MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Nitrobacter winogradskyi Nb-255 chromosome

Total Repeats: 168

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_007406	AATTGA	2	12	229	240	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
2	NC_007406	ATGGCG	2	12	33192	33203	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
3	NC_007406	GCCGCA	2	12	87231	87242	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
4	NC_007406	AAGCGA	2	12	159572	159583	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
5	NC_007406	AAGGCC	2	12	171065	171076	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_007406	AAAGCG	2	12	270721	270732	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
7	NC_007406	ATAGAG	2	12	275222	275233	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8	NC_007406	CTTATC	2	12	315147	315158	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_007406	AAAAAG	2	12	362622	362633	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
10	NC_007406	GGCGCG	2	12	377079	377090	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_007406	TGATCT	2	12	483226	483237	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
12	NC_007406	ATCTCC	2	12	497921	497932	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
13	NC_007406	CGATCA	2	12	543586	543597	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_007406	AGATCA	2	12	699745	699756	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
15	NC_007406	CAGGGA	2	12	735940	735951	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
16	NC_007406	TGATTT	2	12	784003	784014	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
17	NC_007406	TGGCGA	2	12	794728	794739	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
18	NC_007406	CGTCAC	3	18	807506	807523	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
19	NC_007406	GCTTTT	2	12	818686	818697	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
20	NC_007406	GAGGCG	2	12	820685	820696	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
21	NC_007406	GGGATG	2	12	824404	824415	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
22	NC_007406	TCAAGA	2	12	846047	846058	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
23	NC_007406	CATGAT	3	18	863698	863715	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
24	NC_007406	CAAGCG	2	12	908334	908345	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_007406	TTGCGT	2	12	915500	915511	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
26	NC_007406	CGGCTG	2	12	918061	918072	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_007406	CGCGCA	2	12	918152	918163	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
28	NC_007406	CGGCAT	2	12	922612	922623	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
29	NC_007406	CGACGT	2	12	936476	936487	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_007406	GATGCT	2	12	951476	951487	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
31	NC_007406	CCTTCG	2	12	951636	951647	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
32	NC_007406	TCCTCA	2	12	970472	970483	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
33	NC_007406	TCGAAG	2	12	985259	985270	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
34	NC_007406	GAGTTT	2	12	986216	986227	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
35	NC_007406	GGGTCC	2	12	1022878	1022889	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_007406	GAAGCC	2	12	1040814	1040825	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_007406	CGGCAT	2	12	1073197	1073208	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_007406	TTCACG	2	12	1078979	1078990	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
39	NC_007406	GGCGCG	2	12	1082682	1082693	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_007406	CGGTTC	2	12	1093432	1093443	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_007406	GCCTGC	2	12	1126670	1126681	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
42	NC_007406	GTTTTC	2	12	1131304	1131315	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
43	NC_007406	CTTCCG	2	12	1151600	1151611	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
44	NC_007406	CGCTGG	2	12	1196919	1196930	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
45	NC_007406	CCGGAG	2	12	1207821	1207832	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
46	NC_007406	CATCTT	2	12	1240391	1240402	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
47	NC_007406	GCTTAC	2	12	1251801	1251812	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
48	NC_007406	GGATCA	2	12	1337703	1337714	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
49	NC_007406	TCACCT	2	12	1358269	1358280	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
50	NC_007406	CCGTTC	2	12	1360191	1360202	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
51	NC_007406	ACCGGA	2	12	1361957	1361968	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
52	NC_007406	GGTGCC	2	12	1375980	1375991	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
53	NC_007406	TGCCGC	2	12	1376390	1376401	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
54	NC_007406	GCTGGC	2	12	1376589	1376600	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
55	NC_007406	GACTCT	2	12	1377983	1377994	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
56	NC_007406	GCAAAT	2	12	1409131	1409142	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
