MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Non-Coding Repeats of Nostoc sp. PCC 7120 plasmid pCC7120alpha

Total Repeats: 109

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_003276	AG	3	6	17631	17636	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
2	NC_003276	AT	3	6	18173	18178	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_003276	TA	3	6	21060	21065	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_003276	GA	3	6	21357	21362	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5	NC_003276	TA	3	6	26690	26695	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_003276	TG	3	6	31784	31789	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
7	NC_003276	CT	3	6	33961	33966	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
8	NC_003276	TG	3	6	41283	41288	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
9	NC_003276	CA	3	6	43231	43236	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
10	NC_003276	GT	3	6	46464	46469	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
11	NC_003276	AT	3	6	47825	47830	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_003276	TA	3	6	55225	55230	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_003276	GA	4	8	57879	57886	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
14	NC_003276	AT	3	6	61967	61972	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_003276	TA	3	6	62066	62071	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_003276	TA	3	6	62678	62683	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_003276	TA	3	6	62957	62962	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_003276	GA	3	6	64040	64045	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
19	NC_003276	AT	3	6	69569	69574	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_003276	GT	3	6	74584	74589	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
21	NC_003276	CA	3	6	81483	81488	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
22	NC_003276	AG	3	6	83155	83160	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
23	NC_003276	AT	4	8	84237	84244	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_003276	CT	3	6	84432	84437	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
25	NC_003276	TG	3	6	84485	84490	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
26	NC_003276	CA	3	6	90673	90678	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
27	NC_003276	TA	3	6	93940	93945	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_003276	CT	4	8	98192	98199	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
29	NC_003276	GA	3	6	99849	99854	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
30	NC_003276	TC	3	6	101842	101847	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
31	NC_003276	AT	3	6	104200	104205	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_003276	AT	3	6	104221	104226	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_003276	TC	3	6	107643	107648	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
34	NC_003276	CA	3	6	107680	107685	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
35	NC_003276	TG	3	6	144195	144200	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
36	NC_003276	TA	3	6	150224	150229	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_003276	CA	3	6	153883	153888	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
38	NC_003276	AT	3	6	156544	156549	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_003276	TA	3	6	162977	162982	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_003276	AT	3	6	164032	164037	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_003276	CT	3	6	174866	174871	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
42	NC_003276	AT	3	6	176678	176683	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_003276	TA	3	6	178651	178656	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_003276	AT	3	6	180011	180016	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_003276	GA	3	6	180399	180404	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
46	NC_003276	TG	3	6	180483	180488	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
47	NC_003276	AT	3	6	182569	182574	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_003276	AT	3	6	184245	184250	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_003276	CT	3	6	184773	184778	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
50	NC_003276	AC	3	6	186977	186982	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
51	NC_003276	GA	3	6	188418	188423	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
52	NC_003276	CA	3	6	193752	193757	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
53	NC_003276	CA	3	6	199146	199151	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
54	NC_003276	GA	3	6	199654	199659	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
55	NC_003276	TC	3	6	201617	201622	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
56	NC_003276	AC	3	6	201737	201742	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
57	NC_003276	TG	3	6	203629	203634	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
58	NC_003276	TA	3	6	203742	203747	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_003276	TA	3	6	205893	205898	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_003276	TG	3	6	211664	211669	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
61	NC_003276	GA	3	6	211769	211774	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
62	NC_003276	TA	4	8	212952	212959	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_003276	CT	3	6	219369	219374	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
64	NC_003276	AT	3	6	231517	231522	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_003276	AC	3	6	237579	237584	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
66	NC_003276	GA	3	6	237609	237614	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
67	NC_003276	AG	3	6	242091	242096	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
68	NC_003276	AG	3	6	245729	245734	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
69	NC_003276	TA	3	6	255491	255496	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_003276	TA	3	6	255586	255591	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_003276	GA	3	6	263108	263113	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
72	NC_003276	GA	3	6	265089	265094	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
73	NC_003276	AC	3	6	267741	267746	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
74	NC_003276	TA	4	8	268502	268509	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_003276	AT	3	6	271716	271721	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_003276	GA	3	6	274654	274659	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
77	NC_003276	CT	3	6	277388	277393	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
78	NC_003276	TA	3	6	278956	278961	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_003276	AC	3	6	279598	279603	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
80	NC_003276	TC	3	6	280741	280746	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
81	NC_003276	GA	3	6	288270	288275	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
82	NC_003276	TG	3	6	296180	296185	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
83	NC_003276	AT	3	6	299341	299346	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_003276	AG	3	6	308518	308523	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
85	NC_003276	GA	3	6	308617	308622	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
86	NC_003276	TA	3	6	311391	311396	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_003276	CA	3	6	333429	333434	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
88	NC_003276	AG	3	6	335467	335472	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
89	NC_003276	TA	3	6	339471	339476	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_003276	TA	3	6	344180	344185	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_003276	AT	3	6	356760	356765	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_003276	AT	3	6	357166	357171	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_003276	AG	3	6	357680	357685	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
94	NC_003276	CA	3	6	361470	361475	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
95	NC_003276	GA	3	6	374246	374251	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
96	NC_003276	TA	3	6	378222	378227	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_003276	AG	3	6	379843	379848	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
98	NC_003276	GT	3	6	380035	380040	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
99	NC_003276	CT	3	6	382880	382885	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
100	NC_003276	AG	3	6	385677	385682	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
101	NC_003276	TA	3	6	386498	386503	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_003276	CT	3	6	388828	388833	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
103	NC_003276	CT	3	6	390291	390296	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
104	NC_003276	AC	5	10	390399	390408	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
105	NC_003276	TC	3	6	390959	390964	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
106	NC_003276	AT	3	6	394594	394599	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_003276	TG	3	6	395501	395506	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
108	NC_003276	GT	3	6	406174	406179	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
109	NC_003276	TG	3	6	407110	407115	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.