	TTGGA	2	10	3215088	3215097	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
10079	NC_007484	ATT	2	6	3215109	3215114	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10080	NC_007484	CTT	2	6	3217734	3217739	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10081	NC_007484	CTT	2	6	3217801	3217806	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10082	NC_007484	CTC	2	6	3217810	3217815	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10083	NC_007484	TTC	2	6	3220156	3220161	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10084	NC_007484	TAA	3	9	3220217	3220225	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10085	NC_007484	TGC	2	6	3220236	3220241	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10086	NC_007484	GA	3	6	3220252	3220257	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
10087	NC_007484	CTG	2	6	3220357	3220362	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10088	NC_007484	ATA	2	6	3220363	3220368	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10089	NC_007484	TAA	2	6	3220369	3220374	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10090	NC_007484	C	6	6	3220383	3220388	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
10091	NC_007484	TTCC	2	8	3220398	3220405	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
10092	NC_007484	CACCTC	2	12	3220487	3220498	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10093	NC_007484	TA	4	8	3220546	3220553	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10094	NC_007484	AAT	2	6	3220554	3220559	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10095	NC_007484	ATCA	2	8	3220573	3220580	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
10096	NC_007484	T	7	7	3220581	3220587	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10097	NC_007484	A	6	6	3220643	3220648	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10098	NC_007484	CTT	2	6	3220664	3220669	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10099	NC_007484	T	6	6	3220668	3220673	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10100	NC_007484	TCA	2	6	3220698	3220703	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10101	NC_007484	TAT	2	6	3220768	3220773	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10102	NC_007484	CTA	2	6	3220823	3220828	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10103	NC_007484	AT	3	6	3220840	3220845	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10104	NC_007484	TTAA	2	8	3220900	3220907	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10105	NC_007484	TC	3	6	3220926	3220931	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
10106	NC_007484	GGCA	2	8	3220938	3220945	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
10107	NC_007484	CAC	2	6	3220948	3220953	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10108	NC_007484	AGAC	2	8	3220973	3220980	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
10109	NC_007484	TA	3	6	3221019	3221024	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10110	NC_007484	AACT	2	8	3221043	3221050	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
10111	NC_007484	AT	3	6	3221058	3221063	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10112	NC_007484	TAT	2	6	3221103	3221108	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10113	NC_007484	AGC	2	6	3222108	3222113	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10114	NC_007484	CAA	2	6	3223175	3223180	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10115	NC_007484	A	8	8	3223195	3223202	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10116	NC_007484	G	6	6	3223226	3223231	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
10117	NC_007484	TCAT	2	8	3223265	3223272	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
10118	NC_007484	A	7	7	3224579	3224585	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10119	NC_007484	ACCT	2	8	3224667	3224674	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
10120	NC_007484	CCG	2	6	3224677	3224682	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10121	NC_007484	ACC	2	6	3224683	3224688	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10122	NC_007484	GTA	2	6	3224761	3224766	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10123	NC_007484	AT	3	6	3226770	3226775	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10124	NC_007484	TGA	2	6	3230776	3230781	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10125	NC_007484	ACTA	2	8	3230849	3230856	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
10126	NC_007484	ATT	2	6	3230875	3230880	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10127	NC_007484	CTG	2	6	3230903	3230908	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10128	NC_007484	AACA	2	8	3230924	3230931	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
10129	NC_007484	AT	3	6	3233328	3233333	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10130	NC_007484	AAT	2	6	3233345	3233350	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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