57	NC_007406	TTTGAT	2	12	1410574	1410585	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
58	NC_007406	TTTTTG	2	12	1435318	1435329	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
59	NC_007406	CGTTAA	2	12	1450312	1450323	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
60	NC_007406	GCTTCC	2	12	1473980	1473991	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
61	NC_007406	AGAATC	2	12	1494512	1494523	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
62	NC_007406	CGTCTT	2	12	1547081	1547092	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
63	NC_007406	GCGCGT	2	12	1548797	1548808	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
64	NC_007406	ATCCGC	2	12	1552949	1552960	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
65	NC_007406	CATGAT	2	12	1599706	1599717	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
66	NC_007406	CCGGCG	2	12	1684513	1684524	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
67	NC_007406	ATCGGA	2	12	1703645	1703656	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
68	NC_007406	TGATTT	2	12	1711509	1711520	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
69	NC_007406	GAAGCG	2	12	1749544	1749555	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
70	NC_007406	GGCATT	2	12	1769218	1769229	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
71	NC_007406	GTTCAT	2	12	1778178	1778189	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
72	NC_007406	GCGACC	2	12	1793288	1793299	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
73	NC_007406	GTTTAC	2	12	1804456	1804467	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
74	NC_007406	CCGAAG	2	12	1809515	1809526	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
75	NC_007406	TCGAAA	2	12	1822573	1822584	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
76	NC_007406	ATCGCC	2	12	1849166	1849177	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
77	NC_007406	ATATCA	2	12	1860037	1860048	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
78	NC_007406	TGATTT	2	12	1883978	1883989	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
79	NC_007406	CCAAAG	2	12	1932856	1932867	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
80	NC_007406	TGATCG	2	12	1932974	1932985	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
81	NC_007406	CGGCCG	2	12	1944023	1944034	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
82	NC_007406	TGACGC	2	12	1946475	1946486	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
83	NC_007406	CGATAG	2	12	1951347	1951358	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
84	NC_007406	TGATCT	2	12	1951527	1951538	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
85	NC_007406	TCGGAT	2	12	1962325	1962336	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
86	NC_007406	ACCGCC	2	12	1997943	1997954	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
87	NC_007406	CCCCCG	2	12	1998738	1998749	0 %	0 %	16.67 %	83.33 %	Non-Coding
88	NC_007406	CTCAAA	2	12	2032545	2032556	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
89	NC_007406	TCGCTC	2	12	2044575	2044586	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
90	NC_007406	AGAAGC	2	12	2052517	2052528	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
91	NC_007406	TGATTT	2	12	2052537	2052548	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
92	NC_007406	TTTTGA	2	12	2078024	2078035	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
93	NC_007406	TGATTT	2	12	2083805	2083816	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
94	NC_007406	GATTCG	2	12	2083938	2083949	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
95	NC_007406	TGCGGA	2	12	2092743	2092754	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
96	NC_007406	CAGCGG	2	12	2155956	2155967	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
97	NC_007406	GTCTTA	2	12	2157429	2157440	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
98	NC_007406	CCAGAT	2	12	2157486	2157497	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
99	NC_007406	CGGAAG	2	12	2160892	2160903	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
100	NC_007406	GAACGT	2	12	2183251	2183262	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
101	NC_007406	TCCGCC	2	12	2194685	2194696	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
102	NC_007406	TTTCGA	2	12	2227578	2227589	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
103	NC_007406	GGCACG	2	12	2239357	2239368	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
104	NC_007406	TTCAAC	2	12	2249029	2249040	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
105	NC_007406	GGCCGG	2	12	2255993	2256004	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
106	NC_007406	CGGCAC	2	12	2256281	2256292	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
107	NC_007406	GCTTGC	6	36	2258673	2258708	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
108	NC_007406	AAGCCG	2	12	2299182	2299193	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
109	NC_007406	CACGTC	2	12	2299680	2299691	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
110	NC_007406	TGCGCG	2	12	2299923	2299934	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
111	NC_007406	GACGGT	2	12	2339088	2339099	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
112	NC_007406	CGTTCT	2	12	2344932	2344943	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
