MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Non-Coding Repeats of Natronomonas pharaonis DSM 2160 plasmid PL131

Total Repeats: 326

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_007427	AGC	2	6	1689	1694	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_007427	GAA	2	6	1712	1717	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3	NC_007427	AAT	2	6	2661	2666	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_007427	ATA	2	6	2675	2680	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_007427	TTG	2	6	2685	2690	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6	NC_007427	GTT	2	6	2713	2718	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7	NC_007427	CAG	2	6	2744	2749	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_007427	CGA	2	6	2897	2902	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_007427	ACC	2	6	2929	2934	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10	NC_007427	AAC	2	6	2958	2963	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_007427	GCC	2	6	2976	2981	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
12	NC_007427	CCA	2	6	3065	3070	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13	NC_007427	CGA	2	6	4076	4081	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_007427	CAC	2	6	4220	4225	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
15	NC_007427	CTC	2	6	4275	4280	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
16	NC_007427	CAG	2	6	4393	4398	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_007427	ACG	3	9	4399	4407	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_007427	CGT	2	6	6039	6044	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_007427	CGC	2	6	6058	6063	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
20	NC_007427	GGC	2	6	6618	6623	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
21	NC_007427	CCA	2	6	7022	7027	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
22	NC_007427	GAA	2	6	7060	7065	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
23	NC_007427	TAT	2	6	7183	7188	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_007427	GCC	2	6	7191	7196	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
25	NC_007427	TCC	2	6	8070	8075	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
26	NC_007427	GCG	2	6	8118	8123	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_007427	GCG	2	6	8570	8575	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_007427	TCT	2	6	8718	8723	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
29	NC_007427	CCA	3	9	8758	8766	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
30	NC_007427	GTA	2	6	8929	8934	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
31	NC_007427	GCT	2	6	11134	11139	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
32	NC_007427	CTA	2	6	11140	11145	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
33	NC_007427	GAA	2	6	11177	11182	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
34	NC_007427	CTT	4	12	12064	12075	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_007427	CGG	2	6	12090	12095	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_007427	CTA	2	6	13925	13930	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_007427	GTC	2	6	13999	14004	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_007427	CGG	2	6	14079	14084	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
39	NC_007427	GCT	2	6	14138	14143	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_007427	CGG	2	6	14188	14193	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_007427	GCC	2	6	14204	14209	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
42	NC_007427	TGA	2	6	14238	14243	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
43	NC_007427	CTG	2	6	16325	16330	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
44	NC_007427	CGG	2	6	16333	16338	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
45	NC_007427	GTT	2	6	17330	17335	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
46	NC_007427	AAC	2	6	17385	17390	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
47	NC_007427	TTG	2	6	17407	17412	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
48	NC_007427	GCG	2	6	17536	17541	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
49	NC_007427	GTC	2	6	17597	17602	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
50	NC_007427	ACG	2	6	17625	17630	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
51	NC_007427	GTC	2	6	17648	17653	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
52	NC_007427	CTG	2	6	17708	17713	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
53	NC_007427	TCG	2	6	17737	17742	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
54	NC_007427	TCA	2	6	17745	17750	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
55	NC_007427	GCT	2	6	17776	17781	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
56	NC_007427	GGC	2	6	17811	17816	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
57	NC_007427	CCA	2	6	17969	17974	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
58	NC_007427	CCT	2	6	17993	17998	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
59	NC_007427	GAA	2	6	18012	18017	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
60	NC_007427	GCT	2	6	18050	18055	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
61	NC_007427	CCG	2	6	19598	19603	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
62	NC_007427	TTG	2	6	19672	19677	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
63	NC_007427	TCA	2	6	19747	19752	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
64	NC_007427	CAA	2	6	19786	19791	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
65	NC_007427	TTG	2	6	19874	19879	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
66	NC_007427	TGA	2	6	20015	20020	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
67	NC_007427	GTG	2	6	20056	20061	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
68	NC_007427	CGA	2	6	20093	20098	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
69	NC_007427	GAT	2	6	20118	20123	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
70	NC_007427	ACT	2	6	20158	20163	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
