MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Nostoc sp. PCC 7120 chromosome

Total Repeats: 397

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_003272	AACACT	2	12	39106	39117	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_003272	ATAAAA	2	12	47752	47763	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_003272	TTTTAT	2	12	47783	47794	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_003272	GCTGTT	2	12	50717	50728	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
5	NC_003272	TTTGAT	2	12	72360	72371	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
6	NC_003272	TGAGCG	2	12	74051	74062	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
7	NC_003272	TCCCCA	2	12	94609	94620	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8	NC_003272	GCACAG	2	12	101635	101646	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_003272	TACCCC	2	12	129577	129588	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10	NC_003272	AAGCTA	2	12	182139	182150	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
11	NC_003272	TAGTAA	2	12	184824	184835	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
12	NC_003272	TGAAAT	2	12	190676	190687	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
13	NC_003272	TTAATT	2	12	196009	196020	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_003272	ATTCCC	2	12	203742	203753	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
15	NC_003272	TATTAG	2	12	207504	207515	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
16	NC_003272	TAAACT	2	12	207535	207546	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
17	NC_003272	AGCATC	2	12	225741	225752	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_003272	CAAAAA	2	12	229753	229764	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
19	NC_003272	AAATAA	2	12	237265	237276	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_003272	AGGAAA	2	12	251699	251710	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
21	NC_003272	AAATGA	2	12	262069	262080	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
22	NC_003272	CAACCG	2	12	275071	275082	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
23	NC_003272	ATTATA	2	12	282512	282523	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_003272	AGGGGT	2	12	287660	287671	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
25	NC_003272	AAGCGC	2	12	305597	305608	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
26	NC_003272	ATAAAG	2	12	309598	309609	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
27	NC_003272	ACAAAA	2	12	322956	322967	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
28	NC_003272	CAAAAA	2	12	338597	338608	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
29	NC_003272	CCATCA	2	12	378081	378092	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
30	NC_003272	CATTGC	2	12	383935	383946	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_003272	ATTAGC	2	12	384128	384139	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
32	NC_003272	CTTCCC	2	12	393456	393467	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
33	NC_003272	GCGGAA	2	12	397359	397370	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
34	NC_003272	TTAATT	2	12	401568	401579	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_003272	GGAAAG	2	12	412194	412205	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
36	NC_003272	AAAAAT	2	12	433089	433100	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_003272	ATTCAT	2	12	446491	446502	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
38	NC_003272	CCAGGC	2	12	446814	446825	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
39	NC_003272	AGCGTT	2	12	473145	473156	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
40	NC_003272	GAAATA	2	12	504173	504184	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
41	NC_003272	TAAATT	2	12	507483	507494	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_003272	CTATAA	2	12	514174	514185	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
43	NC_003272	CAGTTA	2	12	519910	519921	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
44	NC_003272	ATGACT	2	12	563615	563626	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
45	NC_003272	AGGAGA	2	12	568659	568670	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
46	NC_003272	AAATTC	2	12	593019	593030	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
47	NC_003272	AAAATT	2	12	607481	607492	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_003272	AAATAA	2	12	614396	614407	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_003272	CCCAAT	2	12	620254	620265	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
50	NC_003272	AGAAGT	2	12	635714	635725	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
51	NC_003272	AATCCC	2	12	641745	641756	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
52	NC_003272	ATAAAA	2	12	695773	695784	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_003272	CCGCTA	2	12	738550	738561	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
54	NC_003272	AATTTA	2	12	742105	742116	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_003272	TAAAAT	2	12	747154	747165	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_003272	TTCAAA	2	12	748898	748909	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
57	NC_003272	GAGTTT	2	12	753710	753721	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
58	NC_003272	ACAAAA	2	12	774149	774160	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
59	NC_003272	TTTGGC	2	12	780012	780023	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
60	NC_003272	GTATCC	2	12	783579	783590	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
61	NC_003272	CTAAAT	2	12	842798	842809	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
62	NC_003272	AAGCAG	2	12	857259	857270	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
63	NC_003272	ATCTTT	2	12	866252	866263	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
64	NC_003272	AAATTT	2	12	892956	892967	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_003272	AAGCTA	2	12	900928	900939	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
66	NC_003272	AGTAAC	2	12	903268	903279	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
67	NC_003272	TATCTA	2	12	928773	928784	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
68	NC_003272	ATGTTT	2	12	930938	930949	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
69	NC_003272	TTTATT	2	12	956581	956592	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_003272	ATTCTC	2	12	959263	959274	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
71	NC_003272	TAGCTT	2	12	978202	978213	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
72	NC_003272	TAAATT	2	12	1008191	1008202	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_003272	TAATTG	2	12	1012481	1012492	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
74	NC_003272	AGTTAG	2	12	1037411	1037422	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
75	NC_003272	ACTTAT	2	12	1050303	1050314	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
