MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Nanoarchaeum equitans Kin4-M chromosome

Total Repeats: 52

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_005213	TTTTA	2	10	628	637	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_005213	TAAAG	2	10	10960	10969	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
3	NC_005213	AAATA	2	10	25119	25128	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_005213	AAATA	2	10	27529	27538	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_005213	TATAT	2	10	29350	29359	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_005213	TATTG	2	10	48343	48352	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
7	NC_005213	AGAAA	2	10	48391	48400	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
8	NC_005213	AAACT	2	10	55219	55228	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
9	NC_005213	ACCAA	2	10	55530	55539	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
10	NC_005213	TAAAA	2	10	73653	73662	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_005213	TCTTT	2	10	98511	98520	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
12	NC_005213	GCAAA	2	10	111282	111291	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
13	NC_005213	TAAAA	2	10	150642	150651	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_005213	TTTTA	2	10	173181	173190	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_005213	AAAAG	2	10	179008	179017	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
16	NC_005213	AAAAT	2	10	179180	179189	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_005213	TTTGG	2	10	191934	191943	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
18	NC_005213	TTATT	2	10	192039	192048	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_005213	TAGCT	2	10	220499	220508	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
20	NC_005213	TAATT	2	10	250676	250685	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_005213	TATAT	2	10	259436	259445	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_005213	ATTAC	2	10	259623	259632	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
23	NC_005213	TATAA	2	10	259703	259712	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_005213	TTAAA	2	10	265738	265747	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_005213	AGCTA	2	10	277735	277744	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
26	NC_005213	TATAA	2	10	277837	277846	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_005213	ATTCC	2	10	304191	304200	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
28	NC_005213	ATTTT	2	10	304640	304649	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_005213	ATTTT	2	10	306315	306324	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_005213	TTTTC	2	10	309014	309023	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
31	NC_005213	ATAAA	2	10	327558	327567	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_005213	AAAGA	2	10	327575	327584	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
33	NC_005213	CTTTT	2	10	335344	335353	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
34	NC_005213	TTATT	2	10	347623	347632	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_005213	TGATA	2	10	379934	379943	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
36	NC_005213	TAATA	2	10	380225	380234	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_005213	CCGGG	2	10	395261	395270	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
38	NC_005213	GAAGA	2	10	396146	396155	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
39	NC_005213	TAAAA	2	10	399285	399294	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_005213	GATTA	2	10	402538	402547	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
41	NC_005213	CATAT	2	10	409853	409862	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
42	NC_005213	CTAAG	2	10	417576	417585	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
43	NC_005213	AAAAC	2	10	420453	420462	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
44	NC_005213	GCCGG	2	10	432877	432886	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
45	NC_005213	TAATT	2	10	437412	437421	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_005213	GTTTT	2	10	472111	472120	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
47	NC_005213	GGTTC	2	10	487672	487681	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
48	NC_005213	GAAAT	2	10	489239	489248	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
49	NC_005213	TATAT	2	10	489384	489393	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_005213	ATTAT	2	10	490212	490221	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_005213	AATTA	2	10	490690	490699	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_005213	CAAAA	2	10	490784	490793	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.