MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Natronomonas pharaonis DSM 2160

Total Repeats: 68

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_007426	ACGGGG	2	12	159810	159821	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
2	NC_007426	GTTTCC	2	12	188458	188469	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_007426	TCGGCA	2	12	193573	193584	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_007426	ACCGCG	2	12	195386	195397	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
5	NC_007426	CCCCAC	2	12	203036	203047	16.67 %	0 %	0 %	83.33 %	Non-Coding
6	NC_007426	GGCCGC	2	12	206053	206064	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
7	NC_007426	CTCTCA	2	12	215648	215659	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
8	NC_007426	CAACAC	2	12	216367	216378	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
9	NC_007426	GCGTCG	2	12	236876	236887	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_007426	CGAACC	2	12	266492	266503	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
11	NC_007426	TTCGTC	2	12	302202	302213	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
12	NC_007426	GGAGGG	2	12	302320	302331	16.67 %	0 %	83.33 %	0 %	Non-Coding
13	NC_007426	CGGTTT	2	12	353291	353302	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
14	NC_007426	TCGGCT	2	12	414078	414089	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_007426	CGTAAT	2	12	434629	434640	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
16	NC_007426	GTGAAA	2	12	439187	439198	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17	NC_007426	TTTCAC	2	12	478941	478952	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_007426	CCGCTC	2	12	489495	489506	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
19	NC_007426	GTGAAA	2	12	527486	527497	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
20	NC_007426	ACGGCG	2	12	567609	567620	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
21	NC_007426	CTGTAC	2	12	568335	568346	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_007426	CTCAAA	2	12	721767	721778	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_007426	GAAACC	2	12	730710	730721	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
24	NC_007426	GCCGCG	2	12	782250	782261	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
25	NC_007426	ATTTTC	2	12	812877	812888	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
26	NC_007426	ATATTT	2	12	865230	865241	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_007426	GTCCCC	2	12	875782	875793	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
28	NC_007426	TTTGTG	2	12	883719	883730	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
29	NC_007426	GTGGCG	2	12	895604	895615	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
30	NC_007426	GCAGCC	2	12	917646	917657	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
31	NC_007426	CATTTC	2	12	923633	923644	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
32	NC_007426	TGGACT	2	12	945419	945430	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
33	NC_007426	CGTCGC	2	12	996960	996971	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
34	NC_007426	CCCGGC	2	12	1034597	1034608	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
35	NC_007426	CCGTGG	2	12	1034648	1034659	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_007426	ACCCGG	2	12	1062006	1062017	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
37	NC_007426	GACGCG	2	12	1086399	1086410	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_007426	CTCAAA	2	12	1133171	1133182	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
39	NC_007426	ACGCGC	2	12	1133221	1133232	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
40	NC_007426	CGGAGA	2	12	1134039	1134050	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
41	NC_007426	CAACGA	2	12	1141019	1141030	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
42	NC_007426	TGAGCA	2	12	1177836	1177847	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
43	NC_007426	TTTTGT	2	12	1196323	1196334	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
44	NC_007426	GCGAGG	2	12	1234581	1234592	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
45	NC_007426	AAAGCA	2	12	1254188	1254199	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
46	NC_007426	CGAGCG	2	12	1299663	1299674	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
47	NC_007426	GTACGC	2	12	1309017	1309028	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
48	NC_007426	AACCGT	2	12	1449329	1449340	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
49	NC_007426	GTTCCG	2	12	1473737	1473748	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
50	NC_007426	TGGTCT	2	12	1501539	1501550	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
51	NC_007426	TTTCAC	2	12	1603866	1603877	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
52	NC_007426	ACAGCC	2	12	1604102	1604113	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
53	NC_007426	CGAAGG	2	12	1643822	1643833	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
54	NC_007426	GGAAAC	2	12	1670640	1670651	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
55	NC_007426	CTTCGA	2	12	1793141	1793152	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
56	NC_007426	CCGGCC	2	12	1803714	1803725	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
57	NC_007426	TGTCGG	2	12	1988003	1988014	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
58	NC_007426	CAGCGG	2	12	2026545	2026556	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
59	NC_007426	AAAAGC	2	12	2079387	2079398	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
60	NC_007426	GGGATG	2	12	2165143	2165154	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
61	NC_007426	AGTCCG	2	12	2186045	2186056	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
62	NC_007426	GGCACG	2	12	2225527	2225538	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
63	NC_007426	CCACAC	2	12	2247541	2247552	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
64	NC_007426	TTGCCA	2	12	2280574	2280585	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
65	NC_007426	CAGCGC	2	12	2311428	2311439	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
66	NC_007426	GGCCCG	2	12	2450182	2450193	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
67	NC_007426	CGGCGA	2	12	2541854	2541865	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
68	NC_007426	AGGGGG	2	12	2580223	2580234	16.67 %	0 %	83.33 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.