76	NC_003272	GGTGTA	2	12	1085362	1085373	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
77	NC_003272	CTACGC	2	12	1092678	1092689	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
78	NC_003272	TACTGA	2	12	1092731	1092742	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
79	NC_003272	AGCTTC	2	12	1098574	1098585	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
80	NC_003272	CTGAAG	2	12	1099664	1099675	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
81	NC_003272	GGGCTA	2	12	1102760	1102771	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
82	NC_003272	ATTAGT	2	12	1118037	1118048	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
83	NC_003272	CTAAAC	2	12	1123712	1123723	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
84	NC_003272	CGCTAC	2	12	1161855	1161866	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
85	NC_003272	ATGGCA	2	12	1166462	1166473	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
86	NC_003272	AGGGTT	2	12	1180986	1180997	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
87	NC_003272	TCATCT	2	12	1183808	1183819	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
88	NC_003272	CACCAG	2	12	1194891	1194902	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
89	NC_003272	TAAAAA	2	12	1195791	1195802	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_003272	ATTGGT	2	12	1204296	1204307	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
91	NC_003272	ATTAAA	2	12	1223743	1223754	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_003272	TTCAAT	2	12	1261647	1261658	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
93	NC_003272	ATTTAA	2	12	1267026	1267037	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_003272	GATTAA	2	12	1270451	1270462	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
95	NC_003272	TAGCTT	2	12	1276961	1276972	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
96	NC_003272	CAATCC	2	12	1281897	1281908	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
97	NC_003272	GCTACC	2	12	1292418	1292429	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
98	NC_003272	CATCTC	2	12	1294357	1294368	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
99	NC_003272	CGTTTT	2	12	1331090	1331101	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
100	NC_003272	CCAAAA	2	12	1340717	1340728	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
101	NC_003272	CGAAGT	2	12	1353798	1353809	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
102	NC_003272	ACTGCG	2	12	1360120	1360131	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
103	NC_003272	ACGGCT	2	12	1398387	1398398	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
104	NC_003272	AAACTG	2	12	1403030	1403041	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
105	NC_003272	ATCCTT	2	12	1403098	1403109	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
106	NC_003272	ACAGCC	2	12	1405333	1405344	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
107	NC_003272	TCATAT	2	12	1413267	1413278	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
108	NC_003272	TAGAGT	2	12	1420954	1420965	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
109	NC_003272	CTAAAC	2	12	1421601	1421612	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
110	NC_003272	AATATT	2	12	1450872	1450883	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_003272	AACCCC	2	12	1470905	1470916	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
112	NC_003272	AATCTA	2	12	1472062	1472073	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
113	NC_003272	TAATAT	2	12	1486850	1486861	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_003272	TTTGAT	2	12	1503557	1503568	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
115	NC_003272	TTTTAA	2	12	1507254	1507265	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_003272	TATCCC	2	12	1514308	1514319	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
117	NC_003272	AAATAT	2	12	1514473	1514484	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_003272	AGGGTA	2	12	1551671	1551682	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
119	NC_003272	TCCCCA	2	12	1587575	1587586	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
120	NC_003272	AAGGAA	2	12	1608892	1608903	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
121	NC_003272	TTTAAA	2	12	1614269	1614280	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_003272	ATTTTT	2	12	1646410	1646421	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_003272	AGCAAC	2	12	1666202	1666213	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
124	NC_003272	TATAAA	2	12	1671525	1671536	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_003272	TGGTTT	2	12	1690843	1690854	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
126	NC_003272	TTTAAT	2	12	1733181	1733192	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_003272	AGCGGA	2	12	1759040	1759051	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
128	NC_003272	TTTAAG	2	12	1761586	1761597	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
129	NC_003272	TAGCTT	2	12	1803520	1803531	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
130	NC_003272	TAGCTT	2	12	1835213	1835224	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
131	NC_003272	TGAAAC	2	12	1837571	1837582	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
132	NC_003272	AAACTC	2	12	1843201	1843212	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
133	NC_003272	AACCTC	2	12	1847627	1847638	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
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251	NC_003272	AACTAT	2	12	3773394	3773405	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
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372	NC_003272	ATTTAT	2	12	5854282	5854293	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
373	NC_003272	AAACTT	2	12	5882099	5882110	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
374	NC_003272	ATTTAA	2	12	5907139	5907150	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
375	NC_003272	CGGGTA	2	12	5943858	5943869	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
376	NC_003272	TGTCTG	2	12	5945448	5945459	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
377	NC_003272	AGGAGA	2	12	5963031	5963042	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
378	NC_003272	CACAAC	2	12	5986370	5986381	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
379	NC_003272	AAGCTA	2	12	6005430	6005441	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
380	NC_003272	TAAAGT	2	12	6014233	6014244	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
381	NC_003272	GGGATT	2	12	6026178	6026189	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
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392	NC_003272	TTCACC	2	12	6289366	6289377	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
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397	NC_003272	AGCAAT	2	12	6385286	6385297	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.