MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Non-Coding Repeats of Nitrosococcus oceani ATCC 19707 plasmid A

Total Repeats: 80

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_007483	TGC	2	6	95	100	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_007483	GTT	3	9	159	167	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3	NC_007483	ATG	2	6	198	203	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4	NC_007483	TAG	2	6	1680	1685	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5	NC_007483	TCA	2	6	1772	1777	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_007483	CTC	2	6	1968	1973	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7	NC_007483	CAA	2	6	2118	2123	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_007483	GCC	2	6	4028	4033	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
9	NC_007483	CAA	2	6	4059	4064	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_007483	GCC	2	6	4068	4073	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11	NC_007483	CGC	2	6	4102	4107	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
12	NC_007483	CCG	2	6	4136	4141	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
13	NC_007483	ACG	2	6	4327	4332	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_007483	AGA	2	6	4400	4405	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15	NC_007483	ATG	2	6	4508	4513	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16	NC_007483	TTC	2	6	5435	5440	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_007483	CTC	2	6	6673	6678	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
18	NC_007483	AAG	2	6	6820	6825	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
19	NC_007483	TCA	2	6	9686	9691	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
20	NC_007483	ATC	2	6	9699	9704	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
21	NC_007483	ATC	2	6	9731	9736	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_007483	TTC	2	6	9752	9757	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_007483	GTA	2	6	11692	11697	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
24	NC_007483	CGG	2	6	11813	11818	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_007483	GAT	2	6	11982	11987	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
26	NC_007483	GTA	2	6	13601	13606	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
27	NC_007483	AGG	2	6	13658	13663	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
28	NC_007483	CTT	2	6	13686	13691	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
29	NC_007483	ATT	2	6	13774	13779	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_007483	CAC	2	6	13780	13785	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
31	NC_007483	AAT	2	6	14675	14680	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_007483	TCA	2	6	14719	14724	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
33	NC_007483	ATT	2	6	14851	14856	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_007483	ATG	2	6	14898	14903	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
35	NC_007483	GAG	2	6	14957	14962	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
36	NC_007483	AAT	2	6	18188	18193	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_007483	ATA	3	9	18195	18203	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_007483	TTA	2	6	18204	18209	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_007483	ATT	2	6	18212	18217	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_007483	GCG	2	6	18326	18331	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_007483	ATT	2	6	19031	19036	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_007483	CAT	2	6	19578	19583	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_007483	ATC	2	6	20823	20828	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
44	NC_007483	TCA	2	6	20832	20837	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
45	NC_007483	TCC	2	6	20877	20882	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
46	NC_007483	TTA	2	6	20982	20987	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_007483	ATA	2	6	21007	21012	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_007483	CGT	2	6	23556	23561	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
49	NC_007483	CAC	2	6	23769	23774	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
50	NC_007483	GAT	2	6	23814	23819	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
51	NC_007483	ACT	2	6	23904	23909	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
52	NC_007483	GCT	2	6	23926	23931	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
53	NC_007483	CCG	2	6	23954	23959	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
54	NC_007483	ACC	2	6	30348	30353	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
55	NC_007483	CGG	2	6	30359	30364	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
56	NC_007483	GCC	2	6	30477	30482	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
57	NC_007483	GCT	2	6	30520	30525	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
58	NC_007483	CAC	2	6	30558	30563	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
59	NC_007483	GCC	2	6	30586	30591	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
60	NC_007483	ATT	3	9	30613	30621	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_007483	GGC	2	6	30771	30776	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
62	NC_007483	ATT	2	6	32119	32124	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_007483	TTA	2	6	32128	32133	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_007483	ATG	2	6	32371	32376	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
65	NC_007483	CGG	2	6	32425	32430	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
66	NC_007483	ATA	2	6	34304	34309	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_007483	TGG	2	6	35074	35079	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
68	NC_007483	GAC	2	6	35091	35096	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
69	NC_007483	GGA	2	6	35118	35123	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
70	NC_007483	ATT	2	6	36188	36193	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_007483	TTA	2	6	36220	36225	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_007483	GAC	2	6	36779	36784	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
73	NC_007483	AAT	2	6	36957	36962	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_007483	GTT	2	6	37841	37846	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
75	NC_007483	CTT	2	6	38020	38025	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
76	NC_007483	TTC	2	6	38187	38192	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
77	NC_007483	TCT	2	6	38569	38574	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
78	NC_007483	GCT	2	6	38974	38979	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
79	NC_007483	AGA	2	6	39057	39062	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
80	NC_007483	CTG	2	6	39078	39083	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.