MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Nitrosomonas europaea ATCC 19718 chromosome

Total Repeats: 7885

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
6001	NC_004757	CTG	2	6	2163800	2163805	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6002	NC_004757	GA	4	8	2163858	2163865	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
6003	NC_004757	GCG	2	6	2168605	2168610	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6004	NC_004757	AGT	2	6	2168617	2168622	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6005	NC_004757	AGC	2	6	2168673	2168678	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6006	NC_004757	AAC	2	6	2168688	2168693	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6007	NC_004757	AAC	2	6	2168721	2168726	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6008	NC_004757	CCT	2	6	2168784	2168789	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6009	NC_004757	TGG	2	6	2168813	2168818	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6010	NC_004757	ATC	2	6	2168966	2168971	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6011	NC_004757	AAATAA	2	12	2168996	2169007	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6012	NC_004757	ATA	2	6	2169016	2169021	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6013	NC_004757	TTA	2	6	2169022	2169027	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6014	NC_004757	CAA	2	6	2169096	2169101	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6015	NC_004757	TCC	2	6	2169136	2169141	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6016	NC_004757	CCA	2	6	2169152	2169157	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6017	NC_004757	CAT	2	6	2169165	2169170	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6018	NC_004757	GAG	2	6	2169475	2169480	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6019	NC_004757	AAG	2	6	2169490	2169495	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6020	NC_004757	AAGCG	2	10	2169546	2169555	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
6021	NC_004757	AAG	2	6	2169560	2169565	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6022	NC_004757	AG	3	6	2169595	2169600	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
6023	NC_004757	TCT	2	6	2169722	2169727	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6024	NC_004757	CAT	2	6	2169731	2169736	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6025	NC_004757	CAT	2	6	2169827	2169832	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6026	NC_004757	TACTTG	2	12	2169858	2169869	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
6027	NC_004757	T	6	6	2169970	2169975	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6028	NC_004757	AGT	2	6	2170001	2170006	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6029	NC_004757	CAG	2	6	2170117	2170122	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6030	NC_004757	CACGCA	2	12	2170216	2170227	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
6031	NC_004757	AGT	2	6	2170349	2170354	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6032	NC_004757	GCT	2	6	2170463	2170468	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6033	NC_004757	ATT	2	6	2170487	2170492	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6034	NC_004757	CGT	2	6	2170577	2170582	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6035	NC_004757	CAC	2	6	2170630	2170635	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6036	NC_004757	GCC	2	6	2170661	2170666	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6037	NC_004757	AAT	2	6	2170675	2170680	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6038	NC_004757	ATT	2	6	2170757	2170762	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6039	NC_004757	A	6	6	2170764	2170769	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6040	NC_004757	ATT	2	6	2170790	2170795	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6041	NC_004757	TGC	2	6	2170796	2170801	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6042	NC_004757	ACC	2	6	2170835	2170840	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6043	NC_004757	GTT	2	6	2170883	2170888	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6044	NC_004757	ATC	2	6	2170895	2170900	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6045	NC_004757	GAT	2	6	2170925	2170930	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6046	NC_004757	ATTG	2	8	2171027	2171034	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
6047	NC_004757	GCG	2	6	2171049	2171054	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6048	NC_004757	CCT	2	6	2171100	2171105	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6049	NC_004757	GTGA	2	8	2171115	2171122	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
6050	NC_004757	ATT	2	6	2171138	2171143	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6051	NC_004757	ACC	2	6	2171165	2171170	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6052	NC_004757	TGC	2	6	2171278	2171283	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6053	NC_004757	CAT	2	6	2171329	2171334	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6054	NC_004757	TTAA	2	8	2171424	2171431	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6055	NC_004757	CAT	2	6	2171489	2171494	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6056	NC_004757	GCCT	2	8	2171510	2171517	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
6057	NC_004757	CCT	2	6	2171608	2171613	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6058	NC_004757	GC	3	6	2171633	2171638	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6059	NC_004757	TTC	2	6	2171650	2171655	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6060	NC_004757	GAC	2	6	2171675	2171680	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6061	NC_004757	TAG	2	6	2171793	2171798	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6062	NC_004757	GCT	2	6	2171845	2171850	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6063	NC_004757	ATG	3	9	2171852	2171860	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6064	NC_004757	TCG	2	6	2171922	2171927	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6065	NC_004757	CATT	2	8	2172032	2172039	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
