MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Neisseria gonorrhoeae FA 1090 chromosome

Total Repeats: 9622

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_002946	A	7	7	248645	248651	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1002	NC_002946	T	7	7	248677	248683	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1003	NC_002946	GGTAT	2	10	248715	248724	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
1004	NC_002946	CGG	2	6	248791	248796	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1005	NC_002946	TGA	2	6	250614	250619	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1006	NC_002946	TTTAT	2	10	251305	251314	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
1007	NC_002946	GCAA	2	8	251333	251340	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
1008	NC_002946	A	6	6	251447	251452	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1009	NC_002946	CGAC	2	8	251497	251504	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
1010	NC_002946	GGC	2	6	251505	251510	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1011	NC_002946	GC	3	6	251509	251514	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1012	NC_002946	GCC	2	6	251536	251541	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1013	NC_002946	TTC	2	6	251564	251569	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1014	NC_002946	GTC	2	6	251595	251600	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1015	NC_002946	AAAT	2	8	251607	251614	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1016	NC_002946	GCC	2	6	252664	252669	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1017	NC_002946	GGC	2	6	252704	252709	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1018	NC_002946	TGTT	2	8	252743	252750	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
1019	NC_002946	T	6	6	252749	252754	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1020	NC_002946	TGC	2	6	252800	252805	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1021	NC_002946	GCCCC	2	10	252869	252878	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
1022	NC_002946	CGC	2	6	252956	252961	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1023	NC_002946	GAA	2	6	253163	253168	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1024	NC_002946	CCG	2	6	253188	253193	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1025	NC_002946	AAC	2	6	253327	253332	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1026	NC_002946	GGC	2	6	254894	254899	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1027	NC_002946	G	10	10	255811	255820	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1028	NC_002946	CGG	3	9	255862	255870	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1029	NC_002946	TGG	2	6	255873	255878	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1030	NC_002946	T	6	6	255948	255953	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1031	NC_002946	GGC	2	6	256687	256692	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1032	NC_002946	GCCCC	2	10	257798	257807	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
1033	NC_002946	GGC	2	6	257819	257824	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1034	NC_002946	GCT	2	6	257942	257947	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1035	NC_002946	CCGAA	2	10	257951	257960	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
1036	NC_002946	ACA	2	6	258066	258071	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1037	NC_002946	TAG	2	6	258085	258090	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1038	NC_002946	AT	3	6	258138	258143	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1039	NC_002946	GAA	2	6	258207	258212	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1040	NC_002946	AGGCGC	2	12	258229	258240	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
1041	NC_002946	GCG	2	6	258274	258279	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1042	NC_002946	CCGAT	2	10	258292	258301	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
1043	NC_002946	CGG	2	6	258347	258352	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1044	NC_002946	CGG	2	6	258365	258370	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1045	NC_002946	TACGG	2	10	258428	258437	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
1046	NC_002946	ACG	2	6	258474	258479	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1047	NC_002946	CGA	2	6	258481	258486	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1048	NC_002946	AGA	2	6	258520	258525	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1049	NC_002946	CCG	4	12	258601	258612	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1050	NC_002946	ACA	3	9	258708	258716	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1051	NC_002946	GCTGAA	2	12	258718	258729	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
1052	NC_002946	CG	3	6	258764	258769	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1053	NC_002946	CGG	2	6	258771	258776	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1054	NC_002946	CAG	2	6	258796	258801	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1055	NC_002946	GTC	2	6	259025	259030	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1056	NC_002946	GGTC	2	8	259035	259042	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
1057	NC_002946	GCA	2	6	259098	259103	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1058	NC_002946	GGC	2	6	259164	259169	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1059	NC_002946	CAC	2	6	259190	259195	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1060	NC_002946	GAA	2	6	259200	259205	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1061	NC_002946	GCGG	2	8	259216	259223	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
1062	NC_002946	AACCG	2	10	259261	259270	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
1063	NC_002946	CCTT	2	8	259314	259321	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1064	NC_002946	CAG	2	6	259454	259459	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1065	NC_002946	TTGCCG	2	12	259486	259497	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1066	NC_002946	A	6	6	259501	259506	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1067	NC_002946	CAG	2	6	259522	259527	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1068	NC_002946	ATT	2	6	259555	259560	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1069	NC_002946	CCGG	2	8	259697	259704	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1070	NC_002946	GCTT	2	8	259841	259848	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