71	NC_007427	GAC	2	6	20181	20186	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
72	NC_007427	GCT	2	6	20858	20863	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
73	NC_007427	GAC	2	6	20909	20914	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
74	NC_007427	AGC	2	6	21020	21025	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
75	NC_007427	CGC	2	6	21037	21042	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
76	NC_007427	CCA	2	6	22268	22273	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
77	NC_007427	GAC	2	6	22277	22282	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
78	NC_007427	AGT	2	6	22349	22354	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
79	NC_007427	CTG	2	6	22417	22422	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
80	NC_007427	GAT	2	6	22481	22486	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
81	NC_007427	CAG	2	6	22495	22500	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
82	NC_007427	CTG	2	6	22510	22515	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
83	NC_007427	TCG	2	6	22568	22573	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
84	NC_007427	CAA	3	9	23078	23086	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
85	NC_007427	CTC	2	6	23104	23109	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
86	NC_007427	TTG	2	6	23141	23146	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
87	NC_007427	GAA	2	6	23158	23163	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
88	NC_007427	CCA	2	6	23210	23215	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
89	NC_007427	CGA	2	6	24883	24888	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
90	NC_007427	GCG	2	6	25948	25953	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
91	NC_007427	TTC	2	6	25963	25968	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
92	NC_007427	ACG	2	6	26043	26048	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
93	NC_007427	AGC	2	6	26049	26054	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
94	NC_007427	CCT	2	6	26071	26076	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
95	NC_007427	ACC	2	6	26155	26160	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
96	NC_007427	CCG	2	6	27993	27998	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
97	NC_007427	AGC	2	6	28114	28119	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
98	NC_007427	GCT	2	6	29812	29817	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
99	NC_007427	TGC	2	6	29892	29897	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
100	NC_007427	TCG	3	9	30542	30550	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
101	NC_007427	GAG	2	6	30589	30594	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
102	NC_007427	GCT	2	6	30609	30614	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
103	NC_007427	ATA	2	6	30633	30638	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_007427	GTA	2	6	32312	32317	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
105	NC_007427	GTC	2	6	32416	32421	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
106	NC_007427	CGA	2	6	32434	32439	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
107	NC_007427	GTC	2	6	32441	32446	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
108	NC_007427	CAA	2	6	32447	32452	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
109	NC_007427	TAT	2	6	32544	32549	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_007427	ACG	2	6	33583	33588	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
111	NC_007427	GCC	2	6	33603	33608	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
112	NC_007427	CGA	2	6	33750	33755	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
113	NC_007427	GTC	2	6	33791	33796	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
114	NC_007427	GGC	2	6	35572	35577	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
115	NC_007427	GCG	2	6	35759	35764	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
116	NC_007427	GAC	2	6	35771	35776	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
117	NC_007427	CTG	2	6	35826	35831	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
118	NC_007427	GTG	2	6	35845	35850	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
119	NC_007427	GAG	2	6	35906	35911	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
120	NC_007427	CGA	2	6	36179	36184	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
121	NC_007427	CGA	2	6	36228	36233	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
122	NC_007427	GCG	2	6	38026	38031	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
123	NC_007427	AAC	2	6	38166	38171	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
124	NC_007427	ACG	2	6	38266	38271	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
125	NC_007427	GGA	2	6	38342	38347	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
126	NC_007427	TCG	2	6	44538	44543	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
127	NC_007427	TGC	2	6	44731	44736	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
128	NC_007427	GCG	2	6	44867	44872	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
129	NC_007427	TTC	2	6	44899	44904	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
130	NC_007427	TCG	2	6	44922	44927	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
131	NC_007427	TTC	2	6	45050	45055	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
132	NC_007427	GGT	2	6	45909	45914	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
133	NC_007427	TAT	2	6	46028	46033	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_007427	GAC	2	6	49030	49035	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
135	NC_007427	GGT	2	6	49089	49094	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
136	NC_007427	AGA	2	6	49106	49111	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
137	NC_007427	TAA	2	6	49248	49253	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_007427	CTC	2	6	50873	50878	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
139	NC_007427	TGG	3	9	50885	50893	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
140	NC_007427	TCA	2	6	50937	50942	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.