6066	NC_004757	ATC	2	6	2172050	2172055	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6067	NC_004757	AAC	2	6	2172061	2172066	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6068	NC_004757	TAC	2	6	2172110	2172115	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6069	NC_004757	GCA	2	6	2172117	2172122	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6070	NC_004757	A	6	6	2172200	2172205	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6071	NC_004757	AG	3	6	2172257	2172262	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
6072	NC_004757	GACA	2	8	2172268	2172275	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
6073	NC_004757	GTA	2	6	2172277	2172282	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6074	NC_004757	AGG	2	6	2173275	2173280	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6075	NC_004757	AGT	2	6	2174393	2174398	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6076	NC_004757	AC	3	6	2174405	2174410	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
6077	NC_004757	CA	3	6	2174422	2174427	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
6078	NC_004757	ATG	3	9	2174490	2174498	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6079	NC_004757	GGT	2	6	2174577	2174582	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6080	NC_004757	TAA	2	6	2174631	2174636	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6081	NC_004757	ATG	2	6	2174658	2174663	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6082	NC_004757	ATTG	2	8	2174701	2174708	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
6083	NC_004757	AAG	2	6	2174753	2174758	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6084	NC_004757	ATG	2	6	2175149	2175154	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6085	NC_004757	CTG	2	6	2175165	2175170	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6086	NC_004757	CCA	2	6	2175236	2175241	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6087	NC_004757	T	6	6	2175262	2175267	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6088	NC_004757	TGT	2	6	2175298	2175303	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6089	NC_004757	TCA	2	6	2175317	2175322	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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6091	NC_004757	ATCCG	2	10	2175537	2175546	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
6092	NC_004757	CGC	2	6	2175549	2175554	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6093	NC_004757	GCC	2	6	2175561	2175566	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6094	NC_004757	CAG	2	6	2175572	2175577	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6095	NC_004757	TTG	2	6	2175625	2175630	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6096	NC_004757	CCAT	2	8	2175637	2175644	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
6097	NC_004757	TTCG	2	8	2175715	2175722	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
6098	NC_004757	AAC	2	6	2175730	2175735	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6099	NC_004757	GCC	2	6	2175744	2175749	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6100	NC_004757	ATT	2	6	2175756	2175761	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6101	NC_004757	ATA	2	6	2175813	2175818	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6102	NC_004757	GTA	2	6	2175828	2175833	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6103	NC_004757	TCA	2	6	2175909	2175914	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6104	NC_004757	AAT	2	6	2175921	2175926	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6105	NC_004757	ATA	2	6	2176006	2176011	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6106	NC_004757	TCTG	2	8	2176026	2176033	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
6107	NC_004757	GATT	2	8	2176066	2176073	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
6108	NC_004757	GTA	2	6	2179412	2179417	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6109	NC_004757	CAA	2	6	2186182	2186187	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6110	NC_004757	AGGG	2	8	2186192	2186199	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
6111	NC_004757	CAG	2	6	2186278	2186283	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6112	NC_004757	A	6	6	2186335	2186340	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6113	NC_004757	A	6	6	2186414	2186419	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6114	NC_004757	AAT	2	6	2186455	2186460	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6115	NC_004757	GTC	2	6	2186475	2186480	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6116	NC_004757	ATA	2	6	2186491	2186496	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6117	NC_004757	TGAT	2	8	2186499	2186506	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
6118	NC_004757	AT	3	6	2186516	2186521	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6119	NC_004757	TCA	2	6	2187430	2187435	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6120	NC_004757	TGA	2	6	2187526	2187531	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6121	NC_004757	GC	3	6	2187564	2187569	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6122	NC_004757	CGATT	2	10	2187579	2187588	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
6123	NC_004757	AGTTG	2	10	2187592	2187601	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
6124	NC_004757	GTG	2	6	2187630	2187635	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6125	NC_004757	TAC	2	6	2187668	2187673	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6126	NC_004757	ATG	2	6	2187797	2187802	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6127	NC_004757	ATC	2	6	2187859	2187864	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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6129	NC_004757	ACA	2	6	2188113	2188118	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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6131	NC_004757	TGC	2	6	2188239	2188244	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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6255	NC_004757	TG	3	6	2237140	2237145	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
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6260	NC_004757	CCCTC	2	10	2240696	2240705	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
6261	NC_004757	CTGA	2	8	2240765	2240772	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
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