1071	NC_002946	TCT	2	6	259893	259898	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1072	NC_002946	ATCTGA	2	12	259924	259935	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
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1075	NC_002946	CGG	2	6	260039	260044	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1076	NC_002946	T	7	7	260187	260193	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1078	NC_002946	A	6	6	260289	260294	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1079	NC_002946	TCA	2	6	260415	260420	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1080	NC_002946	ATT	2	6	260424	260429	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1081	NC_002946	CGA	2	6	260486	260491	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1083	NC_002946	TTG	2	6	260581	260586	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1084	NC_002946	TG	3	6	261768	261773	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1085	NC_002946	TCT	2	6	263414	263419	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1086	NC_002946	CGG	2	6	263461	263466	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1087	NC_002946	TTG	2	6	263480	263485	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1088	NC_002946	CAGG	2	8	263504	263511	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
1089	NC_002946	TGTC	2	8	263519	263526	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
1090	NC_002946	GT	3	6	263530	263535	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1091	NC_002946	GAAA	2	8	263540	263547	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
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1094	NC_002946	GGC	2	6	270064	270069	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1095	NC_002946	GGGCG	2	10	270087	270096	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
1096	NC_002946	GAC	2	6	270115	270120	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1097	NC_002946	GTC	2	6	270142	270147	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1098	NC_002946	TG	3	6	270149	270154	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1099	NC_002946	GGA	2	6	270292	270297	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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1101	NC_002946	ATG	3	9	270373	270381	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1102	NC_002946	CG	3	6	270409	270414	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1103	NC_002946	T	6	6	270472	270477	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1104	NC_002946	GCG	2	6	270484	270489	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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1106	NC_002946	GGC	2	6	270669	270674	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1107	NC_002946	GCC	2	6	270698	270703	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1108	NC_002946	GGC	2	6	270718	270723	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1109	NC_002946	GCG	2	6	270755	270760	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1110	NC_002946	CCGTTT	2	12	270793	270804	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
1111	NC_002946	GCCT	2	8	270830	270837	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
1112	NC_002946	CG	3	6	270845	270850	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1113	NC_002946	GCG	2	6	270880	270885	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1114	NC_002946	TG	3	6	270914	270919	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1115	NC_002946	A	6	6	270968	270973	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1116	NC_002946	GAA	2	6	271006	271011	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1117	NC_002946	ATTTT	2	10	272267	272276	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
1118	NC_002946	GTG	2	6	277127	277132	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1119	NC_002946	T	7	7	277140	277146	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1120	NC_002946	TCAT	2	8	277154	277161	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
1121	NC_002946	A	6	6	277184	277189	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1122	NC_002946	CTTT	2	8	277213	277220	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
1123	NC_002946	GGTTC	2	10	277260	277269	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
1124	NC_002946	ATA	2	6	277352	277357	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1125	NC_002946	GCTTT	2	10	277415	277424	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
1126	NC_002946	ATC	2	6	277425	277430	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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1128	NC_002946	T	6	6	277436	277441	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1129	NC_002946	CGT	2	6	277467	277472	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1130	NC_002946	TTCG	2	8	277508	277515	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
1131	NC_002946	GGC	2	6	277550	277555	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1132	NC_002946	CGGAA	2	10	279697	279706	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
1133	NC_002946	GGC	2	6	281677	281682	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1134	NC_002946	GCAG	2	8	281701	281708	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
1135	NC_002946	AGC	2	6	281718	281723	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1136	NC_002946	CCG	2	6	281737	281742	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1137	NC_002946	CAAA	2	8	281747	281754	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
1138	NC_002946	CCG	2	6	281781	281786	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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1261	NC_002946	ATCA	2	8	317415	317422	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
1262	NC_002946	ATA	2	6	317455	317460	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1263	NC_002946	TAT	2	6	317482	317487	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1265	NC_002946	TA	3	6	317850	317855	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1266	NC_002946	CCTT	2	8	317930	317937	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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1269	NC_002946	GGT	2	6	320296	320301	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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1271	NC_002946	AT	3	6	321141	321146	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1272	NC_002946	AAT	2	6	321152	321157	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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