113	NC_007406	TGATTT	2	12	2363144	2363155	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
114	NC_007406	ACCCGA	2	12	2377380	2377391	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
115	NC_007406	AATCTA	2	12	2387158	2387169	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
116	NC_007406	TCCCTC	2	12	2387299	2387310	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
117	NC_007406	CGATGG	2	12	2422839	2422850	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
118	NC_007406	GACGCA	2	12	2441459	2441470	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
119	NC_007406	ACCATA	2	12	2442250	2442261	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
120	NC_007406	CCATAG	2	12	2442320	2442331	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
121	NC_007406	GATGGT	2	12	2522106	2522117	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
122	NC_007406	CGATCC	2	12	2522192	2522203	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
123	NC_007406	GATGGC	2	12	2525792	2525803	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
124	NC_007406	TTCGCG	2	12	2535386	2535397	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
125	NC_007406	CTTTAT	2	12	2573519	2573530	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
126	NC_007406	TGGGGA	2	12	2574287	2574298	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
127	NC_007406	CGGAAT	2	12	2667925	2667936	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
128	NC_007406	CGCCAA	2	12	2671956	2671967	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
129	NC_007406	CCGCTC	2	12	2681943	2681954	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
130	NC_007406	GGGAGA	2	12	2753581	2753592	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
131	NC_007406	CCCTCC	2	12	2836989	2837000	0 %	16.67 %	0 %	83.33 %	Non-Coding
132	NC_007406	CATGCC	2	12	2841120	2841131	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
133	NC_007406	CGATCC	2	12	2923529	2923540	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
134	NC_007406	CCTGCT	2	12	2940350	2940361	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
135	NC_007406	TCAAAA	2	12	2969932	2969943	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
136	NC_007406	CTGAAC	2	12	2987829	2987840	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
137	NC_007406	GGCCTG	2	12	2988153	2988164	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
138	NC_007406	TCCGAA	2	12	2997112	2997123	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
139	NC_007406	GCGCGG	2	12	3006635	3006646	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
140	NC_007406	CCCGGC	2	12	3029693	3029704	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
141	NC_007406	GCTTCC	2	12	3052825	3052836	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
142	NC_007406	CGTGAG	2	12	3054829	3054840	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
143	NC_007406	CGTCGA	2	12	3064571	3064582	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
144	NC_007406	GCCCTC	2	12	3071889	3071900	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
145	NC_007406	GAACGC	2	12	3073760	3073771	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
146	NC_007406	GATCGA	2	12	3133755	3133766	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
147	NC_007406	ATCGGA	2	12	3142754	3142765	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
148	NC_007406	TCGCTC	2	12	3172610	3172621	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
149	NC_007406	CTCCTT	2	12	3173634	3173645	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
150	NC_007406	TTAACC	2	12	3211114	3211125	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
151	NC_007406	GATGAG	2	12	3211255	3211266	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
152	NC_007406	ACGCAT	2	12	3213736	3213747	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
153	NC_007406	GGTTCC	2	12	3213781	3213792	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
154	NC_007406	TGGCGG	2	12	3248778	3248789	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
155	NC_007406	CCTCGA	2	12	3255085	3255096	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
156	NC_007406	AAATCA	2	12	3264140	3264151	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
157	NC_007406	TCGCCG	2	12	3304613	3304624	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
158	NC_007406	GCCGTC	2	12	3322200	3322211	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
159	NC_007406	GTTGAG	2	12	3340509	3340520	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
160	NC_007406	GCCACC	2	12	3345645	3345656	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
161	NC_007406	CCAAAT	2	12	3346293	3346304	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
162	NC_007406	TTCGAG	2	12	3347171	3347182	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
163	NC_007406	CACTCT	2	12	3354092	3354103	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
164	NC_007406	TTCTCT	2	12	3382697	3382708	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
165	NC_007406	AAGCCC	2	12	3388730	3388741	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
166	NC_007406	TATTTG	2	12	3394442	3394453	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
167	NC_007406	TCCGCG	2	12	3397830	3397841	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
168	NC_007406	ACCGGC	2	12	3399493	3399504	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.